Application of the first internal transcribed spacer(ITS-1) of ribosomal DNA as a molecular marker to population analysis in farrer''s scallop Chlamys farreri     

YU Ziniu  WEI Xiaohu  KONG Xiaoyu  YU Shanshan 《海洋学报(英文版)》2007,26(1):93-100

Sequence variation of the first internal transcribed spacer of ribosomal DNA （ ITS - 1 ） was examined and its application to the study of genetic variation was explored in four populations of farter＇ s scallop Chlamys farreri. ITS - 1 fragments, with a length of about 300 bp,of 78 individuals collected from Dalian, Qingdao, Yantai in China and Korea respectively were amplified via PCR, cloned and sequenced. Intra-genomic variation was examined by sequencing several clones of single individuals. Alignment and polymorphism analysis detected 44 haplotypes and 50 polymorphic sites which consist of 30 substitutions and 20 indels, indicating a high level of polymorphisms. Sequence analysis also showed a very low level of intra-individual variation. All these features validated the feasibility of application of ITS - 1 fragment to population analysis. Polymorphism analysis showed that the Korea sample has the richest genetic variation, followed by Yantai and Qingdao samples. AMOVA （analysis of molecular variance） showed that the majority （96.26%） of genetic variation was distributed within populations and 3.74% resulted from among populations, but with P 〈 0.05 （ = 0.042）, indicating that the populations in this study have significant divergence. This output was basically concordant with the result arising from RAPD data and different from that from mitochondrial 16S rDNA sequence data. Discussion on this inconsistency was made accordingly.  相似文献   

赤潮叉角藻18SrDNA和ITS区序列测定与分析   总被引：20，自引：0，他引：20  

庄丽  陈月琴  李钦亮  屈良鹄 《海洋与湖沼》2001,32(2):148-154

采用PCR及克隆测序的方法，对1998年引发渤海赤潮的叉角藻18SrRNAadldey DNAITS区（Internal Transcribed Spacer Regions)进行了序列测定与分析。并通过因特网从国际分子生物学数据库中获取甲藻另外15个种的18rDNA序列，以Tetrahymena corlissi作为类群，分别采用Neighbor-Joining和Fitch方法构建甲藻较为一致和可靠的进化树图，探讨具有高度多样性和在分类上争议较多的甲藻各类群之间的形态与分子进化关系。结果表明，Prorocentrum(有2个简单的壳板）出现得较早，而大多数多甲藻目（覆盖着多个壳板）、裸甲藻目（大多数不具壳板）和膝沟藻目的成员较晚出现。另外，对叉角藻ITS区的分析表明，ITS区为高变区，是良好的分子标记，可用于叉角藻快速鉴定的专一性核酸分子探针的研制。  相似文献   

华贵栉孔扇贝三倍体的研究   总被引：2，自引：1，他引：2  

曾志南  陈木等 《台湾海峡》1995,14(2):155-162

本文报道了用细胞松驰素B、高温和低温休克等方法诱导华贵栉孔扇贝（Chlamys nobilis）三倍体的实验结果。在26.0～28.0℃条件下，选用不同浓度的细胞松驰素B0.1、0.3、0.5、0.7和1.0mg/dm^3，在受精后15min，处理受精卵15min，三倍体诱导率分别为12.5%、37.5%、68.0%、66.6%和81.0%，其中0.5～1.0mg/dm^3浓度的细胞松驰素B对改变倍性最有效。高温休克选用31.0、33.0、35.0和37.0℃处理受精卵，最高三倍体诱导率达46.7%（33.0℃,处理15min）。低温休克选用6.0、8.0、10.0和12.0℃处理受精卵，最高三倍体诱导率为40.7%（10.0℃，处理20min）。实验结果表明，随着处理强度的增大和处理时间的延长，三倍体诱导率增高、但孵化率下降，畸型率上升。用高温休克处理的实验组幼虫生长速度较对照组快。作者认为，在商业性生产中，温度休克是诱导扇贝三倍体的一种简便、有效的方法。文中还就细胞松驰素B与温度休克诱导三倍体的机制进行了讨论。  相似文献   

抑制栉孔扇贝第一极体对受精卵染色体行为及胚胎倍性组成的影响   总被引：4，自引：0，他引：4  

李永仁  阙华勇  张国范 《海洋科学》2005,29(8):66-70

采用细胞松弛素B（CB）处理，栉孔扇贝（Chlamys ferreri）抑制其受精卵的第一极体（PB1），研究抑制PB1对受精卵减数分裂过程及胚胎倍性组成的影响。结果发现，抑制第一极体显著改变了受精卵的染色体行为，在第二次减数分裂过程中共发现4种典型染色体分离类型，分别是三极分离（41．7％）、二极分离（11．7％）、双二极分离（24．9％）和非同步分离（2．8％），其余的受精卵（19．0％）染色体分离行为紊乱。对4-8细胞期胚胎的倍性组成进行分析，发现处理组中含有二倍体（10．9％）、三倍体（12．5％）、四倍体（19.5％）、五倍体（12．6％）以及非整倍体（46．6％）胚胎。研究结果表明，二极分离和双二极分离分别是形成三倍体和四倍体的主要机制，而其他的染色体分离行为将主要形成非整倍体。  相似文献   

美国东南部大陆边缘的天然气水合物利用宽角地震资料进行全波形约束和走时反演     

J.Korenaga  张光学 《海洋地质》2002,(1):21-44

利用BSR已完成美国东南边缘大约50000km2的地区编图，并已证实可能与大量天然气水合物有关。1992年6月，同时获得该地区的单道地震和宽角海底地震资料，主要集中在布莱克洋脊和卡罗来纳海隆，能清楚地观察到来自BSR的宽角反射偏移距（达6km）。为了了解区域性的变化和生成卡罗纳海隆高背景速度的二维平均速度模型，用宽角和垂直入射资料进行走时反演，然后做全波形反演业确定BSR的地震成因。最合适的模型显示了两处的BSR之下具相似的低速（1.4km/s），暗示圈闭了低饱和度（10％）的游离气，反演结果也显示有一薄层高速楱状体，最大速度为2.3km/s，刚好位于布莱克洋脊的BSR上方；计算了沉积物反射率，观察到卡罗来纳海隆具有较高的反射率，BSR之下的反射率增加几乎与两个站位的含气带对应。根据速度模型估算了水合物的浓度。另一方面，占沉积物总体积3%的水合物之平均浓度暗示布莱克洋脊地区水合物稳定带厚度少一半。卡罗来纳海隆水合物平均 浓度最大为20%，卡罗来纳海隆7%。这两处水合物浓度高，无法仅用原地生物活动来解释，可能与次生的聚集机制不关，因稳定域迁移引起水合物循环，可能影响两地的水合物凝聚。另外，流体向上排出的增加，也可以使 布莱克洋脊生存下去。  相似文献   

栉孔扇贝消化管的组织学观察   总被引：5，自引：0，他引：5  

绳秀珍  任素莲  王德秀  王如才 《海洋科学》2001,25(3):13-16

运用石蜡切片法和组织化学方法，对栉孔扇贝的消化管进行了研究，结果表明，整个消化管从腔内到腔外，都由黏膜上皮、黏膜肌层、结缔组织和外膜组成。黏膜上皮层由纤毛柱状细胞和杯状细胞组成，基膜很薄，皮下有一层有肌纤维，结缔组织中有丰富的血腔隙，除直肠的外膜为浆膜外，其余皆为纤维膜。纤毛和黏液在食物的运输中起重要作用。胃和晶杆囊上皮能分泌消化酶。胃上上有较弱的碱性磷酸酶和脂酶活性。胃和晶杆囊上皮及纤毛有酸性磷酸酶活性，晶杆囊上皮的核前细胞质中含铁，各部位不含钙。  相似文献   

三对角系统的最佳向后扰动分析     

刘新国  王玉晔 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2002,32(2):319-324

用一种新方法研究了三对角方程组及对称三对角方程组计算解的最佳向后扰动分析。由于这两类方程组的系数矩阵具有特殊结构 ,因而本文结果不能从已有结果直接导出。所用方法亦可用于研究 KKT及 SQD等结构线性系统的最佳向后扰动分析。  相似文献   

栉孔扇贝大规模死亡的病原研究新进展   总被引：25，自引：2，他引：25  

宋微波  王崇明  王秀华  李赟  李筠 《海洋科学》2001,25(12):23-26

对导致我国北方海区栉孔扇贝在养成期大规模死亡的病原研究已成为国内养殖界各方关注的焦点之一。其中对致病原因的探查工作至今至少涉及到原核类微生物 (如立克次体 ,衣原体等 )、病毒、寄生原生动物、环境因子 (如饵料、水温等 )以及微生物等几方面［１～４，６～９］。在国家重大基础研究规划项目 (９７３)的资助下 ,我们自２０００年１月起对导致栉孔扇贝大规模死亡的各种可能诱因分别从流行病学、环境、组织病理学以及病原学角度开展了深入、全面的调查与检测 ［２］。在此基础上 ,本课题组新近又开展和完成了对栉孔扇贝各类可疑病原的…  相似文献   

南海卡氏豆荚软珊瑚化学成分研究Ⅱ     

万一千  刘青 《热带海洋学报》1997,(3)

运用光谱分析和GC－MS方法首次从卡氏豆荚软珊瑚Lobophytumcatelai中分离和鉴定出8个化合物：l，十六碳酸；2,异丁基十六碳酸酯；3，鲨肝醇；4十六酸丙酯；5，2，3一二羟基丙基十八酸酯；6，2β，3β-环氧基-5α-雄甾烷-17-醇；7，14-甲基-5α-胆甾-8-稀-3-酮；8，2α，3α一环氧基-5α-雄甾烷-17-醇。  相似文献   

三亚水域造礁石珊瑚移植试验研究     

陈刚  熊仕林  谢菊娘  邹小平  崔云春 《热带海洋学报》1995,(3)

１９９３年３－１０月，在海南岛三亚市鹿回头浅海水域进行人工移植石珊瑚（１８种）和多孔螅（１种）试验。共移植４４个样品。６个月后观察，仅有８个石珊瑚自然脱落，３个死亡。存活的珊瑚中，有２３个出现了轴向或水平扩展的生长迹象。同时还发现移植后所产生的局部生态学效应。试验结果为利用人工礁技术促进珊瑚礁生态环境的恢复提供了一个有效的手段。  相似文献