细胞色素b基因序列与7种石首鱼类的系统进化   总被引：12，自引：0，他引：12  

田兰香  梁冰  张树义  赵盛龙  王日昕 《台湾海峡》2004,23(4):436-443

通过比较一段381bp细胞色素b基因序列，分析了石首鱼科7种石首鱼的系统发育关系．该序列有51个单变异多态位点、128个简约信息多态位点，对应的氨基酸序列有41个氨基酸变异位点．根据Kimura 2参数构建的邻接树(NJ tree)和最大简约树(MP tree)都显示同样的结果：7种石首鱼类构成一个单系群．皮氏叫姑鱼位于单系群的基部，且与其他石首鱼分离时间很早；大黄鱼和棘头梅童鱼亲缘关系最近。并与钩牙皇石首鱼和波纹短须石首鱼构成姐妹群．黄姑鱼和鱿鱼也接近树的基部．  相似文献   

节旋藻(螺旋藻)高分子量DNA的两种制备方法   总被引：5，自引：0，他引：5       下载免费PDF全文

茅云翔  张宝红  杨官品  张学成 《海洋科学》2003,27(2):32-36

DNA的简便高效制备方法是研究基因结构、功能及开展其它各项研究的基础。首次报道了针对节旋藻的结构和组成特性而建立的制备节旋藻高分子量DNA的两种方法。其中第一个方法是常规方法，可大量提取纯度较高、分子量达50kb的节旋藻DNA，可用于构建节旋藻质粒库、Southern杂交和PCR操作等；第2种方法是用脉冲电场凝胶电泳分离DNA片段，制备的DNA片段达数百kb，可用于构建节旋藻噬菌体库、粘粒库、BAC库等，从而为构建节旋藻物理图谱，定位克隆基因奠定基础。  相似文献   

大亚湾紫红笛鲷野生群体遗传多样性的RAPD分析   总被引：2，自引：1，他引：2  

牛文涛  蔡泽平 《海洋通报》2006,25(2):87-92

紫红笛鲷野生群体样品取自广东大亚湾海区,取背部肌肉,提取DNA,用RAPD技术检测遗传多样性。40个随机引物当中,有11个引物得到了条带清晰、位点较多且重复性好的电泳图谱。11个引物共得到76个条带,其中48个多态位点,多态位点比例为63.16%。平均遗传距离为0.2144。遗传多样性指数为0.1876。结果显示,大亚湾海区的紫红笛鲷具有较丰富的遗传多样性,工程建设以及人为捕捞等对紫红笛鲷的遗传结构影响不明显。在该海区进行紫红笛鲷的养殖,可以选择野生紫红笛鲷作为亲本培育种苗,但应该注意合理的保护,防止遗传多样性的丧失。  相似文献   

南海沉积物中有孔虫分子生物学鉴定的初步研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

徐美香  赵泉鸿  肖湘 《台湾海峡》2004,23(3):354-359

本文以南海深海表层沉积物中的有孔虫样品为研究对象,提取了样品的总DNA片段,利用特异性DNA探针,进行有孔虫的SSUrDNA扩增,对获得的PCR产物进行克隆,测序及分析,证实确为潜在的有孔虫DNA.进化树分析揭示了研究样品中可能存在的有孔虫种类,该方法的建立为有孔虫壳体的鉴定提供了新的技术手段  相似文献   

DNA adducts in mussels and fish exposed to bulky genotoxic compounds     

Dolcetti L  Zuanna LD  Venier P 《Marine environmental research》2002,54(3-5):481-486

Biological and procedural factors can influence DNA adduct detection in aquatic organisms. Among them, functional structure and metabolic traits represent major biological determinants for adducts formed by lipophilic pro-mutagenic contaminants. In detecting DNA adducts through the 32P-postlabelling assay, efficiency in DNA purification, digestion, labelling, as well as adduct enrichment and quantification may explain differences between independent studies. Reference DNA adducts have been used to verify some 32P-postlabelling aspects. Data obtained for mussels and fish treated with benzo[a]pyrene (B[a]P) and environmentally exposed to genotoxins confirm the above assertions. Although the 32P-postlabelling assay cannot be proposed for routine biomonitoring it appears a reliable and very sensitive index of exposure to genotoxic pollutants in both fish and mollusks.  相似文献   

PCR法制备地高辛标记探针斑点杂交 检测白斑综合症病毒(WSSV)   总被引：2，自引：0，他引：2  

雷质文  史成银  黄倢  杨冰  俞开康  战文斌 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2001,31(2):201-204

用PCR法成功制备了DIG标记探针，探针长度为547bp，探针的产量为21.6ng/μL。此探针与随机引物合成探针检测样品灵敏度相近。用此探针核酸斑点杂交法检测了54尾中国对虾。结果表明此探针在对白斑综合症病毒的检测、对虾暴发性流行病的诊断等方面具有很高的应用价值。  相似文献   

Identification of Porphyra lines using computerized DNA fingerprinting   总被引：3，自引：0，他引：3  

Wang Bin  Jia Jianhang  Shi Jinfeng  Chen Yihu  Jin Demin  Xu Pu  Mei Junxue  Weng Manli 《海洋学报(英文版)》2001,20(3):401-407

ImpIONPorghyra is one of the most important rnarine a1gae with glObal distribution and importanterenomic value. AIthOtJgh the yield of POrPhpo is lower than that of kelp, the output valueof Porghpp occupies the first place in rnarine algae in China. The traditional taxonomy ishanly had on the morpbolOgical characteristics, such as the morpbobeical traits size, rnar-gin celIs and the number of repnductive cells. However, most of morPhobeical traits are af:fected by environrnntal factOrs …  相似文献   

卵磷脂对花尾胡椒401幼鱼谷肤甘肤一硫一转移酶，谷肤甘肤过氧化物酶和DNA完整性的影响   总被引：7，自引：0，他引：7  

董宏坡  陈彦  谢仰杰  王重刚 《海洋科学》2004,28(4):25-28

采用不同卵磷脂添加量的配合饲料投喂花尾胡椒鲷(Plectorhyncchus cinctus）幼鱼，同步测定幼鱼的谷胱甘肽-硫-转移酶和谷胱甘肽过氧化物酶活性以及DNA完整程度。结果表明，谷胱甘肽-硫-转移酶和谷胱甘肽过氧化物酶活性随着饲料中卵磷脂含量的增加而提高，而DNA单链断裂程度随着饲料中卵磷脂含量的增加而减少。这提示卵磷脂能够提高鱼体的抗氧化防御系统的机能。  相似文献   

两种海蜇毒素的分子标记研究     

苏秀榕  杨春  黄晓春  李太武 《海洋与湖沼》2006,37(3):206-210

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术研究了8种同工酶在海蜇的刺胞和中胶层的表达特异性,利用RAPD技术对海蜇刺胞组织的DNA标记进行研究。结果表明,作为生物体防御清除自由基的SOD,在刺胞和中胶层均有表达。而与酯类化合物代谢相关的EST、维持细胞正常的能量代谢的ATPase,能在海蜇和口冠海蜇的刺胞中表达,而不能在中胶层中表达,所以,EST和ATPase可作为刺胞毒素的分子标记。碳水化合物代谢中重要的酶类MDH和ADH、清除细胞内H2O2的POD、催化磷酸单酯水解的重要酶类(与磷脂的转移、消化、吸收等活动密切相关的)ACP、在体外碱性环境下能水解有机磷脂键而产生一个有机基团和无机磷酸根的ALP,这5种酶仅在毒性较强的口冠海蜇刺胞中表达,MDH和ACP活性很高,在毒性相对较弱的海蜇刺胞中不表达。所以,这5种酶可作为海蜇毒性强弱的标记。以两种海蜇刺胞DNA为模板,S11、S32、S38、S95等4个随机引物的RAPD谱图差异明显,亦可作为毒素强弱的间接分子标记。  相似文献   

福建太平洋牡蛎种群微卫星DNA分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

陈曦  黄勤  江锦祥  马平 《台湾海峡》2007,26(4):548-554

本文采用Ucdcg153、157、202微卫星引物对福建两个太平洋牡蛎(学名为长牡蛎Crassostrea gigas)养殖种群进行扩增分析和序列测定.与采自漳浦旧镇的近江牡蛎(C. ariakensis)比较,前者对以上三种引物全部呈阳性反应,后者只对Ucdcg157显阳性.与Genebank提供的相关序列比较,福建太平洋牡蛎与Genebank样品应属同源,其中漳浦霞美和厦门白礁的样品则可能代表同一种群的两个衍生品系.本项调查结果同时显示,近亲繁殖的育苗方式已经导致福建太平洋牡蛎种群裂化;任其发展不利于维护良种优势.本次采集的样品中未发现显示葡萄牙牡蛎、熊本牡蛎和美洲牡蛎微卫星特征的个体.  相似文献