福建太平洋牡蛎种群微卫星DNA分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

陈曦  黄勤  江锦祥  马平 《台湾海峡》2007,26(4):548-554

本文采用Ucdcg153、157、202微卫星引物对福建两个太平洋牡蛎(学名为长牡蛎Crassostrea gigas)养殖种群进行扩增分析和序列测定.与采自漳浦旧镇的近江牡蛎(C. ariakensis)比较,前者对以上三种引物全部呈阳性反应,后者只对Ucdcg157显阳性.与Genebank提供的相关序列比较,福建太平洋牡蛎与Genebank样品应属同源,其中漳浦霞美和厦门白礁的样品则可能代表同一种群的两个衍生品系.本项调查结果同时显示,近亲繁殖的育苗方式已经导致福建太平洋牡蛎种群裂化;任其发展不利于维护良种优势.本次采集的样品中未发现显示葡萄牙牡蛎、熊本牡蛎和美洲牡蛎微卫星特征的个体.  相似文献   

切尔诺贝利核事故泄漏¹³⁷Cs在苏皖地区湖泊沉积物中的蓄积及时标意义   总被引：16，自引：1，他引：16  

项亮  王苏民  薛滨 《海洋与湖沼》1996,27(2):132-137

通过对１９９１年５月－１９９２年１０月间采自江苏固城湖和安徽女山湖的３个沉积孔柱中人工放射性核素１３７Ｃｓ比度垂直分布的分析研究，发现在该地区切尔诺贝利核事故泄漏１３７Ｃｓ有明显的蓄积，其峰值与核武器试验导致的１９６３年１３７Ｃｓ时最大蓄积峰值相当，具有同样的时标意义。因此，在苏皖地区这－１３７Ｃｓ蓄积峰值对研究现代湖泊沉积、水土流失和区域环境变化等都有重要价值。  相似文献   

Sequences Characterization of Microsatellite DNA Sequences in Pacific Abalone(Haliotis discus hannai)   总被引：1，自引：0，他引：1  

Kijima Akihiro 《中国海洋大学学报(英文版)》2007,(1)

1 Introduction Microsatellites or simple sequence repeats (SSRs) are tandemly repeated motifs of one to six bases found in all prokaryotic and eukaryotic genomes analysed to date (Zane et al., 2002). Due to their hyper-variable and co-dominant nature, relatively high abundance and random distribution in the genome, microsatellites are among the most efficient class of molecular markers. Such repeats display high polymorphism because of variation in repeat length and can be rapidly analysed t…  相似文献   

南海海域4种笛鲷的微卫星DNA分析     

郭煜嵩  刘楚吾 《广东海洋大学学报》2007,27(6):7-12

摘要：采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术，从20对西大西洋笛鲷（Lutjanus campechamus）的微卫星引物中筛选适用于红鳍笛鲷（L．erythopterus）、勒氏笛鲷（L.russellii）、紫红笛鲷（L.argentimaculatus）和约氏笛鲷（L.johnii）基因组分析的微卫星引物，分析4种笛鲷的遗传多样性及系统发生。经反应条件的优化，从20对引物中筛选出17对可稳定扩增出特异片段的引物。通过测序证实扩增产物含微卫星位点后，以该17对引物对4个种的群体进行遗传多样性分析。其中16对可在约氏笛鲷、勒氏笛鲷、紫红笛鲷基因组中扩增出重复性好的特异性条带，分别有65％、65％、60％呈现出种内多态：15对可在红鳍笛鲷中扩增出重复性好的特异性条带，并且全部呈现出种内多态。四种笛鲷中，红鳍笛鲷的多态性最高，高度多态基因座占检测座位的66．67％；勒氏笛鲷的多态性最低，低度多态基因座占43．75％。获得3个种间特异性分子标记。用风和DA两种方法计算4种笛鲷的遗传距离，构建了系统发生树。  相似文献   

长江、黄河和辽河水系中华绒螯蟹野生和养殖群体遗传变异的微卫星分析   总被引：15，自引：1，他引：14  

刘青  刘皓  吴旭干  何杰  董鹏生  王幼鹏  成永旭 《海洋与湖沼》2015,46(4):958-968

我国中华绒螯蟹(以下简称河蟹)养殖主要集中在长江、黄河和辽河流域,经过多年的人工养殖、跨流域引种和增殖放流等活动可能会对其遗传特性造成一定的影响,因此本研究利用29个微卫星标记对3个水系的野生和养殖群体进行了遗传特征分析。结果表明:(1)6个群体均表现出较高的遗传杂合度水平(Ho=0.702—0.744),香农信息指数(I)显示6群体的遗传多样性水平依次为:长江野生长江养殖黄河野生辽河养殖黄河养殖辽河野生。(2)分子方差分析(AMOVA)结果显示,来源于种群内个体间和个体内部的变异分别为14.02%和85.88%,群体间的遗传分化处于较低水平(FST0.05);(3)瓶颈效应和遗传结构分析显示,所有群体近期均经历过有效种群的降低,且6种群内个体的遗传组成混杂。综上所述,三水系野生和养殖群体均具有较高的遗传多样性,长江和黄河野生群体的遗传多样性略高于养殖群体;三水系河蟹野生群体的遗传分化与地理距离具有一定的相关性,长江养殖群体、黄河野生及养殖群体间的遗传分化较小可能与其跨流域引种及养殖群体逃逸造成其种质混杂有关。  相似文献   

长牡蛎(Crassostrea gigas)微卫星多重PCR 体系构建及其在家系鉴定中的应用     

纪仁平  李焕军  冯艳微  张荣良  王卫军  杨建敏 《海洋与湖沼》2015,46(6):1542-1548

筛选多态性高、特异性好、片段大小适中的10 个长牡蛎微卫星位点进行优化组合, 根据扩 增片段大小及同一荧光不重叠原则构建了两组五重PCR 体系。运用CERVUS 3.0 软件对0527 组27 个长牡蛎全同胞家系的643 个子代和0612 组27 个全同胞家系382 个子代分别进行亲权鉴定。结果 发现, 用两组微卫星五重PCR 鉴别时, 在0527 组和0612 组的鉴定成功率均为100%; 只用第一组微 卫星五重PCR, 可以将0527 组96%的子代和0612 组96%的子代鉴定到亲本; 只用第二组微卫星五 重PCR, 可以将0527 组97%的子代和0612 组95%的子代鉴定到亲本。本研究中筛选出的两组微卫 星五重PCR 体系在两组家系中的鉴定效率均较高, 可以快速有效地将子代个体鉴定至所属父母本, 在长牡蛎家系鉴定中具有很好的应用价值。  相似文献   

Genetic structure of the reef grouper Epinephelus merra in the West Indian Ocean appears congruent with biogeographic and oceanographic boundaries          下载免费PDF全文

Delphine Muths  Emmanuel Tessier  Jerome Bourjea 《Marine Ecology》2015,36(3):447-461

The reef fauna connectivity of the West Indian Ocean (WIO) is one of the least studied globally. Here we use genetic analyses of the grouper Epinephelus merra (Bloch 1793) to determine patterns of connectivity and to identify barriers to dispersal in this WIO marine area. Phylogeographic and population‐level analyses were conducted on cytochrome b sequences and microsatellites (13 loci) from 557 individuals sampled in 15 localities distributed across the West Indian Ocean. Additional samples from the Pacific Ocean were used to benchmark the WIO population structure. The high level of divergence revealed between Indian and Pacific localities (of about 4.5% in sequences) might be the signature of the major tectonic and climatic changes operating at the Plio‐Pleistocene transition, congruently with numerous examples of Indo‐Pacific speciation. In comparison, the E. merra sequences from the Indian Ocean constitute a monophyletic clade with a low average genetic distance (d < 0.5%). However both genetic markers indicated some structure within this ocean. The main structure revealed was the isolation of the Maldives from the WIO localities (a different group signature identified by clustering analysis, great values of differentiation). Both marker types reveal further significant structure within the WIO, mainly the isolation of the Mascarene Islands (significant AMOVA and isolation‐by‐distance patterns) and some patchy structure between the northernmost localities and within the Mozambique Channel. The WIO genetic structure of E. merra appeared congruent with main biogeographic boundaries and oceanographic currents.  相似文献   

东北亚地区Ms5.0以上地震前后空间电场时空演化特征研究     

杨牧萍  张学民  泽仁志玛  申旭辉  黄建平  钱庚  金艳铭  黄明威 《地震》2021,41(4):78-92

本文利用2005年1月—2009年12月DEMETER电磁卫星观测的极低频/甚低频(ELF/VLF)39 Hz~6 kHz频段电场功率谱密度(PSD)观测量, 将研究频段划分为5个子频段对东北亚地区(38°N~58°N; 105°E~145°E)内发生的8个M_S≥5.0地震前后空间电场时空演化特征进行研究。 研究发现同一地震不同频段异常扰动区域并不完全在同一位置, 且同一地震的不同频段地震前后扰动形态也并不一致; 8个地震40次统计中有25% 的统计数据虽然基本在地震前后所有时间段都超过阈值2σ, 但未见明显扰动规律, 其余75%的统计数据中发现其扰动特征可以归纳为3类: 52%的统计数据在震前扰动幅度增大, 达到最大时发震, 震后持续降低; 7.5%的统计数据在震前扰动幅度达到高值, 而后下降过程中发震; 15%的统计数据在震前扰动幅度一直在增加且绝大部分时间低于2σ, 直至震后超过2σ, 且出现这种类型的异常均为震例的第五频段演化特征。 异常扰动区域主要集中在震中±4°以外的区域。  相似文献   

巴基斯坦N区块浪控三角洲沉积相划分及模式     

陈旭  欧荣生  斯尚华  董玉文  柯钦 《沉积学报》2022,40(1):255-266

浪控三角洲砂体是海陆交互带沉积有利的油气储层和勘探目标,目前业界对其微相划分、沉积机理和沉积模式研究较少.以巴基斯坦N区块为例,依据岩心、测井、地震及分析测试资料,开展受波浪改造作用的海相三角洲沉积相带划分、展布及沉积模式研究.结果表明:综合大量沉积相标志分析,研究区白垩系处于砂质高能海岸带,三角洲入海口受到强烈的波浪...  相似文献   

Anthropogenic marker evidence for accelerated sedimentation in Lake Illawarra,New South Wales,Australia   总被引：1，自引：0，他引：1  

B. E. Chenhall  I. Yassini  A. M. Depers  G. Caitcheon  B. G. Jones  G. E. Batley  G. S. Ohmsen 《Environmental Geology》1995,26(2):124-135

The chronology of near-surface sediments in Lake Illawarra has been investigated using radiocarbon dating and anthropogenically derived substances including trace metals, ash, and¹³⁷Cs. Sediments at depths about 1 m below the water-sediment interface ranged in age from Modern to 786 calendar years bp on the basis of radiocarbon dating ofNotospisula trigonella valves. Multiple marker (for example ash-trace metals) depth-concentration sediment profiles yielded estimates of sedimentation rate ranging from 3 to 5 mm yr^–1 at Griffins Bay to more than 16 mm yr^–1 at Macquarie Rivulet. Sedimentation rates of approximately 10 mm yr^–1 appeared to be typical of the western and southwestern portions of the lagoon. Rates of sediment accretion, prior to catchment clearing, urbanization, and industrialization have been estimated at less than 1 mm yr^–1, thus indicating a general tenfold increase in sediment accumulation adjacent to the western foreshore caused by catchment development. Accelerated sedimentation in shallow coastal lagoons constitutes significant environmental impacts including shoaling, degradation of seagrass beds, and increased turbidity with consequent loss of aesthetic appeal. Management policy should be directed at attempts to reduce the amount of sediment input by the construction of strategically placed sediment retention ponds. Siltation within the shallow embayments of Lake Illawarra could be ameliorated by a carefully planned program of dredging.  相似文献