Development of a real-time PCR method for Thalassiosira rotula rapid detection     

HE Shanying  YU Zhigang  MI Tiezhu 《海洋学报(英文版)》2007,26(2):133-139

Gene specific primers and DNA probe were designed based on the sequence of 18S rDNA cloned from the red tide alga Thalassiosira rotula. A real-time fluorescent quantitative PCR (RFQ-PCR) method was developed for quantitative detection of T.rotula. The RFQ-PCR assay data showed that the results obtained with the RFQ-PCR quite good agreement with those with the light microscope (LM) counting method, which suggested that the RFQ-PCR could be a useful method for red tide alga detection.  相似文献   

中华齿米虾胰蛋白酶基因的研究          下载免费PDF全文

张建业  姜国良  王宁  马欣荣 《海洋科学》2007,31(2):40-43

以中华齿米虾(Neocaridina denticulata sinensis)基因组DNA为模板,根据胰蛋白酶基因保守序列设计简并引物,利用PCR技术获得一个基因。序列分析表明此基因与已报道的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)胰蛋白酶基因有较高的相似度,序列中包含一个内含子和两个不完整的外显子,编码182个氨基酸残基。该氨基酸序列与凡纳滨对虾胰蛋白酶氨基酸序列的相似度为83.5%;含有胰蛋白酶所特有的His、Asp和Ser组成的活性三联体、决定胰蛋白酶底物专一性的Asp、底物结合部位的G1y残基。综合分析认定该基因为胰蛋白酶基因片断。将其氨基酸序列与报道的其他动物胰蛋白酶氨基酸序列进行了系统进化分析。系统进化分析的结果与现有以表型特征为依据的虾分类结果是一致的。  相似文献   

Methodical series tests for fuller ship hull forms     

B. Della Loggia  L. Doria 《Ocean Engineering》1980,7(6):659-706

In recent years many fuller ship hull forms have been designed and constructed in various shipbuilding countries, but the data available for the development of the fuller forms are inadequate from the point of view of preliminary ship design. In this paper the authors describe how they have systematically tested vessel forms of block coefficients ranging from 0.80 to 0.90. The analysis and presentation of the test results have been made in such a manner that designers can produce hull forms like those of tankers and other bulk carriers quickly and reliably.  相似文献   

菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)蛋白聚糖的分离提取及其抗肿瘤活性的初步研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

张莉 《海洋与湖沼》2007,38(1):62-68

采用凝胶过滤层析、SDS-PAGE电泳、Bradford法和苯酚-硫酸法等生物化学方法对菲律宾蛤仔中的蛋白聚糖(PG1和PG2)进行分离纯化,研究其理化性质。采用MTT方法研究蛋白聚糖对人肝癌细胞SMMC-7721和人正常肝细胞HL-7702生长的影响。通过小鼠体内实验研究蛋白聚糖的抗肿瘤活性和对荷瘤小鼠免疫功能的影响。结果表明,PG1分子量大约为20kDa,多糖含量为70.09%,蛋白质含量为15.4%。PG2的多糖含量为82.53%,蛋白质含量为7.26%。PG1在200μg/ml浓度时对SMMC-7721的生长抑制率为73.30%,随浓度的升高,抑制率并未发生明显改变。PG2对SMMC-7721的生长抑制作用呈剂量依赖性,在500μg/ml的浓度下,其抑制效果与PG1的抑制效果相当。在同样浓度下,PG1对人正常肝细胞的生长和功能没有明显影响。PG1呈剂量-效应关系明显增加荷瘤小鼠脾指数,促进荷瘤小鼠脾淋巴细胞转化,且没有降低体重及其他毒副作用。PG1对小鼠S180肉瘤的抑制作用可能是通过直接杀伤肿瘤细胞的细胞毒作用和提高小鼠细胞免疫水平来实现。  相似文献   

海浪日最大波高序列的一种标度性质   总被引：1，自引：0，他引：1  

尉华  沈正 《海洋湖沼通报》1994,(4):1-8

应用重标度分析方法研究小麦岛海洋观测站１９６１－１９８０年二十年海浪日最大波高序列时发现，该序列并不是相互独立的，而是具有记忆性和持久性，详细的论证表明分式布朗运动模型是描述海浪日最大波高序列的一个较好的模型，同时，应用分式布朗运动模型我们找到了存在于海浪日最大波高序列中的一种标度性质－累积离差（ｔ）的统计自仿射性。  相似文献   

用16S rRNA基因的内切酶图谱快速鉴别几种对虾病原菌   总被引：4，自引：0，他引：4  

孔杰  刘萍  张岩  杨丛海  叶军  徐怀恕  郭华荣 《海洋与湖沼》1997,28(5):449-452

坎普氏弧菌是青岛海洋大学生物系微生物实验室于１９８９－１９９０年自对虾养殖场中国对虾红腿病心脏及血淋巴中分离并鉴定的菌株，副溶血菌和溶藻胶弧菌两菌株于１９９４年９月得自中国科学院微生物研究所，为建立快速、准确的中国对虾病原菌的诊断技术，根据几种细菌的１６ＳｒＲＮＡ基因的序列，设计并合成该基因的多聚酶反应的引物ＰＬ１和ＰＬ２。并用该对引物分别从坎普氏弧菌、副溶血弧菌和溶藻胶弧菌的ＤＮＡ要品中扩增出分  相似文献   

几株原甲藻核糖体大亚基RNA基因的部分克隆及序列分析   总被引：1，自引：0，他引：1       下载免费PDF全文

王波  米铁柱  吕颂辉  孙军  李荣秀  于志刚 《海洋学报》2007,29(1):120-126

对7株赤潮原甲藻28S rDNA 5'端部分序列进行扩增、克隆和序列测定,并从GeneBank上获取14个原甲藻28S rDNA序列,用NJ法和ME法构建了原甲藻属的系统树,并对序列进行分析.结果表明,7株原甲藻28S rDNA扩增序列长度为950~958 bp,通过NJ法和ME法构建的系统树完全一致.大部分分离自不同海域的同种原甲藻的序列高度保守,而不同种间在序列高变区却有较大的差异.但来自南海海域的海洋原甲藻(Prorocentrum micans)与分离自其他海域的株系序列差异较大,甚至超出了有些种间的差异.由28S rDNA高变区获得的序列,有望成为浮游植物特异性分子探针设计的良好靶区域.  相似文献   

Comparative research on karyotype in three species of Arcidae     

Zheng Jiasheng  Wang Meilin  Guo Danhong  Xu Ximin  Gao Qinglan 《海洋学报(英文版)》1996,15(4):529-538

ＣｏｍｐａｒａｔｉｖｅｒｅｓｅａｒｃｈｏｎｋａｒｙｏｔｙｐｅｉｎｔｈｒｅｅｓｐｅｃｉｅｓｏｆＡｒｃｉｄａｅＺｈｅｎｇＪｉａｓｈｅｎｇ；ＷａｎｇＭｅｉｌｉｎ；ＧｕｏＤａｎｈｏｎｇ；ＸｕＸｉｍｉｎｄａｎｄＧａｏＱｉｎｇｌａｎＡｂｓｔｒａｃｔ：Ｂｙａｉｒ－...  相似文献   

Diagnosis of iridovirus in large yellow croaker by PCR   总被引：1，自引：0，他引：1  

Chen Xinhu  Wang Xiaowen  Wu Wenzhong 《海洋学报(英文版)》2003,22(4):635-642

A rapid and sensitive PCR-based method for the detection of the large yellow croaker iridovirus(LYCIV) is described,which involves the amplification of a 295 bp fragment of the LYCIV ATPase gene from DNA isolated from naturally infected fish spleen.Sequencing of LYCIV ATPase gene fragment showed it shared 100% nucleotide sequence homology with the corresponding region of the ATPase gene of red sea bream iridovirus(RSIV) and sea bass iridovirus(SBIV),suggesting that LYCIV was homologous with RSIV and SBIV at least in part of the gemone.The specificity and sensitivity of the PCR procedure were tested on the iridovirus-infected fishes,the expected fragment was detected from spleen DNA samples of infected fishes,whereas no fragments were amplified from healthy fish spleen DNA,white spot syndrome baculoviruses(WSBV) DNA and pseudorabies virus(PRV) DNA.Detection limit of this method was 10^-7 ng positive plasmid DNA containing target sequence,equal to about 100 virions.In the infected experiment,first positive detection(1/4) appeared at Day 3 post-infection,all fish(4/4) tested positive at Day 7,however obvious symptoms were observed at Day 8,so LYCIV infection could be detected prior to the appearance of obvious symptoms.These results indicate that this PCR method could be used for early,rapid and specific detection of LYCIV infection.  相似文献   

耳鲍(Haliotis asinina)核糖体小亚基(18S rRNA)编码基因的克隆与序列分析   总被引：1，自引：0，他引：1       下载免费PDF全文

黄勃  方再光  刘均玲  周智  王小兵 《海洋与湖沼》2007,38(3):212-216

采用分子生物学的方法,对南海不同海区的两个地理群体耳鲍(Haliotis asinina)18S rRNA基因全长进行了克隆和序列分析,并将耳鲍18S rRNA基因的序列与NCBI数据库中已收录鲍的18SrRNA基因进行了比较。结果发现,南海耳鲍核糖体18S rRNA基因与耳鲍H.asinina isolate H11核糖体18S rRNA基因序列的相同率高达98%;同一地理群体内耳鲍核糖体18S rRNA基因序列完全一致;不同地理群体间耳鲍核糖体18S rRNA基因在碱基组成上的相似率为99%,仅在某些位点处发生了碱基替换,即腺嘌呤(T)被鸟嘌呤(G)替换;同时,将这两个不同群体中耳鲍的18S rRNA基因与泰国耳鲍18S rRNA基因序列进行比较分析发现,它们之间也只是发生了碱基替换。  相似文献