| 两种鲨鱼鳃部真菌菌群的PCR-DGGE分析 |
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| 引用本文： | 张翼,穆军,冯妍,阎松.两种鲨鱼鳃部真菌菌群的PCR-DGGE分析[J].海洋与湖沼,2014,45(1):183-188. |
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| 作者姓名： | 张翼 穆军 冯妍 阎松 |
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| 作者单位： | 大连交通大学,大连交通大学,大连交通大学,大连交通大学 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（面上项目，重点项目，重大项目）,中国博士后科学基金 |
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| 摘 要： | 以提取自东海海域两种鲨鱼(尖吻鲭鲨和噬人鲨)鳃耙组织的总DNA为模板,对其真菌菌群rDNA的基因内转录间隔区ITS1序列进行了PCR扩增,扩增产物经变性梯度凝胶电泳(DGGE)分离,电泳图谱中的7条主要条带经过二次PCR扩增后进行了克隆测序。NCBI-BLAST比对及分子系统发育分析结果表明,尖吻鲭鲨鳃部真菌菌群的优势种来自四个分类单元,其中一个来自青霉属,三个来自曲霉属;噬人鲨鳃部真菌的优势种来自四个分类单元,其中一种来自青霉属、两个来自梗孢酵母属、一个来自枝顶孢属;青霉属为两种鲨鱼鳃部共同的优势菌;另外DGGE指纹图谱显示还有种类较丰富的劣势菌存在。数据库检索显示多数真菌分类单元具有较好的产生生物活性天然产物的潜力。该PCR-DGGE分析揭示鲨鱼鳃部栖生有较丰富的真菌类群,它们的代谢产物及其与宿主之间的相互作用还有待深入研究。
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| 关 键 词： | 鲨鱼 鳃 真菌菌群 ITS rDNA 变性梯度凝胶电泳 |
| 收稿时间： | 2012/12/5 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2013/3/14 0:00:00 |
The PCR-DGGE analysis of fungal community in the gills of two shark species |
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| Zhang Yi,Mu Jun,Feng Yan and Yan Song.The PCR-DGGE analysis of fungal community in the gills of two shark species[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2014,45(1):183-188. |
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| Authors: | Zhang Yi Mu Jun Feng Yan and Yan Song |
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| Institution: | Dalian Jiaotong University,Dalian Jiaotong University,Dalian Jiaotong University,Dalian Jiaotong University |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sharks Gills Fungal community Internal transcribed spacer ribosomal DNA Denatured gradient gel electrophoresis |
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