产胞外黑色素海洋菌的鉴定及发酵条件优化     

田欣欣  ;王琛  ;曹为  ;曲凌云 《台湾海峡》2014,(2):290-296

从山东近海海域沉积物的微生物筛选中获得了一株高产胞外黑色素的菌株QJNY82,通过对该菌株菌落形态特征观察、生理生化检验及16S rDNA序列测定,初步确定该菌株为发光杆菌属细菌.通过对菌株QJNY82的胞外产物进行红外光谱分析,得到该细菌的胞外产物为黑色素,纯化后的黑色素的红外光谱图与标准黑色素（SIGMA）的红外光谱图一致,且该细菌所产黑色素的理化性质与标准黑色素具有一致性.该海洋菌株具有产黑色素速度快,产量高且不需要L-酪氨酸诱导的特点,而且经L-酪氨酸诱导后,可显著提高菌株QJNY82胞外黑色素的产量,在L-酪氨酸的含量为0.75 g/dm3、盐度为30、pH值为8.0、温度为28℃的条件下,菌株黑色素产量是未加L-酪氨酸的3.5倍,其产量达1.325g/dm3.鉴于菌株QJNY82具有产黑色素的特性,将成为发光杆菌属的一个新的菌种资源.  相似文献   

厚壳贻贝(Mytilus coruscus)中抗生素耐受细菌多样性研究     

栗洋洋  贾梦雪  王锦乙  吴紫琪  羊妍珂  严小军  廖智  何建瑜 《海洋与湖沼》2022,53(2):405-413

抗生素的滥用是当前水产养殖业发展及食品安全面临的重大威胁。贻贝体内含有丰富的附生菌群,但目前尚不清楚贻贝附生菌群在抗生素残留背景下的动态变化和耐受性特征。为此进行了厚壳贻贝中抗生素耐受细菌多样性研究。将厚壳贻贝暴露于含有青霉素、链霉素和卡那霉素的养殖水体中,之后采用超声法获取含贻贝软体部组织表面附着菌群的超声液,经Zobell 2216E液体培养基培养后,将组织超声液和培养液一并经16S rDNA高通量测序来分析厚壳贻贝微生物的群落组成。结果表明,超声处理后获得的微生物主要为拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)和疣微菌门(Verrucomicrobia)。多重抗生素的处理可以显著下降贻贝体内微生物的OTU数,对微生物群落结构有明显影响。经264h恢复养殖后,在门水平上观察到贻贝体内微生物群落可以恢复重建,表明其具有一定的韧性。研究结果将为今后进一步探索宿主相关微生物群落构建机制及特殊抗性微生物奠定基础。  相似文献   

棘头梅童鱼的细胞遗传学特征和X1X1X2X2/X1X2Y性染色体系统     

张寿康  郑娇  张静  王志勇  王艺磊  蔡明夷 《海洋学报(英文版)》2018,37(4):34-39

我们通过荧光染色、自身基因组原位杂交（Self-GISH）和多色荧光原位杂交（FISH），首次研究了棘头梅童鱼（Richardson，1844）的核型特征。雌性核型有24对端部着丝粒染色体（2n=48a，NF=48），而雄性核型包含22对端部着丝粒染色体，2条端部着丝粒染色体单体和1条中间着丝粒染色体（2n=1m+46a，NF=48）。雌性和雄性核型之间的差异表明，棘头梅童鱼的性染色体系统为X₁X₁X₂X₂/X₁X₂Y型，其中Y为雄性中特有的中间着丝粒染色体。三色FISH结果显示，5S rDNA和18S rDNA位点定位在最大的端着丝粒染色体（X₁）以及Y染色体的短臂；X₁染色体上有一个特异的臂间端粒信号（ITS），与5S rDNA位点部分重叠。Self-GISH结果显示，在推定的性染色体DNA重复序列聚集。根据实验结果我们提出关于棘头梅童鱼Y染色体起源的假说：Y染色体起源于祖先核型（2n=48a）中的两条端部着丝染色体融合，并且在此过程中伴随着片段缺失。本研究首次在石首鱼科中描述了异形的性染色体，将为其他石首鱼的性染色体研究提供线索。  相似文献   

环境16S rDNA和16S rcDNA序列分析湖光岩玛珥湖的浮游细菌组成     

秦青英  曾永辉  郭倩茹  简纪常  鲁义善  吴灶和 《广东海洋大学学报》2013,(3):1-9

通过提取环境总16S rDNA和总16S rRNA分别构建DNA克隆文库和反转录cDNA文库,并进行克隆测序和序列分析,探讨湖光岩玛珥湖浮游细菌和浮游活性细菌的遗传多样性。结果表明:构建两个水层的4个克隆文库,即1 m和10 m水层总菌的16S rDNA文库和总活性菌的16S rcDNA文库,共获得413条序列,分属15门、32目、52科;1 m水层的rDNA文库与rcDNA文库中Verrucomicrobia类群所占比例最大(36.8%和32.1%),其次为Alphaproteobacteri(a 15.1%和16%)和Betaproteobacteri(a 17.9%和16%);在10 m水层的2个文库中,Alphaproteobacteria类群均占绝对优势,分别为63.5%(rDNA)和43.8%(rcDNA),其次为Verrucomicrobia(11.5%和14.3%),其他细菌类群包括Acidobacteria、Chloroflexi、Firmicutes、待定门OD1、Planctomycetes、Spirochetes和Deltaproteobacteria,比例在0.8%~3.8%之间;在科的水平上,SAR11为湖光岩玛珥湖最为丰富的类群,占总克隆数的26.9%,其中在10 m水层的比例高达51.5%。序列同源性分析表明,绝大多数序列(89.8%)来源于新种,其中19.6%的序列可能来自于新属,69%的序列可能来自于全新的科。湖光岩玛珥湖浮游细菌群落结构较为独特,有大量的浮游细菌种类尚未获得相应的纯培养物,蕴含着丰富而新颖的微生物资源。  相似文献   

Spatial distribution of Dactylogyrus wunderi Bychowsky on gills of Abramis brama orientalis Berg (Leuciscinae) in Irtysh River, China     

郝翠兰  岳城  姚卫建  殷建国  焦丽  朱梦莹  贾舒安  王娜  王新 《中国海洋湖沼学报》2013,31(5):979-986

The spatial distribution of the monogenean Dactylogyrus wunderi Bychowsky,1931 on the gill filaments of the bream Abramis brama orientalis Berg(Leuciscinae) inhabiting the Irtysh River of Xinjiang,China was investigated from June to July 2012.D.wunderi was identified by sequencing a fragment of its ITS rDNA region.Sixty-five fish were examined,with 55% testing positive for monogenean infection.The prevalence of the parasite in the left and right gill arches was 46% and 48%,respectively.In fish with a large body length,the prevalence of the parasite and the infection intensity did not significantly differ between the right and left gill arches but both were slightly higher in the former.Among the three size groups of fish(small,medium and large) the prevalence and the intensity of infection were lowest in fish with small body lengths.The distribution of the monogenean population in the host gills showed an aggregate distribution,with little change in the degree of aggregation,suggesting that most hosts were either not or only slightly infected by D.wunderi and that the parasite infected only a few hosts.In addition,differences in D.wunderi infections between gill arches of A.brama orientalis were not significant(P>0.05).  相似文献   

Phylogenetic analyses of four species of Ulva and Monostroma grevillei using ITS, rbc L and 18S rDNA sequence data     

林中姮  沈颂东  陈伟洲  李慧慧 《中国海洋湖沼学报》2013,31(1):97-105

Chlorophyta species are common in the southern and northern coastal areas of China. In recent years, frequent green tide incidents in Chinese coastal waters have raised concerns and attracted the attention of scientists. In this paper, we sequenced the 18S rDNA genes, the internal transcribed spacer (ITS) regions and the rbcL genes in seven organisms and obtained 536-566 bp long ITS sequences, 1 377-1 407 bp long rbcL sequences and 1 718-1 761 bp long partial 18S rDNA sequences. The GC base pair content was highest in the ITS regions and lowest in the rbcL genes. The sequencing results showed that the three Ulva prolifera (or U. pertusa) gene sequences from Qingdao and Nan’ao Island were identical. The ITS, 18S rDNA and rbcL genes in U. prolifera and U. pertusa from different sea areas in China were unchanged by geographic distance. U. flexuosa had the least evolutionary distance from U. californica in both the ITS regions (0.009) and the 18S rDNA (0.002). These data verified that Ulva and Enteromorpha are not separate genera.  相似文献   

南大西洋热液区盲虾虾鳃可培养附生菌多样性分析     

张晓波  曾湘  董纯明  邵宗泽 《台湾海峡》2013,32(1):73-78

对来自于南大西洋洋中脊(SMAR)的盲虾Rimicaris sp.虾鳃中的附生好氧菌及厌氧菌进行了富集培养,共分离得到14株低温好氧菌和2个稳定的厌氧富集菌群.通过对好氧菌的16S rDNA序列系统发育分析,发现14株低温分离菌株分别属于海源菌(Idiomarina)、海杆菌(Marinobacter)、涅斯捷连科氏菌(Nesterenkonia)、赤杆菌(Erythrobacter)、盐单胞菌(Halomonas)、交替单胞菌(Alteromonas)、嗜冷菌(Psychrobacter)、Mesonia8个属,其中9株属于变形菌门(2株属于α-变形菌纲,占总菌株数的14.3％;7株属于γ-变形菌纲,占总菌株数的50.0％).对2个厌氧富集菌群的16S rDNA文库的39个阳性克隆子进行分析,获得2种基因型,分别为γ-变形菌纲的产碱杆菌属(Alcaligenes)和β-变形菌纲的嗜麦芽寡营养单胞菌属(Stenotrophomonas).结果表明,南大西洋洋中脊盲虾虾鳃附生菌类型较为丰富,对于附生菌的研究能够更加全面的认识盲虾与附生菌之间的相互作用.  相似文献   

中国裸胸鳝属10种鱼类分子系统发育关系的16SrDNA分析     

杜民  尹绍武  刘艳红  牛宝珍  齐兴柱  张本  廖经球  霍蕊 《海洋科学》2013,37(6):16-23

为了阐明南中国海裸胸鳝属(Gymnothorax)鱼类系统进化情况,利用聚合酶链式反应扩增目的产物,将其连接到T载体后,并对其序列进行测定,共得到9种裸胸鳝属鱼类线粒体16S ribosomalDNA(16S rDNA)基因的部分序列,采用多个生物软件对序列变异和碱基组成进行分析,计算了Kimura2-parameter遗传距离,转换/颠换比等遗传信息指数,下载基因库中16SrDNA基因的同源序列,以鳗鲡属(Anguilla)的花鳗鲡(Anguilla marmorata)为外群构建NJ(Neighbore-Joining)、MP(MaximumParsimony)和ME(Minimum Evolution)系统进化树。根据所得分子数据并结合形态学特征推论如下:(1)在所研究的10种裸胸鳝鱼中共有516个位点、其中143个核苷酸位点存在变异(27.7%);(2)序列变异的转换/颠换比值的平均值为3.441;相对遗传距离数据表明斑颈裸胸鳝(G. margaritophorus)和网纹裸胸鳝(G. reticularis)差异最大(0.177),褐祼胸鳝(G. hepaticus)与布雷顿氏裸胸鳝(G. breedeni)差异最小(0.022);(3)NJ树、ME树表明裸胸鳝属内部存在3个平行进化的姐妹分支,分支内部的种类组成与地理分布无关。  相似文献   

Assessment of introduced Kappaphycus (Solieriaceae, Rhodophyta) species relationships in China with molecular markers     

LIU Chenlin  HUANG Xiaohang  LIU Jianguo 《海洋学报(英文版)》2013,32(2):59-65

Due to morphological plasticity and paucity of diagnostic morphological characters, the taxonomy of Kappaphycus gets more and more confused with the expanding of commercial cultivation. In this study, the phylogenetic relationship of 13 strains of introduced Kappaphycus species in China was defined using DNA molecular markers, such as 18S rDNA, rbcL and cox2-cox3 spacer region. The resolutions obtained by three different molecular markers were compared: both cox2-cox3 spacer region and rbcL sequences are eligible in interspecies identification of Kappaphycus, whereas cox2-cox3 spacer region is more variable than rbcL sequence. There is several basepairs’ discrepancy among 18S rDNA sequences, while it is 100% identical among both cox2-cox3 spacer region and rbcL sequences of the ten strains of K. alvarezii. We suppose that 18S rDNA sequence can provide more information in biogeography study of Kappaphycus than other two DNA sequences.  相似文献   

阿特拉津低温降解菌的筛选及降解机理研究   总被引：1，自引：1，他引：0  

刘娜  毕海涛  任何军  姬克宁  郑松志 《吉林大学学报(地球科学版)》2009,39(5)

以阿特拉津为唯一氮源, 在低温条件下(10℃),从吉林市污水处理厂的活性污泥中分离、筛选出1株能够高效降解地下水中阿特拉津的菌株W4.通过16S rDNA碱基测序和比对,初步确定该菌为假单胞菌属;通过室内降解条件优化,确定W4的最佳降解条件:初始pH范围为7～9,最佳碳源为蔗糖和乳糖,最佳碳源加入量为0.4 g/L.在最佳降解条件下,W4对初始质量浓度为34 mg/L、22 mg/L和10 mg/L的阿特拉津的生物降解反应符合零级反应动力学方程,对初始质量浓度为5 mg/L的阿特拉津的生物降解反应符合一级反应动力学方程.GC/MS分析结果显示,菌株W4降解阿特拉津遵循氯水解途径,代谢产物为2-羟基-4-乙胺基-6-异丙胺基-1,3,5-三嗪.  相似文献