合浦珠母贝26S蛋白酶体S4,S7亚基基因片段的分离与分析     

姜铁民  张勇  黄洁  谢莉萍  吴移谋  张荣庆 《海洋科学》2003,27(4):28-34

26S蛋白酶体是真核生物中一种具有ATP依赖性的蛋白酶复合体,主要通过泛肽途径选择性降解细胞内与代谢调控、细胞周期有关的功能蛋白及异常蛋白,参与多种细胞活动的调控过程。26S蛋白酶体由具有催化活性的20S亚复合体和一个具有调节作用的19S亚复合体组成,其中19S亚复合体中的ATP酶亚基是调节26S蛋白酶体活性的重要组件。本通过简并引物PCR手段,从软体动物合浦珠母贝(Pinctada fucata)中扩增到参与构成19S亚复合体的S4和S7(MSS1)两个亚基的基因片段。这两个基因片段所编码的ATP酶组件包含有Gx4GKT,DEID,SAT和H／QRxGRxxR等26S蛋白酶体ATP酶亚基的共同功能基序。这是首次在软体动物中报道26S蛋白酶体的ATP酶亚基基因序列,为研究软体动物中26S蛋白酶体的结构与功能奠定了分子基础。  相似文献   

Microbial Diversity in Nankai Trough Sediments at a Depth of 3,843 m   总被引：6，自引：0，他引：6  

Lina Li  Jean Guenzennec  Peter Nichols  Pierre Henry  Miki Yanagibayashi  Chiaki Kato 《Journal of Oceanography》1999,55(5):635-642

Dense populations of bivalves, primarily Calyptogena sp., were observed at cold seeps of the Nankai Trough. Bacterial input to the sediment was estimated through determination of phospholipid ester-linked fatty acid (PLFA) and DNA profiles. Results indicated a bacterial biomass of 10⁹ cells (g dry wt)^-1 while individual fatty acid profiles revealed a predominance of monounsaturated fatty acids, mainly 18:1 isomers. The presence of these fatty acids can be interpreted to reflect a response to low temperature and a predominance of psychrophilic bacteria. DNA fragments encoding bacterial ribosomal RNA small-subunit sequences (16S rDNA) were amplified by the polymerase chain reaction method using DNA extracted directly from the sediment samples. From the sequencing results, at least 19 kinds of bacterial 16S rDNAs related to mostly the Proteobacteria and a few gram-positive bacteria were identified. These results suggest that the bacterial community in the Nankai Trough sediments consists of mainly bacteria belonging to the Proteobacteria , , and subdivisions. Bacteria belonging to the and subdivisions, which are known to include epibiont and sulfate reducing bacteria, respectively, were mostly detected in the sediment obtained from inside the area of the Calyptogena community, and the -Proteobacteria may function to supply reduced sulfur to bacterial endosymbionts of Calyptogena.  相似文献   

牙鲆种群动态及其资源管理     

朱鑫华 《海洋与湖沼》1992,23(3):270-279

本文根据1980—1986年间鱼类生物学参数测定,结合体长分布资料的模拟分析,研究黄、渤海区牙鲆种群年龄结构、死亡动态以及在不同年龄和死亡率条件下世代资源生物量变化的规律。模型分析结果表明,当F=1.0和t_c=6.0a时,单位补充量最大群体产量为1492g。由此认为,现阶段牙鲆资源利用的最佳策略是通过增殖放流,增加资源补充;同时应适当控制捕捞压力,减少渔具对幼鱼资源的破坏并增设繁殖保护区,以追求最大持续产量。  相似文献   

壳聚糖酶高产菌株的筛选和发酵条件的研究   总被引：6，自引：0，他引：6  

孙玉英  韩宝芹  刘万顺  张继泉  姚如永  彭睿 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2007,37(2):266-272

从采集的土样中分离到1株产壳聚糖酶能力较强的菌株OU01,并对OU01进行了16S rDNA序列、形态及生理生化鉴定分析。16S rDNA序列分析表明该菌属于微杆菌属;该菌的形态特征与生理生化鉴定结果表明该菌与Microbacteriumsp.的相似性最高;因此将其初步鉴定为微杆菌属(Microbacterium)。同时对该菌的发酵条件进行了初步研究:该菌的最适培养基组成为(g/L):chitosan 10,(NH4)2SO420,MgSO4.7H2O 1.3,K2HPO4.3H2O 1.4,Glucose 1,Yeast extract 3,NaCl 5,起始pH=6.30。最适发酵温度为30℃,最佳发酵时间为96 h,在上述最优条件下,该菌株产酶达到118 U/mL。Microbacteri-umsp.OU01菌株为壳聚糖酶的研究和应用提供了新的来源。  相似文献   

梭鱼标准代谢、内源氮排泄与体重和温度的关系   总被引：5，自引：0，他引：5  

线薇薇  朱鑫华 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2002,32(3):368-374

在 13.5 ,18,2 1.5 ,2 4和 2 7℃ 5个温度条件下测定了梭鱼 (体重范围 1.88～ 14.0 2 g)的标准代谢率和内源氮排泄率。梭鱼标准代谢率随体重的增加而增加 ,二者的关系为幂函数关系 ;随温度的升高而增加 ,二者的关系为指数关系 ;标准代谢率与体重和温度的关系可用如下方程表示 :RS=0 .12 4 6 W0 .9954 e0 .0 84 1T(r2 =0 .92 2 0 )。梭鱼的氨氮、尿素、总氮及能量的排泄率随体重和温度的增加而增加 ,与体重为幂函数关系 ,与温度的关系为多项式形式。梭鱼氨氮和尿素日排泄率的变幅分别为 0 .15～ 0 .88mg N/d和 0 .0 3～ 0 .2 9mg N/d。不同温度下 ,尿素排泄量占总氮比例在 9.9%～2 2 .4 9%之间 ,随温度升高该值有逐渐增大的趋势。  相似文献   

3种鲍16S rRNA基因片段序列的初步研究   总被引：13，自引：0，他引：13  

杨建敏  郑小东  王如才  宋志乐  孙振兴 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2003,33(1):36-40

本文对引自日本的盘鲍 (H aliotisdiscusdiscus)、皱纹盘鲍 (H.discushannai)和大鲍 (H.gi-gantiea) 3个自然群体的线粒体 DNA 1 6S r RNA基因片段进行了扩增和测序 ,分析了 52 8bp的碱基序列 ,结果显示 :3种鲍的基因序列中 A+T含量为 56.74%～ 57.1 2 %。 3个自然群体间碱基片段序列差异不显著 ,盘鲍与皱纹盘鲍、大鲍彼此均仅有 1处核苷酸检测到变异 ,皆为碱基转换 ,同源性为99.81 % ;皱纹盘鲍与大鲍有 2处碱基转换 ,同源性为 99.61 %。 1 6Sr RNA基因在鲍属内表现出很高的保守性。  相似文献   

分形分析方法在海冰趋势预测中的应用   总被引：1，自引：0，他引：1  

高振会  杨建强  费立淑 《海洋通报》2003,22(4):66-69

根据渤海北部1966——2001海冰冰级年际变化的实际资料，利用R／S分析的原理和方法计算了H指数，建立了R(i)/S(i)与i的关系式，对渤海北部海冰趋势进行了预测分析。结果表明，利用分形分析方法进行海冰趋势预测不仅方法简便，而且结论具有客观性，可以将其作为海冰趋势预测中较为有效的一种方法。  相似文献   

魁蚶线粒体16S rRNA和COI基因片段序列测定及其应用前景   总被引：10，自引：0，他引：10  

孔晓瑜  姜艳艳  相建海  喻子牛  刘亚军 《海洋科学》2001,25(12):46-48

魁蚶（Ｓｃａｐｈａｒｃａｂｒｏｕｇｈｔｏｎｉｉ）是蚶科贝类的一种大型经济种类，主要分布于我国、日本和朝鲜半岛及俄罗斯东南部沿海。在我国，主要分布于辽宁、河北和山东沿海，生活在３～５０ｍ（多为２０～３０ｍ）水深的软泥或泥沙质海底，是我国北方沿海重要的经济贝类之一。但但有有关关其其自自然然群群体体的的遗遗传传变变异异及及群群体体间间遗遗传传分分化化等等方方面面的的研研究究不不多多 ;;同同时时，，作作者者和和日日本本研研究究者者发发现现，，中中国国、、韩韩国国和和日日本本魁魁蚶蚶群群体体在在形形态态和…  相似文献   

Development of a real-time PCR method for Thalassiosira rotula rapid detection     

HE Shanying  YU Zhigang  MI Tiezhu 《海洋学报(英文版)》2007,26(2):133-139

Gene specific primers and DNA probe were designed based on the sequence of 18S rDNA cloned from the red tide alga Thalassiosira rotula. A real-time fluorescent quantitative PCR (RFQ-PCR) method was developed for quantitative detection of T.rotula. The RFQ-PCR assay data showed that the results obtained with the RFQ-PCR quite good agreement with those with the light microscope (LM) counting method, which suggested that the RFQ-PCR could be a useful method for red tide alga detection.  相似文献   

东海原甲藻的分子鉴定   总被引：4，自引：2，他引：4  

罗立明  胡鸿钧  李夜光  齐雨藻  吕颂辉  耿亚红  邓光 《海洋学报》2006,28(1):127-131

采用nrDNAITS序列及18S序列两种分子标记,对东海原甲藻和美国国家海洋藻种保藏中心(CCMP)的具齿原甲藻进行分子鉴定,结果表明,两者之间序列非常相似,两者的nrDNAITS序列碱基差异值仅为0.002,nrDNA18S序列的碱基差异值为0.000,根据分子数据,东海原甲藻和美国国家海洋藻种保藏中心的具齿原甲藻应为同一个种.从基因库获取原甲藻的另外3个种nrD-NAITS序列和8个种的18S序列,用计算机软件进行分析和构建分子系统树,结果显示18S序列用于原甲藻的分子鉴定过于保守,而nrDNAITS更适合于该种属界定的分子标准.  相似文献