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利用ITS 基因研究徐闻滨珊瑚的系统发生关系
引用本文:李文娟,刘楚吾,刘 丽,廖宝林.利用ITS 基因研究徐闻滨珊瑚的系统发生关系[J].海洋科学,2012,36(7):56-60.
作者姓名:李文娟  刘楚吾  刘 丽  廖宝林
作者单位:1. 广东海洋大学水产学院,南海水产经济动物增养殖广东省普通高校重点实验室,广东湛江524025
2. 徐闻珊瑚礁国家级自然保护区,广东湛江,524100
基金项目:广东省海洋渔业科技推广专项(A200908F01);国家海洋公益性行业科研专项(201105012)
摘    要:分别研究了徐闻3种滨珊瑚的ITS1和ITS2基因的碱基组成和G+C含量,并和已上传至Genbank上的其他9种滨珊瑚的ITS序列进行比较,研究了徐闻3种滨珊瑚的系统发生关系.序列分析结果显示,3种滨珊瑚的ITS1的长度为205 bp~209 bp,G+C含量为37.6%~45.5%,ITS2的长度为192 bp~226 bp,G+C含量为45.1%~50.7%,利用MEGA4.1软件计算滨珊瑚属基于ITS1和ITS2基因的平均遗传距离分别为0.097和0.200.基于ITS1和ITS2的NJ系统进化树都显示出,灰黑滨珊瑚位于进化树的基部,是原始的类群,普格滨珊瑚是进化类群,澄黄滨珊瑚是过渡类群.

关 键 词:滨珊瑚  ITS基因  系统发生关系
收稿时间:2011/11/11 0:00:00
修稿时间:2012/1/22 0:00:00

Phylogeny analysis of Porites link in Xuwen using its gene
LI Wen-juan,LIU Chu-wu,LIU Li,LIAO Bao-lin.Phylogeny analysis of Porites link in Xuwen using its gene[J].Marine Sciences,2012,36(7):56-60.
Authors:LI Wen-juan  LIU Chu-wu  LIU Li  LIAO Bao-lin
Institution:1.Fisheries College,Guangdong Ocean University,Key Laboratory of Aquaculture in South China Sea for Aquatic Economic Animal,Regular High Education Institution of Guangdong Province,Zhanjiang 524025,China;2.Xuwen National Coral Reef Nature Reserve,Zhanjiang 524100,China)
Abstract:
Keywords:porites  ITS genes  phylogeny
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