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鲤JAK2基因分子克隆及组织表达分析
引用本文:付友,高谦,文春根,吴平,刘德立.鲤JAK2基因分子克隆及组织表达分析[J].广东海洋大学学报,2015(1):8-17.
作者姓名:付友  高谦  文春根  吴平  刘德立
作者单位:南昌大学生命科学与食品工程学院;中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室;华中师范大学生命科学学院
基金项目:国家自然科学基金面上项目(31272666);国家自然科学基金面上项目(30871937);国家科技支撑计划课题(2012BAD25B0202)
摘    要:采用同源克隆策略和RACE-PCR技术,克隆得到可能的鲤(Cyprinus carpio)两面神激酶2(JAK2)基因的c DNA全长序列,包括3 378 bp的开放阅读框,732 bp的5'-非编码区,529 bp的3'-非编码区,总长度达4 639bp。开放阅读框可编码1 125个氨基酸,推测分子质量和理论等电点分别为129.33 ku和6.99。同源性分析显示,克隆的鲤鱼基因与斑马鱼(Danio rerio)JAK2同源性最高,其氨基酸序列同一性和相似度分别达89%和95%。结构域预测表明,所编码氨基酸序列包含FERM、SH2及两个酪氨酸激酶结构域,这4个结构域也保守地存在于其他脊椎动物的JAK分子中。高级结构预测显示,鲤JAK2主要包括α-螺旋(α-helix)、β-折叠(β-sheet)和连接环(loop)等3类结构元件。脊椎动物JAK分子系统进化树显示,JAK1、JAK2、JAK3和TYK2等4类JAK分子分别聚类,鲤JAK2处于JAK2支系中,与所有其他的鱼类JAK2聚为一大支,并与两栖类和哺乳类组成的另一大支构成姊妹群,表明它们具有共同的祖先基因,为直系同源关系。实时荧光定量PCR检测结果表明,鲤JAK2在皮肤中表达量最高,其次是肠、血液和脑,而在肌肉、鳃、头肾、心、肝、脾中表达量较低;鲤JAK3在脾中表达量最高,在其他组织中表达量均很低,甚至未检出。

关 键 词:  JAK2  JAK3  基因克隆  组织表达分析

Cloning and Expression Analysis of JAK2 Gene in Common Carp,Cyprinus carpio
FU You;GAO Qian;WEN Chun-gen;WU Ping;LIU De-li.Cloning and Expression Analysis of JAK2 Gene in Common Carp,Cyprinus carpio[J].Journal of Zhanjiang Ocean University,2015(1):8-17.
Authors:FU You;GAO Qian;WEN Chun-gen;WU Ping;LIU De-li
Institution:FU You;GAO Qian;WEN Chun-gen;WU Ping;LIU De-li;School of Life Science and Food Engineering, Nanchang University;State Key Laboratory of Freshwater Ecology and Biotechnology, Institute of Hydrobiology,Chinese Academy of Sciences;College of Life Science,Central China Normal University;
Abstract:
Keywords:
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