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中国对虾遗传多样性的RAPD分析──朝鲜半岛西海岸群体的DNA多态性 总被引：29，自引：4，他引：25
１９９７年４月自黄海越冬场采集中国对虾朝鲜半岛西海岸群体样品。采用ＲＡＰＤ对该群体共３３个个体的基因组ＤＮＡ多态性进行了检测。利用２０个随机寡核苷酸引物共检测１０５个位点,其中多态位点４１个,占３９％,单个引物获得的标记为１￣１０个,分子量为１８０－２２００ｂｐ,个体间的平均遗传距离为０．０９３,群体的平均杂合度为０．２１７６。表明该对虾群体的遗传多样性较低,低水平的遗传多样性一方面使中国对虾的生 相似文献
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RAPD标记在大连湾牡蛎种群研究中的应用 总被引：10，自引：3，他引：7
对四个不同地点（莱州，荣成，青岛和日照）的大连湾牡蛎（Ｃｒａｓｏｓｔｒｅａｔａｌｉｅｎｗｈａｎｅｎｓｉｓ）进行了ＲＡＰＤ分析，结果表明相邻两地种群的遗传距离不明显。地理相距越远，遗传距离越大。莱州种群中具有ＯＰＫ１１—６８５标记，日照种群具有ＯＰＫ１１—７８０标记。上述两地之间的青岛和荣成种群中，６２．５％的个体同时具有这两个标记；只有２０％的个体为ＯＰＫ—７８０标记。莱州和日照种群间的基因流动有一定的局限性，而位于这两地之间的种群存在明显的基因流动现象 相似文献
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用ＲＡＰＤ技术对东方Ｔｕｎ属的红鳍东方Ｔｕｎ和假晴东方Ｔｕｎ共三个群体进行分析,经２０个随机引物扩增,得到每一个体的多态片段。比较所有图谱,没有发现能够鉴别三个群体的特异性谱带,而且采自日本的红鳍东方Ｔｕｎ与采自中国的东鳍东方钝的电泳图谱基本相似。 相似文献
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石莼属(Ulva)和浒苔属(Enteromorpha)绿藻的RAPD分析 总被引：9，自引：1，他引：8
于１９９７年下半年在大连石油庙海区采集石莼、孔石莼、砺菜、缘管浒苔、肠浒苔、管浒苔、刚毛藻等７种海藻样品,采用ＲＡＰＤ技术对大连地区绿藻门石莼属和浒苔属进行了初步的分子系统学研究。所试６０个引物中有３２个经扩增得到了２３７个多态片段。应用ＰＨＹＬＩＰ软件包,按照ＵＰＧＭＡ法和Ｎ－Ｊ法聚类分析的结果均表明,缘管浒苔（Ｅｎｔｅｒｏｍｏｒｐｈａ ｌｉｎｚａ）与石莼属有较近的亲缘关系,应深水探究其分类地位 相似文献
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RAPD标记鉴别红鳍东方鲀和假睛东方鲀种群的初步研究 总被引：8，自引：0，他引：8
用ＲＡＰＤ技术对东方纯属（Ｆｕｇｕ）的红鳍东方鲀（Ｆｕｇｕ ｒｕｂｒｉｐｅｓ）和假睛东方鲀（Ｆｕｇｕｐｓｅｕｄｏｍｍｕｓ）共三个群体进行分析,经２０个随机引物扩增,得到每一个体的多态片段。比较所有图谱,没有发现能够鉴别三个群体的特异性谱带;而且采自日本的红鳍东方纯与采自中国的红鳍东方鲀的电泳图谱基本相似。结果还表明,红鳍东方纯与假睛东方鲀电泳图谱的差异也甚小,说明二者的亲缘关系非常接近,这与以前用同工酶进行分析的结果相一致（王可玲等,１９８４）, 相似文献
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长江中华鲟遗传多样性变化 总被引：1，自引：0，他引：1
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对2000年共30尾长江中华鲟(Acipenser sinensis)幼鲟遗传多样性进行了分析。共用40个10bp长的随机引物,在25个可分析的引物中,只有OPK01,OPK02,OPK03,OPK09和OPK14RAPD-PCR产物有多态现象,多态引物占20%。25个引物共扩增出101条稳定的DNA带。其中12条为多态带,多态座位比例为9.9%。香农遗传多样性指数(H0)为2.6332,遗传多样性指数(H)为0.0261,遗传相似性指数平均为0.9824,遗传距离平均为0.0176。其遗传多样性明显低于葛洲坝截流以前。 相似文献
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星斑川鲽(Platichthys stellatus)养殖群体的RAPD分析 总被引：4，自引：2，他引：4
利用RAPD技术对星斑川鲽养殖群体的遗传多样性进行了研究。将实验用星斑川鲽养殖群体的活鱼苗解剖,取其肌肉,高盐法抽提获得总DNA,质量鉴定和浓度测定后用随机引物进行PCR扩增,从20个随机引物中筛选出18个用于群体遗传学分析,共扩增出133条带,谱带大小为100~2 000 bp,大多数谱带分布在250~1 000bp。多态谱带数为83,每个引物扩增谱带数为1~14条,平均为7条。多态谱带比例为62.41%,Shannon的信息指数和Nei的多样性指数分别为0.21和0.316 6。 相似文献
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进口大菱鲆Scophthalmus maximus L.苗种的遗传结构分析 总被引：20，自引：6，他引：20
利用随机扩增多态性DNA(RAPD)和微卫星两种分子标记技术分析了从法国(F)、英国(E)、西班牙(S)引进我国的三个大菱鲆群体的遗传结构。20个RAPD随机引物对每个群体各20尾大菱鲆的基因组DNA进行扩增，共获得125个重复性好且谱带清晰的RAPD标记，片段大小在200—2500bp之间，三群体的多态位点比例在12．80％—20．00％之间，Nei基因多样性指数在0．0142—0．0352之间，Shannon多样性指数在0．0423—0．0720之间。微卫星引物的分析结果与RAPD一致。总体上，三个群体的遗传多样性均较低，其中西班牙群体遗传多样性水平最高，英国群体次之，而法国群体最低。利用Shannon多样性指数和Nei多样性指数估算群体遗传变异的来源，两者得出一致的结论：群体问遗传分化很弱。AMOVA分析结果进一步证实了shannon多样性指数和Nei基因多样性指数的分析结果：群体的遗传变异有97％以上是由群体内个体问的遗传变异引起的，遗传变异主要来自于群体内个体间，显著性检验表明群体间的变异对总变异的影响不显著。实验结果证明我国进口大菱鲆群体种质较单一。 相似文献
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大黄鱼(Pseudosciaena crocea)岱衢洋选育群体和官井洋养殖群体的遗传差异分析 总被引：8，自引：0，他引：8
应用RAPD技术对大黄鱼岱衢洋选育群体和官井洋养殖群体的遗传差异进行研究,选取15条10bp随机引物,共检测出96个RAPD位点。结果表明,岱衢洋选育群体的多态位点比例为33.33%,平均杂合度为0.3008,Shannon多样性信息指数为0.0879,群体内个体间平均遗传相似系数为0.9079,平均遗传距离为0.0921;官井洋养殖群体的多态位点比例为43.75%,平均杂合度为0.3298,Shannon信息指数为0.1221,群体内个体间平均遗传相似系数为0.8784,平均遗传距离为0.1216。大部分遗传变异(93.52%)存在于群体内,少部分遗传变异(6.48%)存在于群体间。两群体间的Nei氏标准遗传距离为0.0123。以上分析表明,大黄鱼官井洋养殖群体的遗传多样性水平高于岱衢洋选育群体,但两个群体都处于较低的遗传多样性水平,需要对大黄鱼的种质资源进行科学管理和保护,以避免遗传多样性下降。 相似文献
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采用随机扩增多态性DNA技术,对花鲈(Lateolabrax japonicus)皮肤溃疡病抗性和敏感两个群体的遗传多样性进行了研究.从100个10 bp随机引物中筛选出25个随机引物,在两个群体中共扩增了326个位点,抗性群体多态住点比率为44.24%,遗传变异度为0.123 7,Shannon多样性值为0.1149,分别比敏感群体高3.87%,5.82%和2.68%,表明花鲈抗病群体比敏感群体具有更丰富的遗传多样性.25条随机引物中,7条引物在两群体中的扩增结果存在差异,其中S11,S15,S4,S414,S416,S9在抗性群体的扩增结果比敏感群体多1个多态住点,S52多2个多态位点.在这8个特异多态位点中,S52-1,S4-1,S414-6,S9-2在敏感群体中全部出现,呈单态性;S15-5,S11-6,S416-6,S52-5只在抗性群体中出现,出现频率分别为38.5%,30.8%,23.1%和23.1%.说明这8个位点在两群体中存在较大的差异.研究表明,花鲈皮肤溃疡病在遗传上是比较复杂的,并不是简单地与某个遗传标记有关,可能与多个遗传因素相关. 相似文献
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利用RAPD和ISSR两种分子标记技术,分析了丹江口水库野生赤眼鳟30个个体的遗传多样性。用11个RAPD引物对其基因组DNA进行扩增,共获得101个重复性好且谱带清晰的扩增位点,片段大小在100—3000bp之间,其中多态性位点63个,多态位点比例为62.38%;个体间遗传距离在0.1049—0.3417之间,平均为0.1742。用10个ISSR引物共检测到88个位点,其中多态性位点61个,多态位点比例为69.32%;个体间遗传距离在0.1088—0.3847之间,平均为0.1907。结果显示,丹江口水库野生赤眼鳟群体的多态位点比例和平均遗传距离均较大,说明其有较高的遗传多样性。 相似文献
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几种紫菜种质资源遗传多样性的RAPD分析 总被引：10，自引：0，他引：10
用随机多态DNA(RAPD)标记方法对11个紫菜(Porphyra)样品进行遗传多样性检测,从46个随机引物中筛选出27个有效引物,共扩增出282条DNA带,其中多态位点224个,占79．4％。用类间平均链锁法对各样品间的遗传距离进行聚类分析。结果显示,2个条斑紫菜之间的亲缘关系很近,遗传相似系数达98．1％,和坛紫菜的亲缘关系较远;坛紫菜不同样品间的遗传相似系数在75．8％～90．6％之间,表明坛紫菜种质资源具有丰富的遗传多样性,是良种选育的遗传基础。 相似文献
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翡翠贻贝3个野生种群遗传多样性分析 总被引：10，自引：0，他引：10
采用表型性状、RAPD和ISSR分子标记对取自广西北海、广东湛江和汕尾的3个翡翠贻贝Perna viridis种群进行遗传多样性分析。翡翠贻贝种群间表型性状(壳长、壳高、壳宽、软体部重、体重和肥满度指数)存在显著的差异(p<0.05)。11个RAPD引物共扩增出114条带,扩增片断大小为237—2099 bp,种群的多态性位点比例和遗传多样性指数分别为57.14%—60.78%和0.174 8—0.190 1。10个ISSR引物共扩增出134条带,扩增片断大小为218—2 695 bp,种群的多态性位点比例和遗传多样性指数分别为72.48%—75.22%和0.245 7—0.253 4。RAPD和ISSR分析都表明汕尾与北海翡翠贻贝种群间的遗传距离最大。结果表明,(1)翡翠贻贝种群具有较高的遗传多样性;(2)RAPD与ISSR标记适合于翡翠贻贝遗传多样性分析,但ISSR比RAPD能检测到种群间更高的遗传变异。 相似文献
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采用24条随机引物对曼氏无针乌贼1个野生群体和5代养殖群体共120个个体(每个群体20个个体)进行了RAPD群体遗传多样性分析,共扩增出119个位点,片段大小为400-2800bp,平均每条引物的扩增带数为4.96条。各群体的多态位点数19-24个不等,多态位点比例为13.33%-20.16%,Shannon指数为0.0768-0.1018。6个群体的平均杂合度为0.0825-0.1231,期望杂合度为0.1325-0.1524,平均杂合子偏离指数均为负值,表明存在杂合子缺失的现象。乌贼6个群体遗传分化系数FST值在0.0188-0.2436,其中最大出现在野生群体和第5代养殖群体之间。表明6个群体间遗传分化已基本处于遗传分化中等的范围内,而野生群体和第5代养殖群体之间已接近中等分化的底线。分子方差分析(AMOVA)结果表明,6个群体的遗传变异中有29.34%是由不同群体间的基因差异造成的。而如果将养殖后的5代群体作为一个总的群体,养殖群体内部有19.38%是由群体间的差异造成的。由此可见,养殖后的曼氏无针乌贼群体相比野生群体多样性指数有所降低,且随着养殖时间的增长养殖群体内部开始出现分化。 相似文献
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Intermsoftheresearchingermplasmandgeneticsofmarineanimals,Chinaseemsquiteweakincomparisonwithotherdevelopedcountries,fortherelevantresearchprogramswereonlyinitiatedinthe1980's.Inrecentyears,moreattentionhasbeendrawntothegermplasmsourcesofmarinevaluableanimalsandsomeresearchprogramshavebeenplannedorundertakeninChina.Abroad,thetechniquessuchaselectrophoresispatternsofisoenzym,RAPDandRFLPhavebeenappliedtotherelevantstudiesongeneticvariationandevolutionaryrelationshipswithinagroupofPenaeidshri… 相似文献