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坛紫菜磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的克隆与序列分析
引用本文:张晓娟,王广策,何林文,陈昌生.坛紫菜磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因的克隆与序列分析[J].海洋科学,2011,35(4):70-76.
作者姓名:张晓娟  王广策  何林文  陈昌生
作者单位:1. 中国科学院,海洋研究所,山东,青岛,266071;中国科学院,研究生院,北京,100049
2. 中国科学院,海洋研究所,山东,青岛,266071;天津科技大学海洋学院,天津,100039
3. 集美大学,渔业学院,福建,厦门,361020
基金项目:国家自然科学基金重点项目(30830015); 海洋公益性行业科研专项项目(201105008-2, 201105023-7)
摘    要:采用同源克隆的方法和RACE技术,从坛紫菜cDNA中获得了磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)的序列,该段序列含2538个核苷酸包含一个终止密码子TAG和191 bp的3'端非编码区(UTR),可编码846个氨基酸.该段序列中无跨膜结构和信号肽序列,推导的氨基酸序列中C末端第813位氨基酸是丙氨酸(A),表明是一个C<,...

关 键 词:坛紫菜  PEPC基因  序列分析  系统进化分析
收稿时间:2010/4/10 0:00:00
修稿时间:2010/5/20 0:00:00

Cloning and analysis of the phosphoenolpyruvate carboxylase gene of Porphyra haitanensis (Rhodophyta)
ZHANG Xiao-juan,WANG Guang-ce,HE Lin-wen,CHEN Chang-sheng.Cloning and analysis of the phosphoenolpyruvate carboxylase gene of Porphyra haitanensis (Rhodophyta)[J].Marine Sciences,2011,35(4):70-76.
Authors:ZHANG Xiao-juan  WANG Guang-ce  HE Lin-wen  CHEN Chang-sheng
Abstract:Phosphoenolpyruvate carboxylase (PEPC; EC 4.1.1.31) plays an important role in photosynthesis. To get a deeper insight into the PEPC gene of Porphyra haitanensis T. J. Chang et B. F. Zheng (Bangiales, Rhodophyta), we cloned a partial-length cDNA by homology cloning and RACE. This sequence includes 2538bp encoding a propetide of 846 amino acid residues. The deduced polypeptide shows high identities with the PEPC genes ranging from bacteria and unicellular algae to green plant. Phylogenetic tree analysis shows that he PEPC gene from the Porphyra haitanensis is a C3-like PEPC and more closely related to the ancestral type.
Keywords:Porphyra haitanensis  phosphoenolpyruvate carboxylase gene  sequence analysis  phylogenetic tree analysis
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