Contrasting genetic diversity with phenotypic diversity in coloration and size in Xantho poressa (Brachyura: Xanthidae), with new results on its ecology     

Silke Reuschel  & Christoph D. Schubart 《Marine Ecology》2007,28(2):296-305

The ecology of Xantho poressa (Olivi, 1792) (Brachyura) was studied during field trips to the Mediterranean Sea, the Black Sea and the Spanish Atlantic Ocean. Our results reveal that X. poressa lives from the intertidal to the shallow subtidal zone, and inhabits relatively protected rocky shores, often with pebble underground, from juvenile to adult stages. A mark–recapture experiment revealed a high population density in this habitat. All stages, but predominantly juveniles, show a variability of colour patterns, which allow the crabs to blend in with the rocky substratum, thereby hiding from predators as passive defence. Adulthood can be reached with a carapace length smaller than 6 mm. The morphometric analysis of the species revealed allometric growth in carapace shape. Variability in overall size could be observed at different collecting sites. Neither the colour morphs nor the size differences could be attributed to differences of Cytochrome Oxidase subunit I mitochondrial DNA sequences, suggesting that ecological rather than genetic patterns are responsible for the different phenotypes.  相似文献   

用RAPD技术对养殖环境溶藻弧菌遗传多样性的研究   总被引：5，自引：1，他引：5  

陈偿  胡超群  张吕平  沈琪  陈晓燕  任春华 《热带海洋学报》2002,21(4):49-54

利用RAPD技术对不同宿主，不同环境分离的8个溶藻弧菌Vibrio alginolyticus株系进行了遗传多样性分析，8个引物共获得了46条多态性条带，将8个株系分为3个类群，不同宿主（石斑鱼Einephelus fario和凡纳对虾Penaeus vannamei)，不同环境及药物处理前后的株系之间有很高的遗传多样性，使用药物后，溶藻弧菌株系遗传多样性和基因型发生了明显的变化，而同一环境和同一时间分离的菌株之间有较高的同源性。从患病石斑鱼上分离到的致病朱与非致病株有极高的相似性，但有一个约2kb的条带的差异，该差异条带可能与溶藻弧菌的致病性相关。  相似文献   

线纹舌鳎(Cynoglossus lineolatus)18S rRNA基因长片段复制:不等交换模型(unequal crossing over model)罕见的分子证据     

龚理  时伟  杨敏  司李真  孔晓瑜 《海洋学报(英文版)》2016,35(12):38-50

尽管18S rRNA基因序列极其保守,但是在一些种类中仍然发现其存在序列多态性。本研究在线纹舌鳎18S rRNA基因中发现了3种差异显著的序列类型（Type A,B和C）,说明其为非协同进化,而不是严格遵循协同进化方式。基于以上三种类型序列GC含量、二级结构、最小自由能等差异,我们推测Type A和B可能是假基因类型。此外,在Type A类型中还发现了一段长达189 bp的重复序列。据我们所知,如此长的重复序列,这在硬骨鱼类核糖体基因中还是首次报道。通过比较分析产生重复序列常见的模型,我们认为不等交换模型最有可能解释该重复序列的形成。本研究结果不仅为不等交换模型提供了罕见的分子证据,而且为鱼类18S rRNA基因研究奠定了很好的基础。  相似文献   

论超高压变质的矿物学标志     

游振东  钟増球  索书田 《现代地质》2007,21(2):195-202

近20多年来,对超高压变质的研究日益深入。超高压变质的矿物学标志,已远远超出柯石英一种,结合实验矿物学的成果,发现许多新的矿物标志。 可以归纳为以下3类：（1）矿物的多形转变, 如柯石英和金刚石;（2）超高压矿物的出溶,如K-单斜辉石、majorite-镁铝榴石和高硅榍石;（3）超高压(高压)变质矿物或矿物组合, 如多硅白云母、文石和菱镁矿等。文中介绍了这些矿物学标志的地质学和矿物学特征及应用前景。  相似文献   

中国鲎(Tachypleus tridentatus)微卫星标记筛选及种群遗传多样性和遗传结构分析     

翁朝红  谢仰杰  肖志群  王志勇 《海洋与湖沼》2020,51(2):345-353

采用FIASCO方法构建了中国鲎(Tachypleus tridentatus)(CA)_n微卫星富集文库,对214个阳性克隆进行测序,筛选获得60条含有微卫星的序列,其中可设计引物的序列共38条。38对微卫星引物在37个中国鲎个体中PCR检测发现,只有9个位点具有多态性,其等位基因数为5—14个,每个位点平均具有8.1个等位基因。9个位点之间不存在连锁。利用该9个具有多态性微卫星标记分析了中国沿海9个中国鲎地理群体的种群遗传多样性和遗传结构。结果表明:中国沿海的中国鲎种群遗传多态性水平仍较高, 9个地方群体间无遗传差异,它们之间未见显著分化,且有着较高的基因流;推测人为的迁移是造成遗传无分化的主要原因。我们建议中国鲎已绝迹的海域可从其他海域引入中国鲎个体来恢复地方群体资源。  相似文献   

长臂缨鲆核糖体RNA基因序列多态性特征分析     

杨敏  孔晓瑜  时伟  龚理 《热带海洋学报》2019,38(1):55-66

为了解鲽形目Pleuronectiformes鲆科Bothidae长臂缨鲆Crossorhombus kobensis (Jordan & Starks, 1906) 核糖体RNA基因的序列多态性特征, 本研究共获得该鱼类包括18S、5.8S、ITS1和ITS2全长及28S部分序列的128条克隆序列。经序列比对、聚类分析以及重组检测, 结果显示5.8S (158bp) 无长度变异, 而其他4个基因片段则表现出较高的长度多态性, 并可分为不同序列类型: 18S (1856~1893 bp) 有4种序列类型A、B、C和R; 28S (967~974bp) 和ITS1 (407~ 505bp) 均有3种类型A、B和R; ITS2 (423~447 bp)存在2种类型A和B。此外5个基因片段在碱基组成中均表现出GC偏倚, 并且ITS2 (71.14%)>ITS1 (65.37%)>28S (62.22%)>5.8S (57.67%)>18S (54.95%)。对具有不同序列类型的18S、28S和ITS进行真、假基因推断时, 通常的判别特征不足以提供有力依据, 因此增加了与4种鲆科近缘鱼类长冠羊舌鲆Arnoglossus macrolophus、青缨鲆Crossorhombus azureus、大鳞短额鲆Engyprosopon grandisquama以及冠毛鲆Lophonectes gallus相应基因片段的比对。各基因片段的插入/缺失以及特异性碱基差异位点比对结果显示: 18S和28S的短序列类型A与4种鲆科鱼类序列一致, 而其他序列类型则不同; ITS1序列类型A与4种鲆科鱼类在类型B的缺失位点均无缺失, 因此推测18S、28S和ITS1的A类型为真基因, 而其他类型为假基因。ITS2的A和B类型在差异位点上与4个鲆科鱼类不存在一致性, 没有足够的依据对两个类型做出真、假基因的推断。长臂缨鲆核糖体RNA基因中, 5.8S序列最为保守遵循协同进化的方式, 而其他4个基因片段为非协同进化的方式。  相似文献   

Physical and chemical limnology of six hydroelectric lakes on the Waikato River, 1970–72     

C. H. D. Magadza 《新西兰海洋与淡水研究杂志》2013,47(4):561-572

The Waikato River flows from oligotrophic Lake Taupo through eight impoundments to the sea. As it does so, physicochemical changes occur; conductivity and dissolved oxygen levels decrease, patterns in the seasonal variation in pH and alkalinity change, and the nitrogen and phosphorus concentrations increase. Except for the changes in conductivity, changes in the other parameters are characteristic of eutrophication. This eutrophication is associated with an increase in the intensity of pastoral farming in the catchment of the Waikato River downstream of Lake Taupo.  相似文献   

刺参(Apostichopus japonicus)不同组织基因组甲基化状态MSAP分析     

郭婷婷  孙国华  杨建敏  赵强  李雪燕 《海洋与湖沼》2013,44(1):77-82

利用MSAP技术分析成体刺参的呼吸树、肠、肌肉和体壁等组织的基因组DNA甲基化水平,获得了四个组织基因组甲基化率.甲基化水平由高到低依次是呼吸树、体壁、肌肉和肠,分别是35.77％、33.51％、32.72％和28.0％,其中全甲基化位点各占19.46％、18.39％、19.18％和15.97％.统计学分析结果显示肠组织的甲基化水平与其它组织的差异显著(P＜0.05),其余三个组织间差异不显著(P＞0.05),但呼吸树与肌肉的半甲基化水平差异显著(P＜0.05).由MSAP分析差异位点克隆得到四个甲基化特异性片段,经测序分析功能未知,推测为刺参基因足非编码区或新功能基因序列.  相似文献   

凡纳滨对虾CTSL基因与生长相关的SNP位点的特征   总被引：1，自引：0，他引：1  

朱景花  李义军  王平  施泓  阮灵伟 《台湾海峡》2014,(1):53-59

对3个凡纳滨对虾品系的CTSL基因进行单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）筛查,发现在生长指标差异的对虾中存在特征较为显著的7个SNP位点,其中3个属于外显子上的突变,4个属于内含子上的突变．B210对虾品系体重月平均生长量约为7．58g,体长月平均生长量约为2．31cm,B310对虾品系体重月平均生长量约为3．96g,体长月平均生长量约为1．48cm,HNIT对虾品系体重月平均生长量约为3．04g,体长月平均生长量约为2．18em．从市场价值来看,B210和B310品系比HNTr品系生长相对好些．进一步的PCR产物直接测序比较分析表明在生长指标较好的对虾品系,这7个SNP位点表现为纯合子;而在生长指标较差的对虾品系,在这7个SNP位点上31．6％表现为杂合子．虽然国内外有不少关于CTSL基因SNP位点的报道,但是与生长快慢的相关分析还鲜有报道,且这些SNP位点与前人发现的位点有所不同．本研究发现的CTSL基因的SNP位点与对虾生长快慢相关,将为凡纳滨对虾生长研究提供有用信息,从而有助于为对虾选育提供可靠的分子标记．  相似文献   

流沙湾卵鳎微卫星标记的遗传多样性分析     

徐秀菊  刘丽  刘楚吾  申玉春 《广东海洋大学学报》2014,(4):14-18

为分析湛江流沙湾海域优势渔种卵鳎的遗传多样性,应用微卫星标记技术,选用15对微卫星引物,以等位基因数、基因杂合度、多态信息含量、固定指数等遗传参数为指标,评估卵鳎群体内的遗传多态性。结果表明:共检测到90个等位基因,等位基因数从1~12不等,平均为6.0;有效等位基因数从1.0~8.4,平均为4.0,多态性位点比例为53%,显示其具有中等杂合子水平,其中8个多态位点的期望杂合度(He)为0.670~0.881,平均为0.800,观测杂合度(Ho)为0.353~1.000,平均为0.773,多态信息含量(PIC)值为0.616~0.870,平均为0.773,群体内固定指数F为-0.199~0.564,平均为0.046;流沙湾卵鳎群体具有高度遗传多样性。  相似文献