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Bacterial abundance, phytoplankton community structure and environmental parameters were investigated to study the relationships between bacteria and phytoplankton during giant jellyfish Nemopilema nomurai blooms in the central Yellow Sea during 2013. N. nomurai appeared in June, increased in August, reached a peak and began to degrade in September 2013. Results showed that phosphate was possible a key nutrient for both phytoplankton and bacteria in June, but it changed to nitrate in August and September. Phytoplankton composition significantly changed that pico-phytoplankton relative biomass significantly increased, whereas other size phytoplankton significantly decreased during jellyfish bloom. In June, a significantly positive correlation was observed between chlorophyll a concentration and bacterial abundance(r=0.67, P0.001, n=34).During jellyfish outbreak in August, there was no significant correlation between phytoplankton and bacteria(r=0.11, P0.05, n=25), but the relationship(r=0.71, P0.001, n=31) was rebuilt with jellyfish degradation in September. In August, small size phytoplankton occupied the mixed layer in offshore stations, while bacteria almost distributed evenly in vertical. Chlorophyll a concentration significantly increased from(0.42±0.056) μg/L in June to(0.74±0.174) μg/L in August, while bacterial abundance just slightly increased. Additionally, the negative net community production indicated that community respiration was not entirely determined by the local primary productivity in August. These results indicated that jellyfish blooms potentially affect coupling of phytoplankton and bacteria in marine ecosystems. 相似文献
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聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)较容易受到某些抑制成分的影响,尤其是在对复杂环境样品进行的荧光定量PCR反应中,定量结果的准确性更易受到影响。为减轻这种抑制作用,以采自长江口邻近海域沉积物的DNA为研究对象,采用稀释模板法和添加BSA法对荧光定量PCR反应进行了优化。结果表明2种方法都有减轻抑制的作用,但若考虑方法的准确性和检测的便捷性,则以添加BSA的方法更为优越,最适添加浓度为0.1～0.5μg/μL。这一检测方法的改进,为研究沉积物中微生物在硝化过程中的重要作用提供了可靠的技术途径。 相似文献
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本研究利用Illumina Hiseq2000对不同生长时期的玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi)进行转录组测序,得到的转录本通过NR、NT、Swiss-Prot和KOG数据库进行功能分类,通过GO和KEGG数据库进行相关代谢途径分析和基因差异表达分析,在此基础上构建了S.marinoi的脂肪酸生物合成途径,发现共存在26种酶和蛋白对应的33个编码基因,对这33个基因序列进行比对发现其与假微型海链藻(Thalassiosira pseudonana)的同源性较高。在该代谢通路中,S.marinoi在不同生长时期出现显著差异表达的基因有15个。与指数期相比,柠檬酸裂解酶和长链酰基-CoA合成酶(Comp14198_c0)的编码基因在稳定期和衰亡期出现显著下调表达,而柠檬酸合酶的编码基因仅在稳定期出现显著下调表达。与之相反的是,以乙酰-CoA羧化酶编码基因为代表的12个编码基因在稳定期和衰亡期均出现了显著上调。通过分析,初步推测S.marinoi在稳定期的脂肪酸合成能力高于指数期。这些信息为海洋微藻脂肪酸生物合成途径的研究提供了理论基础,有助于对S.marinoi进行基因改造,提高脂肪酸的合成量。同时,又能为赤潮的防治提供新的思路。 相似文献
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本文以氨氧化细菌(ammonia-oxidizing bacteria,AOB)特征基因氨单加氧酶(ammonia monooxygenase,AMO)α亚基基因(amoA)为目标基因(～491bp),分别采用克隆文库、454高通量测序和illumina测序技术对其群落结构进行了比较研究。结果表明, 454高通量测序和illumina测序技术得到的菌群多样性及丰富度均高于克隆文库技术。在菌群组成方面,虽然3种测序技术检测到的优势类群均为亚硝化螺菌,但在菌群丰度方面存在差异。3种测序技术中,克隆文库技术在很大程度上可能高估物种丰度,且对部分低丰度类群的检测能力有限;illumina单端测序由于其测序片段较短,可能存在物种注释错误、不能准确区分各物种间序列差异等问题;比较而言, 454高通量测序技术能较为全面和准确地反映海洋沉积物中AOB的菌群结构特征。 相似文献
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全球甲烷排放主要来源于厌氧环境中产甲烷菌的代谢活动。采集渤海典型站位沉积物样品,测定了沉积物中甲烷和硫酸盐含量。通过提供不同类型产甲烷底物进行培养,分析了各样品中甲烷产量;通过高通量测序,分析了产甲烷菌群落特征。结果表明,渤海沉积物中产甲烷途径以甲基营养型为主,同时具有H2/CO2还原型途径。同一站点随着深度的增加,甲烷产生量逐渐减少,产甲烷速率相应降低。古菌群落以Crenarchaeota、 Asgardaeota和Nanoarchaeota为主,产甲烷菌Ca.Methanofastidiosales占据优势地位。本研究为全面了解产甲烷菌在海洋生境中产甲烷过程提供了重要参考。 相似文献
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实时荧光定量PCR(qRT-PCR)是定量分析基因表达的常用方法,选择合适的内参基因对准确分析目的基因表达水平至关重要。本研究以不同铁浓度培养条件下的玛氏骨条藻为材料,定量分析Cytb、EF-1α、HPRT、UBC、GAPDH、β-actin以及β-tubulin 7个内参基因的表达情况,并利用GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件对这些内参基因的稳定性进行综合评价。结果表明,Cytb和EF-1α的表达稳定性较好,EF-1α+Cytb组合的稳定性最佳,是玛氏骨条藻基因表达研究的理想内参基因,而其他基因的表达稳定性较差,不适合作为内参基因。本研究为玛氏骨条藻基因表达研究过程中内参基因的选择提供了方法学上的依据。 相似文献
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赤潮藻鉴定与定量检测方法进展 总被引：2，自引：0，他引：2
从基于形态学差异的图像识别技术、基于核酸分析的检测方法、基于免疫分析的检测方法、基于特征色素的方法和基于光学特性的方法5个方面,比较系统地回顾了有关赤潮藻定性鉴定和定量检测技术的发展,并就存在的问题和发展趋势作了简要分析。 相似文献
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于2006年6月和2007年4月在长江口及毗邻海区采集了表层沉积物样品，利用水淘选法对沉积物进行了粒径分级，并采用改进后的SEDEX方法对沉积物样品及分粒级沉积物样品进行了磷形态分析。结果表明，2006年6月和2007年4月长江口及毗邻海区沉积物总磷变化分别为1256~1964 μmol/g和899~1991 μmol/g，其中碎屑磷是磷的主要存在形态。可交换态磷、铁结合态磷、有机磷、自生磷灰石磷及难分解有机磷在长江口外的平面分布比较一致，均在紧邻长江口门外、杭州湾外的条状带出现了含量的高值，而在口门内及口门外河口靠海一侧碎屑磷含量较高。不同形态磷在不同粒径沉积物中的含量不尽相同：有机磷、自生磷灰石磷以及难分解有机磷是小于8 μm粒级沉积物中磷的主要组成部分，而且其在总磷中所占比例随沉积物粒径的增加而下降；碎屑磷则主要集中在粗沉积物中，为32~63 μm及大于63 μm粒级沉积物中磷的主要贡献者。沉积物的粒度分异以及各形态磷在不同粒径沉积物中含量的差异，共同影响着河口沉积物中磷的分布 相似文献
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Behavior of different phosphorus species in suspended particulate matter in the Changjiang estuary 总被引：1，自引：0，他引：1
Suspended particulate matter (SPM) collected in the Changjiang (Yangtze River) estuary in June 2006 was separated into five
fractions via water elutriation: clay-very fine silt (<8 μm), fine silt (8–16 μm), medium silt (16–32 μm), coarse silt (32-63
μm) and sand (>63 μm). The SPM and fractionated particles were sequentially analyzed by a modified SEDEX sequential extraction
method to obtain six species of phosphorus: exchangeable or loosely-sorbed P, organic P, Fe-bound P, authigenic P, detrital
P and refractory P. The results indicated that all particulate phosphorus species except for detrital P were negatively correlated
to particle size; a high detrital P content was found in coarse silt and very coarse silt. From the inside of the river mouth
to the gate of the river mouth, organic P, Fe-bound P and refractory P in the suspended particles decreased and a higher amount
of exchangeable P appeared around the gate of the river mouth. From the gate of the river mouth to the sea, exchangeable P
and organic P in suspended particles increased distinctly. The total particulate P flux into the estuary from the Changjiang
River was about 45.45×108 μmol/s during sampling. Of this, about 8.27×108 μmol/s was associated with the “truly suspended” fraction. The bio-available particulate P flux was about 13.58×108 μmol/s. Of this, about 4.24×108 μmol/s was transported by “truly suspended” particles. 相似文献