强光照和黑暗条件下刺参体壁的基因表达差异     

张立斌  冯其明  孙丽娜  房燕  徐冬雪  张涛  杨红生 《海洋学报(英文版)》2018,37(5):54-66

参对光照变化非常敏感，研究刺参对光照的分子响应非常重要。本研究应用RNA测序获取了刺参暴露于强光（“强光”）、正常光照（“对照”）和完全黑暗（“黑暗”）环境下体壁的基因表达谱情况，通过“对照”与“黑暗”，“对照”与“强光”和“黑暗”与“强光”的比较，在|log₂ ratio|≥1和FDR≤0.001的标准下分别发现了1161、113和1705个差异表达基因（DEGs）。基因本体分析表明，“cellular process”和“binding”在“生物过程”和“分子功能”类别中的DEGs富集最多，而“cell”和“cell part”在“细胞组分”类别中的DEGs富集最多。将DEGs与Kyoto Encyclopedia基因和基因组数据库上的于214、41和229条通路进行比对，发现了51、2和57条通路分别显著富集。本研究发现的光特异性DEGs可作为深入研究刺参对光照变化的生化适应机制的重要目标基因。  相似文献   

雨生红球藻β-胡萝卜素酮化酶基因克隆、分析及叶绿体表达载体构建     

檀琮萍  梁成伟  苏忠亮  秦松 《海洋通报》2007,26(1):35-40

β-胡萝卜素酮化酶(BKT)是雨生红球藻虾青素合成途径中的关键酶。根据GenBank中所收录的雨生红球藻BKT的cDNA序列设计特异性引物,以高光照处理的雨生红球藻细胞的总RNA为模板,采用RT-PCR的方法克隆出了β-胡萝卜素酮化酶基因(bkt)。序列测定结果表明,bkt全长960bp编码320个氨基酸。克隆的bkt序列与GenBank收录的BKT的cDNA(AY603347)序列只相差一个碱基。并对其编码的氨基酸进行了二级结构的预测和疏水性分析。同时将所克隆的bkt构建入衣藻叶绿体表达载体p64Dbkt,为基因的进一步表达研究及探索其作用机制奠定了基础。  相似文献   

盐胁迫对番茄同工酶基因表达的影响     

高明君  常青山  董树刚  刘志鸿  李玉真 《中国海洋大学学报(自然科学版)》1996,(1)

分析了普通番茄（Lycopersicumesculentum）在NaCl胁迫下酯酶（EST）和过氧化物酶（PRX）同工酶的变化，考察了盐胁迫对10个同工酶位点21个等位基因在特定组织中表达的影响。发现许多EST和PRX等位基因在盐胁迫下表达，产生盐诱导同工酶；另有些等位基因的表达受盐抑制，它们在盐胁迫下的表达活性显著减弱或消失。实验表明，EST和PRX同工酶表达的变化与番茄对盐胁迫的遗传适应性有密切关系。  相似文献   

引物退火控制技术在差异表达基因克隆中的应用   总被引：4，自引：0，他引：4  

谢芳靖  张子平  林鹏  王艺磊 《海洋科学》2007,31(5):70-75

许多年以来,分离差异表达基因的方法仅限于差异筛选cDNA文库,直到1992年Liang等[1]发明了一种检测基因转录模式的方法,即mRNA差异显示技  相似文献   

假单胞菌(Pseudomonas sp.cn4902)磷酸甘油磷酸酯酶基因克隆与鉴定     

刘广发  张会永  谢金镇 《海洋与湖沼》2005,36(4):313-318

采用随机克隆、功能筛选、逐次排除和同源比较的基因克隆新策略进行克隆假单胞菌(Pseudomonas sp．cn4902)磷酸甘油磷酸酯酶基因的研究。结果表明，该结构基因长819bp，与铜绿假单胞菌的磷酸甘油磷酸酯酶基因的核苷酸一致性达61．5％，氨基酸同源性为56．2％。该基因已输入GenBank数据库，收录号AF348165。将该基因转化大肠杆菌，受体菌在含NaCl 1．0mol／L的培养基中甘油含量升高2．9倍，最终菌浓度提高3．6倍。可见这是一个与生物耐盐性相关的主基因，以其转化、培育耐盐农作物的前景十分光明。  相似文献   

现场海域水平扩散系数的探讨　Ⅱ．黄河三角洲埕北海域的计算     

匡国瑞  陈伯海  徐天真  钱成春  俞光耀 《中国海洋大学学报(自然科学版)》1995,(3)

根据Ｔａｙｌｏｒ的湍流扩散理论和Ｈａｙ、Ｐａｓｑｕｉｌｌ提出的拉格朗日流和欧拉流的相关函数的相似性，用黄河三角洲埕北海域的实测资料，按四种不同方案计算出该海域的水平扩散系数和谱密度分布。指出：该海区潮流扩散系数主要受潮流的影响，其分布特征与潮流的分布基本一致，所求的水平扩散系数主要是由周期性的潮运动给予潮流扰动所致。方案４是通过富氏变换滤波消去了周期性潮流扰动，本方案计算的水平扩散系数是由周期为６ｈ以下的小尺度涡提供能量。  相似文献   

Information for Contributors     

《海洋工程》2007,(4):F0003

  相似文献   

最小弧菌热不稳定型溶血素基因克隆与序列分析     

李涛  吴后波 《台湾海峡》2006,25(3):324-329

根据已发表的最小弧菌热不稳定型溶血素（heat-labile hemolysin）基因核苷酸序列，设计和合成一对特异性引物，以最小弧菌96-6-3的基因组DNA为模板，PCR扩增得到热不稳定型溶血素基因片段，克隆到质粒载体pMD-18T中进行测序和分析．其结果表明扩增的热不稳定型溶血素基因片段与已发表的最小弧菌热不稳定型溶血素的同源性高达98％，扩增片段编码由446个氨基酸组成的多肽，推测分子量为50200．软件分析表明编码的氨基酸有较高的抗原性，可作为基因工程疫苗的候选基因片段．  相似文献   

等离子体技术及其在地质上的应用     

S．E．Jackson周世光  王圣洁 《海洋地质前沿》1994,(7):19-21

激光烧蚀微探针等离子体质谱的地质应用。自1989年以来，我们实验室就积极开展了激光烧蚀微探针(LAM)试样引入系统的研究工作，这种技术适合于ICP—MS分析地质样品中小体积矿物(激光烧蚀孔穴直径低于10—100μm)．对某些样品．采用Nd：YAG激光的基本IR波长(1064nm)，作为多数用途，4倍频率(uv)的波长(266nm)能产生较小的直径，并较好地形成孔穴．  相似文献   

旧路改建高速公路中地基强夯效应测试与工艺参数分析   总被引：2，自引：1，他引：1  

吕国仁  崔新壮 《岩土力学》2008,29(9):2542-2546

旧路改建高速公路遇到的最主要的问题是地基的不均匀沉降。数值分析表明,对新的天然地基进行处理是解决这一问题的关键。强夯是加固地基的一种有效措施,为了对强夯工艺参数进行优化研究,对夯锤冲击地面过程中产生的动孔隙水压力、动土应力以及夯后超静孔隙水压力的消散过程进行了跟踪测试与分析。结果表明,对以风化料为主的地基,最大夯击数不宜超过4击,而且铺底夯完成2d后就可进行满夯。  相似文献