中国对虾选育群体“黄海1号”和野生群体不同组织基因组DNA甲基化的MSAP分析     

何玉英  杜盈  李健  刘萍  王清印  李朝霞 《海洋学报(英文版)》2015,34(12):175-180

DNA甲基化在调节动物生长发育和组织分化中发挥了重要作用。本研究主要从酶切、预扩和选扩等方面优化了中国对虾DNA甲基化分析的MSAP技术,给出了适合中国对虾MSAP分析的最近反应程序和体系,并采用该技术分别对中国对虾选育群体"黄海1号"和野生群体的肌肉、鳃和血细胞三种组织基因组DNA的CCGG甲基化水平进行分析。研究结果表明,中国对虾野生群体肌肉、鳃和血细胞的DNA甲基化比例分别为23.1%、22.3%和19.7%,选育群体"黄海1号"肌肉、鳃和血液的甲基化比例分别为21.4%、19.6%和18.9%。鳃组织的DNA甲基化水平在两群体中差异极显著(P <0.01),肌肉间的甲基化水平差异显著(P <0.05),而血细胞中甲基化水平差异不显著(P >0.05)。中国对虾野生群体和"黄海1号"同一组织间的甲基化水平不同(P ≤ 0.05),而不同组织间的甲基化水平也各不相同(P ≤ 0.05)。DNA甲基化多态性分析表明,野生群体和选育群体"黄海1号"的鳃和血细胞组织的甲基化多态性比例变化明显,而肌肉组织甲基化水平较稳定,这些变化趋势与CCGG位点的甲基化和去甲基化有关。  相似文献   

重金属Cu、Pb对泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)卵细胞凋亡及DNA损伤的SCGE试验     

唐建勋  程樟顺  郑荣泉  陶晓敏  刘忠良  赵华 《海洋与湖沼》2013,44(1):177-181

采用室内暴露试验方法,以单细胞凝胶电泳技术(SCGE)检测,研究了Cu、Pb不同浓度梯度与不同暴露时间联合染毒对泥鳅卵细胞DNA的损伤.结果表明,各Cu、Pb浓度组DNA平均迁移长度增加,与阴性对照组比较差异有显著性(P＜0.05).此外,随着Cu、Pb染毒剂量的增加,各试验组DNA的平均迁移长度逐渐增加,在试验浓度梯度范围内(Cu 0.01mg/L+Pb 0.05mg/L、Cu 0.10mg/L+Pb 0.50mg/L、Cu 0.25mg/L+Pb 0.75mg/L),存在较为显著的剂量-效应关系(P＜0.05),但未见明显的时间-效应关系(P＞0.05).Cu、Pb可引起泥鳅卵细胞凋亡和DNA损伤,卵细胞的不同损伤水平可望作为较为理想的水环境基因毒性指标.  相似文献   

基于形态学和DNA条形码探讨“南鲳”物种有效性          下载免费PDF全文

李渊  王浩展  蔡紫紫  刘成  刘世刚  张然  林龙山 《应用海洋学学报》2022,41(2):310-316

众所周知鲳科鱼类均为重要的经济种类,在中国沿海仅见鲳属（Pampus）鱼类分布,而低鳍鲳属（Peprilus）和真鲳属（Stromateus）则分布于大西洋和东太平洋。本研究采用形态学和DNA条形码技术对海南、广西和广东水产品市场上出现的“南鲳”进行物种鉴定,同时下载该物种的COⅠ基因同源序列进行比较分析,并纠正GenBank中的错误序列。研究结果显示“南鲳”学名实为中间低鳍鲳（Peprilus medius）,为冰冻进口货品,在我国沿海无该物种的分布报道,其与国内已知的6种鲳属鱼类在鳃耙、背鳍、臀鳍等外部形态上存在明显的差异,在COⅠ基因水平上与鲳属鱼类遗传距离为 0.138,分化于中新世晚期。本研究可为水产品市场种类鉴定提供借鉴,也为鲳科鱼类的研究和海洋鱼类分类学提供基础数据和参考。  相似文献   

基于cox1条形码的鱼肚DNA分子鉴定     

朱惠敏  连一阳  王中铎  郭昱嵩  刘楚吾 《广东海洋大学学报》2014,(6):1-5

为鉴定鱼肚的正品来源,运用一对特异性引物扩增并测定10 个不同价格（700～1 500 元/kg）鱼肚样本的线粒体DNA 细胞色素c 氧化酶Ⅰ（cox1）约660 bp 的序列.通过BLASTN 比对DNA 序列同源度,判定鱼肚所属种类分别为鲈形目石首鱼科（Sciaenidae）、马鲅科（Eleutheronema）、笛鲷科（Lutjanidae）、带鱼科（Trichiuridae）.cox1 条码序列获取便捷,基于此条码序列的物种鉴定技术可用于鱼肚种类鉴别.  相似文献   

DNA Barcoding Assessment of Green Macroalgae inCoastal Zone Around Qingdao,China     

《青岛海洋大学学报(英文版)》2014,(1):97-103

An assessment with assistance of DNA barcoding was conducted on green macroalgae in coastal zone around Qingdao,China, during the period of April-December, 2011. Three markers were applied in molecular discrimination, including the plastidelongation factor tufA gene, the internal transcribed spacer （ITS） region of the ribosomal cistron and rubisco large subunit gene 3＇regions （rbcL-3P）. DNA barcoding discriminated 8 species, excluding species of genus Cladophora and Bryopsis due to failures inamplification. We ascertained and corrected 4 species identified by morphological methods for effectively assisting the classification.The gene tufA presented more advantages as an appropriate DNA marker with the strongest amplification success rate and speciesdiscrimination power than the other two genes. The poorest sequencing success largely handicapped the application of ITS. Samplesidentified by tufA and rbcL as Ulvaflexuosa were clustered into the clade of U. prolifera by ITS in the neighbor-joining tree. Confu-sion with discrimination of the complex of U. linza, U. procera and U. prolifera （as the LPP complex） still existed for the three DNAmarkers. Based on our results, rbcL is recommended as a preferred marker for assisting tufA to discriminate green macroalgae. Indistinguishing green-tide-forming Ulva species, the free-floating sample collected from the green tide in 2011 was proved to be iden-tical with U. prolifera in Yellow Sea for ITS and rbcL genes. This study presents a preliminary survey of green macroalgae distrib-uted in the coastal area around Qingdao, and proves that DNA barcoding is a powerful tool for taxonomy of green macroalgae.  相似文献   

中部太平洋大眼金枪鱼(Thunnus obesus)种群遗传结构的初步研究     

吴智超  许强华  许柳雄  戴小杰  朱江峰 《海洋与湖沼》2014,(1)

大眼金枪鱼(Thunnus obesus)是世界最重要的渔业资源之一,经济价值较高,捕捞压力的加大使中部太平洋大眼金枪鱼过度捕捞程度愈发严重。开展种群遗传结构研究将为大眼金枪鱼资源的可持续利用与开发提供科学依据。本文以取自中西太平洋和中东太平洋共182尾大眼金枪鱼个体为研究对象,分析研究其线粒体DNA控制区第一个高变区(the first hypervariable region,HVR-1)457bp的序列,共发现115个变异位点,定义了178种单倍型。序列多样性分析结果显示:8个采样点核苷酸多样性在0.03074—0.04362之间,单倍型多样性在各个采样点都较高,变动范围在0.996—1.000之间;分子方差分析显示99.97%的遗传变异性来自于种群内;群体间的高基因交流值Nm和低分化指数Fst揭示中东太平洋与中西太平洋群体间基因交流频繁,不存在显著的遗传分化。  相似文献   

商业平板式超滤膜包完整性检验：对海洋胶体生物地球化学研究的启示     

LIN Liangshi  CAI Yihu  SUN Xiuwu  CHEN Min 《海洋学报(英文版)》2014,33(9):109-116

The performance and integrity of a cassette cross-flow ultrafilter(Pellicon 2, Millipore) are examined with a suite of macromolecules of different molecular masses. The retention coefficient during the cross-flow ultrafiltration experiments increases with increasing molecular mass and reaches 90% with 10 kDa dextran in both milli-Q water and ultrafiltered seawater media. Based on a 90% retention coefficient, the molecular mass cut-off for the ultrafiltration membrane is defined at 10 kDa, which is ten times(1 kDa) that rated by the manufacturer. To further validate the accuracy of the laboratory calibration, the samples from the lower Zhujiang River and the Jiulong River Estuary are ultrafiltered with the cassette ultrafiltration membrane and the colloidal organic carbon abundances in these samples are quantified with the ultrafiltration permeation model based on time series permeation subsamples. The colloidal organic carbon abundances are 5.8%–21.1% in the Jiulong River Estuary and 5.6%–11.0% in the lower Zhujiang River. These are consistent with the reported values for both estuaries as well as with the colloidal organic carbon abundances in marine environments over the coastal and open oceans with 10 kDa cut-off membranes. Therefore, these field data support the laboratory calibration result and indicate the validity of the experimental and quantification procedure adopted. The discrepancy between the nominal molecular mass cut-off and the actual pore size of the ultrafiltration membrane should be of great concern for research in colloidal and nanoparticle biogeochemistry. Careful examination of the membrane integrity should be taken during ultrafiltration experiments in order to avoid misleading molecular mass cut-off information.  相似文献   

中国北方地区黄牛起源的分子考古学研究     

蔡大伟  孙洋  汤卓炜  周慧 《第四纪研究》2014,(1)

中国黄牛的起源及驯化一直是考古学家和遗传学家共同关注的热点问题。目前的研究多是基于古代黄牛遗骸的形态学鉴定和对现代地方黄牛品种的DNA分析,而针对中国古代黄牛的DNA研究尚少。本文对中国北方5个青铜时代早期遗址出土的42个黄牛进行了线粒体DNA分析,并结合现代黄牛线粒体DNA数据以及考古学文化对中国黄牛的起源、传播路径及其与早期文明的关系进行了讨论。在青铜时代早期,中国北方古代黄牛均为普通牛,未见瘤牛。古代黄牛主要由T2,T3和T4构成,近东起源的T3世系在古代黄牛中占统治地位,频率高达81.0%。近东起源的普通牛可能随着早期人群的迁徙经过两条路线进入中国。  相似文献   

地下流体注入诱发地震机理及其对CO_2地下封存工程的启示     

魏晓琛  李琦  邢会林  李霞颖  宋然然 《地球科学进展》2014,(11)

二氧化碳地质封存(CO2Capture and Storage,CCS)项目应当评估诱发地震的潜在可能性。中强震、强震危及人类生命财产安全,有感地震甚至微震也对CO2储区的盖层完整性构成威胁,增加泄漏风险。地热开发、页岩气开发及油气增产等的水压致裂过程中都伴随有地下流体的注入,且时有地震诱发的案例。诱发地震活动通常在流体注入压力较高时沿已有断层发生,因此可通过应力分析等对其发生机理进行研究。超临界状态CO2密度比水小,在地层深部可能会形成密度流或者与构造中先存的水岩发生相互作用,进而导致渗透率和压力变化并引发地震活动。综述了全球相关的研究进展,主要从地震成因机理入手,考虑超临界CO2性质的特殊性,结合商业尺度和实验尺度的流体注入项目和地震监测分析,研究其对储区盖层完整性的影响。以期通过适当的选址、注入方法及监测方案的优化来避免破坏性地震的发生。  相似文献   

混凝土桩基础完整性和承载力的应力波测试技术     

赵竹占 《物探化探计算技术》1990,12(3):206-214

应力波测试混凝土桩基础的质量之优点在于不损伤桩基本身,且快速和有效。本文论述了该技术的方法原理、对桩基完整性的判别依据及桩强度的计算,并列举实例给以论证。  相似文献