| 黄口荔枝螺转录组数据的微卫星标记开发与分析 |
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| 引用本文： | 李 威,赵 姗,焦海峰,林志华,包永波.黄口荔枝螺转录组数据的微卫星标记开发与分析[J].海洋科学,2015,39(11):61-67. |
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| 作者姓名： | 李 威 赵 姗 焦海峰 林志华 包永波 |
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| 作者单位： | 浙江万里学院 浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验,浙江万里学院 浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验,宁波市海洋与渔业研究院,浙江万里学院 浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验,浙江万里学院 浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验 |
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| 基金项目： | 宁波市农业科技攻关项目(2014C10018) |
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| 摘 要： | 以黄口荔枝螺转录组测序所得到的拼接序列为基础,利用MISA软件进行微卫星分析,利用Primer5.0设计引物160对。结果显示,83对引物能够成功扩增,引物在黄口荔枝螺渔山列岛群体多态性检测中发现,37个SSR位点能够表现出多态性,一共获得了129个等位基因,各位点等位基因数为2~5个,平均每个位点等位基因数为3.49个,观测杂合度H_o,期望杂合度H_e,多态信息含量PIC范围分别介于0.000~0.800、0.146~0.645、0.139~0.573之间,有9个表现为高度多态,20个表现为中度多态,8个表现为低度多态。实验结果进行Hardy-Weinberg平衡检测后,利用Bonferroni correction法进行校正,有29个位点显著偏离,结果表明渔山列岛黄口荔枝螺群体总体遗传多样性水平较低。
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| 关 键 词： | 黄口荔枝螺 转录组 微卫星 遗传多样性 |
| 收稿时间： | 2015/6/16 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2015/7/22 0:00:00 |
Characterization and analysis of microsatellite markers in Thais luteostoma using next generation sequencing |
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