| 条斑紫菜SSU 中内含子分析 |
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| 引用本文： | 李星辰,徐佳杰,林中姮,沈颂东.条斑紫菜SSU 中内含子分析[J].海洋科学,2015,39(3):12-18. |
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| 作者姓名： | 李星辰 徐佳杰 林中姮 沈颂东 |
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| 作者单位： | 苏州大学 医学部基础医学与生物科学学院，细胞生物学系，江苏 苏州 215123 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(41276134) |
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| 摘 要： | 根据GenBank中已知的条斑紫菜(Porphyra yezoensis)SSU和LSU r RNA基因序列分别设计引物,分别以混合个体和单个个体的基因组DNA以及c DNA为模板进行扩增,测序分析后推测SSU r RNA基因中的内含子转录后加工可能仍被保留,而在LSU r RNA基因上游序列中没有发现内含子。长511bp的内含子位于SSU r RNA基因序列的上游,其插入位点为TCTGGTG-CCAGCAGCC,内含子5′和3′端的核苷酸序列分别为AAC-和-ATGG。该内含子的剪接位点以及保守区P,Q,R,S与I型内含子是不同的。研究发现,在同种紫菜中,不同个体SSU基因中内含子的有无、分布及结构特征是不同的,说明内含子对于分类是不太适合的。但是内含子的长度以及核苷酸序列在种间又具有一定的特异性,可以为红藻种间以及种内亲缘关系较远的亚种和不同地理群的区分和鉴定提供参考。
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| 关 键 词： | 条斑紫菜(Porphyra yezoensis) rRNA基因 内含子 同质性 系统发育 |
| 收稿时间： | 2014/5/11 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2014/9/26 0:00:00 |
Analysis of intron in SSU of Porphyra yezoensis |
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| LI Xing-chen
,
XU Jia-jie
,
LIN Zhong-heng
,
SHEN Song-dong.Analysis of intron in SSU of Porphyra yezoensis[J].Marine Sciences,2015,39(3):12-18. |
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| Authors: | LI Xing-chen XU Jia-jie LIN Zhong-heng SHEN Song-dong |
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| Institution: | LI Xing-chen;XU Jia-jie;LIN Zhong-heng;SHEN Song-dong;Cell Biology Department, School of Biology and Basic Medical Sciences, Medical College of Soochow University; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Porphyra yezoensis ribosomal DNA introns homogeneity phylogenetic development |
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