基于SLAF测序分析3个塔形马蹄螺群体的遗传结构和多样性*     

黄景  欧泽奎  刘文广  何毛贤 《热带海洋学报》2020,39(5):1-18

塔形马蹄螺(Tectus pyramis), 海洋软体动物, 广泛分布于中国深圳大鹏湾、海南岛、西沙和南沙群岛的珊瑚礁生态系统中。文章采用特异性位点扩增片段简化基因组测序技术(SLAF-seq)对来自深圳(SZ)、三亚(SY)和西沙(XS)的塔形马蹄螺群体的遗传多样性和结构进行分析。通过测序共获得115.74Mb读长数据, 平均测序深度为337.87倍, 测序质量值(Q₃₀)平均为94.07%。研究获得118679个多态性SLAF标签, 获得846502个高度一致的群体单核苷酸多态性位点(SNPs), 其中有155个显著差异SNPs。3个群体的平均观察杂合度(H_o)和期望杂合度(H_e)值分别为0.1441~0.1611和0.2537~0.2695。平均多态性信息含量(PIC)为0.2048~0.2176。通过系统发育树分析、主成分分析和聚类分析, 将45个个体大致分为3个类群, 每个群体的所有个体都可以聚类成一个类群。SZ和SY群体的遗传结构相似, 遗传距离最低(0.2510), 遗传分化系数F_st值最低(0.0818)。但XS与其他两个群体间的遗传分化明显, 尤其是XS和SZ群体(F_st=0.1868)。3个群体的遗传分化可能与海流和地理位置有关。  相似文献   

湖南省涉水生态敏感区数据库的构建与分析     

《湿地科学与管理》2019,(4):39-43

通过资料收集和野外实地调查湖南省重要涉水生态敏感区的类型、面积、河长和空间分布等基本情况,基于Arcgis软件构建湖南省涉水生态敏感区数据库,对湖南省涉水生态敏感区进行统计分析。结果表明:湖南省涉水生态敏感区共166个,其中国家级水产种质保护区和国家级湿地公园数量分别占全省涉水生态敏感区总数的20%和17%;湘江、沅江和澧水涉水生态敏感区河长分别为2 053.8 km、1 542.84 km、1 301.27 km,分别占全省涉水生态敏感区总河长的33.38%、25.07%和21.15%。国家级水产种质资源保护区总面积3 126.65 km~2,涉及河长2 108.8 km,主要保护对象33种,其中沅江特有鱼类国家级水产种质资源保护区(沅水鲮)、澧水源特有鱼类国家级水产种资源保护区(大眼鳜、长吻鳜、鲁氏鳜、长须黄颡鱼、瓦氏黄颡鱼、光泽黄颡鱼等)和浏阳河特有鱼类国家级水产种质资源保护区(花?)具有地域特有性。目前,湖南省已形成多类型、多层次的生态敏感区保护体系,对长江流域乃至我国生态资源保护具有重要独特作用。  相似文献   

四个鲤鱼种群ITS-1序列的遗传变异分析   总被引：1，自引：1，他引：0  

钟立强  张成锋  周凯  李冰  王建新  朱健 《湖泊科学》2011,23(2):271-276

对我国四个鲤鱼种群的核糖体DNA内转录间隔区ITS-1进行了PCR扩增、测序.序列分析显示,370bp的ITS-1序列中GC含量明显高于AT含量,共检测到34个变异位点,96个样本得到14个单倍型,平均单倍型多样性为0.637±0.055,核苷酸多样性为0.00857±0.00200,遗传多样性表现较低.黑龙江野鲤种群...  相似文献   

优化改良养鲍鱼     

《海洋世界》2013,(11):46-47

鲍鱼肉质鲜美，营养丰富，深受人们喜爱。由于鲍鱼天然产量很少，所以价格昂贵。目前，很多产鲍的国家都在发展人工养殖，我国也不例外。当前，国内养殖鲍病害严重，鲍苗难培育，养殖成鲍生长缓慢，存活力低下，而种质退化、养殖生态环境恶化和养殖技术不当等是造成以上危害的关键因素。  相似文献   

基于ISSR分子标记数据的兰州百合核心种质构建方法研究     

李谋强  师桂英  叶树辉  黄彦玮  边小荣 《中国沙漠》2015,35(6):1573-1578

利用ISSR分析获得的数据,研究了依据Nei & Li、SM和Jaccard遗传距离,采用UPGMA聚类法进行逐步聚类筛选核心种质的效果,并最终采用SM遗传距离逐步聚类从175份兰州百合种质中筛选出了37份核心种质。保留了初始种质21.14%的样品,多态性位点数、多态性位点百分率、Nei's遗传多样性指数和Shannon's信息指数的保留率分别为96.08%、96.59%、105.27%、103.62%,t检验表明核心种质的Nei's遗传多样性指数和Shannon's信息指数与原种质没有显著差异,表明构建的核心种质能很好的代表原始种质的遗传多样性。  相似文献   

中国湿地中植物资源的现状和保护与利用对策北大核心CSCD     

李庞微  娄彦景  唐浩然  于冬佳  肖海丰 《湿地科学》2022,(4):517-528

掌握中国湿地中植物资源的现状是植物保护的基础。通过对相关资料的整理,系统梳理了中国湿地中植物资源的现状,针对性地提出了湿地中植物资源的保护与合理利用建议。目前,共有369种植物被开发利用;其中,272种为经济植物(包括食用植物47种、药用植物191种、工业用植物100种),89种为环境保护植物,80种为种质资源植物;有30种珍稀濒危植物,有43种国家重点保护植物(包括5种国家一级重点保护植物和38种国家二级重点保护植物)。在全球环境变化和人类活动影响加剧的背景下,建议继续加强对湿地中的植物资源的调查,建立湿地中植物资源信息库和评价系统,科学有序地开发和利用湿地中的植物资源。  相似文献   

基因间隔序列（ITS）在水产动物种质鉴定和遗传多样性分析中的应用   总被引：1，自引：0，他引：1  

徐田军  刘楚吾刘丽董秋芬  杨叶欣 《广东海洋大学学报》2006,26(1):84-88

近年来，由于国内外市场对水产品的需求不断增长，水产业因此获得了长足的发展，许多水产种类的养殖量有了大幅度的增加，在给我国国民经济的增长作出贡献的同时，已经不可避免的带来了许多弊端，一些方面甚至在一定程度上会影响未来水产业的发展。其中最应该引起关注的是由于目前捕捞强度的增加、生态环境的恶化等，导致许多种群的数量大量减少，产量也随之降低，种质资源遭到前所未有的破坏和衰退。因此，种质鉴定、种群分析及保护和遗传多样性的研究已经成为当前水产研究的当务之急。  相似文献   

《海藻遗传学》书评     

管华诗 《海洋与湖沼》2005,36(3):226-226

海藻遗传学是研究海藻遗传和变异的遗传学分支，是海藻种质改良的理论基础。第一部藻类遗传学专著《The Genetics of Algae》是1976年出版的，主编是美国藻类学家R．A．Lewin先生，此后没有这方面的专著出版。这本由中国海洋大学张学成教授、中国科学院海洋研究所秦松研究员、上海水产大学马家海教授、江苏省海洋水产研究所许璞研究员等编著的《海藻遗传学》是我国在该领域的首部专著，  相似文献   

组织培养板在获取微藻种质中的应用   总被引：3，自引：0，他引：3  

周成旭  严小军 《海洋技术学报》2006,25(4):54-57

报道一种基于选择演替和及时显微跟踪的原理获取一次野外水样中多种微藻的方法。利用组织培养板方便的显微观测条件和适宜容积提供微藻存活的空间,在不同培养条件下,进行微藻群落演替、及时显微跟踪检测和优势种分离,可以使野外水样初期低生物量种类优势化,以利于纯系种质的获得。并通过不同演替条件获得其中出现的未鉴定或初期样品中未检出的种质,提供进一步研究的基础。该方法在获取微藻种质和种质库建设上不失为一可行技术手段。论文以一次野外采集海水样品在不同营养条件下的主要优势种类演替跟踪检测、低生物量种质优势化过程和纯系种质分离为例,说明该方法在获取微藻种质中的应用。  相似文献   

远洋梭子蟹ITS-1基因片段的序列分析     

徐雪娜  吴惠仙  薛俊增  董双林 《海洋学研究》2007,25(4):74-80

采用PCR扩增和序列测定等技术,对远洋梭子蟹Portunus pelagicus核rDNA的第一内转录间隔区(internal transcribed spacer 1,ITS-1)的基因片段进行了初步研究。经PCR扩增和序列测定,得到ITS-1基因片段的碱基序列。该物种ITS-1基因片段的大小为552 bp,碱基A、T、G和C的含量分别为23.00%、25.54%、23.91%和27.54%。同时还对近年来ITS-1在十足目动物分子系统学研究中的应用作一概述并列举了已测出ITS-1序列的十足目动物种类。  相似文献