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121.
FAXDC2(fatty acid hydroxylase domain-containing protein 2)是脂肪酸羟化酶家族中的成员,在脂肪酸的合成与代谢中发挥重要功能。真蛸(Octopus vulgaris)是中国南方近海的经济种类,为了研究饥饿对真蛸FAXDC2(OvFAXDC2)基因表达的影响,本研究从课题组真蛸转录组数据库中筛选获得OvFAXDC2基因序列。采用从头至趾方法进行验证,最终获得OvFAXDC2的cDNA全长序列共1384 bp。它包含100 bp的5′非编码区(UTR)、228 bp的3′UTR和1056 bp的开放阅读框(ORF), ORF共编码351个氨基酸,预测其分子量为3.98 kDa,理论等电点为8.93。系统进化树分析显示,真蛸和加州双斑蛸(O. bimaculoides)聚为一支,而与其他无脊椎动物分开。实时荧光定量PCR分析表明, OvFAXDC2在消化腺中表达量最高,在鳃和鳃心中次之。在幼体饥饿试验中,随着时间的推移, OvFAXDC2表达量先升后降,在第三天达到最高,表明OvFAXDC2表达量的变化趋势可作为幼体代谢是否正常的一个指标。 相似文献
122.
精氨酸激酶是调节能量代谢的重要酶类,在无脊椎动物体内能量平衡过程中起重要作用。利用PCR扩增技术,从白肛海地瓜的cDNA文库中克隆得到精氨酸激酶(arginine kinase)基因,其全长为2139bp,包括5′非翻译区(5’-UTR)序列92bp,3′端非翻译区(3’-UTR)序列934bp和1113bp的ORF,编码371个氨基酸,预测分子量大小和等电点分别为42.32kDa和7.19。构建了精氨酸激酶原核表达质粒并转化表达菌株,经IPTG诱导表达后,获得了与预期的分子量大小一致的表达产物。利用该目的蛋白制备了白肛海地瓜精氨酸激酶的特异性多克隆抗体,经Western blot证明该蛋白为精氨酸激酶。 相似文献
123.
MOLECULAR CLONING AND SEQUENCE ANALYSIS OF INSULIN-LIKE GROWTH FACTOR ⅠcDNA FROM LARIMICHTHYS CROCEA
《海洋与湖沼》2012,43(1)
采用RT-PCR和RACE技术克隆了大黄鱼胰岛素样生长因子-Ⅰ（IGF-Ⅰ）cDNA的全序列,序列全长2027bp,由57bp的5’非翻译区、1409bp的3’非翻译区和561bp的开放阅读框组成。序列分析表明,大黄鱼IGF-Ⅰ编码区包括信号肽、成熟肽（B、C、A、D）和E等6个区域的186个氨基酸,形成成熟肽时,信号肽和E区被切除,成熟肽分子量7.5kDa,等电点（pI）为7.76,成熟肽的B区和A区有6个保守的半胱氨酸残基,形成3对二硫键,起到了稳定IGF-Ⅰ三维结构的作用。与其它物种的IGF-Ⅰ比对后发现A、B区域比较保守,C、D区域保守性较差;E区域的分析结果表明,大黄鱼IGF-ⅠcDNA序列为Ea-4亚型。核苷酸同源性分析发现,大黄鱼IGF-ⅠcDNA与美国红鱼同源性最高,为99.47%;与斜带石斑鱼、金头鲷和褐牙鲆的同源性依次降低,分别为97.68%、97.50%和95.90%。 相似文献
124.
ZHU Yanbing LIU Guangming LI Hebin LIU Jingwen BAI Xiaoming GUAN Rong CAI Huinong 《海洋学报(英文版)》2012,31(6):117-126
The gene(741 bp) encoding carboxylesterase from the thermophilic bacterium Geobacillus sp.ZHl was cloned and overexpressed in Escherichia coli.The purified recombinant protein presented a molecular mass of about 40 kDa by SDS-PAGE analysis.Enzyme assays using p-nitrophenyl esters with different acyl chain lengths as the substrates confirmed its esterase activity,yielding highest specific activity with p-nitrophenyl acetate.Among the p-nitrophenyl esters tested,the carboxylesterase presented preference for p-nitrophenyl caprylate,but hydrolyzed p-nitrophenyl butyrate more efficiently.When p-nitrophenyl butyrate was used as a substrate,the recombinant carboxylesterase exhibited highest activity at pH 8.0 and 60℃.Almost no decrease in esterase activity was observed at 60℃for 3 h,and over 40% of activity was still maintained after incubation at 90℃for 3 h.These results indicate that Geobacillus sp.ZH1 recombinant esterase was thermostable.The enzymatic activity was inhibited by the addition of phenylmethylsulfonyl fluoride,indicating that it contains serine residue,which plays a key role in the catalytic mechanism.Except SDS and xylene,this esterase showed stability toward other tested detergents and organic solvents.Cloning,expression,and biochemical characterization of Geobacillus sp.ZH1 carboxylesterase lay a good foundation for its structural characterization and industrial application. 相似文献
125.
《海洋与湖沼》编辑部 《海洋科学》2012,36(7):128-129
Bohaisea-9145海洋耶氏酵母碱性脂肪酶基因的克隆、异源表达和重组酶酶学性质采用基因重组和分子生物学相关技术,对海洋耶氏酵母(Yarrowia lipolytica)Bohaisea-9145海洋低温碱性脂肪酶(Y.lipolytica Bohaisea-9145,LipYp)基因lipYp(1116bp)克隆,并在巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)中进行了异源真核表达研究。结果表明,阳性重组子经摇瓶发酵54 h后 相似文献
126.
采用RT-PCR和RACE技术克隆了大黄鱼胰岛素样生长因子-Ⅰ(IGF-Ⅰ)cDNA的全序列,序列全长2027bp,由57bp的5’非翻译区、1409bp的3’非翻译区和561bp的开放阅读框组成。序列分析表明,大黄鱼IGF-Ⅰ编码区包括信号肽、成熟肽(B、C、A、D)和E等6个区域的186个氨基酸,形成成熟肽时,信号肽和E区被切除,成熟肽分子量7.5kDa,等电点(pI)为7.76,成熟肽的B区和A区有6个保守的半胱氨酸残基,形成3对二硫键,起到了稳定IGF-Ⅰ三维结构的作用。与其它物种的IGF-Ⅰ比对后发现A、B区域比较保守,C、D区域保守性较差;E区域的分析结果表明,大黄鱼IGF-ⅠcDNA序列为Ea-4亚型。核苷酸同源性分析发现,大黄鱼IGF-ⅠcDNA与美国红鱼同源性最高,为99.47%;与斜带石斑鱼、金头鲷和褐牙鲆的同源性依次降低,分别为97.68%、97.50%和95.90%。 相似文献
127.
遥感图像分类受自然环境的复杂性和实际样本数据的分布情况约束,其结果将直接影响对土地利用、覆盖情况的认知。人工免疫系统具有自学习、自组织、记忆的能力,可解决非线性分类问题中的局部极值、鲁棒性等难点。该文将人工免疫系统引入遥感图像分类领域,设计了基于克隆选择算法的遥感图像监督分类方法,并将其应用于广州市遥感影像分类。实验结果表明:与最大似然法相比,该方法具有更高的精度;同时该方法对公路、桥梁等线状城市用地较敏感,适用于快速发展的中心城市的遥感影像分类。 相似文献
128.
17β-羟类固醇脱氢酶1(17β-HSD1)的主要作用是将雌酮(El)转化为发挥功能的雌二醇(E2)。作者从牙鲆(Paralichthys olivaceus)性腺转录组数据库获得该基因的开放阅读框(ORF)序列,对其进行了验证,并分析了该基因在高温、外源性激素处理条件下性腺分化期性腺组织中的差异表达以及c AMP和转录因子(NR5a2和NR0b1)在精巢原代细胞中对该基因表达的作用。结果显示,牙鲆17β-HSD1基因的ORF为873bp,编码290个氨基酸,与其他鱼类的有很高的相似性。半定量RT-PCR结果表明,该基因在卵巢中高表达,精巢有少量表达,并且在雌性个体的鳃、头肾、肾、脾、胃和肠中也有表达。实时定量RT-PCR结果显示,该基因在卵巢或精巢分化的关键时期表达量较高;在精巢原代培养细胞中,外源信号分子c AMP及转录因子NR5a2可以显著下调17β-HSD1基因的表达(P0.05),且呈现剂量效应,转录因子NR0b1对该基因的调控也与剂量有关。作者推测牙鲆17β-HSD1基因在性腺分化中起一定的作用,其表达受到调控因子的作用,这些结果将有助于增加对鱼类性腺分化和发育的认识。 相似文献
129.
采用RT-PCR及RACE技术首次获得总长为1667bp的半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)-淀粉酶(Amy)基因cDNA序列, 其开放阅读框为1539bp, 编码512个氨基酸, 已录入GenBank (登录号: KC122678)。同源性分析结果显示, 与斑点绿河豚(Tetraodon nigroviridis)、美洲拟鲽(Pseudo pleuronectes americanus)等同源性较高(86%、83%)。采用邻接法构建系统进化树, 发现半滑舌鳎与点带石斑、鳜鱼等聚为一支。用分别添加0%、0.5%、1%、2%牛磺酸的微颗粒饲料投喂23日龄半滑舌鳎稚鱼28天, 采用相对定量法检测Amy基因表达水平。结果表明, 1%组和0.5%组显著高于0%组(P<0.05), 1%组与0%组差异极显著(P<0.01); 2%组与0%组无显著差异。上述结果表明, 半滑舌鳎稚鱼Amy基因表达受饲料中牛磺酸含量影响, 1%添加量作用显著。 相似文献
130.
WEI Manman ZHANG Rubing WANG Yuguang JI Houguo ZHENG Ji CHEN Xinhu ZHOU Hongbo 《海洋学报(英文版)》2013,32(2):42-51
The aim of this study is to investigate microbial structures and diversities in five active hydrothermal fields’ sediments along the Eastern Lau Spreading Centre (ELSC) in the Lau Basin (southwest Pacific). Microbial communities were surveyed by denatured gradient gel electrophoresis (DGGE) and clone library analysis of 16S rRNA genes. The differences in microbial community structures among sediment samples from the five deep-sea hydrothermal sites were revealed by DGGE profiles. Cluster analysis of DGGE profiles separated the five hydrothermal samples into two groups. Four different 16S rRNA gene clone libraries, representing two selected hydrothermal samples (19-4TVG8 and 19-4TVG11), were constructed. Twenty-three and 32 phylotypes were identified from 166 and 160 bacterial clones respectively, including Proteobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes, Nitrospirae and Planctomycetes. The phylum Proteobacteria is dominant in both bacterial libraries with a predominance of Gamma-Proteobacteria. A total of 31 and 25 phylotypes were obtained from 160 and 130 archaeal clones respectively, including Miscellaneous Crenarchaeotic Group, Marine Group Ⅰ and Ⅲ, Marine Benthic Group E, Terrestrial Hot Spring Crenarchaeota and Deep-sea Hydrothermal Vent Euryarchaeota. These results show a variety of clones related to those involved in sulfur cycling, suggesting that the cycling and utilization of sulfur compounds may extensively occur in the Lau Basin deep-sea hydrothermal ecosystem. 相似文献