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实验运用淀粉凝胶电泳的方法检测了１龄养殖太平洋牡蛎Ｃｒａｓｏｓｔｒｅａｇｉｇａｓ５个基因座位上的基因型和杂合度。根据孟德尔自由分离规律,从子代的基因型推断出亲代可能的基因。杂合度的分析表明,人工培育的１龄太平洋牡蛎在Ａａｔ２、Ａｈ１、Ａｈ２、Ｉｄｈ１和Ｌａｐ５个多态位点上的杂合度符合Ｈ－Ｗ平衡规律,未发现明显的杂合子缺失现象。 相似文献
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凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)体重、存活性状的遗传参数和基因型与环境互作效应 总被引：3，自引：1，他引：2
利用7个凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)引进群体,通过双列杂交和巢式交配设计构建家系,建立育种基础群体,估计体重、存活性状的遗传参数和基因型与环境互作效应(genotype by environment interactions,G×E)。结果表明,凡纳滨对虾基础群体体重和存活性状的遗传力估计值范围分别在(0.19±0.09)—(0.43±0.09),(0.27±0.04)—(0.45±0.06),均属于中高遗传力水平,并且统计检验显著(P<0.05)。Z-score检验表明,体重和存活性状遗传力估计值在河北黄骅(HBHH)和青岛鳌山(QBAS)两个测试场间差异均不显著。体重和存活性状的表型和遗传相关系数分别为0.007和0.008,表现为低度线性负相关。对于体重和存活性状,HBHH和QBAS场间的遗传相关分别为0.83±0.04和0.40±0.11。体重性状的G×E效应不显著(K<0.5),但存活性状存在显著的G×E效应(K>0.5)。上述结果显示,凡纳滨对虾基础群体体重和存活性状的遗传变异丰富,多代选择可获得较大的遗传进展。 相似文献
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Marine waters from seven sites around Hong Kong with varying levels of sewage pollution were analyzed for Hepatitis A virus (HAV) by PCR cloning and DNA sequencing of the highly variable VP1/2A junction of the HAV genome. Phylogenetic analysis of 10 PCR clones from each of the HAV-positive marine sites indicated that human HAV genotype IB is the most widely distributed type in Hong Kong waters. A sensitive and quantitative TaqMan-based PCR method targeting the 5′-noncoding region (5′-NCR) of HAV was used to quantify HAV particles in marine water samples along with the total Escherichiacoli counts being enumerated on TBX medium for comparison. Our results showed that no correlation of any significance between HAV and E. coli counts was observed which underscores the inadequacy in using E. coli as a sanitary standard to predict the levels of HAV in marine waters. 相似文献
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JD Klein AE Bester-van der Merwe ML Dicken A Emami-Khoyi KL Mmonwa 《African Journal of Marine Science》2019,41(1):115-118
Genomic data can be a useful tool in the management and conservation of biodiversity. Here, we report the development of genomic resources for the spotted ragged-tooth shark Carcharias taurus using genome-wide DNA data from Illumina next-generation sequencing. We explored two commonly used genetic marker types: microsatellites and mitochondrial DNA. A total of 4 394 putative microsatellites were identified, of which 10 were tested on 24 individuals and found to have ideal properties for population genetic analyses. Additionally, we reconstructed the first complete mitochondrial genome of a South African spotted ragged-tooth shark, and highlight the most informative gene regions to facilitate future primer design. The data reported here may serve as a resource for future studies and can ultimately be applied in the sustainable conservation and fisheries management of this apex predator. 相似文献
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开展了海湾扇贝南北亚种杂交子代同海湾扇贝北方亚种间回交、杂交子二代及北方亚种对照组等群体的基因型和温度、盐度等环境因素之间的互作研究。研究结果表明,杂种F2和回交组别相对纯种组别存在生长优势。温度和盐度均对不同基因型群体的生产和存活产生显著的影响,其中在逆境温度下杂种F2和回交组能够更加适应并表现出更高的生长优势,而在盐度中结果却并非如此,这表明基因型和环境之间的互作机制比较复杂。研究结果为继续在不同海区环境下开展海湾扇贝回交育种提供了积极的理论依据和实践参考。 相似文献
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淋巴囊肿病毒是引起多种海、淡水鱼淋巴囊肿病的病原,且不同淋巴囊肿病毒分离株间存在一定的差异。本文对25株淋巴囊肿病毒分离株mcp基因的变异特征进行分析,结果表明:分离自同一宿主的淋巴囊肿病毒mcp基因序列并非完全一致,有些同宿主分离株间存在着较少的变异,其MCP蛋白序列间的变异位点多位于不规则结构域、属于非蛋白相互作用位点;分属不同基因型淋巴囊肿病毒分离株MCP蛋白序列间的变异位点也多位于不规则结构域,变异位点为蛋白相互作用位点的比率仅占21.98%。金头鲷淋巴囊肿病毒分离株LCDV-sa是一种新的淋巴囊肿病毒基因型,此25株淋巴囊肿病毒可分为7个基因型。对淋巴囊肿病毒变异的研究,可加深对其感染机制的认识,有助于了解其传播途径,可为淋巴囊肿病的防控提供重要的理论依据。 相似文献
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微卫星分型方法进行中国明对虾家系系谱鉴定 总被引：2，自引：1，他引：2
微卫星(microsatellite)又称简单序列重复(simple sequence repeats,SSR),是20世纪80年代末期发展起来的DNA分子标记技术,以其数量多、分布广、多态性丰富、检测快速方便、共显性遗传等优点而被广泛应用于构建连锁图谱、个体识别、亲子鉴定、遗传多样性分析、疾病诊断、基因定位等诸多领域.微卫星研究的层次也从群体、个体到基因的表达.虽然有关微卫星起源、演化等相关的理论问题还未研究清楚,但自微卫星标记被发现始就被应用于相关研究,并显示出明显优势,是最具应用价值的标记技术之一. 相似文献
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为选育出具有广适性和适应某一特定环境的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)家系,实验采用巢式交配设计建立了凡纳滨对虾选育家系,并从中选出7个体质量性状优良的家系进行主效可加互作可乘模型(AMMI)分析,得出7个凡纳滨对虾选育家系体质量基因型与环境互作效应。结果表明,凡纳滨对虾7个家系的基因型与环境互作效应(G×E)达极显著水平(P<0.01);G×E效应平方和占总平方和的20.608%,家系效应平方和占总平方和的12.814%,环境效应平方和占总平方和的64.289%,说明家系体质量差异受环境效应影响显著,此外环境与基因型互作效应对体质量也存在影响,且影响力大于家系效应;基于双标图AMMI模型分析和稳定性参数分析,家系G2产量较高,为12.90 g,但G2对环境的选择能力以及依赖性较强,不适合广泛推广;G6产量为9.00 g,与G2相比虽然产量稍低,但其家系稳定性较高,对环境选择能力以及依赖性较弱,适合在多种类型环境下养殖,因此G6为中产、稳定、广适应性的家系,其基因型适合新品系的选育及推广;通过AMMI模型双标图功能形态分析,G11在E1环境中体质量最高产,适合与在E1环境下推广;G2在E2环境中最高产,适合在E2环境下推广;G5在E3环境中体质量最高产,适于在E3环境下推广。 相似文献
9.
温度对杂色鲍不同群体生长率与存活率的影响 总被引：1，自引：0，他引：1
在16、20、24和28℃这4个设定的水温下,以杂色鲍（Haliotisdiversicolor）日本群体、台湾群体、越南群体和“东优1号”为材料,进行为期40d的养殖试验,对4个杂色鲍群体在不同温度下的壳长日增长率（LGR）和体重日增长率（WGR）进行比较．结果表明,“东优l号”杂色鲍群体在28℃时的LGR和WGR值分别达到162．23±15．79lxm／d和46．52±6．89mg／d,在4个温度下的LGR和WGR值都优于其他3个群体,台湾群体在较高温度（24和28℃）条件下的LGR和WGR值要高于日本群体,而日本群体在较低温度（16和20℃）时的值则高于台湾群体．双因素方差分析的结果进一步表明,温度对杂色鲍不同群体的生长率指标具有显著影响． 相似文献
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对采集自南极乔治王岛和北极新奥尔松地区的32份地衣标本中共生藻rDNA ITS序列进行测定,发现均为Trebouxia jamesii;结合Genbank中来自不同地区地衣中该藻的序列信息,发现T. jamesii的基因型与地衣物种及采集地都没有明确的对应关系。广布于全球范围的T. jamesii作为地衣优势共生藻,存在多种基因型,并且可以被多种地衣共生菌选择;其中优势基因型A在采集自南极洲、欧洲、北美洲和北极地区的地衣中均有发现,而其它基因型则在一定程度上出现地区特有性。本研究为地衣中的藻交换提供了证据,并提出地衣体碎片是实现地衣共生藻长距离传播的载体。 相似文献