大菱鲆免疫球蛋白轻链IgL全长cDNA的分离、鉴定及表达分析     

王贤丽  张玉喜  孟亮  陈松林 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2010,40(4)

实验采用末端快速扩增(RACE)技术从大菱鲆脾脏cDNA文库中筛选得到了免疫球蛋白轻链IgL的全长cD-NA片段。该序列包含47 bp的5′末端非编码区(5′UTR),738 bp的开放阅读框(ORF)和202 bp 3′UTR,整个开放阅读框编码246个氨基酸。系统发生分析表明大菱鲆IgL基因与五条鰤的IgL基因起源关系最近。RT-PCR分析表明,大菱鲆IgL基因只在正常脾脏、肾脏和头肾组织中表达;IgL在大菱鲆胚胎发育细胞期就已开始表达,在大菱鲆胚胎尾芽期和体节期表达持续增强;在鳗弧菌感染大菱鲆脾脏和头肾早期均检测到IgL基因强烈表达,后期表达逐渐减弱;大菱鲆胚胎细胞(TEC)在用鳗弧菌感染48h后,IgL开始表达。这些结果均表明IgL基因在大菱鲆免疫应答中起着重要作用。  相似文献   

太平洋真宽水蚤(Eurytemora pacifica) Cu/Zn SOD基因克隆及在重金属胁迫下的表达分析     

胡利腾  夏立萍  武敏敏  陈晋  张建设 《海洋与湖沼》2018,49(2):384-394

铜锌超氧化物歧化酶(Superoxide dismutase,SOD)是一种广泛存在于生物体中最主要的抗氧化酶之一,在抵御过多活性氧簇对机体毒害的过程中起重要作用。本研究以太洋真宽水蚤为研究对象,采用RT-PCR与RACE方法克隆得到太平洋真宽水蚤Cu/Zn SOD基因全长c DNA序列。Cu/Zn SOD(Gen Bank登录号:MF289343)基因序列全长837bp,其中完全开放阅读框为456bp编码152个氨基酸,5′非编码区长297bp,3′非编码区长84bp,分子量约为15.050k Da,理论等电点为5.73。序列比较表明,太平洋真宽水蚤Cu/Zn SOD c DNA的氨基酸序列与其他甲壳动物的一致性较高;存在8个蛋白翻译后修饰位点及蛋白家族标签序列,无跨膜结构域与信号肽。在重金属铬与镍胁迫下,通过实时荧光定量PCR对太平洋真宽水蚤Cu/Zn SOD m RNA体内表达特点分析显示,其表达量均呈现先升后降趋势,在暴露12小时后表达量达到峰值;铬胁迫下的表达量略高于镍;联合胁迫下呈现出拮抗作用。本研究结果将有利于深入探讨桡足类Cu/Zn SOD基因的结构与功能,为进一步研究抗氧化分子机理奠定基础。  相似文献   

实时定量RT-PCR方法检测太平洋牡蛎中的诺沃克样病毒   总被引：1，自引：0，他引：1  

岳志芹  汪俊  梁成珠  雷质文  高宏伟  徐彪  朱来华  薛长湖 《海洋科学》2008,32(8):1-4

建立了Taqman 实时定量RT-PCR方法检测诺沃克样病毒(Norwalk-like Virus,NLV)的方法,并对中国的牡蛎样品进行了分析.选取GⅡ型NLV的RNA聚合酶区域,利用Primer Express 2.0软件设计引物和探针,建立了定量RT-PCR反应体系.将含有NLV扩增片段的质粒10倍梯度稀释,作为标准品进行反应以确定检测灵敏度并制备标准曲线.结果表明,质粒密度在6×106,6×105,6×104,6×103,6×102,6×101,6个拷贝之间,共7个数量级的范围内,定量RT-PCR反应都有"S"型扩增曲线,检测灵敏度为6个拷贝.制备的标准曲线中,病毒拷贝数(X)与Ct值的关系为Ct = -3.36lg X 37.11,相关系数R2=0.998.对中国37批太平洋牡蛎(Crassostrea gigas Thunberg)样品进行了定量检测,有6批样品为阳性,并根据标准曲线测定了NLV的含量.  相似文献   

金锡杉中紫杉醇合成途径GGPPS和TDC1的基因序列与时空表达分析     

刘彦君  王云鹏 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2021,51(2):63-68

紫杉醇是一种具有高效抗癌特性的二萜类物质,其生物合成途径一直是科学家们研究的热点.'金锡杉'是南方红豆杉变种,相较于原种含有更加丰富的紫杉醇,因此是一种重要的遗传资源.本研究以'金锡杉'为材料,运用生物信息学方法分析了紫杉醇合成途径中两种关键酶基因GGPPS(geranylgeranyl diphosphate syn...  相似文献   

H5、H7和H9亚型禽流感分子鉴别诊断方法的建立     

黄淑坚  龚中贵  陈秀玲  梁小英  冼琼珍  顾万军  王林川  辛朝安 《广东海洋大学学报》2007,27(1):77-80

为快速、敏感、特异地鉴别诊断现较为重要的禽流感病毒亚型,根据H5、H7和H9亚型禽流感病毒HA基因序列的保守区域设计出并合成3对特异性引物,利用这3对引物对H5、H7和H9亚型禽流感病毒的HA基因片断进行多联RT-PCR扩增,并对多联RT-PCR检测方法进行敏感性及特异性实验。结果表明:3对引物能特异性地扩增出H5、H7和H9亚型禽流感病毒HA基因片段,大小分别为490bp,365bp和686bp;该检测方法敏感性高,特异性强;初步建立起快速、敏感、特异地鉴别检测H5、H7和H9亚型禽流感病毒的分子诊断方法。  相似文献   

温度选择对刺参群体在不同温度下生长及热休克蛋白表达的影响   总被引：1，自引：0，他引：1  

刘广斌  杨红生  刘石林 《海洋科学》2010,34(7):49-53

高温(26℃)培育刺参(Apostichopus japonicus)幼体获得选择群体,生长至1.03 g±1.30 g,与对照组幼参在18、20、22和24℃温度下培育。二者的成活率随着温度升高而降低,而选择组幼参24℃的成活率显著高于对照群体(P0.05)。不同温度下的特定生长率之间没有差异。TRIzol法提取刺参总RNA,获得刺参HSP70片断基因序列,利用实时定量PCR方法检测,选择群体HSP70mRNA的表达量在正常温度和热激条件下都较对照组高,但表达量升高的倍数相近,选择组为1.99倍,对照组为2.07倍。  相似文献   

Death of <Emphasis Type="Italic">Prorocentrum donghaiense</Emphasis> may be a programmed autolysis     

Guanpin Yang  Yongjian Liu  Bingjun Li 《中国海洋大学学报(英文版)》2008,7(3):276-280

  相似文献   

高温诱导对中间球海胆hsp70基因和hsp90基因的表达研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

白雪秋  庞震国  张伟杰  常亚青  高银雪  丁君 《海洋与湖沼》2015,46(5):1034-1039

以中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)作为实验对象,研究其在高温胁迫条件下热休克蛋白基因中hsp70基因和hsp90基因(以下简称hsp70和hsp90)的响应。采用荧光实时定量PCR技术,检测hsp70和hsp90在40枚中间球海胆的不同组织(管足、体腔细胞、肠、性腺和口器)中的相对表达量,以及在海胆耐热家系和对照家系(共240枚)的管足组织中的相对表达量。结果显示:(1)中间球海胆的各组织中均有hsp70和hsp90基因的表达,且对温度急剧变化均有应答。高温诱导过程中,海胆管足、体腔细胞和肠组织中hsp70和hsp90基因的相对表达量经过6h(29°C)达到最大值且显著高于其初始值(P0.05);性腺中hsp70和hsp90基因的相对表达量分别经过12h(24°C)和24h(22°C)达到最大值;口器中两个基因的相对表达量都经过12h达到最大值。(2)高温诱导过程中,hsp70和hsp90基因在海胆体腔细胞和管足中的表达趋势相似,且表达量在各时间点的相对差异不显著(P0.05)。(3)高温诱导过程中,hsp70基因在海胆耐热家系和对照家系中的表达趋势均为先升高后降低,且耐热家系和对照家系间各时间点的相对表达量没有显著差异(P0.05);hsp90基因的表达量随温度的变化呈现先升高后降低的趋势,诱导12h时在2个耐热家系中的相对表达量显著高于2个对照家系(P0.05)。结果表明,温度变化会显著影响中间球海胆hsp90基因的表达,hsp90基因可作为中间球海胆耐热品系选育的候选指示因子。  相似文献   

Detection of Hepatitis A virus in shellfish by reverse transcription PCR     

Wang Bin  Yang Feng  Chen Rongzhong  Xu Xun 《海洋学报(英文版)》1997,16(4):527-535

Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ　ｏｆ　Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ　Ａ　ｖｉｒｕｓ　ｉｎ　ｓｈｅｌｌｆｉｓｈ　ｂｙ　ｒｖｅｒｓｅ　ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ　ＰＣＲTXＤｅｔｅｃｔｉｏｎｏｆＨｅｐａｔｉｔｉｓＡｖｉｒｕｓｉｎｓｈｅｌｌｆｉｓｈｂｙｒｅｖｅｒｓｅｔｒａｎｓｃｒ...  相似文献   

Cloning and expression of alpha class glutathione S-transferase gene from the small hermaphroditic fish Rivulus marmoratus (Cyprinodontiformes, Rivulidae)     

Young-Mi Lee  Sung Yeoul Chang  Sang-Oun Jung  Hee-Seok Kweon  Jae-Seong Lee   《Marine pollution bulletin》2005,51(8-12):776

In order to assess its potential as a biomarker of aquatic pollution, an alpha class glutathione S-transferase gene (GSTα gene) was cloned from the small hermaphroditic fish Rivulus marmoratus. The R. marmoratus GSTα gene spanned 1.3 kb, consisting of 6 exons encoding 221 amino acid residues. It showed high similarity to zebrafish GST. We named this R. marmoratus GSTα gene as rm-GSTα. The cDNA of the rm-GSTα gene was also investigated for its phylogeny, tissue-specific and chemical-induced expression. Rm-GSTα was subcloned into a 6 × His-tagged pCR^®T7 TOPO TA expression vector to produce the recombinant 6 × His-tagged rm-GST protein. This will be used in future to raise an rm-GSTα antibody for use in the study of phase II metabolism involved in detoxification. We also exposed R. marmoratus to 300 μg/l of 4-nonylphenol in water, and found approximately 4-fold induction of R. marmoratus GSTα mRNA in the treated animals. In this paper, we discuss the characteristics of the R. marmoratus GSTα gene as well as its potential use in relation to environmental pollution.  相似文献