宽体沙鳅(Botia reevesae)β-肌动蛋白基因的cDNA克隆与表达分析     

覃川杰  陈立侨  岳兴建  李二超  王永明  邹远超  谢碧文  齐泽民 《海洋与湖沼》2013,44(2):396-402

利用RT-PCR和快速扩增cDNA末端(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术首次克隆了宽体沙鳅(Botia reevesae)-肌动蛋白基因的cDNA全序列,该序列全长为1795bp,由长100bp的5非翻译区(untranslated region,UTR)、570bp的3非翻译区和1125bp的开放阅读框(open reading frame,ORF)组成,编码375个氨基酸。宽体沙鳅-actin氨基酸序列包含1个糖基化位点、9个N-豆寇酰化位点、3个actin信号位点等主要结构区域。PSI-BLAST比对表明,宽体沙鳅-actin氨基酸与真鲷、罗非鱼、虹鳟等鱼类同源性达99%。NJ法系统进化分析显示宽体沙鳅-actin首先与鲢聚在一起,然后与、尖头等鱼类聚在一起。荧光定量PCR检测-actin基因在宽体沙鳅脑、鳃、心脏、肝、胃等12个组织的表达无显著差异(P<0.05),具有良好的稳定性。  相似文献   

浙江枝吻纽虫（Dendrorhynchus zhejiangensis）凝溶胶蛋白和肌动蛋白基因的克隆与序列分析          下载免费PDF全文

陈蕾  李晔  苏秀榕  江锦坡  李太武  李振  周君  刘艳  夏长革 《海洋与湖沼》2011,42(2):193-200

利用已构建的浙江枝吻纽虫cDNA文库,通过PCR技术扩增得到gelsolin和actin基因的全长cDNA序列。其中,gelsolin的cDNA全长1947bp,5′-非翻译区62bp,3′-非翻译区778bp,开放阅读框1107bp,编码369个氨基酸;actin的cDNA全长为1830bp,5′-非翻译区167bp...  相似文献   

鳜鱼(Siniperca chuatsi)β-肌动蛋白基因cDNA全序列与5′侧翼区的克隆与分析   总被引：4，自引：0，他引：4  

刘秀霞  梁旭方  王琳  端金霞  李光照  廖婉琴 《海洋与湖沼》2009,40(1):102-108

采用RT-PCR及RACE法,分离、克隆鳜鱼β-肌动蛋白基因cDNA全序列,再用基因组步行法(Genome Walker)克隆鳜鱼β-肌动蛋白基因5'调控区.序列分析结果表明,鳜鱼β-肌动蛋白基因全长1897bp,其中5'-UTR长94bp,3'-UTR长675bp,编码区长1128bp,编码375个氨基酸.将所得序列与其它动物类群的β-肌动蛋白基因序列进行比较分析显示,鱼类、两栖类、鸟类、哺乳类等不同类群脊椎动物B-肌动蛋白氨基酸序列同源性均在96%以上,说明该基因在生物进化过程中高度保守.通过鳜鱼与其它脊椎动物β-肌动蛋白基因的核苷酸序列构建的进化树显示,脊椎动物β-肌动蛋白聚类成3个分支,鱼类β-肌动蛋白基因形成一个独立的分化群,说明鱼类β-肌动蛋白基因起源于-个共同祖先.克隆得到的鳜鱼β-肌动蛋白基因5'侧翼序列长1399bp,对其进行序列分析,在其起始密码字ATG上游200bp范围内发现含有CAAT box、CC(A/T)6GG(CArG box)、TATA box对转录调控起重要作用的顺式元件,同时在侧翼区也发现含有GC box、MYOD、YY1、SP1、GATA等多个潜在调控元件.鳜鱼β-肌动蛋白基因5'侧翼序列的克隆成功,为今后转基因鳜鱼的研究工作奠定了基础.  相似文献   

Cloning and characterization of an actin gene of Chlamys farreri and the phylogenetic analysis of mollusk actins   总被引：1，自引：0，他引：1  

马洪明  麦康森  刘付志国  徐玮 《中国海洋湖沼学报》2007,25(3):304-309

  相似文献   

Cloning and Characterization of an Abalone （Haliotis discus hannai ） Actin Gene   总被引：2，自引：0，他引：2  

MAHongming XUWei MAIKangsen LIUFUZhiguo CHENHong 《中国海洋大学学报(英文版)》2004,3(2):145-149

1　Introduction　Actinisanimportantcontractileproteinineukary oticcells .Itisoneofthetwomajorcomponentsin volvedinthecontractionofmusclecells .Innon mus clecells ,itisthemajorpartofcytoskeletoninvolvedinmanyprocessessuchascellmotility ,endocytosis ,exocyt…  相似文献   

缢蛏(Sinonovacula constricta)cDNA文库的构建及肌动蛋白基因的研究     

秦玉明  苏秀榕  李晔  马斌  李惠  王孟前  贺静静  李太武 《海洋与湖沼》2010,41(1):54-60

  相似文献   

曼氏无针乌贼(Sepiella maindroni)-肌动蛋白基因的 cDNA 全长克隆与序列分析     

李继姬  郭宝英  吴常文 《海洋与湖沼》2011,42(6):787-793

采用RT-PCR和快速扩增cDNA末端(rapid amplification of cDNA ends, RACE)技术首次克隆了曼氏无针乌贼?-肌动蛋白基因的 cDNA 全序列, 该序列全长为 2000bp, 由长 197bp 的 5’非翻译区(untranslated region, UTR), 669bp 的 3’非翻译区, 和 1134bp 的开放阅读框(open reading frame, ORF)组成。阅读框共编码 377 个氨基酸, 推算的分子量约为 42.0kDa, 理论等电点为 5.16。曼氏无针乌贼-actin 氨基酸序列中 Ile12、Ser172、Ser174、Gln223、His227、Ile231、Gly232、Ser320、Glu328、 Thr360等10个氨基酸残基具有特异性, 以及2个特殊的氨基酸残基位点和2个软体动物特有的氨基酸残基。曼氏无针乌贼?-actin 氨基酸序列与软体动物、节肢动物、脊椎动物的相似性高达 97%。NJ法系统进化分析显示曼氏无针乌贼首先与软体动物聚在一起, 然后与节肢动物聚在一起, 再与鱼类、两栖类、哺乳类聚在一起。  相似文献   

一种基于干扰肌动蛋白基因导致方形网纹溞(Ceriodaphnia quadrangula)死亡的RNA干扰(RNAi)模型构建     

陈宏健  谢松  李理想  柳峰松 《海洋与湖沼》2014,45(2):322-327

方形网纹溞(Ceriodaphnia quadrangula)可作为研究水生动物生物学的良好模式动物。为探索细菌介导表达的双链RNA(dsRNA)对方形网纹溞进行RNA干扰(RNAi)技术是否可行,本研究构建了方形网纹溞肌动蛋白(actin)基因的干扰载体Actin-L4440,并将其转入大肠杆菌HT115。此宿主菌经异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)诱导后能表达actin基因部分片段的dsRNA。将此宿主菌投喂方形网纹溞,能抑制其体内actin基因的表达,并导致方形网纹溞死亡率明显提高。本研究成功构建了方形网纹溞的RNAi模型,为以后的研究提供了一定的参考。  相似文献   

合浦珠母贝β-肌动蛋白基因的克隆和序列分析   总被引：2，自引：1，他引：1  

凌立  谢莉萍  张勇  蒲训  张荣庆 《海洋科学》2006,30(8):64-70

为进一步研究珍珠质基质蛋白外排机制,同时为今后合浦珠母贝(Pinctada fucata)不同组织的基因表达研究提供阳性对照,根据大鼠(Rattus norvegicus)胞质型肌动蛋白β-actin设计引物,通过RT-PCR方法克隆鉴定了合浦珠母贝肌动蛋白同源基因片段。序列分析表明,该片段编码的氨基酸序列与相应同源片段具有较高的保守性。合浦珠母贝β-肌动蛋白有多个特有的氨基酸残基。合浦珠母贝可能是在系统进化上较早分出的一支。  相似文献   

心跳的秘密     

《海洋世界》2009,(2):9-9

是什么控制了心跳？实验证明，心跳的过程并没有我们想象得那么复杂。心脏细胞中钙离子的突然增加使细胞中的大量纤维互相“拉扯”、收缩，进而引发心跳。这些纤维由两种蛋白组成肌动蛋白和肌球蛋白。在纤维收缩发生之前，肌动蛋白必须首先被激活。过去，人们认为钙离子和肌球蛋白共同参与了肌动蛋白的激活过程。伦敦大学国王学院的研究者发现，激活肌动蛋白似乎只有钙离子而已。  相似文献