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川纹笛鲷消化道优势菌群PCR-DGGE指纹图谱比较分析
引用本文:周志刚,石鹏君,姚 斌,何夙旭,苏永全.川纹笛鲷消化道优势菌群PCR-DGGE指纹图谱比较分析[J].海洋科学,2008,32(11):9-12.
作者姓名:周志刚  石鹏君  姚 斌  何夙旭  苏永全
作者单位:1. 中国农业科学院,饲料研究所,北京,100081;汕头大学,海洋生物研究所,广东,汕头,515063
2. 中国农业科学院,饲料研究所,北京,100081
3. 厦门大学,海洋与环境学院,福建,厦门,361005
基金项目:国际科技合作重点项目(2004DF100229); 中国博士后科学基金项目(2005037625); 淡水生态与生物技术国家重点实验室开放课题(2005FB05); 广东省自然科学基金项目(05300945)
摘    要:采用免培养的16S rDNA梯度凝胶电泳技术(DGGE)对集约化海水网箱养殖川纹笛鲷(Lutjanus sebae)的消化道胃壁、胃内容物、肠壁、肠内容物优势菌群结构进行了比较分析。研究结果显示,川纹笛鲷消化道存在着丰富多样的细菌群落,对DGGE指纹图谱聚类分析表明菌群组成相似度高于55%,其中胃内容物及胃壁细菌组成相似度最高(90%),这可能与摄食饵料在消化道推移有关;而胃壁与肠壁相似度相对最差,可能反应了由于生理环境不同引起的宿主差异性。通过建立川纹笛鲷消化道16S rDNA-DGGE指纹图谱及比较分析,为澄清川纹笛鲷消化道微生物区系奠定了基础。

关 键 词:川纹笛鲷(Lutjanus  sebae)  16S  rDNA  梯度凝胶电泳  指纹图谱
收稿时间:2005/12/6 0:00:00
修稿时间:2008/9/12 0:00:00

Comparison of the PCR-DGGE fingerprints in the gastrointestinal predominant bacterial community in Lutjanus sebae
ZHOU Zhi-gang,SHI Peng-Jun,YAO Bin,HE Su-xu,SU Yong-quan.Comparison of the PCR-DGGE fingerprints in the gastrointestinal predominant bacterial community in Lutjanus sebae[J].Marine Sciences,2008,32(11):9-12.
Authors:ZHOU Zhi-gang  SHI Peng-Jun  YAO Bin  HE Su-xu  SU Yong-quan
Abstract:The comparison of the predominant bacterial community structure in the gastro-intestine in Lutjanus sebae based on 16S rDNA PCR-DGGE fingerprint using a culture-independent method was conducted in present research.The results showed that abundant bacterium existed in the gastro-intestine of Lutjanus sebae,the similarity was above 55% in the community structures in the gastro-intestine with the highest similarity of 90% in the bacteria ingredients between the stomach wall and the sto-mach content,which might...
Keywords:Lutjanus sebae  16S rDNA  DGGE  fingerprint  
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