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1.
目的：通过网络药理学方法结合分子对接技术研究半夏泻心汤治疗反流性食管炎（RE）的潜在有效成分及分子作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）查找半夏泻心汤活性成分和药物潜在靶点。基于GeneCards、OMIM、DrugBank和TTD数据库获取RE疾病靶点,使用R语言4.0.4得到药物和疾病的交集靶点。采用Cytoscape 3.8.0分析软件筛选并构建“中药-活性成分-靶点”网络,结合STRING数据库对交集靶点进行蛋白互作网络分析,使用R软件进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。利用AutoDock Vina 1.1.2对关键活性成分与作用靶点进行分子对接验证。结果：半夏泻心汤治疗RE共收集到162个活性化学成分和151个靶点,Cytoscape 3.8.0软件筛选出Jun激酶（JUN）、信号传导与转录激活因子3（STAT3）、MYC基因（MYC）、丝裂原活化蛋白激酶3（MAPK3）、肿瘤蛋白p53（TP53）、丝裂原活化蛋白激酶14（MAPK14）、蛋白激酶（AKT1）、丝裂原活化蛋白激酶8（MAPK8）、核转录因子-κB/p65（RELA）、丝裂原活化蛋白激酶1（MAPK1）、肿瘤坏死因子（TNF）、细胞周期蛋白D1（CCND1）等核心靶点和槲皮素、山柰酚、汉黄芩素、柚皮素、黄芩素等关键活性成分。GO富集条目2740个,包括2470个生物过程、84个细胞组成和186个分子功能;KEGG通路富集得到糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物-晚期糖基化终产物受体、白细胞介素17、TNF、p53和缺氧诱导因子-1等信号通路。分子对接结果显示半夏泻心汤的关键活性成分可以对JUN、STAT3、MYC、MAPK3、TP53、MAPK14、AKT1、MAPK8等核心靶点产生调控作用。结论：半夏泻心汤可以通过多成分、多靶点、多通路治疗RE,为半夏泻心汤治疗RE作用机制的进一步阐明提供了指引。 相似文献
2.
目的：基于网络药理学和分子对接研究加减蠲痰方治疗多囊卵巢综合征（PCOS）的作用机制。方法：通过TCMSP数据库获取加减蠲痰方的药物有效成分及作用靶点;利用GeneCards、OMIM等数据库筛选PCOS相关靶点;通过微生信平台获得加减蠲痰方与PCOS的交集靶点。利用Cytoscape 3.7.1软件构建药物、靶点与疾病之间的关系网络。应用STRING数据库构建交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,并运用Metascape数据库进行基因本体（GO）功能、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。利用分子对接技术验证关键成分与核心靶点的对接能力。结果：获得山柰酚、豆甾醇、异鼠李素、汉黄芩、柚皮素等96种活性成分,有丝分裂激活蛋白激酶3（MAPK3）、细胞肿瘤抗原p53（TP53）、有丝分裂激活蛋白激酶1（MAPK1）、转录因子AP-1、蛋白激酶B1等126个交集靶点以及磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B、丝裂原激活的蛋白激酶、肿瘤坏死因子、转录因子、糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物及其受体（AGE-RAGE）信号通路。槲皮素与9个关键靶点均可良好结合,结果排前3位的靶点为MAPK3、TP53、MAPK1。结论：加减蠲痰方治疗PCOS具有多成分、多靶点、多通路的特点,可能通过改善胰岛素抵抗、抑制颗粒细胞自噬并促进卵泡发育、减轻排卵障碍、促进细胞凋亡、调控血糖稳态、调节激素水平、抗炎等药理作用来调治PCOS,为后期进一步研究提供理论依据。 相似文献
3.
目的：通过网络药理学及分子对接技术探讨全真一气汤治疗慢性阻塞性肺疾病（COPD）的作用机制。方法：通过TCMSP、ETCM筛选全真一气汤活性成分,利用TCMSP和Swiss Target Prediction数据库预测潜在靶点,通过GeneCards、DisGeNET、DrugBank数据库收集COPD靶点,并取疾病及药物靶点交集。利用Cytoscape 3.9.1软件构建药物-成分-靶点可视化网络,利用STRING平台构建交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图并筛选核心靶点,利用Metascape平台对交集靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。关键成分和核心靶点蛋白采用Auto Dock Vina进行分子对接。结果：筛选得到全真一气汤有效成分44种,作用靶点295个,疾病靶点1865个,核心靶点为转录激活因子3（STAT3）、肉瘤基因（SRC）、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）、肿瘤蛋白p53（TP53）、丝裂原活化蛋白激酶1（MAPK1）、染色体基因（JUN）、人雌激素受体α（ESR1）;GO功能主要涉及对无机物的反应、蛋白激酶活性、膜筏等,KEGG信号通路主要涉及磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B（PI3K-Akt）、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）、肿瘤坏死因子（TNF）等;分子对接结果显示关键成分与核心靶点结合较好。结论：全真一气汤可通过多成分、多靶点、多途径治疗COPD,本研究结果为中医药治疗COPD的实验研究提供了参考。 相似文献
4.
目的：基于网络药理学及分子对接技术研究桃仁-红花治疗膝骨关节炎（KOA）的作用机制。方法：采用TCMSP及Uniprot数据库收集整合桃仁、红花的活性成分及其药理作用靶点,在GeneCards数据库检索KOA的靶点基因,通过Venny获取疾病-药物交互靶点,借助STRING 数据库及Cytoscape软件构建蛋白互作网络图并上传Metascape数据库进行GO功能和 KEGG通路富集分析,最后运用 AutoDock和Pymol将核心有效成分与相应的关键靶点进行分子对接预测。结果：1）桃仁-红花有效活性成分45个,主要成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素等;2）KOA与药物的共同靶点120个,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）、转录因子AP-1（JUN）、肿瘤坏死因子（TNF）、细胞肿瘤抗p53（TP53）、转录因子p65（RELA）、丝裂原激活的蛋白激酶1（MAPK1）、白细胞介素6（IL-6）、热休克蛋白（HSP90AA1）、血管内皮生长因子A （VEGFA）、丝裂原激活的蛋白激酶8（MAPK8）等为关键靶点;3）分子对接结果显示山柰酚可靶向结合AKT1、TNF;4）GO功能富集分析得出桃仁-红花治疗KOA主要涉及细胞增殖、生长因子的反应、细胞应激反应的调节、细胞死亡的正调控等生物合成过程;5）KEGG通路富集分析显示白细胞介素17（IL-17）、雌激素信号通路为桃仁-红花干预KOA的主要信号通路。结论：桃仁-红花中的槲皮素、山柰酚、木犀草素等有效成分通过AKT1、JUN、TNF、TP53、RELA、MAPK1、IL-6、HSP90AA1、VEGFA、MAPK8等关键靶点与IL-17和雌激素信号通路等主要通路发挥抗炎、调控细胞增殖、凋亡及应激反应的方式治疗KOA。 相似文献
5.
目的：通过网络药理学方法探析板蓝根-山豆根-白茅根治疗银屑病的作用机制。方法：应用 TCMSP 平台检索板蓝根-山豆根-白茅根的化学成分,利用GeneCards等数据库检索银屑病的相关靶点基因,将药物靶点与疾病靶点取交集绘制韦恩图。运用Cytoscape 3.8.2软件构建药物-成分-靶点网络图,构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图,对交集靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：共获有效成分52种,如β-谷甾醇、槲皮素、山柰酚等;与银屑病相关靶点90个,其中白细胞介素-6、肿瘤坏死因子、肿瘤蛋白p53、白细胞介素-1β、活化蛋白-1等为核心基因;GO功能富集分析中共确定了614条GO条目,其中生物过程480条、细胞组分52条、分子功能82条;KEGG富集分析中共确定了102条通路,涉及多种癌症通路、肝炎、磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）-丝氨酸-苏氨酸-激酶（Akt）信号、肿瘤坏死因子信号、丝裂原活化蛋白激酶等信号通路。结论：板蓝根-山豆根-白茅根可通过多种活性成分、多个靶点、多条通路抑制炎症因子的表达及角质细胞增殖、分化而发挥治疗作用。 相似文献
6.
目的：基于网络药理学探讨荷叶抗非酒精性脂肪肝（NAFLD）的作用机制。方法：利用TCMSP平台和Swiss Target Prediction 等数据库搜集荷叶活性成分和作用靶点。通过GeneCard、GenCLiP3数据库获取NAFLD的相关靶点,利用Cytoscape 3.8.2 软件构建荷叶成分-疾病-靶点蛋白网络。使用STRING数据库和Cytoscape 3.8.2 软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,进行基因本体（GO）功能与京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：获得荷叶活性成分15种,潜在靶点441个,疾病相关靶点1316个,成分-疾病-靶点161个。PPI网络显示,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、白细胞介素6、肿瘤抑制基因 p53、血管内皮生长因子、肿瘤坏死因子等靶点与荷叶抗NAFLD的关系最密切。GO功能主要有药物的反应、凋亡过程的负调控、胞液、核浆、细胞质、线粒体酶结合、细胞因子活性、转录因子结合等。KEGG通路主要涉及乙型肝炎、癌症的途径、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路、缺氧诱导因子-1信号通路等。结论：荷叶通过调控161个靶点参与TNF信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路等作用于NAFLD。 相似文献
7.
目的：应用网络药理学与分子对接技术探究连脂清肠汤（LQD）治疗溃疡性结肠炎（UC）的作用机制。方法：利用TCMSP和TCMID数据库收集LQD的活性成分及靶点,通过GeneCard、OMIM及TTD数据库获取UC疾病靶点,将药物与疾病靶点匹配得到共同靶点,使用Cytoscape 软件构建“中药-成分-靶点-疾病”网络图,将关键靶点导入STRING平台构建PPI网络,并用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体（GO）功能、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,利用Auto Dock Tools对筛选所得活性成分与靶点蛋白进行分子对接验证。结果：获得LQD有效活性成分123种,LQD作用靶点216个,UC靶点1189个,共同靶点117个。LQD治疗UC的主要活性成分包括槲皮素、山柰酚、柚皮素、甘草查尔酮a、芒柄花黄素等。核心靶基因包括信号转录活化因子3（STAT3）、转录因子激活蛋白1（JUN）、丝氨酸/苏氨酸激酶1（AKT1）、核转录因子-κB p65（RELA）、白细胞介素-6（IL-6）等。GO功能主要包括RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、凋亡过程的负调控、细胞核、细胞溶质、细胞质、蛋白结合、酶结合等。KEGG通路主要有癌症通路、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路等。分子对接结果表明核心成分与核心靶点结合性较好。结论：LQD治疗UC具有多组分、多靶点和多通路的特点。 相似文献
8.
目的：通过网络药理学和分子对接技术对“蒲黄-姜黄”抗动脉粥样硬化的作用机制进行探讨。方法：基于TCMSP数据库获取“蒲黄-姜黄”的有效活性成分及靶点,通过OMIM、GeneCards、DisGeNet、DrugBank数据库挖掘动脉粥样硬化的潜在靶点,将药物与疾病靶点取交集后,利用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析,使用R语言进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,最后使用PyMOL、AutoDock Vina进行分子对接。结果：共筛选出“蒲黄-姜黄”有效成分9个,与动脉粥样硬化相关靶点190个,核心靶点为转录因子激活蛋白1（JUN）、肿瘤蛋白P53（IP53）、丝裂原激活蛋白激酶1（MAPK1）、苏氨酸蛋白激酶（AKT1）等。GO功能富集分析显示生物过程有2438个、细胞组分有97个、分子功能有252个,共计2787个GO功能条目。KEGG通路富集筛选得到信号通路170条,主要涉及血脂和动脉粥样硬化、流体剪切应力和动脉粥样硬化等。分子对接显示各个成分与靶点均能较好地结合,其中AKT1靶点与这些成分的结合强度最佳。结论：“蒲黄-姜黄”可以多成分、多靶点、多通路地抗动脉粥样硬化。 相似文献
9.
目的：利用网络药理学构建七味白术散药效成分、腹泻、靶点及通路间的网络关系,探讨七味白术散治疗腹泻的作用机制。方法：利用中药系统药理分析平台查询筛选七味白术散的药效成分及对应靶点,从GeneCards数据库获取腹泻相关靶点,使用在线软件Venny 2.1筛选药物与疾病作用的交集靶点;基于David数据库对潜在靶标进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。利用STRING在线数据库构建蛋白相互作用网络;用Cytoscape软件绘制活性成分-疾病靶点关系网络。结果：七味白术散的药效成分有125种,以黄酮类成分为主;其治疗腹泻的关键靶点有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶（AKT1）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、白细胞介素-6（IL-6）、肿瘤抑制因子p53（TP53）等。GO富集分析后得到与生物过程（BP）相关的有药物响应、基因表达调控、细胞凋亡调控和RNA聚合酶II启动子的转录调节;KEGG通路主要涉及乙型肝炎、结直肠癌、胰腺癌、锥虫病、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、膀胱癌等。结论：七味白术散中的主要成分为黄酮类,通过抑制炎症反应及促进肠黏膜修复等途径起到抗腹泻的作用。 相似文献
10.
目的：运用网络药理学及分子对接技术预测并验证苏子降气汤治疗哮喘的作用机制。方法：通过TCMSP和UniProt数据库预测苏子降气汤的活性成分及靶点,根据GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库筛选哮喘相关靶点,利用Venny 2.1平台筛选中药和疾病共同基因,利用Cytoscape 3.9.1进行可视化分析;利用 STRING 数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图,利用Bioconductor 数据库和R版本4.1.3 (64 bit)软件进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,并通过 Autodock 软件对核心成分及靶点进行分子对接。结果：筛选出54种化合物,257个靶点,涉及哮喘的治疗靶点共134个。其中槲皮素、木犀草素、丹参酮ⅡA、黄芩素等为关键活性成分。丝裂原激活蛋白激酶14（MAPK14）、表皮生长因子受体（FGFR）、原癌基因蛋白(MYC)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、缺氧诱导因子1A（HIF1A）、肿瘤蛋白P53(TP53) 为关键基因靶点。GO功能和KEGG通路富集分析得到人巨细胞病毒感染、MAPK信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路等多条信号通路。将核心成分与核心靶点进行分子对接验证,大部分结合能＜-5 kal·mol-1,具有较强的结合能力。结论：苏子降气汤通过抗炎、调节免疫等多靶点、多通路治疗哮喘,为后续分子机制研究提供了理论基础。 相似文献
11.
营口市位于辽宁省的中南部，面对渤海的辽东湾，背依鞍山市平原丘陵，东邻辽东崇山峻岭，西接盘锦市沿海平原，有辽河蜿蜒人海，海岸线绵延曲折。由于受海洋、河流的影响．营口市四季分明，气候宜人，蕴藏着丰富的滨海旅游资源，海蚀景观、地质珍迹、人文景观等资源各显异彩；尤其是海水浴场，条件极为优越，与国际上一流的海水浴场相比．毫不逊色，在某些特征上还稍胜一筹。 相似文献
12.
A. P. Tolstosheev 《Physical Oceanography》2009,19(6):358-365
A method for the estimation of the results of reconstruction of the trajectories of drifting buoys is proposed. It is based
on the comparison of the estimates of power spectral densities for the components of current velocity computed according to
three data sets: the data set of the coordinates of a drifting buoy with a built-in GPS receiver, the data set of coordinates formed on the basis of the first set but with data missing and observational errors
corresponding to the actual trajectory measurements by the Argos satellite location and data collection system by the Doppler method, and the data set of coordinates obtained as a result
of interpolation of the second set. As an example, we consider the procedure of realization of the proposed method and demonstrate
the efficiency of its application for the improvement of the reliability of reconstruction of the trajectories of drifting
buoys. 相似文献
13.
I. E. Timchenko A. A. Primalenny V. D. Yarin E. F. Vasechkina E. M. Igumnova 《Physical Oceanography》2001,11(4):367-378
We use many-year archival observations of hydrologic and hydrobiologic state of the Sea of Azov for the identification of
the structure of a model of its ecosystem. The ecosystem model, supplemented with expert estimates of bioresource consumption
(fish reserve), contamination level, and possible ecologic fines for violation of the sea natural state, is formalized by
the method of system dynamics. Hereat, the major part of influence functions is found in terms of observational data with
application of self-organization algorithms. We also present the results of simulated experiments with the model of the ecosystem,
which enable us to analyse scenarios of its behaviour under the influence of various external factors (wind, river discharge,
water exchange with the Black Sea, etc.).
Translated by Peter V. Malyshev and Dmitry V. Malyshev 相似文献
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An attempt has been made to estimate the fishery potentials of the EEZ of India on the basis of data on primary and secondary production. The total column primary production and zooplankton production have been calculated to be 265·9 and 9 million tonnes of carbon per year, respectively. From these values the fishery potential has been estimated as 2·5 million tonnes per year. To this, if we add the estimated demersal fish catch, being 1·2 million tonnes per year, the total potential yield comes to 3·7 million tonnes per year. Since the present average total catch is about 1·6 million tonnes in a year, the fish catch could be doubled. 相似文献
16.
天然气水合物地球化学特征 总被引：4，自引：0，他引：4
天然气水合物是在低温、高压以及有足够气体供应条件下形成的一种天然气(主要为甲烷)与水组成的似冰状固态化合物。天然气水合物中包含的甲烷碳是全球甲烷资源的重要组成部分,是一种数量巨大的潜在能源[1]。而且由于甲烷的温室效应,天然气水合物分解释放的甲烷进入大气中会严重 相似文献
17.
1992年，联合国21世纪议程提出了综合管理的概念，并认为它是海岸管理的最重要目标，而海岸管理的目的就是改进业已存在的管理实践的效率和效果。在21世纪议程的实施过程中，沿海国家面临着巨大的困难，即：为了使综合管理在实践中具有可操作性而建立适合的政府机构。韩国正是在国家范围和次一级区域进行这项工作的实验场所。这项工作的最重要成就是在1996年成立了具有综合协调各涉海部门职能的韩国海洋事务与渔业部（MOMAF）。这篇文章的内容主要来自于这些观察，即韩国政府为建立海岸带综合机制而进行了各种努力，特别是1992年联合国环发大会召开后到1997年初海洋事务与渔业部成立了海岸带管理处这段时间里开展的各种工作，文章重点在于评价在建立海岸带综合机制的过程中综合的概念是如何被应用并被挑战的。文章提出了在东亚地区沿海国家开展合作的可能区域的建议。 相似文献
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19.
Values of root mean square slope 0 and its variations -0 are estimated using the brightness field of an image of the surface of the sea near a speck of light. When 0 and -0 are defined it is highly important to take into account direct as well as dissipated solar radiation.The space-time analysis of the structure of the image brightness field is performed. This gives an opportunity to estimate dispersion relationship and the running effect of a brightness contrast packet. Comparison of the parameters obtained with the theoretical dispersion ratio of internal waves (IW) allows one to make a conclusion that IW surface manifestations are recorded in a frame.UDK 551.463.5 相似文献
20.
The analysis of the structure of the cryolithozone, facies, and thicknesses of the Quaternary sediments and the results of the physicochemical mathematical modeling of the modern shelf of the western part of the Laptev Sea support the influence of the Late Pleistocene glaciations on the heat conditions and the distribution of the permafrost in the area. A ～200-m thick glacier formed under aerial conditions from atmospheric precipitation represented the metamorphosed snow cover. According to the modeling, the long-living (from 60?50 to 10?4 ky) glacier reduced the thickness of the permafrost rocks in the reviewed shelf area for 280–360 m. The Holocene marine transgression additionally decreased the thickness from 50–140 m on the inner shelf to 220–350 m on the outer shelf. The modern submarine cryolithozone 450-0 m thick is wide-spread in the studied region from the coast to the shelf boundary (isobaths of 130–140 m), where it pinches out at a distance of ～380 km from the coast at a depth of ～250 m above the sea level. 相似文献