Methods Comparison for Microsatellite Marker Development： Different Isolation Methods, Different Yield Efficiency     

Aibin Zhan  Zhenmin Bao  Xiaoli Hu  Wei Lu  Jingjie Hu 《中国海洋大学学报(英文版)》2009,8(2):161-165

Microsatellite markers have become one kind of the most important molecular tools used in various researches. A large number of microsatellite markers are required for the whole genome survey in the fields of molecular ecology, quantitative genetics and genomics. Therefore, it is extremely necessary to select several versatile, low-cost, efficient and time- and labor-saving methods to develop a large panel of microsatellite markers. In this study, we used Zhikong scallop (Chlamys farreri) as the target species to compare the efficiency of the five methods derived from three strategies for microsatellite marker development. The results showed that the strategy of constructing small insert genomic DNA library resulted in poor efficiency, while the microsatellite-enriched strategy highly improved the isolation efficiency. Although the mining public database strategy is time- and cost-saving, it is difficult to obtain a large number of microsatellite markers, mainly due to the limited sequence data of non-model species deposited in public databases. Based on the results in this study, we recommend two methods, microsatellite-enriched library construction method and FIASCO-colony hybridization method, for large-scale microsatellite marker development. Both methods were derived from the mi-crosatellite-enriched strategy. The experimental results obtained from Zhikong scallop also provide the reference for microsatellite marker development in other species with large genomes.  相似文献   

雷州半岛灯楼角珊瑚礁海区夏季的浮游动物   总被引：6，自引：0，他引：6  

尹健强  黄晖  黄良民  李开枝  练健生 《海洋与湖沼》2008,39(2):131-138

2004年8月在雷州半岛灯楼角珊瑚礁海区分别使用浅水Ⅰ型和浅水Ⅱ型浮游生物网进行了浮游动物调查,共鉴定浮游动物72种和浮游幼虫19个类群(或类型),其中桡足类的种数最多达45种。结果表明,浮游动物种数分布由近岸往远岸递增,约3/4的种类属于终身浮游生物,1/4属于阶段性浮游生物。中小型的浮游动物种类多,数量大。两种网具采集的浮游动物总种数、总密度、多样性指数、均匀度和中小型优势种的密度差异相当显著,而大型优势种的密度差异不明显。用浅水Ⅱ型网采集的浮游动物总密度平均值为5270ind/m3,是浅水Ⅰ型网的110倍。桡足类占浮游动物总密度的72.45%,其次幼虫占23.41%。浮游动物密度呈斑块状分布,最高达16257ind/m3,底质为珊瑚礁的测站的浮游动物数量一般较多。优势种主要是中小型种类和底栖动物的幼虫,如强额孔雀哲水蚤、蔓足类无节幼虫、细长腹剑水蚤、驼背隆哲水蚤、无节幼虫、双壳类面盘幼虫、桡足幼体、简长腹剑水蚤等。  相似文献   

盐度对MPN法测定沿岸海水粪大肠菌群数的影响   总被引：1，自引：0，他引：1  

张瑜斌  章洁香  张才学  孙省利 《海洋技术学报》2008,27(4)

粪大肠菌群是在44℃温度下能生长并发酵乳糖产酸产气的微生物生理群,是总大肠菌群中的一部分,水质污染的生物学指标之一。文中使用五管发酵MPN法研究了培养液和稀释水盐度在5,10,15,20,25,30,35七个盐度梯度下对沿岸海水粪大肠菌群数量的影响,结果表明:5~35的七个盐度梯度间的粪大肠菌群数量差异极显著(P<0.01),在盐度为10~25时,粪大肠菌群数量较为丰富,而在两端盐度的范围,粪大肠菌群数量较少,表明使用MPN法测定近岸海水的粪大肠菌群数量时,培养液和稀释水的盐度不宜过高和过低。调查站位间粪大肠菌群数的水平差异与陆源排污及其影响有关。  相似文献   

开发治理并重 查堵补漏结合 清丰县四年新增耕地两万亩     

岳志强  王太坤 《河南国土资源》2009,(1)

"今年,靠承包地种西瓜卖的钱,我家不仅新买了大彩电,还盖起了5间大瓦房。"2008年岁末的一天,清丰县大屯乡南召市村农民雷青顺指着自家刚完工不久的瓦房,喜上眉梢。  相似文献   

耕作层土壤剥离再利用的若干问题探讨   总被引：2，自引：0，他引：2  

蔡洁 《浙江国土资源》2008,(3):42-43

近年来,随着社会经济发展对用地需求的增加,实现建设占用、补充耕地数量质量平衡的难度愈来愈大,耕地保护形势已经相当严峻。切实提高补充耕地质量已经成为国土资源管理部门最为关注的问题之一。继国土资源部发文要求推广吉林省开展被占用耕地耕作层土壤剥离工作有关做法后,浙江省国土资源厅也在2007年8月发文要求有条件的地市积极开展表土剥离利用工作。但在实际推行中。却面临政策、资金、技术等诸多问题。  相似文献   

充分认识加强国土资源管理艰巨性和紧迫性     

郑利刚 《浙江国土资源》2008,(7)

近年来,中央对加强国土资源管理高度重视,各种紧缩“地根”的政策密集出台,如何正确处理好资源保护与项目推进已经成为制约各地发展的一大“瓶颈”。目前,各地普遍存在着对国土资源现状认识不深,对土地新政把握不透等问题,特别是在如何科学“管好”、“用活”土地资源来加快区域发展上还存在较大差距。主要表现为：农村耕地保护措施不到位,乱占滥用现象时有发生,耕地数量减少,质量下降;土地批后监管不力,擅自改变用地性质、非法交易等行为屡禁不止;  相似文献   

平阴县5个市级土地整理项目通过验收          下载免费PDF全文

郭恒宇 《山东国土资源》2008,24(5):62

近日,由济南市国土、农业、水利、审计等部门专业人员组成的土地整理项目验收组对平阴县孔村镇菩萨山小流域、李沟乡石板台片、玫瑰镇焦庄片、栾湾乡董庄片、孝直镇孝直村土地整理项目进行了验收。通过听取汇报、查阅资料、实地核查,验收组成员一致为：5个项目组织管理措施到位,工程数量、质量符合设计要求,具有较高的科学性和适用性,各种档案资料齐全,符合项目资料归档要求,同意通过验收。  相似文献   

大连沿海排污口及邻近水域细菌动态分析     

杨文新  樊景凤  周君  王中华  葛林科  丁德文  苏秀榕  李太武 《海洋与湖沼》2013,44(5):1249-1256

于2011年3月、5月、8月和10月对大连沿海10个排污口及部分排污口的邻近水域分别采集水样, 对样本进行细菌总数3M试纸计数、2216E培养基和TCBS培养基培养并菌落计数, 对不同菌株进行16S rRNA基因克隆测序, 鉴定种属, 对细菌时间、空间的动态分布与群落结构及细菌分布与生态因子的相关性进行了分析。结果表明, 不同的排污口之间细菌总数差别很大, 数量在(1.6—500.0)×104cfu/mL之间; 排污口与其邻近水域差异明显, 排污口、邻近5m、100m和500m距离的细菌总数全年平均分别为77.94×104、 34.00×104、 4.520×104和0.448×104 cfu/mL。不同季节之间, 远距离水样季节性差异较大, 而排污口间季节性差异相对较小。在群落构成上, 假交替单胞菌属、肠杆菌科、假单胞菌属、弧菌属和希瓦氏菌属为优势菌属, 检出率较高, 数量较大。细菌分布与多种生态因子具有不同程度的相关。  相似文献   

九龙江口外浯屿海域底栖生物种类组成与数量分布     

何明海 《台湾海峡》1996,15(4):368-375

本文根据１９９５年的调查，报道了九龙江口外浯屿海域底栖生物的种类组成与数量分布。结果表明，本区底栖生物种类较丰富，组成以多毛类，甲动物，软体动物和棘皮动物为主。底栖生物数量较大，平均栖息密度为３００个／ｍ＾２，平均生物量为３１．０３ｇ／ｍ＾３，数量分布较不均匀。．  相似文献   

厦门同安西柯对虾养殖池的细菌数量动态   总被引：10，自引：0，他引：10  

林美兰  倪纯治  刘文华  叶德赞  周宗澄  林燕顺  曾活水 《台湾海峡》1998,(2)

本文研究了对虾养成期间养殖池生态系中细菌的数量动态,探讨其变化规律与虾病的关系。结果表明,总细菌、弧菌和发光细菌在水体、底质和虾体中的数量变化各异。在水体各菌数与其环境因子的关系中,除了总菌数与COD存在着正相关外,其它的不存在相关性。虾体的总细菌、弧菌和发光细菌的数量（以细胞计）可以用来预报虾病,三者的阅值分别为107个　／g（湿重）、105个／g（湿重）和104介／g（湿重）。通过对对虾的细菌学跟踪监测,可以及时采取有效的应急防治措施。  相似文献