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视黄酸受体和核受体超家族中的大部分成员对细胞整个分化、增殖过程都具有调控功能。视黄酸受体结合配体后激活，通过结合靶基因启动子区特定的核苷酸序列调控靶基因表达。视黄酸受体结合序列是由核心序列[A/G]G[T/G]TCA间隔不同碱基构成的重复序列，称为视黄酸反应元件。为了实现对长牡蛎基因组中含有的视黄酸反应元件的快速筛选预测，本研究利用Perl工具编写了一个可以批量筛选视黄酸反应元件的脚本，并对长牡蛎基因组中启动子区域序列进行筛选预测，共筛选到412个启动子区含有视黄酸反应元件的基因。随后，将这些基因在各种数据库中比对分析，预测其参与的生物学过程及可能的生物学功能。结果显示，大部分基因与蛋白质结合、核苷酸结合、水解酶活性、蛋白激酶活性等功能有关。 相似文献
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几丁质是贝壳有机框架的重要组成成分，在贝类生物矿化中发挥着重要作用，然而贝壳不同部位的几丁质含量与类型是否存在差异，目前还未有报道。本研究通过脱钙、脱蛋白、漂白的方法分别从长牡蛎贝壳的壳膜、贝壳表面的角质鳞片、贝壳内侧的棱柱层与片层结构中提取到粉末状固体，并通过傅里叶红外光谱（Fourier Transform Infrared Spectroscopy, FTIR）对提取产物进行鉴定，发现这3个部位的提取产物均具有几丁质的特征吸收峰。通过对比3个部位提取产物的吸收峰，发现壳膜和角质鳞片中提取到的几丁质产物FTIR结构较为相似，其结构特征更接近于β-几丁质；而在富含钙质的棱柱层及片层结构中，几丁质提取产物在1 620 ~ 1 660 cm-1波数处有两个特征吸收峰，其结构更接近于α-几丁质。在长牡蛎壳膜、角质鳞片及贝壳内侧的几丁质提取物的含量分别为：（15.14 ± 1.13）%、（4.52 ± 0.85）%、（0.27 ± 0.12）%。3个部位中，壳膜主要由几丁质和基质蛋白构成，角质鳞片则积累了更多钙质，而贝壳内侧的棱柱层与片层结构中含有大量的碳酸钙，这导致壳膜中提取产物得率最高，而在贝壳内侧提取产物得率显著下降。 相似文献
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为探究自然海区与室内养殖环境对软体动物壳色及壳表面细菌群落多样性的影响，以黑色壳长牡蛎（Crassostrea gigas）为研究对象，在自然海区与室内环境分别暂养30 d后，对长牡蛎的壳色及壳表面细菌群落的多样性和差异细菌功能进行分析。结果表明，室内养殖的黑壳长牡蛎出现较为明显的壳褪色现象，其黑色素含量显著下降，远低于自然海区养殖的黑壳长牡蛎。16S rRNA基因测序结果显示，变形杆菌门（Proteobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、蓝细菌（Cyanobacteria）为长牡蛎壳表面的主要优势菌，其中变形杆菌的丰度超过50%。在门水平上，放线菌（Actinobacteria）、俭菌超门（Parcubateria）和Bacterial rice cluster 1（BRC1）在室内、外养殖长牡蛎之间存在较为显著的差异（P<0.05），而具有降解作用的放线菌和俭菌超门细菌在室内养殖的黑壳长牡蛎壳表面丰度较高。在属水平上，两组之间存在显著差异的细菌共计67种。该研究揭示了不同生境条件下，黑壳长牡蛎壳表面的微生物群落物种组成及差异，为解析长牡蛎壳色的形成机制提供了新的分析视角。 相似文献
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人工育苗是我国培育中间球海胆养殖业种苗的主要手段，然而传统的海胆附着基的人工育苗效果不尽如人意，尤其是在控制稚胆剥离损伤方面。目前，海上吊笼养殖是中间球海胆人工养殖最主要的养成方式之一，而随着室内工厂化养殖技术的更新和优化，海胆的室内工厂化养殖产业发展迅速并受到广泛关注。为探明以软质塑料膜作为中间球海胆附着基的育苗效果以及不同规格种苗养殖的效果，分别使用硬质波纹板和软质塑料膜作附着基进行中间球海胆人工育苗，并开展了大、小两种规格（壳径分别为0.5 cm和2.0 cm）的海胆种苗室内工厂化养殖和海区养殖研究，旨在明确软质塑料膜替代传统硬质波纹板作海胆育苗附着基的可行性以及中间球海胆室内工厂化养殖和海区养殖效果的优劣。实验结果表明：软质塑料膜在采苗效率方面与波纹板无异，但在促进稚胆生长和提高存活率方面优势显著（p<0.05）；在不同规格中间球海胆种苗的工厂化养殖和海上养成研究中，相同养殖条件下，养殖12月龄的大规格种苗相较于小规格种苗在生长和存活方面优势显著（p<0.05），同时工厂化养殖能确保更高的养殖成活率和更优的生长性能（p<0.05），然而中间球海胆的工厂化养殖在... 相似文献
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牡蛎是重要的养殖贝类，营固着生活，能聚集形成牡蛎礁，在海洋生态系统中发挥着重要作用。本研究以成体长牡蛎为研究对象，将牡蛎从附着基上剥离下来，去掉其左壳腹缘端的表面鳞片并打磨平整，露出棱柱层，将其紧密粘合于水泥砖、橡胶片、磨砂玻璃三种固着基表面，背缘端用水泥固定，观察并记录牡蛎贝壳的修复及再固着情况。结果发现：左壳损伤后，在贝壳边缘会生长出新的透明壳膜，此时壳膜虽然会紧靠固着基表面生长，但却不能再次固着；将牡蛎从固着基上剥离下来，在三种固着基表面均未发现有“附着斑”形成。因此，为了进一步研究左壳损伤后贝壳修复的分子机制以及不能再次固着的原因，对长牡蛎左壳损伤后的外套膜转录组进行了分析，发现在损伤后的第1 d、第5 d、第9 d、第13 d、第17 d和第21 d，左侧外套膜中差异上调表达的基因显著富集在TGF-β等信号通路，而下调表达的基因显著富集在对温度以及对非生物刺激反应相关通路。通过基因表达数据，还发现壳损伤后Cgfmp、CgTyr、EGF-P1等与黏附相关的基因呈下调表达，这可能是导致成体长牡蛎无法再次固着的原因。长牡蛎贝壳损伤后再固着能力的研究，为贝类生物矿化、附着等机制的研究... 相似文献
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