海洋石油烃降解细菌T1和T2的分子鉴定分类          下载免费PDF全文

田胜艳  王娟  聂利红 《海洋科学》2008,32(9)

从天津滨海潮间带被石油烃严重污染的沉积物（千样含油量0．2g／g）中，筛选分离出能够以柴油为唯一碳源生长的细菌，对其中生物量大、单株菌降解效率较高的两株细菌T1和T2进行16SrDNA克隆，通过测定和比较16SrDNA的部分序列对这两株细菌进行分子鉴定，以期用于石油污染的微生物修复中。结果表明，T1与深红红螺菌（Rhodospirillum rubrum）的同源性为89％，．r2与施氏甲单孢杆菌（Pseudomonas stutzeri）的同源性为99％。  相似文献   

应用DGGE技术分析扇贝养殖海区真核浮游生物种群多样性   总被引：3，自引：0，他引：3  

王娜  蔡玉勇  李赟  王崇明  崔红 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2010,40(12)

为分析扇贝养殖海区真核浮游生物种类和丰度,本研究首先以实验室培养的9种饵料微藻总DNA为模板PCR扩增18S rDNA V1～V3区的高变区序列.筛选用于DGGE分析该扩增序列的变性剂浓度,结果表明,扩增序列长560 bp,DGGE分析町将不同藻种分离开.随后对青岛沙子口扇贝养殖海区9个月份真核浮游生物多样性进行了DGGE分析,结果从9个月份2 m深的海水中总共扩增出38条谱带.其中共有谱带3条,占总数的7.69%,不同月份的特征性谱带11个,占总谱带数的28.2%.不同月份水样中的谱带数显著不同,香农多样性指数为0.4632.相似性分析表明,2009年3和4月养殖海区真核微牛物种类相似性最高,为89.7%.基于不同月份水样微生物种类多样性进行UPGMA聚类分析,结果表明,2008年5,6,8月和2009年1,2,3,4月分别聚为一支,显示取样时间相近的月份微生物种类相似度最高.  相似文献   

记者体验：“饶死肿瘤”     

《发现．图形科普》2001,(6):13-13

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基于28S rDNA的南海刺长腹剑水蚤(Oithona setigera)种群遗传多样性研究     

季莹莹  徐磊  黎红  王亮根  杜飞雁 《热带海洋学报》2019,38(3):89-97

长腹剑水蚤属是海洋中小型浮游动物中最为丰富的类群之一, 在生物地理学与海洋生态学研究中均具有重要地位。本研究基于28S rDNA分析了南海长腹剑水蚤属中较为常见的刺长腹剑水蚤Oithona setigera的单倍型多样性和种群遗传结构。结果显示, 792bp长度的核苷酸片段中, 碱基G+C的平均含量为58.2%, 高于A+T含量(41.8%)。种群平均遗传距离Φ_ST为0.011。在22个种群共计186个个体中, 发现了28个单倍型, 其中单倍型H10在21个种群中均被发现, 最远距离超过1000km, 说明刺长腹剑水蚤可以实现远距离的扩散且受到南海海流影响。Mantel检验结果显示, 刺长腹剑水蚤种群遗传距离和地理距离无线性相关性(R=-0.04615, P=0.678); RDA变差分解结果显示, 空间变量全模型对种群遗传结构的解释率为53.3%, 结合种群平均遗传距离Φ_ST为0.011, 我们判断目前观测到的刺长腹剑水蚤的种群遗传结构可能由历史上种群扩展带来的拓殖隔离造成。  相似文献   

Isolation and Characterization of a Fucoidan-DegradingBacterium from Laminariajaponica     

《青岛海洋大学学报(英文版)》2014,(1):153-156

Fucoidan, a polysaccharide containing abundant fucose and sulfate ester group, was prepared from Laminaria japonica.In order to obtain fucoidan-degrading enzyme, bacteria capable of degrading fucoidan were screened from kelp. A bacterial strainnamed RC2-3 was obtained, which degraded fucoidan by the maximura extent of 54%±1.3%, the highest among all bacterial isolatesHigh-performance size exclusion chromatography （HPSEC） showed that the molecular weight of fucoidan was gradually reduced byRC2-3 with culturing time, suggesting the production of fucoidan-degrading enzyme by RC2-3. Phylogenetic analysis of partial 16Sribosomal RNA gene （16S rDNA） sequence showed that RC2-3 belonged to the family Flavobacteriaceae. However, it showed dif-ferent physiological and biochemical characteristics from the known Flavobacteriaceae members producing fucoidan-degradingenzyme, thus RC2-3 was proposed to be a new member of this family.  相似文献   

两种鲨鱼鳃部真菌菌群的PCR-DGGE分析     

张翼  穆军  冯妍  阎松 《海洋与湖沼》2014,45(1):183-188

以提取自东海海域两种鲨鱼(尖吻鲭鲨和噬人鲨)鳃耙组织的总DNA为模板,对其真菌菌群rDNA的基因内转录间隔区ITS1序列进行了PCR扩增,扩增产物经变性梯度凝胶电泳(DGGE)分离,电泳图谱中的7条主要条带经过二次PCR扩增后进行了克隆测序。NCBI-BLAST比对及分子系统发育分析结果表明,尖吻鲭鲨鳃部真菌菌群的优势种来自四个分类单元,其中一个来自青霉属,三个来自曲霉属;噬人鲨鳃部真菌的优势种来自四个分类单元,其中一种来自青霉属、两个来自梗孢酵母属、一个来自枝顶孢属;青霉属为两种鲨鱼鳃部共同的优势菌;另外DGGE指纹图谱显示还有种类较丰富的劣势菌存在。数据库检索显示多数真菌分类单元具有较好的产生生物活性天然产物的潜力。该PCR-DGGE分析揭示鲨鱼鳃部栖生有较丰富的真菌类群,它们的代谢产物及其与宿主之间的相互作用还有待深入研究。  相似文献   

一株产琼胶酶海洋细菌的分离与鉴定     

梅建凤  李莎  茅鹤婷  王鸿  应国清 《海洋科学》2014,38(2):71-75

为获得琼胶酶活性高产菌株,对采集的海水样品进行了产酶微生物的分离、筛选和鉴定。经过平板培养预筛和两次摇瓶培养筛选,从浙江省舟山市普陀区近海海水样品中分离到一株琼胶酶产生菌G-5,该菌株液体培养产酶活力可达到413.8 U/mL。G-5菌株的菌落呈乳白色、半透明、表面湿润;菌体革兰氏染色阴性,大小0.58~0.69μm×1.50~2.26μm;光学显微镜下呈短杆状,略有弧形。G-5菌株的16S rDNA序列与NCBI数据库中15个弧菌属(Vibrio)菌株的16S rDNA有98%的同源性,可以确定G-5菌株是一株弧菌(Vibrio sp.)。  相似文献   

使用反应器培养钝顶螺旋藻(Spirulina plarensis)过程中细菌群落的组成变化          下载免费PDF全文

董逸  刘敏  王金霞  肖天 《海洋与湖沼》2011,42(1):148-156

使用气升式光生物反应器培养钝顶螺旋藻25天,发现随螺旋藻生物量的增长,细菌生物量有一定的增长趋势.应用PCR-DGGE技术分析螺旋藻培养过程中细菌种类组成,发现在不同时期细菌群落组成变化明显.通过DGGE图谱中18条特征条带的克隆、测序及系统进化分析,发现其中有8条序列与а变形菌纲序列相似,3条与拟杆菌纲序列相似,2条...  相似文献   

地芽孢杆菌属DYth03 DNA聚合酶基因的克隆、表达及性质分析     

罗淑娅  李侃  徐丽美 《台湾海峡》2011,30(1):17-20

从东太平洋热液区E53站位的深海沉积物样品中分离出1株能在65℃生长的嗜热菌（DYth03）.该菌的16S rDNA序列与地芽孢杆菌属（Geobacillus）内各种之间的同源性为98%以上.克隆得到DYth03的DNA聚合酶基因（DYth-pol）,序列分析表明该基因全长为2 631 bp,G＋C含量为55.5%,推测编码为876个氨基酸,与BstDNApolI的同源性最高（达98%）.将该聚合酶基因克隆到pTTQ-h表达载体上,并在大肠杆菌DH1中进行表达.对纯化到的表达产物进行酶活性测定,结果表明该酶具有聚合酶活性和5’-3’外切酶活性.  相似文献   

大庆萨南开发区高台子油层细菌群落结构     

乐建君  任国领  曲丽娜  由春梅  黄永红 《东北石油大学学报》2011,(4):71-76,82

应用分子生态学方法,从大庆油田萨南开发区高台子油层样品(包括1个注入水样和8口油井产出液样组成的混合样)中提取总DNA,扩增其18S rDNA片段,克隆到大肠杆菌,建立16S rDNA克隆文库,研究细菌群落结构.结果表明:从注入水样的微生物得出22个分类操作单元(OUT),从油井产出液样的微生物得出9个分类操作单元(O...  相似文献