基于转录组数据的马氏珠母贝EST-SSR位点的信息分析及其多态性检测     

王忠良  丁燏  许尤厚  简纪常  鲁义善  王蓓  陈刚  吴灶和 《海洋与湖沼》2015,46(3):687-693

为获得稳定可靠的马氏珠母贝SSR分子标记,本文利用MISA软件对转录组测序数据进行了大规模的EST-SSR标记发掘,并分析了位点信息及其多态性。结果表明,马氏珠母贝转录组测序所获得的74007条Unigenes中检测出9872个EST-SSR位点,位点出现频率为13.34%,平均每5102 bp含有1个SSR位点。在转录组SSR中共有132种重复基元类型,其中单核苷酸重复基元为主要类型,占SSR总数的81.46%;单核苷酸重复以A/T基序为主,占SSR总数的71.27%。基于筛选的SSR序列,应用Primer3软件进行引物的批量设计,共为5922条EST-SSR序列成功设计出17766对引物。随机选择80对引物对EST-SSR多态性进行检测,共有62对引物成功扩增出稳定条带,占引物总数的77.5%;其中,17对EST-SSR引物表现出个体多态性,多态性比率为27.42%。以上研究为马氏珠母贝遗传多样性、遗传图谱构建及分子辅助育种研究提供了有效工具,对于马氏珠母贝种质资源保护、优良品种培育和珍珠养殖业的健康发展均具有重要意义。  相似文献   

温度和盐度对4种壳色马氏珠母贝谷胱甘肽过氧化物酶基因表达的影响     

《广东海洋大学学报》2015,(4)

谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)基因表达可反映生物对环境压力的抗逆能力。采用中心复合设计和响应曲面分析法研究不同温度(18~34℃)、盐度(20~40)对4种壳色马氏珠母贝GPX基因表达量的影响。结果表明,马氏珠母贝4种壳色群体GPX基因表达量随着温度和盐度的升高,呈现先降低后升高的趋势。温度的一次、二次效应对4种壳色马氏珠母贝GPX基因表达的影响有统计学意义(P0.01)。盐度的一次效应仅对黑壳色马氏珠母贝GPX基因表达影响有统计学意义(P0.05);盐度的二次效应对白壳色马氏珠母贝GPX基因表达的影响有统计学意义(P0.05),对黑、红、黄壳色马氏珠母贝GPX基因表达的影响有统计学意义(P0.01)。温盐协同效应对黑、红、黄壳色马氏珠母贝GPX基因表达的影响有统计学意义(P0.05),且温度的效应大于盐度效应。经响应曲面分析法和优化,得到马氏珠母贝的GPX基因表达量在适宜的温度、盐度范围内呈峰值变化,白、黑、红、黄等4种壳色马氏珠母贝分别在(21.4℃,30.1)、(24.8℃,28.5)、(25.2℃,30.5)、(25.1℃,29.7)等温盐度组合条件下达到最优(低)值(0.072、0.065、0.057、0.078),满意度分别为100%、100%、97%、100%。所建立回归模型方程的决定系数R2范围为0.971 3~0.995 8,校正决定系数R2范围为0.942 6~0.991 5,预测决定系数R2范围为0.713 9~0.968 0,模型拟合度高,模型恰当,可用于预测温度、盐度对4种壳色马氏珠母贝GPX基因表达量的影响。  相似文献   

马氏珠母贝Pinctada martensii珍珠囊发育的超微结构观察   总被引：1，自引：0，他引：1  

杜晓东  焦钰  邓岳文  王庆恒  黄荣莲 《海洋学报》2010,32(5):160-164

  相似文献   

EFFECTS OF CO—CULTURE AND SALINITY ON THE GROWTH AND AGAR YIELD OF GRACILARIA TENUISTIPITATA VAR LIUI ZHANG ET XIA     

贺丽虹 吴汪黔生钱培元  朱明远 《中国海洋湖沼学报》2002,20(4):365-370

Gracilaria tenuistipitata var Liui were mono-cultivated and co-cultivated with Pinctada martensii under high(33) and low(21) salinity conditions in laboratory.The daily growth rate of the alga was determined.Tissue carbon and nitrogen contents,the yield and fractional composition of agar were analyzed.Results showed that:1.Gracilaria grew better under low salinity conditions,the daily growth rate was twice that under high salinity conditions.Co-cultivated algae grew faster than mono-culti-vated algae under low salinity conditions,the daily growth rate was about 37.6?higher.2.Compared with mono-cultivated algae,tissue nitrogen contents of co-cultivated algae were higher,while the C:N ratios were much lower.3.The agar yields of co-cultivated algae were much lower than those of mono-culti-vated algae.Agar yield was found to be negatively correlated to the tissue nitrogen contents,and positively correlated to the C:N ratios.4.The highest fractional yields obtained from co-cultivated algae were extracted with 40?ethanol,while from mono-cultivated algae,the highest fractional yields obtained were extracted with distilled water at room temperature.  相似文献   

马氏珠母贝外海深水区养殖的初步研究   总被引：5，自引：2，他引：3  

黄海立  刘建勇 《广东海洋大学学报》1999,19(2):14-17

采用延绳式，浮筏式，立桩式在外海深水区进行马氏珠母贝「Ｐｉｎｃｔａｄａ ｍｑａｒｔｅｎｓｉｉ（Ｄｕｎｋｅｒ）」人工养殖试验，结果表明：经１１个月的养殖，其成活率分别为延绳式５６．３％，浮筏式３２．８％，立桩式２０．８％，而 期在 水区养殖时，其成活率分别为浮筏式２８．８％，立桩式１８．５％。  相似文献   

几种抗菌药物对马氏珠母贝D型幼虫的毒性试验     

刘志刚  王本兴 《广东海洋大学学报》1994,(2)

试验了几种抗菌药物对马氏珠母贝幼虫的毒性，结果表明，几种抗菌药物对马氏珠母贝Ｄ型幼虫９６ｈ半数耐受浓度（９６ＴＬＭ＝９６ＬＣ５０）及安全浓度分别为：氯霉素４５．４×１０－６、４．５×１０－６；红霉素５３．０×１０－６、５．３×１０－６；呋喃西林６４．１×１０－６，６．４×１０－６土霉素、百炎净、硫酸链霉素、青霉素Ｇ钠均大于１００×１０－６及１０×１０－６。但若以幼虫活力、摄食率、日生长率的变化作为观察指标，则这些药物的９６ＴＬＭ及安全浓度分别落在下述区间内：土霉素（３８～６７）×１０－６、（３．８～６．７）×１０－６；百炎净（５２～６７）×１０－６、（５．２～６．７）×１０－６；硫酸链霉素（２５～３８）×１０－６、（２．５～３．８）×１０－６；青霉素Ｇ钠仍大于１００×１０－６及１０×１０－６。下列药物在一定浓度下对幼虫的生长有明显的促进作用：青霉素Ｇ钠，百炎净（１３～３８）×１０－６；呋喃西林１３×１０－６。  相似文献   

地球内核的径向振动     

郭俊义 《武汉大学学报(信息科学版)》1997,(2)

研究了地球内核围绕其平衡位置的径向振动，即所谓Ｓｌｉｃｈｔｅｒ模，求出了这一现象的周期。在求解导出的常微分方程组时采用了切贝谢夫配点法，容易而成功地解决了方程在地心处的奇异性带来的困难。所得结果与国外目前公认的结果一致  相似文献   

利玛原甲藻腹泻性毒素的生物学测定   总被引：5，自引：0，他引：5  

邱德全  熊仕林 《热带海洋》1996,15(4):46-49,T001

１９９４年和１９９５年分季度从海南省三亚海区采集附生于褐藻上的利玛甲藻Ｐｒｏｒｏｃｅｎｔｒｕｍ ｌｉｍａ（Ｅｈｒｅｎｂｅｒｇ）Ｄｏｄｇｅ，经丙酮提取。提取液用ｐＨ＝３的水除去麻痹性贝毒（ＰＳＰ），取残留液注入小白鼠（ＢａＢ／Ｃ纯系），有腹泻性贝毒（ＤＳＰ）中毒的症状出现。初步确定此种藻中提取的毒素为ＤＳＰ。  相似文献   

有机锡对金藻（Dicrateria sp.）有毒性效应   总被引：4，自引：0，他引：4  

徐明德  杜春梅 《黄渤海海洋》2001,19(1):66-69

研究了有机锡对金藻的毒性效应，结果表明，三丁基锡（TBT）和三苯基锡（TPT）在低浓度的情况下，即或．可金藻细胞的生长和存活，室内一次培养研究显示，该2种有机锡化合物对金藻表现出很强的毒性，对生长速率的72h半数效应浓度EC50分别为0.58和0.77μg/dm^2。  相似文献   

我国珠母贝属(Pinctada)主要种类亲缘关系的初步分析   总被引：11，自引：0，他引：11  

喻达辉  朱嘉濠  贾晓平 《海洋与湖沼》2006,37(3):211-217

采用核糖体DNA内部转录间隔子1(ITS1)序列初步分析了珠母贝属8个种的亲缘关系。结果表明,ITS1长度范围分布在402—474bp之间,大珠母贝的ITS1序列最长,黑珠母贝的最短。作为外群的企鹅珍珠贝ITS1长385bp。系统发育分析表明,所研究种类聚合成3个类群。类群I包括合浦珠母贝Pinctadafucata和覆瓦珠母贝P.imbricata。类群II包括白珠母贝P.albina、黑珠母贝P.nigra、长耳珠母贝P.chemnitzi和射肋珠母贝P.radiata,其中前2个种聚合成1枝,后两个种聚合成另一枝,分别形成两个亚群类群IIA和类群IIB。类群III包括珠母贝P.margaritifera和大珠母贝P.maxima。类群IIA与类群IIB之间、类群III的大珠母贝与珠母贝之间的遗传距离较近(0.080—0.100),类群I与类群II之间遗传距离较远(0.250—0.270),类群III与类群I和类群II之间的遗传距离最大(0.400—0.570)。类群I中我国的P.fucata和澳大利亚的P.imbricata之间遗传距离很小(0.000—0.013),而两者的种内遗传距离分别为0.002—0.013和0.005,种内与种间遗传距离相重叠,表明P.fucata和P.imbricata应为同种。类群IIA的P.albina与P.nigra之间的遗传距离为0.013,可能为两个亚种。类群IIB中的P.radiata与P.chemnitzi之间的遗传距离只有0.005—0.007,而本研究的P.chemnitzi的ITS1序列与GenBank中的P.chemnitzi的ITS1序列高度一致,表明P.radiata的鉴别可能有误。  相似文献