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Phaeocystis globosaPhaeocystis antarctica叶绿体psbA基因的比较
引用本文:杨泽民,章 群,谢数涛,韩博平,吕颂辉,Hodgkiss.Phaeocystis globosaPhaeocystis antarctica叶绿体psbA基因的比较[J].海洋科学,2005,29(1):24-28.
作者姓名:杨泽民  章 群  谢数涛  韩博平  吕颂辉  Hodgkiss
作者单位:1. 暨南大学,水生生物研究所,广东,广州,510632
2. 香港大学,生物多样性系,香港,999077
基金项目:国家自然科学基金资助项目(40106014),广东省自然科学基金资助项目(000760)
摘    要:测定了2株球形棕囊藻Phaeocystis globosa P1、P2的psbA基因序列。发现得到的2个序列完全相同。以P2序列对比分析了P.globosa和P.antarctica的psbA基因在DNA序列、氮基酸序列和RNA二级结构上的差异性,发现2种棕囊藻psbA基因DNA序列和氨基酸序列非常保守,无插入/缺失,其核苷酸和氨基酸变异率分别为1.88%和1.13%。与核基因核苷酸的碱基替换不同,psbA基因核苷酸的碱基替换主要发生在密码子的第1位上。且不引起氨基酸的变化,引起氨基酸变化的碱基替换都发生在密码子的第2位和第3位上。在RNA二级结构上两序列的1~4茎环结构完全相同,表现出明显的棕囊藻属的特异性,其它结构区域差异较大。种间差异表现明显。由于psbA基因DNA序列和氨基酸序列非常保守,可能不适宜棕囊藻属的系统发育分析。但其RNA二级结构可能对于棕囊藻的分子分类有一定的参考价值。

关 键 词:Phaeocystis  globosa  P.antarctica  psbA  DNA序列  氨基酸序列  RNA二级结构
文章编号:1000-3096(2005)01-0024-05
收稿时间:2004/3/18 0:00:00
修稿时间:2004年3月18日

Comparative study of chloroplast psbA gene between Phaeocystis globosa and P. antarctica
YANG Ze-min,ZHANG Qun,XIE Shu-tao,HAN Bo-ping,Lü Song-hui,Hodgkiss.Comparative study of chloroplast psbA gene between Phaeocystis globosa and P. antarctica[J].Marine Sciences,2005,29(1):24-28.
Authors:YANG Ze-min  ZHANG Qun  XIE Shu-tao  HAN Bo-ping  Lü Song-hui  Hodgkiss
Abstract:
Keywords:Phaeocystis globosa  P  antarctica  psbA DNA sequence  amino acid sequence  secondary structure of RNA
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