基于mtDNA控制区序列的3个黑棘鲷群体遗传结构特性研究   总被引：1，自引：0，他引：1       下载免费PDF全文

施晓峰  苏永全  王文成  王军 《热带海洋学报》2015,34(1):56-63

  相似文献   

12种石鲈科鱼类线粒体16S rRNA基因的部分序列分析   总被引：4，自引：0，他引：4  

任岗  章群  钱开诚  徐忠能  林小涛 《热带海洋学报》2007,26(3):48-52

分析了5属12种石鲈科鱼类的线粒体16S rRNA基因部分序列特征,并参照RNA二级结构模型区分配对区和非配对区。结果表明,配对区对G有偏好(33.5%),非配对区对A有偏好(38.5%);与配对区相比,非配对区存在更多的变异和系统发育信息。从序列的Jukes-Cantor遗传距离结果看,石鲈科胡椒鲷属Plectorhynchus、矶鲈属Parapristipoma、石鲈属Hapalogenys、髭鲷属Pomadasys、Haemulon属5个属属间的差异水平都接近或超过了其与外类群科间的差异水平。从构建的ME系统发育树结果看,石鲈科鱼类分成二大分支,未能形成单一类群。在亲缘关系上,胡椒鲷属和矶鲈属较近,石鲈属和Haemulon属较近,髭鲷属与其它4个属较远,髭鲷属在鲈亚目中的分类地位可能应提高到科的水平。初步确定研究中选用的16S rRNA基因片段基本适用于石鲈科属间和属内种间关系的研究。  相似文献   

栉孔扇贝16S rRNA基因片段序列的多态性研究   总被引：23，自引：7，他引：23  

刘亚军  喻子牛  姜艳艳  张留所  孔晓瑜  宋林生 《海洋与湖沼》2002,33(5):477-483

采用PCR技术扩增了栉孔扇贝（Chlamys farreri)线粒体DNA的16SrRNA基因片段，PCR产物经T载体连接之后进行了克隆，测序，得到634bp的核苷酸序列；分析了该片段的大连，烟台，青岛，朝鲜4个自然群体31个个体的核苷酸序列多态性，共检测到26个多态性核苷酸位点，18种单倍型，结果表明，4个群体中以朝鲜群体遗传多样性最高，其次为烟台，青岛群体，大连群体最低；不同自然分布区的栉孔扇贝未出现明显的遗传分化。  相似文献   

镉离子对鲫鱼肾细胞超微结构的影响   总被引：2，自引：0，他引：2  

凌善锋  华跃进 《海洋湖沼通报》2005,(1):37-42

应用透射电镜的方法，研究了镉的三种浓度对鲫鱼肾细胞超微结构的影响。结果表明：镉离子染毒4天后，肾细胞超微结构即出现变化，且随着处理浓度的升高，变化渐趋明显，主要表现在细胞核和线粒体。细胞核核膜肿胀、弥散、最后解体。线粒体双层膜解体，形成空白区，嵴断裂、膨大和扭曲。此外，内质网膨胀、空泡化、扭曲打转，溶酶体数量和类型随镉处理浓度的升高而增多。  相似文献   

黄鲷线粒体COⅠ基因部分序列遗传变异研究   总被引：3，自引：0，他引：3  

张凤英  夏连军  马凌波  施兆鸿  马春艳 《热带海洋学报》2005,24(5):83-89

对采自中国东海外海和日本海的黄鲷Taius tumifrons线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ亚基（COⅠ）基因进行了研究。利用通用引物对该序列进行了PCR扩增,去掉两端引物及部分序列共得到590bp的碱基片断,其中A、T、G、C平均含量分别为30．4％、24．3％、25．0％和20．3％,A＋T（54．7％）高于G＋C（45．3％）含量。在获得的9个序列中共发现有156个碱基存在变异,其中包括42处简约信息位点,没有发现碱基的插入和缺失,序列中的转换大于颠换。实验结果显示,个体间的遗传距离在0-0．2236之间,c3和j3与其它个体相比遗传差异明显。2群体间平均遗传距离为0．0897,而东海和日本海群体内的平均遗传距离分别为0．0869和0．1133,说明黄鲷个体间遗传差异较大,但群体间的遗传差异不明显。  相似文献   

古基因组学在古代家马研究中的应用     

文少卿  俞雪儿  田亚岐  胡松梅  李悦  孙畅 《第四纪研究》2020,(2):307-320

古DNA是人类学、分子进化和群体遗传学的一个重要的工具.在过去的十年,我们见证了古DNA研究的一场革命.古DNA研究的焦点在很长时间内被限制在了线粒体DNA和有限个核基因组标记,但现在已经能够获得非常古老的全基因组数据.这一突破主要是缘于高通量测序平台以及获取高度降解DNA分子的能力,并发展出了古基因组学这一新领域.本文回顾了马的古基因组研究的发展历程,以及在揭示家马的遗传谱系和基于基因型-表型关联分析预测马的性状两方面的最新进展.我们依据马的基因组研究的新成果,优化三款基于高通量测序的检测panel,分析古代家马的谱系、性别、毛色、运动能力、步态、体型/肩高、高原适应等相关方面.结果显示,遗传谱系和表型特征为探讨中国古代家马的起源和用途,特别是祭祀用马的来源和挑选标准有重要意义.该研究有助于进一步认识中国家马的演化与传播及其与古代社会政治、经济、文化、思想的关系.  相似文献   

雌核发育银鲫两个不同品系线粒体DNA比较   总被引：16，自引：0，他引：16  

樊连春  赖宇鹏  朱蓝菲  梁绍昌  桂建芳 《海洋与湖沼》2000,31(4):370-377

于１９９６年４月在中国科学院水生生物研究所关桥实验场取得银鲫Ｅ系（８♀,２♂）和Ｄ系（９♀,１♂）的卵巢（♀）或肝脏（♂）组织,分离纯化其线粒体ＤＮＡ,以此为材料,用２５种限制性内切酶分析了银鲫这两个雌核发育系的线粒体ＤＮＡ,构建了两系鱼ｍｔＤＮＡ的１９种酶个位点的酶切图谱。统计比较酶切片段的大小,发现５种内切酶（ＡｖａＩＩ,ＢａｍＨＩ,ＢｇｌＩ,ＳｐｈＩ,ＸｂａＩ）酶切位点在两个雌核发育系间存在  相似文献   

Phylogeny of the cuttlefishes (Mollusca: Cephalopoda) based on mitochondrial COI and 16S rRNA gene sequence data   总被引：5，自引：0，他引：5  

LIN Xiangzhi  ZHENG Xiaodong  XIAO Shu  WANG Rucai 《海洋学报(英文版)》2004,23(4):699-707

To clarify cuttlefish phylogeny, mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene and partial 16S rRNA gene are sequenced for 13 cephalopod species. Phylogenetic trees are constructed, with the neighbor-joining method. Coleoids are divided into two main lineages, Decabrachia and Octobrachia. The monophyly of the order Sepioidea, which includes the families Sepiidae, Sepiolidae and Idiosepiidae, is not supported. From the two families of Sepioidea examined, the Sepiolidae are polyphyletic and are excluded from the order. On the basis of 16S rRNA and amino acid of COI gene sequences data, the two genera (Sepiella and Sepia) from the Sepiidae can be distinguished, but do not have a visible boundary using COI gene sequences. The reason is explained. This suggests that the 16S rDNA of cephalopods is a precious tool to analyze taxonomic relationships at the genus level, and COI gene is fitter at a higher taxonomic level (i.e., family).  相似文献   

日本绒螯蟹线粒体DNA序列研究Ⅱ.16S rRNA   总被引：2，自引：2，他引：0  

高天翔  任一平  张秀梅  渡边精一  杨永恒 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2000,30(3):482-486

参考果蝇、卤虫与锯缘青蟹的线粒体 DNA16 S r RNA基因序列进行了日本绒螯蟹相同基因片段的引物设计、PCR扩增及序列测定 ,得到 56 7bp的碱基序列 ,其 A、T、G、C含量分别为194 bp(34.2 2 % )、2 16 bp(38.10 % )、98bp(17.2 8% )、59bp(10 .4 1% ) ,与果蝇、卤虫及锯缘青蟹类的 16 S r RNA基因片段序列含量相似。  相似文献   

日本绒螯蟹放流群体12S rRNA序列研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

高天翔  王溪宏 《海洋湖沼通报》2000,(1):47-51

参考果蝇与蚤状汊序列进行了日本绒螯蟹放流群体的线粒体ＤＮＡ１２Ｓ ｒＲＮＡ基因片段的引物设计、ＰＣＲ扩增及序列测定,得到４５７ｂｐ的碱基序列,其Ａ、Ｔ、Ｇ、Ｃ含量分别为１５８ｂｐ（３４．５７％）、１７８ｂｐ（３８．９５％）、５１ｂｐ（１１．１６％）、７０ｂｐ（１５．３２％）,与果蝇与蚤状相同基因片段序列含量相似。  相似文献