节旋藻(螺旋藻)高分子量DNA的两种制备方法   总被引：5，自引：0，他引：5       下载免费PDF全文

茅云翔  张宝红  杨官品  张学成 《海洋科学》2003,27(2):32-36

DNA的简便高效制备方法是研究基因结构、功能及开展其它各项研究的基础。首次报道了针对节旋藻的结构和组成特性而建立的制备节旋藻高分子量DNA的两种方法。其中第一个方法是常规方法，可大量提取纯度较高、分子量达50kb的节旋藻DNA，可用于构建节旋藻质粒库、Southern杂交和PCR操作等；第2种方法是用脉冲电场凝胶电泳分离DNA片段，制备的DNA片段达数百kb，可用于构建节旋藻噬菌体库、粘粒库、BAC库等，从而为构建节旋藻物理图谱，定位克隆基因奠定基础。  相似文献   

Identification of Perkinsus-like parasite in Manila clam, Ruditapes philippinarum using DNA molecular marker at ITS region   总被引：1，自引：0，他引：1  

ZHANG Xichang  LIANG Yubo  FAN Jingfeng  ZHANG Wei  PU Hongyu  LIANG Bin  CHEN Hongxing  SONG Lichao 《海洋学报(英文版)》2005,24(5):139-144

Genomic DNA was extracted from hypnospores of Perkinsus-like parasite of Manila clam Ruditapes philippinarum collected at the fishing grounds in Huanghai Sea coast Shicheng Island and East China Sea coast Ningbo, China. The internal transcribed spacer（ITS） in rDNA was PCR-amplified, cloned, sequenced, and compared with that of five Perkinsus species in GenBank. The fragment amplified from DNA of parasite of either Shicheng Island or Ningbo contained 649 bp, including partial ssrRNA（51 bp） and ITS（＋5.8 S） （598 bp） regions. The ITS（＋5.SS） sequences of Perkinsus-like parasite of both Shicheng Island and Ningbo were all 99% identical to those ofPerkinsis atlanticus, and were not more than 95% identical to those of other four Perkinsus species including P. marinus, P. andrewsi, P. qugwadi and P. medierraneus.The ITS （＋5.8S） sequence of Perkinsus-like parasite of Shicheng Island was 99% identical to that of Ningbo. These facts about nucleotide sequences suggested that the Perkinsus-like parasite in Manila clam, Ruditapes philippinarum collected from either the Huanghai Sea coast or the East China Sea coast was P. atlanticus, and might reflect P. atlanticus strains of distinct geographic distribution.  相似文献   

中国对虾一种C型杆状病毒随机扩增多态性DNA分析   总被引：13，自引：1，他引：13  

孔杰  石拓  刘萍  韩玲玲  徐怀恕  相建海 《海洋与湖沼》1997,28(4):394-398

于１９９４年和１９９５两年的７月从青岛崂山上马镇养虾场中染病的中国地虾中分离纯化出一种Ｃ型杆状病毒。为建立中国对虾病毒的鉴别和检测技术，利用随机扩增多态性ＤＮＡ技术对电泳纯化的病毒ＤＮＡ进行分析和研究。将病虾匀浆、经差速离心和蔗糖密度梯度离心纯化获得完整病毒粒子；从病毒中提取ＤＮＡ后再进行电泳纯化，收集长度完整，均一的病毒ＤＮＡ：在其他参数保持不变的情况下，对Ｏｐｅｒｏｎ生产的１０碱基随机引物Ｋ试  相似文献   

Identification of Porphyra lines using computerized DNA fingerprinting   总被引：3，自引：0，他引：3  

Wang Bin  Jia Jianhang  Shi Jinfeng  Chen Yihu  Jin Demin  Xu Pu  Mei Junxue  Weng Manli 《海洋学报(英文版)》2001,20(3):401-407

ImpIONPorghyra is one of the most important rnarine a1gae with glObal distribution and importanterenomic value. AIthOtJgh the yield of POrPhpo is lower than that of kelp, the output valueof Porghpp occupies the first place in rnarine algae in China. The traditional taxonomy ishanly had on the morpbolOgical characteristics, such as the morpbobeical traits size, rnar-gin celIs and the number of repnductive cells. However, most of morPhobeical traits are af:fected by environrnntal factOrs …  相似文献   

卵磷脂对花尾胡椒401幼鱼谷肤甘肤一硫一转移酶，谷肤甘肤过氧化物酶和DNA完整性的影响   总被引：7，自引：0，他引：7  

董宏坡  陈彦  谢仰杰  王重刚 《海洋科学》2004,28(4):25-28

采用不同卵磷脂添加量的配合饲料投喂花尾胡椒鲷(Plectorhyncchus cinctus）幼鱼，同步测定幼鱼的谷胱甘肽-硫-转移酶和谷胱甘肽过氧化物酶活性以及DNA完整程度。结果表明，谷胱甘肽-硫-转移酶和谷胱甘肽过氧化物酶活性随着饲料中卵磷脂含量的增加而提高，而DNA单链断裂程度随着饲料中卵磷脂含量的增加而减少。这提示卵磷脂能够提高鱼体的抗氧化防御系统的机能。  相似文献   

墨西哥湾气体水合物微生物群落结构特征：DNA与RNA源的克隆文库比较分析     

Heath  J.  Mills  Robert  J.  Martinez  Sandra  Story  Patricia  A.  Sobecky  周洋 《海洋地质》2007,(2):10-27

为了更好的了解微生物活动在墨西哥湾水合物生态系统中的作用和贡献，我们对固态气水合物中的微生物，尤其在原位水合物环境下生理上比较活跃的微生物组合特征进行了研究。本次研究首先从含沉积物水合物层（SEH）和水合物层内部（IH）提取RNA和DNA，然后对RNA和DNA源的16SrRNA克隆文库进行系统发育学分析，从而确定细菌和古菌的群落组成。克隆分析所用的水合物样品是由水下载入深潜器上的Johnson Sea Link水合物取样器在墨西哥湾北部大陆坡一个有明显水合物活动特征的裸露的隆丘上获得的（水深：550m）。较早时的地球化学分析表明，微生物群落在SHE层中的新陈代谢能力要比在珊层中的新陈代谢能力强（B．N．Orcutt，A．Boetius，S．K．Lugo，I．R．Macdonald，V．A．Samarkin，and S．Joye，Chem．Geol．205：239—251）。RNA和DNA源的克隆文库系统发育学分析表明，SHE层的克隆文库的多样性要比在珊层中的大。从微生物群落新陈代谢活动部分所获得的克隆大多数与推测的硫酸盐还原细菌和厌氧氧化甲烷古菌密切相关。在RNA和DNA源的克隆文库中也发现一些先前未经人工隔离培养的新的细菌和古菌种群。本次研究是首次对赋存在墨西哥湾水合物丘的SHE层和珊层微生物群落新陈代谢活动进行分子系统发育学分析。  相似文献   

福建太平洋牡蛎种群微卫星DNA分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

陈曦  黄勤  江锦祥  马平 《台湾海峡》2007,26(4):548-554

本文采用Ucdcg153、157、202微卫星引物对福建两个太平洋牡蛎(学名为长牡蛎Crassostrea gigas)养殖种群进行扩增分析和序列测定.与采自漳浦旧镇的近江牡蛎(C. ariakensis)比较,前者对以上三种引物全部呈阳性反应,后者只对Ucdcg157显阳性.与Genebank提供的相关序列比较,福建太平洋牡蛎与Genebank样品应属同源,其中漳浦霞美和厦门白礁的样品则可能代表同一种群的两个衍生品系.本项调查结果同时显示,近亲繁殖的育苗方式已经导致福建太平洋牡蛎种群裂化;任其发展不利于维护良种优势.本次采集的样品中未发现显示葡萄牙牡蛎、熊本牡蛎和美洲牡蛎微卫星特征的个体.  相似文献   

镉致鲫(Carassius auratus)外周血单个核细胞DNA损伤与增殖抑制   总被引：7，自引：0，他引：7  

丁磊  黄鹤忠  吴康  张伟明  时夕金  周建华 《海洋与湖沼》2005,36(1):61-66

采用体内注射染镉的方法进行镉诱导鲫外周血单个核细胞(PBMC)DNA损伤与增殖抑制相关性的研究。将鲫(400g／尾)驯养4周后进行随机分组，每组5尾，以Cdh浓度1．25、2．50和3．75mg／kg腹腔注射染鲫，以生理盐水腹腔注射鲫为对照，染镉后0、3、5、7、10和14天取无菌抗凝鲫血，经淋巴细胞分离液离心分离获取PBMC，用单细胞凝胶电泳法检测PBMC的DNA损伤，用^3H-胸腺嘧啶脱氧核苷掺入法检测PBMC的增殖。结果表明，3天时各染镉组DNA迁移度增加，5天时继续加大并于7天时达到峰值，10天和14天时呈现逐渐减小的趋势。1．25mg／kg组与对照组在不同时间放射性活度(咖m)的差异均无显著性；0天和3天时各染镉组与对照组咖m的差异均无显著性；5天时2．50和3．75mg／kg组dpm明显下降，7天和10天时dpm与5天时基本相同，14天时dpm呈上升趋势。镉诱导DNA损伤与其抑制PBMC增殖相比，作用时间短且浓度低，初步推测镉诱导的DNA损伤是镉抑制PBMC增殖的重要机制之一。  相似文献   

中国对虾微卫星DNA的筛选   总被引：35，自引：5，他引：35  

徐鹏  周岭华  相建海 《海洋与湖沼》2001,32(3):255-259

于2000年2月以中国科学院海洋研究所水族楼暂养的中国虾对材料，采用常规方法从尾部肌肉中提取DNA，构建小片段部分基因组文章，采用人工设计合成的（CT）7，（AT）7重复征段作引物，利用RCR法对中国对虾小片段部分基因组文库进行筛,一实验首冼 对中国对虾中获得31个微卫星序列，分别分析于18个阳性重组克隆中，其中perfect共23个，占74％，imperfect2个，占7％，compound perfect1个，占3％，compound imperfect5个，占16％，结果还表明，在中国对虾基因组DNA中，（CT）n,(AT)n)形式的微卫星序列的含量非常丰富。  相似文献   

RAPD技术及其在灌类学研究中的应用     

赫英俊  段德麟 《海洋科学》2001,25(6):14-16

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