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1.
利用 ISSR 分子标记技术对采自浙江省南麂岛和渔山列岛的4株不同形状野生坛紫菜(Porphyra haitanensis)进行了遗传多样性分析.从33条引物中筛选出11条可扩增出清晰条带的引物,在4株坛紫菜中共扩增出62条 DNA 带,其中多态性条带比例达88.71%.遗传距离分析表明4株坛紫菜之间的遗传距离范围是0.3226~0.6129,聚类分析结果表明渔山列岛坛紫菜遗传距离最近,而南麂岛的两株坛紫菜则距离相对较远.该研究说明浙江附近岛屿的野生坛紫菜遗传多样性丰富 相似文献
2.
本研究通过对线粒体控制区序列进行分析的技术手段,对中国宁德（ND）、厦门（XM）、漳浦（ZP）、南澳岛（NAD）、湛江（ZJ）、海口（HK）与北海（BH）的7个野生黄鳍棘鲷（Acanthopagrus latus）群体的遗传多样性和遗传分化进行比较分析。结果表明：中国东南沿海的野生黄鳍棘鲷群体呈现出中等以上的遗传多样性特征,48个黄鳍棘鲷样品的控制区序列长度为580 bp,单倍型数目为44个,总体的单倍型多样性指数（Hd）和核苷酸多样性指数（Pi）分别为0.996和0.017 30。7个野生黄鳍棘鲷群体间的遗传分化程度较低,各群体间的遗传距离为0.010 28~0.029 87。群体间的遗传分化系数（FST）为-0.068 41~0.545 86,北海群体和其他群体间存在一定程度的遗传分化。AMOVA分析显示群体内的遗传变异占比为83.34%,大部分遗传变异发生在组群内;但北海群体与其他6个群体分为两个组群后,组群间的遗传变异占比为42.66%,两个组群间存在较大程度的遗传变异。基于Kimrua距离法构建的系统进化树中显示北海群体聚为一个分支,另外6个群体聚为一支。基于TCS network构建的单倍型网络图中44个单倍型混杂在一起,未按照水系格局和地理距离进行分布,表明黄鳍棘鲷群体间未形成多个单系群。本研究可为中国东南沿海野生黄鳍棘鲷群体的种质资源利用和保护提供科学依据。 相似文献
3.
马氏珠母贝两个与生长性状相关QTL 的验证 总被引：2，自引：0，他引：2
利用2个马氏珠母贝群体对遗传连锁图谱已经定位的,与马氏珠母贝生长性状相关的数量性状位点(Quantitative trait locus,QTL)中的两个进行验证。结果显示:m59标记在2个群体中与壳高、壳长、壳宽和总重具有显著的相关性(P0.05),其GT基因型的个体壳高、壳长、壳宽和总重均显著高于GG基因型的个体;154165标记在湛江群体中与壳高具有显著相关性(P0.05),而在深圳群体中与壳宽具有显著相关性(P0.05);表明QTL标记m59在2个群体中是共享QTL,而154165标记在群体中是特异QTL。基于这两个QTL在这2个群体中分别构建二倍型,发现在湛江群体中二倍型C_1(AAGT)和深圳群体中D_1(AGGT)型和D_2(AAGT)型对马氏珠母贝生长最为有利,可作为优先的基因型组合。 相似文献
4.
菲律宾蛤仔不同地理群体生化遗传结构与变异的研究 总被引：2，自引：0，他引：2
采用聚丙稀酰胺凝胶电泳技术对福建平潭岛、浙江象山港、江苏海州湾和辽宁辽东湾4个海区菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)野生群体的生化遗传特征进行了分析.结果表明,菲律宾蛤仔4个群体的多态位点比例为62.5%～75.0%,平均杂合度观测值在0.274 3～0.338 7之间,与平均杂合度期望值相近;平均有效等位基因数在1.489 1～1.632 5之间,遗传变异水平较高;杂合子缺失不显著.比较群体间的遗传分化指数和群体每代迁移数发现,平潭岛、象山港和海州湾3个群体间的遗传分化不显著,而辽东湾群体与3个群体间出现遗传差异.聚类分析同样表明,平潭岛群体首先与象山港群体聚类,再与海州湾群体相聚,最后与辽东湾群体相汇.讨论了杂合子缺失不显著原因和群体间遗传分化机制. 相似文献
5.
传统的形态鉴定主要依赖于分类者的经验和水平,容易产生分类错误。为提高物种鉴定的准确性,作者采用形态学与线粒体16S rRNA基因序列分析相结合的方式对广西北海涠洲岛采获的3种珍珠贝进行了鉴定。研究结果表明,基于形态学可将3种珍珠贝分别鉴定为企鹅珍珠贝(Pteria penguin)、宽珍珠贝(P.loveni)和中国珍珠贝(P.chinensis),但基于16S r RNA基因序列,形态学鉴定为P.loveni的标本应为P.lata。P.loveni和P.lata是两个完全独立的种,并非为同物异名。珍珠贝属16S rRNA基因序列的种间遗传距离明显大于种内遗传距离,适宜作为该属种类鉴定的分子标记。在基于16S r RNA基因序列构建的系统树中,相同种类的不同个体均形成单系群,并获得很高的支持率。分布于中国沿海的珍珠贝属种类应包括P.lata,是否有P.loveni的分布尚需进一步证实。 相似文献
6.
Seagrass beds degraded significantly since the last century on both, global and local scale. The seagrass species Enhalus acoroides (Linnaeus f.) Royle is a common species found in almost all marine ecosystems including bays, lagoons and around offshore islands in tropical regions of the West Pacific. It was shown that genetic diversity is an essential indicator of the conditions of ecosystems. In the present study, microsatellite markers were used to assess the genetic diversity and population structure of six distinct seagrass beds along the coast of the Khanh Hoa Province, Vietnam. The results indicate that the genetic diversity of the populations in the open sea is higher than in the lagoon. Seagrass beds occurring in disturbed sites show reduced genetic diversity. The fixing index value (FST) depicts a relatively high genetic structure among populations. Structure analysis clusters the populations into open sea and lagoon populations and cluster analysis and AMOVA indicate a significant difference between the two groups. There are low but non-significant positive correlations between geographic and genetic distances. The different habitats of the open sea and the lagoon are probably responsible for forming two groups. 相似文献
7.
Phylogeographic study on the chub mackerel (Scomber japonicus) in the Northwestern Pacific indicates the late Pleistocene population isolation 
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下载免费PDF全文 Shuai Yan Gaetano Catanese Christopher L. Brown Ming Wang Chaopin Yang Tingbao Yang 《Marine Ecology》2015,36(3):753-765
In the present study, the population genetic structure and historical demography of the chub mackerel, Scomber japonicus, in the Northwestern Pacific were examined based on the full‐length sequences of the mitochondrial control region and cytochrome b gene. A total of 320 individuals was sampled from 11 localities along the coast of China and Japan from August 2011 to May 2013. Two main clades representing Chinese and Japanese populations, respectively, were detected, suggesting population isolation of S. japonicus during the late Pleistocene era. The Chinese clade was further divided into two small clades and the distribution of haplotypes were not related to sampling locality, which may be a signature of secondary contact following past division. Analyses of molecular variance and pairwise FST revealed significant genetic differentiation between the Chinese and Japanese populations, but a lack of genetic structure for the populations along the coast of China. Both neutrality tests and mismatch distribution analysis suggested that the populations along the coast of China experienced population expansion during the late Pleistocene. Historical events, biological characteristics and other extrinsic forces such as ocean currents may all be associated with the current phylogeographic pattern of S. japonicus in the Northwestern Pacific. 相似文献
8.
辽宁沿海菲律宾蛤仔不同地理群体形态差异研究 总被引：1，自引：0，他引：1
利用多变量形态度量学方法,对辽宁沿海菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)长兴岛(CXD)、旅顺(LS)、营口(YK)、盘锦(PJ)、锦州(JZH)、海洋岛(HYD)、黑石礁(HSJ)以及金州(JZ)8个野生群体进行形态学比较分析。结果表明:主成分分析得到了3个主成分,贡献率分别为40.21%,19.98%和11.57%,累积贡献率为71.75%。聚类分析结果显示,旅顺群体和锦州群体形态最为接近,而与黑石礁群体差异较大。营口群体的趋异程度最大,长兴岛群体、金州群体和海洋岛群体的趋异程度居中。长兴岛群体壳型最扁,贝壳较厚且重;营口群体软体部最肥;金州群体壳型"凸"型最明显,且质量最大,而黑石礁群体贝壳最薄。这些明显特征揭示了不同群体的形态差异。研究结果为菲律宾蛤仔的地理群体识别、种质资源保护与恢复提供了重要依据。 相似文献
9.
Kensuke Iwamoto Akihiro Takemura Tetsuo Yoshino Hideyuki Imai 《Journal of Oceanography》2009,65(1):103-112
The mitochondrial DNA (mtDNA) control region was sequenced to examine the genetic variability and gene flow of juvenile Siganus spinus and S. guttatus. In total, 461 nucleotide sequences were obtained from 69 specimens of juvenile S. spinus from Okinawa Island and Ishigaki Island, in which 17 variable sites and 22 haplotypes were identified. Haplotype diversity
(h) was high (0.9244 in Okinawa and 0.8984 in Ishigaki), whereas nucleotide diversity (π) was low (0.0063 in Okinawa and 0.0059 in Ishigaki). The two populations were not genetically distinct. Siganus guttatus, which do not form large schools at recruitment, in contrast S. spinus, were also analyzed by studying 152 individuals collected off Okinawa Island, Miyako Island, and Ishigaki Island. Of 476
nucleotide sequences, 50 were variable, and 42 haplotypes were identified. Genetic variability values were high (h = 0.8766 and π = 0.0151 in Okinawa; h = 0.9640 and π = 0.0192 in Miyako; h = 0.9161 and π = 0.0199 in Ishigaki). The Okinawa population was genetically isolated from the Miyako and Ishigaki populations. As a result,
genetic diversity was high for each of these siganid populations despite their being target species for fisheries; however,
the degree of inter-population gene flow was higher for S. spinus than S. guttatus, suggesting that these species exhibit different dispersal strategies. 相似文献
10.
在对历年来在中国近海采集的滨螺科(Littorinidae)贝类标本进行系统整理和研究的过程中,鉴定出隶属于豆滨螺属Peasiella的2个物种:波部豆滨螺Peasiella habei D. ReidMak, 1998和罗豆滨螺Peasiella roepstorffiana Nevill, 1885。标本采自中国山东省及海南省沿海区域,栖息于潮间带及浅海的礁石上。本文对2个物种的贝壳形态、齿舌特征及地理分布等方面进行了详细描述,并对其分类地位以及主要鉴别特征进行了讨论,提出齿舌数量及排列方式即齿式为该属物种区分的重要依据。同时,将张氏马蹄螺Trochus zhangi Dong,2002归于罗豆滨螺Peasiella roepstorffiana Nevill,1885的次异名。 相似文献
11.
为研究东海区厚壳贻贝(Mytilus coruscus)遗传多样性,以厚壳贻贝F mtDNA D-loop为标记,对浙江省舟山嵊山岛、宁波渔山岛、温州南麂岛、福建省宁德湾和莆田南日岛五个海区的厚壳贻贝群体进行了遗传分析。结果表明,厚壳贻贝各群体的遗传多样性差异不明显,在5个群体中,宁德群体的遗传多样性相对最丰富;将5个群体作为一个整体时,呈现出较高的单倍型多样性和较低的核苷酸多样性。对厚壳贻贝5个群体间的遗传分化系数(Fst)和基因流(Nm)进行检测,结果显示群体间Fst值都很低,但Nm值都很高(Nm绝对值1),表明5个群体间存在丰富的基因交流。但宁德群体与浙江沿海的3个群体(嵊山、渔山、温州)的Fst值相对较高,且差异显著(P0.5),表明宁德群体与这3个群体间出现遗传分化。本研究旨在为海洋经济贝类资源的保护管理提供理论依据。 相似文献
12.
为了弄清北部湾涠洲岛6株疑似红色赤潮藻（Akashiwo sanguinea）株的种类,作者采用光学显微镜和荧光显微镜对其进行形态学初步鉴定;并对藻株SSU rDNA、LSU rDNA和ITS序列测序,利用最大似然法构建系统发育树。结果表明,北部湾涠洲岛6株藻与红色赤潮藻形态特征基本符合;3种序列系统发育树分析均发现北部湾涠洲岛6株藻与不同海域来源的红色赤潮藻聚在同一大分支上,自展值高达99、100、100;与来自亚洲海域的韩国安山株、新加坡株、中国厦门港株序列差异最小,亲缘关系最近,而与其他地理来源的红色赤潮藻序列差异大,亲缘关系较远。红色赤潮藻SSU、LSU、ITS种内遗传距离分别为0.001~0.008、0.003~0.025和0.045~0.406,明显小于该藻与其他裸甲藻科（Gymnodiniaceae）藻属下的种间遗传距离0.032~0.072、0.165~0.222和0.589~1.559,因此可确定北部湾涠洲岛6株藻均为红色赤潮藻。研究结果将为北部湾海域赤潮生物来源与组成、赤潮的发生与管理提供基础信息。 相似文献
13.
紫扇贝和海湾扇贝杂交家系的生长和通径分析 总被引：2，自引：0，他引：2
以紫扇贝(Argopecten purpuratus)和海湾扇贝(Argopecten irradians irradians)为亲本,建立了紫扇贝自交(ZZ)、海湾扇贝自交(HH)、紫扇贝(卵)×海湾扇贝(精)(ZH)和海湾扇贝(卵)×紫扇贝(精)(HZ)共4个试验家系.在养殖60、127 d时测定壳高、壳长、壳厚和体质量,并分析各养殖时期影响体质量的主要因素.结果表明:在各养殖时期,2杂交家系子代的壳高、壳厚以及体质量均表现出生长优势(P＜0.01),因此认为通过紫扇贝和海湾扇贝杂交方式是改善扇贝的良好方法.通径分析的结果表明,对于自交家系,壳长是影响体质量的主要影响因素,但对于杂交家系HZ来说,壳长(60 d)和壳厚(127 d)对体质量的决定作用最大;在杂交家系ZH,60 d时壳长和壳厚的协同作用对体质量的决定作用最大,127d时壳高的决定作用最大.因此对于两个杂交家系的选育,应按照不同性状对体质量的决定系数选择各时期的优势性状,以使子代的杂种优势充分表现. 相似文献
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Sara Fratini Lorenzo Zane Lapo Ragionieri Marco Vannini Stefano Cannicci 《Estuarine, Coastal and Shelf Science》2008,79(4):679-686
The “genetic erosion” hypothesis posits that heavy metal stress is related to a loss of genetic diversity at the population level. The genetic diversity of natural populations can, however, be affected by natural processes as well as by human impact. We studied the relationship between heavy metal bioaccumulation and genetic variability in the intertidal crab Pachygrapsus marmoratus. Tissue samples were collected from 40 individuals inhabiting four polluted and four unpolluted sites along the Tuscan coast (Mediterranean basin), and were examined for four heavy metals (arsenic, As, cadmium, Cd, lead, Pb, and copper, Cu). We also assessed the genetic variability of 235 crabs from the same localities using six microsatellite loci.Our results show that the bioaccumulation levels of these individuals accurately reflect the levels of pollution in their immediate environment, and that heavy metals accumulate more in the hepatopancreas than in the gills. Moreover, populations from polluted sites have significantly less genetic variability, measured as mean standardized d2, and a significantly lower percentage of unrelated individuals, than populations from unpolluted sites. This evidence supports the “genetic erosion” hypothesis for metal heavy exposure in natural environments. 相似文献
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engrailed基因属于同源异形基因家族成员,在许多动物的分节、附肢发育、神经系统发育和贝壳形成过程中发挥作用。本研究克隆了长牡蛎两个engrailed同源基因,命名为cgi-eng1和cgi-eng2。序列分析表明,两个基因均具备典型engrailed基因保守的5个EH结构域。利用整装原位杂交技术检测了cgi-eng1和cgi-eng2在贝壳形成的关键时期早期D形幼虫时期的表达情况。结果显示,cgi-eng1和cgi-eng2 m RNA高表达于贝壳外缘,可能与早期贝壳形成过程有关。此外,两个基因的在贝壳外缘的表达模式亦有区别,提示两个基因的功能可能存在一定程度的分化。本研究首次系统鉴定了长牡蛎engrailed基因的成员,并发现它们可能均参与幼虫贝壳形成,研究结果有助于加深对贝类早期发育及贝壳形成的理解。 相似文献
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不同养殖海域栉孔扇贝(Chlamys farreri)混合家系的通径分析 总被引：3，自引：0，他引：3
为了深入认识栉孔扇贝(Chlamys farreri)壳尺寸性状和体重之间的关系,达到通过直观可见形状判断非直观性状,在栉孔扇贝苗种培育中指导种贝挑选工作的目的,本实验将600余只扇贝分别于三个不同纬度养殖环境(山东青岛、山东荣成和辽宁大连)下养殖一年后测量其性状数据,包括壳长、壳高、壳宽、体重,进行壳尺寸性状对体重性状的通径分析。偏回归系数统计表明,除大连海域壳长对体重的偏回归系数为0.266,差异不显著(P0.05)外,其它参数对体重均极显著(P0.01),表明大多数自变量和因变量之间都有极显著的共线性关系。对各个海域建立以壳尺寸为自变量,体重为因变量的回归方程,得出通径系数、各性状间的相关性指数以及各参数对体重的决定系数,计算出了不同养殖地点的栉孔扇贝壳尺寸性状和体重之间关系的回归方程。通径分析显示,对青岛海域栉孔扇贝体重直接作用最大的是壳高,对荣成海域栉孔扇贝体重直接作用最大的是壳长,而对大连海域栉孔扇贝体重直接作用最大的是壳宽。因此,以体重为目标挑选青岛海域的种贝时,应以壳高为优先选择指标;挑选荣成海域的种贝时,优先选择壳长;挑选大连海域的种贝时,优先选择壳宽。不同养殖海域栉孔扇贝的通径分析为栉孔扇贝亲贝的挑选提供了理论支持。 相似文献
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壳色是影响商品贝类经济价值的重要性状。本研究以不同壳色的硬壳蛤（Mercenaria mercenaria）群体为繁殖亲贝，采用个体间随机交配的方法，成功选育了白、红和杂3种壳色的子代群体，并在池塘培育至360日时测量了其壳长（X1）、壳高（X2）、壳宽（X3）及活体质量（Y），并使用相关性分析、主成分分析和通径分析等方法，探究了不同壳色硬壳蛤在幼虫期和稚贝期的生长性状差异及壳形态性状（壳长、壳高、壳宽）对活体质量的影响。研究结果表明：在幼虫期，与白色和红色群体相比，杂色群体生长速度更快、变态率更高，但存活率低（P<0.05）；在稚贝期，白色群体表现出显著的生长优势（P<0.05）。相关性分析结果显示，3种壳色硬壳蛤的壳形态性状（X1、X2、X3）与活体质量（Y）的相关系数均达极显著水平（P<0.01）。主成分分析和通径分析结果表明，硬壳蛤的壳长（X1）是影响其活体质量（Y）的主要因素。本研究结果能够为不同壳色硬壳蛤良种选育提供重要理论依据和基础数据。 相似文献
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肉芝软珊瑚属(Sarcophyton)是珊瑚礁生态系统中常见的软珊瑚,具有极强的药用价值.我国肉芝软珊瑚种类资源十分丰富,但目前国内对此种珊瑚的分类研究处于停滞状态,肉芝软珊瑚外部形态差异较小,难以直接进行种类鉴定.本研究采集海南省三亚市西瑁岛、万宁市甘蔗岛和大洲岛珊瑚礁区的26个肉芝软珊瑚样品,根据骨针形态学初步鉴定,并分析线粒体msh1基因和COI基因序列进行种类鉴定.结果显示:所有采集的26个样品,鉴定为5个种,分别为:Sarcophyton cherbonnieri、Sarcophyton crassum、Sarcophyton trocheliophorum、Sarcophyton glaucum和Sarcophyton ehrenbergi.其中S. cherbonnieri和S. crassum为我国新纪录种.本研究为海南岛附近海域肉芝软珊瑚的鉴定提供参考,并为我国软珊瑚种类鉴定和生物多样性的研究提供基础数据. 相似文献
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真江蓠是原产于西北太平洋的重要经济红藻。我们利用10对微卫星引物检测中国黄渤海地区真江蓠的群体遗传多样性和结构。10个微卫星位点在12个群体中共检测到65个等位基因,每个位点的等位基因（Na）为1~28,有效等位基因（Ne）为1.0~9.6。每个群体的平均等位基因（Na）、平均有效等位基因（Ne）、平均香浓指数（I）、平均观察杂合度（Ho）和平均预期杂合度（He）分别为2.4、1.6、0.419、0.133和0.227,显示较低的群体遗传多样性。中国黄渤海12个真江蓠群体间遗传分化较大（Fst=0.398 7）,基因流有限（Nm=0.377 1）,近交系数为正（Fis=0.391 3,Fit=0.634 0）,表明可能存在近交和杂合子缺失现象。Structure和UPGMA系统进化分析一致将12个群体分为两个遗传组,并在黑石礁群体（HS）和石岛群体（SD）中发现明显的遗传混杂现象。AMOVA分析显示遗传变异主要来自于群体内（73.27%）。该研究可为黄渤海地区真江蓠自然资源保护和管理提供科学依据。 相似文献