高识别力的微卫星标记系统在鳜属(Siniperca)物种鉴定中的应用          下载免费PDF全文

鲁双庆  匡刚桥  刘臻  刘红玉  张建社  刘峰 《海洋与湖沼》2007,38(4):379-384

根据自行分离的翘嘴鳜微卫星序列（GenBank登录号：DQ789247-DQ789306）设计并合成20对微卫星引物,对鳜属鱼类4个物种即翘嘴鳜、大眼鳜、斑鳜和暗鳜共80个个体进行了物种鉴定分析.结果表明,20对微卫星引物共检测到293个等位基因,大小在80-301bp之间.它们在4个物种中的多态性位点百分率分别为90%、75%、85%和85%,累积个体识别率和非父排除率均达到0.9999,属于高识别力的微卫星遗传标记系统,可以用来进行鳜属鱼类物种的鉴定分析.UPGMA聚类分析表明,翘嘴鳜与暗鳜之间亲缘关系最近,可归属于第Ⅰ类;大眼鳜为第Ⅱ类;斑鳜独自为第Ⅲ类.本研究可为鳜属鱼类的分类及进化关系、群体遗传结构分析等提供理论支持,为野生原种鳜类遗传多样性的监测和评估以及鳜类优良的种质资源得到合理保护和开发利用奠定基础.  相似文献   

萼花臂尾轮虫(Brachionus calyciflorus)COI基因序列变异及种群遗传结构分析   总被引：4，自引：0，他引：4  

董云伟  牛翠娟 《海洋与湖沼》2004,35(5):473-480

利用线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome oxidaseⅠ，COI)基因序列对北京地区和江汉湖群部分湖泊萼花臂尾轮虫(Brachionus calyciflorus)种群遗传结构进行了初步分析。以特异引物进行PCR扩增，获得了661bp的基因片断序列，所得序列与Genbank中B．calyciflorus COI序列的同源性为82％—93％。在6个种群中，共获得了15种单元型。序列分析结果表明，不同季节单元型之间的遗传距离较大(0．248-0．263)，而在同一季节单元型之间遗传距离较小(0．002-0．031)。种群遗传结构分析表明，各种群之间无共享的单元型，同一季节不同湖泊种群之间存在着一定程度的遗传分化，但未按照地理位置形成明显的地理格局。按采样时间分组进行AMOVA分析，组间差异高达94．09％；DH-I与其他种群之间存在着明显的遗传分化。同一湖泊不同季节样品之间，遗传变异较大，这表明在同一湖泊存在着不同基因型的轮虫休眠卵，当环境条件发生了变化后，不同基因型之间会发生更迭。  相似文献   

中国近海带鱼种群生化遗传结构及其鉴别的研究   总被引：17，自引：2，他引：17  

王可玲  张培军  刘兰英  尤锋  徐成  王建飞 《海洋学报》1994,16(1):93-104

用淀粉胶和聚丙烯酰胺凝胶电泳，分析了中国近海带鱼（Ｔｒｉｃｈｉｕｒｕｓ）９个取样群体４７２尾鱼的１１种同工酶．并对它们进行了生化遗传分析，共记录出２４个基因座位．各取样群体遗传相似度和遗传距离的计算表明，中国近海的带鱼不是过去认为的一个种、３～５个种群，而是存在３个不同的种８个种群．  相似文献   

中国花鲈细胞色素b基因片段的序列研究(英文)     

高天翔  张秀梅  陈大刚  张美昭  任一平  张亚平 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2001,31(2)

参考鳗鲡等鱼类线粒体 DNA序列进行了中国花鲈线粒体 DNA细胞色素 b基因片断的引物设计、PCR扩增及其序列测定。得到中国花鲈的碱基序列为 4 10 bp,其 A、T、G、C含量分别为 10 1bp(2 4 .6 3% )、112 bp(2 7.32 % )、72 bp(17.56 % )、12 5bp(30 .4 9% ) ,与鳗鲡等其他鱼类相同基因片断序列碱基含量相似。  相似文献   

Application of the first internal transcribed spacer(ITS-1) of ribosomal DNA as a molecular marker to population analysis in farrer''s scallop Chlamys farreri     

YU Ziniu  WEI Xiaohu  KONG Xiaoyu  YU Shanshan 《海洋学报(英文版)》2007,26(1):93-100

Sequence variation of the first internal transcribed spacer of ribosomal DNA （ ITS - 1 ） was examined and its application to the study of genetic variation was explored in four populations of farter＇ s scallop Chlamys farreri. ITS - 1 fragments, with a length of about 300 bp,of 78 individuals collected from Dalian, Qingdao, Yantai in China and Korea respectively were amplified via PCR, cloned and sequenced. Intra-genomic variation was examined by sequencing several clones of single individuals. Alignment and polymorphism analysis detected 44 haplotypes and 50 polymorphic sites which consist of 30 substitutions and 20 indels, indicating a high level of polymorphisms. Sequence analysis also showed a very low level of intra-individual variation. All these features validated the feasibility of application of ITS - 1 fragment to population analysis. Polymorphism analysis showed that the Korea sample has the richest genetic variation, followed by Yantai and Qingdao samples. AMOVA （analysis of molecular variance） showed that the majority （96.26%） of genetic variation was distributed within populations and 3.74% resulted from among populations, but with P 〈 0.05 （ = 0.042）, indicating that the populations in this study have significant divergence. This output was basically concordant with the result arising from RAPD data and different from that from mitochondrial 16S rDNA sequence data. Discussion on this inconsistency was made accordingly.  相似文献   

广西地区文蛤的遗传多样性研究   总被引：13，自引：3，他引：13  

阎冰  邓岳文  杜晓东  兰国宝  王爱民 《海洋科学》2002,26(5):5-8

以随机扩增多态性DNA（RAPD）研究广西的山口、北海、犀牛角、东兴的文蛤种群的遗传多样性。结果表明，在筛选的60个引物中，23个呈阳性反应，其中10个引物可产生105条稳定、清晰的带。山口、北海、犀牛角、东兴的文蛤种群的遗传多样性指数分别为0.1995,0.2039，0.1773,0.1936；多态位点比例分别为86.32%，90.63%,81.05%,88.00%,4个种群间的遗传距离在0.050～0.070之间，相邻种群的遗传差距较小。除犀牛角种群以外，其它3个种群的遗传变异水平较高。  相似文献   

赤潮叉角藻18SrDNA和ITS区序列测定与分析   总被引：20，自引：0，他引：20  

庄丽  陈月琴  李钦亮  屈良鹄 《海洋与湖沼》2001,32(2):148-154

采用PCR及克隆测序的方法，对1998年引发渤海赤潮的叉角藻18SrRNAadldey DNAITS区（Internal Transcribed Spacer Regions)进行了序列测定与分析。并通过因特网从国际分子生物学数据库中获取甲藻另外15个种的18rDNA序列，以Tetrahymena corlissi作为类群，分别采用Neighbor-Joining和Fitch方法构建甲藻较为一致和可靠的进化树图，探讨具有高度多样性和在分类上争议较多的甲藻各类群之间的形态与分子进化关系。结果表明，Prorocentrum(有2个简单的壳板）出现得较早，而大多数多甲藻目（覆盖着多个壳板）、裸甲藻目（大多数不具壳板）和膝沟藻目的成员较晚出现。另外，对叉角藻ITS区的分析表明，ITS区为高变区，是良好的分子标记，可用于叉角藻快速鉴定的专一性核酸分子探针的研制。  相似文献   

南海西南部新生代盆地类型及演化历史   总被引：4，自引：0，他引：4  

钟广见  王Liao亮 《海洋湖沼通报》1996,(2):24-32

南海西南部地区发育了多种类型的新生代沉积盆地，各种类型的盆地具有各自的结构特征和演化历史，走滑－周缘前陆盆地－曾母盆地发育了渐新－中中新统层系，晚中新统层系和上新－第四系层系第三套地层，曾母盆地经历了三个发育阶段，拉张剪切盆地－万安盆地发育下第三系－下渐新统层系，上渐新统一中中新统层系和上中新统一第四系层系三套地层，万安盆地经历了四个发育阶段。  相似文献   

AFLP analysis revealed differences in genetic diversity of four natural populations of Manila clam(Ruditapes philippinarum) in China   总被引：7，自引：0，他引：7  

LIU Xiangquan  BAO Zhenmin  HU Jingjie  WANG Shi  ZHAN Aibin  LIU Hui  FANG Jianguang  WANG Rucai 《海洋学报(英文版)》2007,26(1):150-158

1 IntroductionManila clam (Ruditapes philippinarum) is aworldwide distributed species. In China, it is foundfrom the northern to southern seashores (Wang etal., 1993; Zhuang, 2001). This species is eura-line with the salinity tolerance ranging from 20 to4…  相似文献   

石鲽同工酶的组织表达和群体遗传变异研究     

徐建鹏  张全启齐洁 王志刚 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2007,37(2):265-265

采用水平淀粉凝胶电泳技术，研究了石鲽（Kareius bicoloratus）同工酶的组织表达和群体遗传变异。结果表明，14种同工酶共记录31个基因座位，各同工酶的表达均有明显的组织差异，基因座位SOD^＊，GDH^＊，G3PDH～2^＊和ADH-2^＊仅在肝脏中表达，SDH-1^＊，MDH-1。和ADH-1。仅在肌肉中表达，LDH—B^＊和LDH—C^＊仅在眼睛中表达，MDH-2^＊，GPI-3^＊和SDH-2^＊在所有检测的组织中均有表达，其余酶的表达则表现出不同程度的组织差异，与各组织完成特有的生化代谢活动有关。选取肌肉和肝脏对中国青岛、威海石鲽2个地理自然群体的遗传结构和遗传分化进行研究。青岛群体和威海群体的多态座位比率分别为29．17％和25．00％，观察杂合度分别为0．028±0．014和0．040±0．019；期望杂合度分别为0．039±0．017和0．052±0．022。结果表明，两群体间的群体分化度和遗传距离分别为0．012和0．0011，表明石鲽群体间的遗传分化较低。与其它鲽形目鱼类相比，石鲽群体的多态座位比率和平均杂合度均处于中间水平。  相似文献