一株H_5亚型禽流感病毒血凝素基因的克隆与序列分析     

高志杰  梁秋婵  刘铀  陈绍红 《广东海洋大学学报》2007,27(3):107-111

根据GenBank中发表的H5亚型禽流感病毒HA基因序列设计2对引物,用RT-PCR方法从禽流感病毒广东分离病毒株(A/Chicken/Guangdong/1997)中扩增HA基因cDNA片段,并将其克隆至pMD-18T载体进行核苷酸序列测定。结果表明:用2对引物所扩增的片段大小分别约为1300 bp和800 bp,经序列拼接获得的HA基因cDNA长度约为1601 bp,编码533个氨基酸,与国内己发表的11个代表株的核苷酸和氨基酸序列同源性为分别为96.9%~99.9%和86.5%~93.0%;HA基因编码的氨基酸序列的系统进化树也表明A/Chicken/Guang-dong/1997、A/Goose/Huadong/01/2000、A/Ck/Hk/37.4/2002、A/Chicken/Zhoukou/2/02、A/Duck/Guangxi/53/2002、A/Duck/Fujian/01/2002等毒株处于同一进化枝,亲缘关系较近;而与A/Silly/Chicken/Hongkong/SF189/01株处于不同进化枝,亲缘关系较远。  相似文献   

Studies on immunodiagnosis of hepatopancreatic parvo-like virus disease of the Chinese penaeid,Penaeus Chinensis I. Purification of the virus     

Sun Xiuqin  Wang Wenxing  Zhou Huimin  Zhang Jinxing  Xue Qinggang  Lu Ying  Song Qingyun 《中国海洋湖沼学报》1993,11(2):189-192

The viral discase of penaeids is indistinet but highly dangerous because their symptoms are often masked by some secondary ones. In order to gain knowledge on how to prevent the occurrence and spread of this viral disease, diagnostic studies on the early phase of the hepatopancreatic parvo-like viral (HPV) disease of culturedPenaeus chinensis was conducted using ummuno-serological techniques. The purification of HPV was successfully done by density gradient ultracentrifugation of cane sugar.  相似文献   

Site-specific prediction of West Nile virus mosquito abundance in Greater Toronto Area using generalized linear mixed models     

Eun-Hye Yoo 《International journal of geographical information science》2014,28(2):296-313

Mosquito surveillance programs provide a primary means of understanding mosquito vector population dynamics for the risk assessment of human exposure to West Nile virus (WNv). The lack of spatial coverage and missing observations in mosquito surveillance data often challenge our efforts to predict this vector-borne disease and implement control measures. We developed a WNv mosquito abundance prediction model in which local meteorological and environmental data were synthesized with entomological data in a generalized linear mixed modeling framework. The discrete nature of mosquito surveillance data is accommodated by a Poisson distributional assumption, and the site-specific random effects of the generalized linear mixed model (GLMM) capture any fluctuation unexplained by a general trend. The proposed Poisson GLMMs efficiently account for the nested structure of mosquito surveillance data and incorporate the temporal correlation between observations obtained at each trap by a first-order autoregressive model. In the case study, Bayesian inference of the proposed models is illustrated using a subset of mosquito surveillance data in the Greater Toronto Area. The relevance of the proposed GLMM tailored to WNv mosquito surveillance data is highlighted by the comparison of model performance in the presence of inevitable but quantifiable uncertainties.  相似文献   

对虾白斑综合症病毒vp15基因的RNA干扰研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

张衡  谷力  杨丰 《台湾海峡》2012,31(1):47-52

VP15是对虾白斑综合症病毒(WSSV)的一种核衣壳蛋白,以往的研究表明VP15属DNA结合蛋白,具有潜在的浓缩包装病毒基因组的功能.利用RNAi技术将vp15基因沉默,来研究vp15基因沉默后对WSSV增殖及结构的影响.体外合成了vp15基因的特异双链RNA(vp15-dsRNA)和非特异双链RNA(gfp-dsRNA),分别与WSSV混合共注射淡水原克氏螯虾.在感染后24、36、48 h,每个实验组分别取病虾步足肌肉,样品用Trizol试剂盒提取RNA用于RT-PCR检测、用病毒检测试剂盒提取DNA模板用于荧光定量PCR分析.另外每组随机选取1只虾,取中肠,用于树脂包埋组织超薄切片分析.逆转录PCR分析结果显示vp15-dsRNA能特异性敲除vp15基因转录表达,实时荧光定量PCR分析结果显示vp15-dsRNA干扰vp15基因的表达能有效抑制WSSV病毒粒子的增值.此外,利用树脂包埋组织超薄切片电子显微镜技术观察发现vp15基因被干扰后病毒粒子数量上明显降低并且引起病毒粒子包装异常.通过vp15基因特异dsRNA干扰,有效抑制了WSSV病毒增殖,此外进一步阐明VP15蛋白的功能及其在病毒组装方面的重要作用,对进一步了解病毒组装以及病毒防治具有重要的意义.  相似文献   

Structure and anti-influenza A (H1N1) virus activity of three polysaccharides from Eucheuma denticulatum   总被引：1，自引：0，他引：1  

YU Guangli  LI Miaomiao  WANG Wei  LIU Xin  ZHAO Xiaoliang  LV Youjing  LI Guangsheng  JIAO Guangling  ZHAO Xia 《中国海洋大学学报(英文版)》2012,11(4):527-532

Three polysaccharides(EW,EH and EA) were prepared from a red alga Eucheuma denticulatum by sequential extraction with cold water,hot water and sodium hydroxide water solution.Their monosaccharide compositions,relative molecular mass and structural characterization were determined by gas chromatography,high performance 1iquid chromatography,fourier transform infrared spectroscopy and nuclear magnetic resonance spectroscopy methods.EW was hybrid ι/κ/ν-carrageenan(70 ι/17κ/13ν-carrabiose),EH was mainly ι-carrageenan,and EA was mainly α-1,4-Glucan(88%) but mixed with small amount of ι-carrageenan(12%).The relative molecular mass of EW,EH and EA was 480,580 and 510 kDa,respectively.The anti-influenza A(H1N1) virus activity of these three polysaccharides was evaluated using the Madin-Darby canine kidney cells model.EW showed good anti-H1N1 virus activity,its IC 50 was 276.5 μg mL-1,and the inhibition rate to H1N1 virus was 52% when its concentration was 250 μg mL-1.The IC 50 of ι-carrageenan EH was 366.4 μg mL-1,whereas EA showed lower anti-H1N1 virus activity(IC 50 >430 μg mL-1).Available data obtained give positive evidence that the hybrid carrageenan EW from Eucheuma denticulatum can be used as potential anti-H1N1 virus inhibitor in future.  相似文献   

海洋沉积物病毒荧光计数法的优化     

维妙  徐奎栋 《海洋与湖沼》2017,48(3):516-526

病毒在海洋生态系统的物质循环和能流中起着重要作用,对其进行有效定量是研究其数量变动和生态功能的前提。现行的海洋沉积物病毒定量主要采用荧光染色计数法,但对技术流程中一些处理方法的定量效能尚待验证。本研究利用不同类型海洋沉积物对荧光计数法进行了效能评估和条件优化。结果表明:将沉积物采样后染色封片直接计数或-20°C保存为最佳,保存3个月后未见丰度降低。而不同类型的沉积物经液氮闪冻后于-80°C冷冻保存后的定量效能不同:沙质沉积物保存1个月后病毒丰度下降1个数量级;泥沙质沉积物保存1个月后丰度降低了约27%,2个月后则下降了60%。对焦磷酸钠最优终浓度实验结果显示,使用3mmol/L终浓度获得的病毒计数定量效能优于目前普遍使用的5mmol/L终浓度。水浴超声分离在常温下的定量效果更优,在水浴中添加冰块导致获取的沙质沉积物中的病毒丰度下降约37%。研究发现:处理中用稀释替代离心不仅可降低沉积物颗粒的干扰,而且定量效能更高;离心处理获取的沙质和泥沙质沉积物中的病毒丰度较稀释处理低约40%。对海洋沉积物中原核生物的定量效能与病毒有相似的结果。据此,本文提出了改进的沉积物病毒荧光计数法的操作流程。  相似文献   

新疆地震局局域网用户的计算机和网络安全误区     

哈斯高娃 《高原地震》2007,19(4):52-54

随着计算机和网络的迅速发展，计算机和网络用户日益普及，广大计算机和网络用户随时关注着计算机和网络的安全问题，这也是网络维护人员和网络用户面临的新的挑战。本文主要对新疆地震局局域网用户在计算机和网络安全方面的认识和安全防范措施进行探讨。  相似文献   

“四深”微生物的地质作用：从气候环境变化到生态灾难     

谢树成  罗根明  朱秀昌  王灿发  袁松虎  邱轩  纪建达  阮小燕 《地质论评》2022,68(3):2022062039-2022062039

“四深”微生物是指深海、深地、深空和深时环境的微生物,特别是细菌、古菌、真菌、病毒等。人们对“四深”微生物的了解非常有限,是亟待突破的地球生物学前沿领域。“四深”微生物的研究对理解地球生命起源、界定生物圈的边界条件、促进地球科学与生命科学以及行星科学之间的交叉融合具有不可替代性的贡献。随着我国深海、深空、深地等重大工程计划的推进,一系列与“四深”微生物有关的前沿科学问题不断提出,包括地质微生物与气候环境的相互作用、地质微生物的生物安全与生态安全、地质微生物参与的隐匿地质过程等。特别是,“四深”环境活性氧自由基对微生物的影响、地质病毒对生物演化和地质过程的影响等前沿领域都亟待突破。活性氧自由基能对生物分子、细胞、组织和器官,乃至整个生物圈的演化以及微生物地质作用都产生重要影响。病毒引发了现代和近代诸多全球性疫情爆发,地质病毒则可能对生物的背景灭绝和大灭绝以及一些地质过程产生影响。  相似文献   

Remote sensing and avian influenza: A review of image processing methods for extracting key variables affecting avian influenza virus survival in water from Earth Observation satellites     

Annelise Tran  Flavie Goutard  Lise Chamaillé  Nicolas Baghdadi  Danny Lo Seen 《International Journal of Applied Earth Observation and Geoinformation》2010

Recent studies have highlighted the potential role of water in the transmission of avian influenza (AI) viruses and the existence of often interacting variables that determine the survival rate of these viruses in water; the two main variables are temperature and salinity.  相似文献   

用逆转录聚合酶链式反应检测草鱼出血病病毒的研究   总被引：4，自引：1，他引：4  

王铁辉  李军  易咏兰  周立冉  刘汉勤  陆仁后  陈宏溪 《海洋与湖沼》1997,28(1):1-6

于1994年5月-1995年7月，根据已克隆的草鱼出血病病毒GCHV-861株cDNA的部分序列，设计合成了两对PCR引物，采用RT-PCR技术对GCHV-861及GCHV-873两病毒株的dsRNA进行扩增。结果表明，两对引物仅能特异地检测出GCHV-861病毒株核酸的存在，而不能对GCHV-873病毒株的核酸进行特异扩增，该方法最小可检测出0.1Pg纯化的GCHV-861病毒dsRNA;采用该方法对GCHV-861人工感染的草鱼和稀有鲫组织进行RT-PCR检测，不仅能检测到发病期显症病鱼中GCHV-861病毒的存在，还能检测发病前期及愈后无出血病症状的病毒携带者中病毒的存在;利用该方法还从本所关桥实验场出血病流行季节收集的发病草鱼体内检测出GCHV的存在，说明所设计的引物具有一定的实际意义;利用该法还能检测出感染病毒的组织培养细胞系GCK和CIK上清液中GCHV的存在。还建立了简易的模板制备方法，采用该方法整个检测过程只需3-4h，可大大缩短检测时间。由此可见，RT-PCR技术是检测GCHV的快速、灵敏而特异的方法，发展和完善该技术对草鱼出血病的早期诊断和防治、抗病育种具有重要意义。  相似文献