Effect of macrofaunal bioturbation on bacterial distribution in marine sandy sediments, with special reference to sulphur-oxidising bacteria     

Marisol Goi-Urriza  Xavier de Montaudouin  Rmy Guyoneaud  Guy Bachelet  Rutger de Wit 《Journal of Sea Research》1999,41(4):170

We have studied the impact of the bioturbating macrofauna, in particular the lugworm Arenicola marina and the bivalve Cerastoderma edule, on abundances and distribution patterns of total bacteria and of bacteria of selected functional groups in sandy intertidal sediments. The selected groups comprised the colourless sulphur-oxidising bacteria and the anoxygenic phototrophic bacteria, which are expected to occupy small zones at the oxygen–sulphide interface in stable (non-bioturbated) sediments. The presence of a wooden wreck buried in the sediment at 10 cm depth within a large area of intertidal sand flat colonised by lugworms provided a unique opportunity to confront field observations with laboratory simulations. The site with the wooden wreck, which was used as control site, was devoid of both A. marina and C. edule, while the composition of the rest of the zoobenthic community was rather similar to that of the surrounding area. In the field, the density of total bacteria was approximately one order of magnitude higher in the control site than in the natural (bioturbated) site. This can be explained by the higher contents of silt and clay particles (higher surface-area/volume ratio) and higher total organic-carbon contents found at the control site. It appears that the presence of macrofauna affects sedimentation processes, which indirectly influence bacterial dynamics. Samples from the control site have been incubated in the laboratory with A. marina and C. edule added (bioturbated core), while an unamended core served as a control. The laboratory experiments contrasted with the field observations, because it was found that total bacteria were actually higher in the deeper layers of the bioturbated core. Moreover, the populations were more homogeneous (less stratified) and colourless sulphur bacteria were on average less numerous in the bioturbated core. In general, laboratory incubations resulted in a decrease of total bacteria with a concomitant increase of colourless and phototrophic sulphur-oxidising bacteria and thus in modifications of the bacterial community structure. Hence, our results demonstrate that care must be taken in extrapolating results from laboratory experiments (e.g. mesocosm research) to field situations.  相似文献   

发光细菌一新种──青海弧菌   总被引：36，自引：0，他引：36  

朱文杰  汪杰  陈晓耘  扎西次仁  杨韵  宋瑛 《海洋与湖沼》1994,25(3):273-279

于１９８５年８月从青海湖产的青海裸鲁体表分离到７０株发光细菌，通过表型特性分析，超氧化物岐化酶的凝胶双向扩散试验，以及Ｇ＋Ｃ摩尔百分比测定进行鉴定分类。结果表明，７０株发光细菌在表型特性，免疫学特性等方面彼此高度相似，但与已知的各种发光细菌有显著差异。鉴定为弧菌属的一个新种，定名为青海弧菌Ｖｉｂｒｉｏｑｉｎｇｈａｉｅｎｓｉｓｓｐ．ｎｏｖ．。典型菌株保存于华东师范大学生物系。  相似文献   

海洋生物共栖细菌抑藻活性的初步研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

郑立  韩笑天  严小军  俞志明  王小如 《海洋科学进展》2006,24(4):511-519

针对我国常见赤潮藻种赤潮异弯藻(Heterosigma akashiwo)及海洋原甲藻(Prorocentrum micans),通过细胞活体荧光测定方法,研究了15株海洋生物共栖细菌对微藻生长的抑制作用,同时,对它们进行了分子生物学鉴定,分析了其系统发生学关系。结果表明,7株细菌的代谢产物对2种微藻的生长具有不同程度的抑制作用,并表现出一定的选择性,其中3株海洋细菌NJ6-3-2,QD1-2,ATCI02-4的代谢产物对2种赤潮微藻的生长都具有抑制作用。系统发生学分析显示,具有抑藻活性的海洋细菌中有4株(NJ6-3-1,QD1-2,SSN-6,SS6-4)属于-γproteobac-teria分支,另外3株(NJ5-7-1,NJ6-3-2,ATCI02-4)属于Gram 细菌。  相似文献   

海洋石油降解菌的筛选鉴定及其功能基因研究     

吴福顺  王龙  黄泽瑜  史晓翀  张晓华 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2014,44(9):58-65

以石油原油为唯一碳源,从中国海洋大学海洋微生物菌种库15株菌中筛选到5株石油降解菌。16SrRNA基因测序结果表明,WH072、WH069、WH303、ZXM008和ZXM183分别为耐盐芽孢杆菌(Bacillus halodurans)、除烃海杆状菌(Marinobacter hydrocarbonoclasticus)、弯曲芽孢杆菌(B.flexus)、普里兹湾假交替单胞菌(Pseudoalteromonas prydzensis)和嗜麦芽糖寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)。其中对石油降解率最高的为WH072(高达36.4%),其次是WH069(20.0%)。对这5株菌检测已报道的石油烃降解酶基因,结果在WH072和WH069中均检测到了alkB、P450和almA3种功能基因。根据功能基因编码的氨基酸序列构建系统发育树并分析其各自的进化关系,发现P450基因在一定程度上具有种属特异性。对本研究首次报道的高效石油降解菌耐盐芽孢杆菌WH072,采用高效热不对称性交错PCR(hiTAIL-PCR)方法,成功获得了这3种功能基因的全长序列,其中alkB与已知同源基因序列相似性较低,其结构和功能有待进一步研究。  相似文献   

一株海洋几丁质酶产生菌的筛选及其产酶条件的初步研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

孙菽蔚  王子峰  岳海东  肖天 《海洋科学》2007,31(5):10-16

从胶州湾的海泥中分离到一株几丁质酶高产菌株。经16SrDNA序列分析,认为该菌属于假交替单胞菌(Pseudoaltermonas),并将其命名为SS01。对该菌产几丁质酶的最佳培养条件进行了研究,发现与其它几丁质酶产生菌相比,SS01菌株的最适产酶温度较低,酶活较高。在Zobell2216E培养基中,SS01菌株培养9h进入稳定期。胶体几丁质可诱导该菌几丁质酶的产生。在几丁质培养基中,SS01菌株产酶的适宜条件是:培养温度24℃,培养基起始pH7.0左右,蛋白胨为N源(5g/L),胶体几丁质为C源(5g/L),170r/min振荡培养130h,酶活可达116.2U/mL。  相似文献   

长江口及邻近海域表层海水细菌多样性及群落结构   总被引：4，自引：0，他引：4  

刘晓辉  王健鑫  王帅兵  樊英萍  俞凯成  蒋然  刘明华 《海洋与湖沼》2015,46(6):1531-1541

从长江口及邻近海域10 个站点采集表层海水, 通过DAPI 染色计数和克隆文库构建的方法, 对细菌的多样性及群落结构进行初步研究。DAPI 染色计数结果显示长江口及邻近海域表层海水中 细菌丰度总体较高, 生物量变化较大, 从1.16×10⁵(A04 站点)到 1.48×10⁶ cells/mL (B03 站点); 总体 趋势从长江口向外海增加。细菌克隆文库的系统发育分析表明: 细菌序列以变形菌门为主(占总文库 的60.61%), 其中α-变形菌纲是绝对优势类群(50.62%); 其次是拟杆菌门(15.18%)、放线菌门(14.79%) 和蓝细菌门(4.61%), 还有少量厚壁菌门、绿弯菌门、酸杆菌门、浮霉菌门、纤维杆菌门、疣微菌门 等; 另外柔膜菌门和SAR 类群也有发现。文库多样性分析结果显示长江口及邻近海域部分站点表层 海水中细菌多样性显著, 与研究区海域水产养殖活动有关, 并受到区域洋流和海洋化学环境(如低氧 带)的影响。  相似文献   

南极石油烃降解嗜冷菌的筛选及其降解特性的研究   总被引：6，自引：0，他引：6  

郑洲  刘芳明  张波涛  徐庆龙  缪锦来 《海洋科学进展》2007,25(3):311-316

从385株南极海洋细菌中筛选出2株石油烃降解菌NJ276和NJ341,并对其降解特性进行了初步研究。以柴油为唯一碳源进行降解实验的结果表明,它们在5℃时20 d内对柴油的降解率分别达到23.47%和32.15%,在15℃时20 d内降解率分别达到43.95%和62.47%,其降解能力随着培养温度的升高而显著增强;石油烃降解残油组分的GC-MS分析结果表明,柴油经过嗜冷菌NJ276降解后的残油组分中能检测到C15～C21七种烷烃,经过嗜冷菌NJ341降解后的残油组分只能检测到少量C16,C17和C18三种烷烃。对它们进行16S rDNA基因序列的同源性和系统发育分析结果表明,菌株NJ276属于假交替单胞菌属(Pseudoaltero monas),菌株NJ341属于科尔韦尔氏属(Colwellia)。  相似文献   

低温β-半乳糖苷酶产生菌的筛选、鉴定、生长特性及酶学性质的初步研究          下载免费PDF全文

周春雷  俞勇  李会荣  曾胤新  陈波 《极地研究》2010,22(1):48-55

自北冰洋楚科奇海、加拿大海盆、格陵兰海和中国南极中山站近岸的海水、海冰和沉积物样品中分离的322株低温细菌中筛选出73株低温β-半乳糖苷酶产生菌,并对其中1株BCw006进行了研究。通过16S rDNA序列同源性分析表明,该菌株属于交替单胞菌属,定名为Alteromonas sp.BCw006。对该菌株研究表明:该菌最适生长和产酶温度为24℃;在pH6.0—8.0、含0%—6.O% NaCl的培养基条件下菌株能够较好地生长与产酶,其最适生长和产酶NaCl浓度分别为3%和1%,乳糖对β-半乳糖苷酶合成具有明显诱导作用,酵母粉和蛋白胨是菌株生长和产酶较适宜的氮源,酶的最适作用温度为35℃,0℃时能保持35℃下酶活的25%左右,表明其具有较好的适应低温特性。酶对热敏感,60℃时作用30min后酶活力下降了41%。  相似文献   

海洋中不产氧光合细菌的研究进展   总被引：1，自引：0，他引：1  

李云  李道季 《海洋通报》2004,23(4):86-92

介绍了海洋中需氧的不产氧光养菌(aerobic anoxygenic phototrophic bacteria,简称AAP细菌)在全球海域的分布和丰度、光合作用能力、系统发生、多样性,以及与光合自养生物的关系、在海洋碳循环中的贡献等方面的研究进展,阐述了海洋中不产氧光合细菌在碳、氮、硫、铁等物质循环过程中的重要性和一些新种的发现及其应用,指出了目前海洋中不产氧光合细菌研究中存在的问题。  相似文献   

Identification of five strains of antarctic bacteria producing low-temperature lipase     

YANG Xiuxi  LIN Xuezheng  BIAN Ji  SUN Xiuqin  HUANG Xiaohang 《海洋学报(英文版)》2004,23(4):717-723

1 IntroductionMicroorganism is an important constituentof the antarctic, arctic and deep sea ecosystemswhich are characterized as permanent lowtemperature. To adapt and survive in this ex-treme environment, these microorganisms pro-duce many distinctive substances such as poly-unsaturated fatty acids (PUFA), low-tempera-ture enzymes and novel pigments, etc. (Thomasand Dieckmann, 2002). Low-temperature en-zymes have a property of higher specific activ-ity (Kcat) at low temperature. Owing to…  相似文献