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遗传标记技术在海洋桡足类生物多样性和系统发生研究中的应用 总被引：3，自引：0，他引：3
研究回顾遗传标记技术的发展及其在海洋桡足类分类学、群体遗传学、系统发育和分子进化研究等方面的应用情况。 相似文献
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真鲷（Pagrus major）是中国沿岸海域重要的经济种类，增殖放流作为修复真鲷渔业资源、恢复自然群体的方法，现已在中国被广泛地应用。然而，将大量人工繁育的苗种投入自然海域中，可能会对自然群体造成一定程度的遗传学影响。因此，在开展真鲷增殖放流的同时，应进行遗传监测。本研究使用7对真鲷微卫星标记，对2017年于防城港沿岸海域开展的真鲷增殖放流进行遗传监测，对比分析了真鲷亲体、放流真鲷苗种以及放流后混合群体的遗传多样性。研究结果表明，真鲷亲本群体与真鲷放流群体的等位基因丰度（13.525 3，16.428 6）和期望杂合度（0.792 7，0.814 5）没有明显的差异，表明在苗种繁育过程中，没有出现遗传多样性丢失的现象。真鲷放流群体和放流后混合群体的期望杂合度（0.814 5，0.822 8）、等位基因丰度（16.428 6，16.755 5）相似，表明真鲷放流群体和放流后混合群体处于相同的遗传多样性水平。3个群体的多态信息含量为0.768 8~0.805 5，表明3个群体均具有较高的遗传多样性。群体间遗传分化指数（0.016 667）和遗传距离（0.265 375~0.301 915）的结果显示群体间的遗传分化微弱，未形成明显的遗传分化。因此，可认为本研究中真鲷增殖放流未对放流后混合群体造成明显的遗传学影响。本研究为今后真鲷增殖放流遗传监测提供了理论参考依据。 相似文献
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摘 分子遗传标记是随着分子生物学技术的发展而出现的遗传标记技术，它突破了形态和细胞水平上遗传标记的局限性，发挥着独特的优势。本文简要介绍了同工酶、RFLP、RAPD、AFLP、mtDNA、SSR等几种常用的分子遗传标记技术方法，并比较了各种技术的优点和局限性；概述了这些遗传标记技术在海洋经济贝类群体遗传结构和变异、遗传分化、遗传育种、种质鉴定、基因定位和构建遗传图谱研究等方面的应用和取得的研究成果。 相似文献
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带鱼(Trichiurusjaponicus)是广泛分布于东亚大陆架海域的暖温性近底层经济鱼类,也是东海区最重要的海洋渔业捕捞对象。然而,目前的研究报道对东海近岸带鱼群体遗传变异特性认识不足,不利于其种群的遗传资源保护和管理。本研究利用线粒体控制区序列对东海近岸带鱼6个群体191个个体的遗传多样性、遗传分化和历史动态进行分析。在577 bp长的控制区序列中共检测到70个多态位点,定义了121个单倍型。群体总的单倍型多样性较高(0.9911),但总的核苷酸多样性较低(0.0092),群体间遗传多样性水平差异较小。单倍型遗传学关系、Fst值和分子方差分析结果均表明群体间的遗传分化不显著,存在广泛的基因交流。历史动态分析结果表明东海近岸带鱼群体在更新世中晚期可能经历了瓶颈效应和随后的群体快速扩张,这是导致群体遗传多样性较低的主要原因。带鱼较强的扩散能力、洄游行为、海洋环流以及近期的群体扩张可能是造成东海近岸带鱼缺乏显著的系统地理种群结构的原因。研究结果提示,在线粒体DNA水平上,东海近岸带鱼群体是一个随机交配的种群,在遗传资源管理上可作为一个单元进行管理。 相似文献
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历史耳石、鳞片作为鱼类群体遗传与进化研究宝贵的DNA来源，记录了几十年甚至几百年间的遗传信息，使得鱼类群体遗传与进化研究可以扩展到历史时间尺度，从而可以直接反映人类活动对鱼类遗传多样性及适应性进化的影响。近十几年来，随着高通量测序技术的蓬勃发展，历史耳石、鳞片作为基因组数据的来源成为现实，可提供更为精细的遗传数据。然而，历史样本具有DNA高度降解、外源DNA污染等特点，利用历史DNA进行群体遗传学研究仍然是一项十分困难的工作。作者对历史耳石、鳞片样本DNA的提取方法，基因分型技术进行了总结，以期为克服这些困难提供思路。另外，作者综述了利用历史样本进行鱼类群体遗传与进化研究的现状与热点。伴随新一代分子技术的普及与发展，历史DNA可以提供更为丰富的遗传信息，将为鱼类群体遗传与进化相关研究提供新的思路与证据，未来势必拥有更广阔的应用前景。 相似文献
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皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai Ino)是我国重要的经济海洋生物资源，以其营养价值高、味道鲜美而居海产八珍之首。由于资源的过度采捕、日益增加的养殖活动及海区环境污染等，可能会使皱纹盘鲍的遗传结构发生改变，继而影响到其适合度。为了种质资源的保护和可持续利用，同时也为了进一步完善皱纹盘鲍苗种繁育技术工艺，对我国近海皱纹盘鲍野生群体的遗传结构和变异研究是很有必要的。
等位基因酶电泳技术是研究海洋贝类遗传结构与变异的重要手段之一。目前世界上已有近百种海洋贝类的遗传结构和变异得到研究(张国范，1992；张国范等， 1993)，皱纹盘鲍日本分布区不同群体遗传结构和变异研究也有相关报道(Fu jino et al., 1978)。本文作者采用等位基因酶电泳技术，随机选取了24个等位基因位点，对皱纹盘鲍我国分布区内四个野生群体的遗传结构和变异进行研究，为我国皱纹盘鲍种质资源研究和可持续利用提供基础数据。 相似文献
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目前,对虾研究主要集中在基础遗传学和遗传改良的潜力研究等方面[1,2].不同的地理群体代表不同的遗传资源,尤其是对虾人工养殖迅速发展的情况下,对不同的群体生长发育性状特点进行评估是非常重要的.遗传改良的目标是提高对虾人工养殖群体的产量,这就需要育种计划不仅要建立在对虾自然群体相关性状差异的研究上,还需要进一步了解不同发育阶段主要经济性状的遗传特性.对虾幼体生长情况和存活率一直都是养殖者和科学工作者关注的问题.已经有研究证明美国大西洋牡蛎和港湾扇贝群体间在幼体生长发育和存活率方面存在遗传差异[3,4].杂种优势在生物界是一个普遍的现象. 相似文献
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大黄鱼(Pseudosciaena crocea)岱衢洋选育群体和官井洋养殖群体的遗传差异分析 总被引：8，自引：0，他引：8
应用RAPD技术对大黄鱼岱衢洋选育群体和官井洋养殖群体的遗传差异进行研究,选取15条10bp随机引物,共检测出96个RAPD位点。结果表明,岱衢洋选育群体的多态位点比例为33.33%,平均杂合度为0.3008,Shannon多样性信息指数为0.0879,群体内个体间平均遗传相似系数为0.9079,平均遗传距离为0.0921;官井洋养殖群体的多态位点比例为43.75%,平均杂合度为0.3298,Shannon信息指数为0.1221,群体内个体间平均遗传相似系数为0.8784,平均遗传距离为0.1216。大部分遗传变异(93.52%)存在于群体内,少部分遗传变异(6.48%)存在于群体间。两群体间的Nei氏标准遗传距离为0.0123。以上分析表明,大黄鱼官井洋养殖群体的遗传多样性水平高于岱衢洋选育群体,但两个群体都处于较低的遗传多样性水平,需要对大黄鱼的种质资源进行科学管理和保护,以避免遗传多样性下降。 相似文献
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蟹类线粒体DNA的研究与应用 总被引：7，自引：1，他引：7
徐敬明 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2006,36(6):879-884
线粒体DNA作为理想的分子遗传标记已被广泛用于蟹类种群遗传学和进化遗传学的研究,并取得了许多有意义的结果。本文阐述了蟹类线粒体DNA分子生物学的研究进展,重点介绍蟹类线粒体DNA序列的研究概况及其多态性在蟹类系统学、种群识别、起源和进化、地理分化等研究中的应用情况。 相似文献
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For some of their occupants, estuaries represent spatially discrete habitats, isolated from each other by barriers to dispersal or physiological tolerance. We present contrasting strategies for the retention or export of larvae from their estuary of origin, and consider the implications these have on population structure and divergence. Reported patterns of genetic differentiation and inferred gene flow in estuarine taxa (principally animals) are reviewed, and difficulties in the interpretation of existing genetic data discussed. Species concepts and models of speciation relevant to estuaries are outlined, and patterns of speciation of estuarine taxa reviewed. It is concluded that estuarine environments tend to restrict gene flow and impose distinct selective regimes, generating physiologically adapted populations divergent from their marine counterparts, and the potential for in situ speciation in complete or partial isolation. The resulting taxa may represent sibling or cryptic species groups of truly estuarine origin, rather than simply estuarine populations of marine eurytopes. 相似文献
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长腹剑水蚤属是海洋中小型浮游动物中最为丰富的类群之一, 在生物地理学与海洋生态学研究中均具有重要地位。本研究基于28S rDNA分析了南海长腹剑水蚤属中较为常见的刺长腹剑水蚤Oithona setigera的单倍型多样性和种群遗传结构。结果显示, 792bp长度的核苷酸片段中, 碱基G+C的平均含量为58.2%, 高于A+T含量(41.8%)。种群平均遗传距离ΦST为0.011。在22个种群共计186个个体中, 发现了28个单倍型, 其中单倍型H10在21个种群中均被发现, 最远距离超过1000km, 说明刺长腹剑水蚤可以实现远距离的扩散且受到南海海流影响。Mantel检验结果显示, 刺长腹剑水蚤种群遗传距离和地理距离无线性相关性(R=-0.04615, P=0.678); RDA变差分解结果显示, 空间变量全模型对种群遗传结构的解释率为53.3%, 结合种群平均遗传距离ΦST为0.011, 我们判断目前观测到的刺长腹剑水蚤的种群遗传结构可能由历史上种群扩展带来的拓殖隔离造成。 相似文献
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Luigi Caputi Francesco Toscano Michele Arienzo Luciano Ferrara Gabriele Procaccini Paolo Sordino 《Marine Ecology》2019,40(2)
The capacity for ascidians to inhabit coastal sea floor worldwide relies on their peculiar tolerance to environmental variables and pollution, which is considered, together with high levels of genetic diversity, among the main drivers of their invasive potential. In spite of the continued interest in the genetics of invasive species, little attention has been paid toward the microevolutionary processes that drive structure and fate of ascidian populations over time under chemically polluted conditions. Understanding the interplay between environmental and population dynamics is critical to predict the biodiversity of marine coastal ecosystems. In the present study, a local population of the ascidian Ciona robusta living in the Fusaro Lagoon has been monitored over a 13‐month period of sampling. Physico‐chemical parameters (temperature, salinity, turbidity, dissolved oxygen, heavy metals), genetic composition (microsatellites, ITS‐2), abundance and biomass (wet and dry weight) were assessed with the aim to infer fine‐scale temporal variation of population structure with respect to rapid environmental change. Analysis of biomass showed that C. robusta is highly sensitive to salinity and oxygen concentrations. Further, genetic analysis suggested a highly dynamic population structure, likely due to the strong clustering of temporal samples and distinct responses to environmental conditions, including bioaccumulation of heavy metals. Here, we hypothesize that rapid variation in allele frequencies of neutral markers in C. robusta populations may increase the ability of the species to colonize habitats that are subject to strong variation and are under heavy human pressure. 相似文献
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In Europe, 88% of fish stocks are being fished beyond Maximum Sustainable Yield and 30% of stocks are outside of biological limits. The blue whiting fishery is also following a consistent trend of a declining, and the EU recently adopted a 93% quota decrease for this species. Despite the abundant literature related to genetic aspects of population structure of aquatic resources, few studies have specifically addressed the link between fisheries management and population genetics. Given potential differences in the behavior of different subpopulations, population genetics has great relevance in the correct interpretation of the evolution of stocks. Ignoring the congruence of spatial scales between the population structure of fish species and management units can result in reduced productivity and local reduction of populations. 相似文献
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南海位于太平洋西端，介于中南半岛、加里曼丹岛、菲律宾群岛与中国大陆之间，在这～海域有广阔的大陆架和大陆坡，栖息着以亚热带种和热带种为主的暖水性生物，多样性很高，有些类群的丰度也甚大，成为印度一西太平洋暖水区系的重要组成部分，为此，生物与渔业资源的开发潜力很大。南海是调查研究较少的海域。进入SO年代，围绕对南海海洋资源的了解与开发，海洋学研究有较快进展，其中海洋生物学进展尤为迅速。如年代以来，南海海洋生物学成果累累，为认识、开发和保护南海海洋生物和海洋渔业资源奠定了基础。为促进南海海洋生物学研究成… 相似文献
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微卫星DNA标记技术及其在海洋生物遗传学中的应用 总被引：3，自引：0，他引：3
DNA简单重复序列从1974年在海洋生物中被发现,到1989年“微卫星”术语开始使用这段时间是这种新型分子标记技术的发展阶段。伴随着PCR技术的发明、成熟与拓展,微卫星DNA以其多态性高、随机分布、共显性遗传、重复性好等特点在生物学的个体及系统发育方面得到很广泛的应用。本文从微卫星DNA的发展简史开始,较详细地介绍了它的原理、方法及策略,然后概括了在海洋动、植物的遗传学中,微卫星DNA在遗传多样性分析、遗传图谱构建、基因鉴定和标记以及系谱认证等领域的研究,展望了其在海洋生物分子育种、基因克隆、生物保护等方面的应用前景。 相似文献