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瘤背石磺表皮生长因子基因的克隆、结构及进化分析
引用本文:杨铁柱,沈和定,史艳梅,刘 欣,吴 欣,李 杰.瘤背石磺表皮生长因子基因的克隆、结构及进化分析[J].海洋科学,2017,41(3):8-16.
作者姓名:杨铁柱  沈和定  史艳梅  刘 欣  吴 欣  李 杰
作者单位:上海海洋大学 水产与生命学院,上海海洋大学 水产与生命学院,上海海洋大学 水产与生命学院,上海海洋大学 水产与生命学院,上海海洋大学 水产与生命学院,上海海洋大学 水产与生命学院
基金项目:国家自然科学基金资助项目(41276157); 上海高校水产学一流学科建设项目
摘    要:首次在瘤背石磺(Onchidium struma)中克隆得到一种新的表皮生长因子(EGF)的cDNA序列全长。EGF基因cDNA的全长为1158bp,命名为Os-egf1,其中开放阅读框长度为846 bp,编码一条包含281个氨基酸残基的多肽链。根据氨基酸序列比对和结构域分析结果发现其含有2个保守的EGF结构域和1个EGF-like结构域,每个结构域中均包含至少6个半胱氨酸残基,且形成CX7 CX4-5 CX10-13CXCX8 C结构,其结构域由C1~C3、C2~C4和C5~C6之间形成的3个二硫键维持,符合表皮生长因子家族及其相关蛋白的特征结构域,但其余氨基酸序列与现有相关基因差异较大,推测可能是一种新的EGF-like基因。利用MEGA6.0软件构建Os-egf1与EGF家族相关蛋白的系统进化树,表明EGF家族蛋白具有一定的物种特异性。

关 键 词:瘤背石磺(Onchidium  struma)    EGF    基因克隆    系统进化分析
收稿时间:2016/6/19 0:00:00
修稿时间:2016/11/18 0:00:00

Molecular cloning and characterization of EGF-like gene in Onchidium struma
YANG Tie-zhu,SHEN He-ding,SHI Yan-mei,LIU Xin,WU Xin and LI Jie.Molecular cloning and characterization of EGF-like gene in Onchidium struma[J].Marine Sciences,2017,41(3):8-16.
Authors:YANG Tie-zhu  SHEN He-ding  SHI Yan-mei  LIU Xin  WU Xin and LI Jie
Abstract:
Keywords:Onchidium struma  EGF  gene cloning  phylogenetic analysis
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