南移养殖的刺参(Apostichopus japonicus)cDNA文库的构建及原肌球蛋白基因的研究   总被引：1，自引：1，他引：0  

崔静  李太武  苏秀榕  李晔  徐静  周君  应琪  王中华  李松伟 《海洋与湖沼》2010,41(6):850-856

以南移养殖的刺参为实验材料,采用非均一化的Oliga-dT引物定向克隆技术构建了南移刺参混合组织的cDNA文库。对文库质量的分析结果表明,cDNA文库的库容量为2.2×107cfu,重组率达95.8%,平均插入片段长度750bp左右。挑取cDNA克隆进行5’端测序,成功测序185个反应,分析得到136个单基因簇(Unigene),其中包括40个重叠群(Contigs)、96个单拷贝EST(Singletons)。结果表明,克隆南移养殖的刺参原肌球蛋白(tropomyosin,Trp)cDNA全长序列为1112bp,ORF编码284个氨基酸,其预测蛋白的分子量为33.27kDa,等电点为4.56。该氨基酸序列与紫石海胆、南极大磷虾、锯缘青蟹、文昌鱼、河蟹、家蚕同源性分别为62%、51%、46%、49%、47%、46%。  相似文献   

基于mtDNA 16S rRNA序列的脉红螺(Rapana venosa)与红螺(R.bezoar)的分类学研究     

杨建敏  郑小东  李琪  王如才  王卫军  孙国华  张宇 《海洋与湖沼》2010,41(5):748-755

采用线粒体DNA16SrRNA基因序列测定方法,对中国沿海3目8科的14种腹足类的系统演化关系进行了比较分析。结果显示,共测定了102个个体,获得线粒体DNA16SrRNA基因片段507bp的同源碱基序列;用最大简约法检测到保守位点87个,可变位点409个,简约信息位点254个;计算了碱基替换/颠换率的距离(R)和基于碱基替换+颠换率的距离(D),红螺属内的脉红螺和红螺R值为0.9367,大于0.5,属于种间标志值;采用Kimura2-parametermodel构建了邻接法(NJ)、最小进化法(ME)和最大似然法(MP)等3种系统树,脉红螺和红螺各自均为单系群(支持率=92—100),同时表明它们在检测的14种腹足类中属于相当进化种类。分析结果从线粒体基因序列的层次支持脉红螺与红螺属于不同种类的现代分类方法。  相似文献   

6种鳗鲡(Anguilla)线粒体DNA COⅠ序列的比较研究     

吴宁  黎中宝  林小云  张志红  田鑫江  陈晓姣  陈丽娜 《海洋与湖沼》2010,41(6):930-934

采用基因测序的方法,对6种鳗鲡的COⅠ基因片段进行了PCR扩增和测序。结果表明,6种鳗鲡COⅠ基因片段的长度都为652bp,4种碱基组成非常相似,并且A+T的含量都大于G+C的含量。6种鳗鲡COⅠ基因片段核苷酸序列之间有105bp的差异,其中有18处发生碱基颠换,87处发生碱基转换。非洲鳗鲡和欧洲鳗鲡COⅠ基因片段核苷酸序列差异最大为54bp,同源性为91.72%,而美洲鳗鲡与欧洲鳗鲡COⅠ基因片段核苷酸序列差异最小为24bp,同源性为96.32%。  相似文献   

红树林植物桐花树内生真菌主要无孢类群的分子鉴定     

邓祖军  曹理想  陆勇军  周世宁 《海洋学报》2010,32(2):161-167

1 引言 真菌种类繁多,其形态性状复杂多变且易受环境影响,仅依靠形态、生化等表形特征加以鉴别显得较为困难且易出现偏差,尤其是真菌形态鉴定中占有重要地位的孢子,很多植物内生真菌孢子不能在一般实验室条件下形成,这一点给分类鉴定带来困难.随着分子生物学技术的发展,基于ITS(inter-nal transcribed spacer,ITS)区的多态性,ITS区的序列分析近来已广泛应用于真菌种属水平的分类和系统发育方面的研究[1-4].  相似文献   

基因转移技术简介     

喻达辉 《广东海洋大学学报》2000,20(3):80-86

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鱼类转基因技术综述   总被引：3，自引：0，他引：3  

吴勇  区又君 《海洋通报》2006,25(6):76-84

基因转移的研究为鱼类遗传育种开辟了一条全新的途径。自1985年第1例转基因鱼问世至今已获得20～30种转基因鱼,在促进生长,提高鱼类抗逆性、抗病性等方面取得了巨大成绩。本文主要阐述了转基因鱼的构建机理、方法和检测方法以及各自的优缺点。外源基因的定点整合、稳定表达和遗传仍需要深入研究。构建“全鱼”基因则是今后发展的方向,受到越来越多的关注。  相似文献   

中华鳖(Pelodiscus sinensis)MITF基因的生物信息学及表达差异研究     

田儒品  张海琪  许晓军  何中央  丁雪燕  苏胜齐 《海洋与湖沼》2018,49(3):662-670

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褐斜鲽(Plagiopsetta glossa)线粒体基因组特征及重排机制研究     

董江星  时伟  孔晓瑜  陈世喜 《热带海洋学报》2018,37(1):1-11

冠鲽科(Samaridae)隶属于鲽形目(Pleuronectiformes), 包含冠鲽属(Samaris)、沙鲽属(Samariscus)和斜鲽属(Plagiopsetta)。目前研究表明, 冠鲽(Samaris cristatus)和满月沙鲽(Samariscus latus)的线粒体基因组结构都有重排, 并且两者的基因数量也有差别。为检测斜鲽属鱼类中是否也有不同的特征结构, 我们选用褐斜鲽(Plagiopsetta glossa)作为代表种进行斜鲽属鱼类线粒体基因组特征分析, 同时与冠鲽属及沙鲽属鱼类的线粒体基因组特征进行对比。分析显示, 褐斜鲽的线粒体基因组全长为18723bp, 包括39个基因: 13个蛋白基因、24个tRNA基因、2个rRNA基因、2个控制区、1个轻链复制起点和比典型基因组多的13个间隔子。和经典鱼类的线粒体基因组相比, 褐斜鲽和满月沙鲽都多了tRNA-Cys和tRNA-Tyr两个tRNA, 冠鲽只多了tRNA-Cys, 且3个种类都多了一个控制区, 但褐斜鲽与满月沙鲽的基因排列顺序相同。褐斜鲽线粒体基因的重排导致不同位置的6个tRNA形成了六连体基因簇“tRNA-Cys₁-Tyr₁- Ser1-Lys-Arg-Ser2”, “ND5-ND6-Glu-Cytb-Thr”则位于六连体之后, 但这11个基因相对的排序没有发生变化。采用双复制随机丢失模型(double replications and random loss, DRRL)对褐斜鲽基因的重排现象进行分析, 认为该鱼类基因数量、排列顺序以及比典型基因组多13个间隔子等特征为该模型提供了新的依据。  相似文献   

Heinrich事件期间的混合层增深：多种浮游有孔虫的δ^18O研究     

Harunur Rashid  徐明芝 《海洋地质前沿》2009,25(3):22-24

北大西洋晚更新世Heinrich事件（HEs）以Laurentide冰盖的冰筏碎屑（IRD）层为标志。有8个这样的事件与约65000a以来格陵兰冰心记录的部分Dansgaard-Oeschger（D／O）事件的最冷亚冰期相对应。判断一个D／O事件的开始,根据这样一个典型特征：在仅仅几十年的时间内温度突然上升了9～15℃,其后便是数千年时间的气温逐渐变冷。  相似文献   

淋巴囊肿病毒锌指蛋白基因lcn140的原核表达与结构分析     

闫秀英  孙修勤 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2009,39(6)

应用生物信息学分析方法,预测到中国牙鲆淋巴囊肿病毒分离株(LCDV-cn)的lcn140基因编码锌指蛋白.为了进一步研究lcn140基因的功能,本文对lcn140基因进行了原核表达与结构分析.首先将lcn140基因克隆到pET24a(+)原核载体,再以E.coli BL21(DE3)为宿主菌表达目的蛋白;通过生物信息学软件分析,了解其结构与序列特征.结果表明,lcn140基因在原核载体中得到成功表达,表达的his标签融合蛋白主要以包涵体形式存在;在结构和序列方面,lcn140基因编码C3H1型锌指蛋白,其含有4个C3H1锌指结构和4段简单重复序列.该结果为LCDV-cn的发生、发展提供了分子基础.  相似文献