| 琼东海域珊瑚共附生放线菌的多样性 |
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| 引用本文： | 周 渊,谢富全,牛文涛,郑新庆,李登峰,张改云.琼东海域珊瑚共附生放线菌的多样性[J].应用海洋学学报,2018,37(2):218-228. |
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| 作者姓名： | 周 渊 谢富全 牛文涛 郑新庆 李登峰 张改云 |
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| 作者单位： | 宁波大学;国家海洋局第三海洋研究所 |
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| 基金项目： | 国家海洋局第三海洋研究所基本科研业务费专项资金资助项目（海三科2015002） |
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| 摘 要： | 应用免培养方法与可培养方法相结合的方式对琼东海域6种珊瑚样品中的共附生放线菌进行研究,具体为滨珊瑚(Porite)、扁脑珊瑚(Platygyra)、角蜂巢珊瑚(Favites)、盔形珊瑚(Galaxea)和鹿角珊瑚(Acropora).免培养方法中,利用放线菌特异性引物对样品总DNA进行16S rRNA基因序列扩增,并将扩增产物进行Miseq高通量测序,测序结果分析表明,6种珊瑚样品中的放线菌序列属于37个分类单元,主要分布在酸微菌目、棒杆菌目、微球菌目、丙酸杆菌目和假诺卡式菌目,其中37.8%的分类单元与已有效发表菌株的序列相似性小于97%,可能代表着放线菌新的类群.可培养方法中,通过6种培养基分得137株放线菌,分属于放线菌门放线菌纲5个目11个科下的20个属,优势类群为分枝杆菌属(Mycobacterium)、考克氏菌属(Kocuria)和微球菌属(Micrococcus),其中放线孢菌属(Actinomycetospora)、柠檬球菌属(Citricoccus)和涅斯捷连科氏菌属(Nesterenkonia)是第一次从珊瑚样品中发现;琼东海域珊瑚共附生放线菌多样性丰富,新类型的放线菌资源挖掘潜力比较大.
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| 关 键 词： | 海洋生物学 珊瑚 共附生放线菌 多样性 |
Diversity of coral associated actinobacteria in the east coast of Hainan Island |
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| ZHOU Yuan,XIE Fu-quan,NIU Wen-tao,ZHENG Xin-qing,LI Deng-feng and ZHANG Gai-yun.Diversity of coral associated actinobacteria in the east coast of Hainan Island[J].Journal of Applied of Oceanography,2018,37(2):218-228. |
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| Authors: | ZHOU Yuan XIE Fu-quan NIU Wen-tao ZHENG Xin-qing LI Deng-feng and ZHANG Gai-yun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | marine biology coral associated-actinobacteria diversity |
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