| 杂色龙虾线粒体基因组全序列的测定与分析 |
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| 引用本文： | 刘 皓,姚 维,刘海情,刘楚吾,刘 丽.杂色龙虾线粒体基因组全序列的测定与分析[J].海洋科学,2014,38(11):16-23. |
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| 作者姓名： | 刘 皓 姚 维 刘海情 刘楚吾 刘 丽 |
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| 作者单位： | 广东海洋大学 水产学院 南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室,广东 湛江,524025 |
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| 基金项目： | 国家科技支撑计划资助项目(2007BAD29B03) |
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| 摘 要： | 为了解杂色龙虾(Panulirus versicolor)线粒体基因组多态位点及遗传变异,对龙虾类的分类研究奠定基础,作者通过常规PCR步移扩增法获得杂色龙虾线的线粒体基因组全序列,分析了其线粒体基因组的基本特征以及基因排列情况,并结合中国龙虾(Panulirus stimposni)、波纹龙虾(Panulirus homarus)线粒体基因组全序列,综合分析了龙虾属线粒体编码基因多态位点及基因变异状况。结果表明:杂色龙虾线粒体基因组全序列为15 700 bp,由13个蛋白质编码基因、22个t RNA基因、2个r RNA基因和D-loop区组成,保持了泛甲壳动物线粒体基因组的原始排列。杂色龙虾线粒体DNA的碱基组成具有AT偏好性,A+T含量为67%,4种碱基的含量分别为(A=34.6%,T=32.1%,C=20.5%,G=12.8%)。预测了杂色龙虾18个t RNA以及2个r RNA的二级结构。龙虾属线粒体基因组中的nad 2、nad 5基因以及D-loop区的多态位点比例较高,适合作为分子标记用于龙虾类系统进化关系、种内多态性以及遗传分化等方面的研究。
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| 关 键 词： | 杂色龙虾(Panulirus versicolor) 线粒体基因组 RNA二级结构 分子标记 |
| 收稿时间： | 2013/11/26 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2014/6/22 0:00:00 |
Sequencing and analysis of the complete mitochondrial genome of Panulirus versicolor |
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| LIU Hao
,
YAO Wei
,
LIU Hai-qing
,
LIU Chu-wu
,
LIU Li.Sequencing and analysis of the complete mitochondrial genome of Panulirus versicolor[J].Marine Sciences,2014,38(11):16-23. |
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| Authors: | LIU Hao YAO Wei LIU Hai-qing LIU Chu-wu LIU Li |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Panulirus versicolor mitochondrial genome RNA secondary structure molecular markers |
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