Genetic history of the population of Atlantic salmon, Salmo salar L., under restoration in the Connecticut River, USA     

Ayllon  Fernando; Martinez  Jose L.; Juanes  Francis; Gephard  Stephen; Garcia-Vazquez  Eva 《ICES Journal of Marine Science》2006,63(7):1286-1289

  相似文献   

Spring-spawning herring (Clupea harengus L.) in the southwestern Baltic Sea: do they form genetically distinct spawning waves?     

Hede Jorgensen  Hanne B.; Hansen  Michael Moller; Loeschcke  Volker 《ICES Journal of Marine Science》2005,62(6):1065-1075

  相似文献   

许氏平鲉(Sebastes schlegeli)微卫星标记开发及野生、养殖群体遗传多样性分析   总被引：1，自引：1，他引：0  

韩承慧  马海涛  姜海滨  刘阳  韩慧宗  王斐 《海洋与湖沼》2016,47(1):213-220

对许氏平鲉进行简化基因组测序,设计微卫星引物200对,可稳定扩增的引物190对,占95%。利用一个荣成野生群体对24个多态性较高的微卫星标记进行了评价,每个位点的等位基因数(Na)为2—21个,观测杂合度(Ho)为0.0417—0.9167,期望杂合度(He)为0.0278—0.9722,多态信息含量(PIC)为0.1948—0.9496,结果显示有20个微卫星位点为中高度多态。利用这些引物对荣成野生群体和烟台养殖群体的遗传多样性进行了比较分析,野生和养殖群体的平均等位基因数(Na)分别为8.5000、6.9583,有效等位基因数(Ne)的均值分别为4.5484、3.6365,期望杂合度(He)均值分别为0.6421、0.5840,多态信息含量均值(PIC)分别为0.6088、0.5490,平均香农-威纳指数均值为1.4605、1.2834,但F检验发现无显著差异,发现两个群体的遗传多样性都处于高度多态水平,但养殖群体遗传多样性水平低于野生群体。本研究结果说明许氏平鲉的人工繁育中,通过使用较大数量的亲本进行繁育可有效防止选育群体的遗传多样性降低,但人工定向选育对选育群体的遗传多样性也产生了一定的影响。Bonferroni校正后在两个群体中各有4个位点偏离Hardy-Weinberg平衡。本研究开发的微卫星标记为许氏平鲉遗传图谱构建、分子标记辅助育种等提供了更多标记选择,对野生和养殖群体遗传多样性分析为下一步的遗传育种提供参考。  相似文献   

Preliminary Study on Applicability of Microsatellite DNA Primers from Parasite Protozoa Trypanosoma cruzi in Free-living Protozoa   总被引：1，自引：0，他引：1  

ZHANGWenjing YUYuhe SHENYunfen MIAOWei FENGWeisong 《中国海洋大学学报(英文版)》2004,3(1):80-84

1　Introduction　Generallyknownasacodominantgeneticmarker ,microsatellitehasbeenwidelyusedinstudiesonpopu lationgenetics,high resolutiongenotyping ,genemap ping ,evolution ,linkageanalysis ,conservationbiology ,behaviouralecology ,relationsbetweenparasite…  相似文献   

中国鲎基因组微卫星富集文库的构建及分析     

宁晔凤  黎中宝  戴刚  上官静波  李清荟 《海洋科学》2015,39(4):15-20

本研究旨在从DNA分子水平上研究中国鲎(Tachypleus tridentatus)种群遗传多样性及种群结构等相关信息,以期为保护其野生群体种质资源提供科学依据。本研究通过生物素—磁珠富集法筛选微卫星标记,构建中国鲎基因组微卫星文库。基因组DNA经Fast Digest Tru1I酶切后,选取400 bp~1000 bp片段,用生物素标记的(GT)15、(CT)15混合探针与其杂交,杂交复合物与链霉亲和素磁珠结合,捕获含有重复序列的微卫星片段,纯化后连接PMD19-T载体克隆,构建基因组微卫星文库。从334个阳性克隆中随机选取196个片段大于400 bp的阳性克隆进行测序,共获得127个微卫星序列,其中完美型占69.3%、非完美型占11.0%、复合型占19.7%。除探针使用的GT和CT的重复序列外,还筛选到多碱基GCT、TGG、AAAC、ACAA、GATTT、TTTTA的重复序列。根据微卫星序列设计选择合成40对引物,结果显示其中3对具有较高多态性,可作为进一步评价中国鲎野生种质资源等遗传信息的有效遗传标记。  相似文献   

红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)耐低温相关微卫星标记的初步筛选     

袁晨浩  刘志峰  马爱军 《海洋科学》2022,46(2):97-104

采用微卫星结合混合群体分离分析法技术（SSR-BSA）对红鳍东方鲀群体进行耐低温相关微卫星标记的筛选。首先对300尾红鳍东方鲀幼鱼进行低温处理,分别获得34尾耐低温（S组）和不耐低温个体（D组）。分别在两组中随机挑选15尾提取基因组DNA,构建耐低温和不耐低温DNA混池,然后用148对微卫星引物对其进行扫描。结果发现4个标记（fms45、fms82、fms100和fms182）在耐低温和不耐低温DNA混池中扩增出差异条带。用S组和D组全部个体对4个标记进行单个体验证,结果显示由fms100扩增,携带有116 bp条带的个体在S组和D组的出现频率分别是53%和18%,132 bp条带的出现频率分别是59%（S组）、24%（D组）;由fms182扩增,携带有125 bp的个体在S组和D组出现的频率分别是12%和35%,经卡方检验P值均小于0.05,差异显著。本文关于红鳍东方鲀耐低温分子标记的报道,为研究红鳍东方鲀耐低温的遗传基础以及相关分子机制提供了依据,也为开展红鳍东方鲀耐低温分子标记辅助选育提供了良好的基础。  相似文献   

Analysis of genetic diversity and differentiation of seven stocks of Litopenaeus vannamei using microsatellite markers     

Kai Zhang  Weiji Wang  Weiya Li  Quanqi Zhang  Jie Kong 《中国海洋大学学报(英文版)》2014,13(4):647-656

Seven microsatellite markers were used to evaluate the genetic diversity and differentiation of seven stocks of Litopenaeus vannamei, which were introduced from Central and South America to China. All seven microsatellite loci were polymorphic, with polymorphism information content(PIC) values ranging from 0.593 to 0.952. Totally 92 alleles were identified, and the number of alleles(Na) and effective alleles(Ne) varied between 4 and 21 and 2.7 and 14.6, respectively. Observed heterozygosity(Ho) values were lower than the expected heterozygosity(He) values(0.526–0.754), which indicated that the seven stocks possessed a rich genetic diversity. Thirty-seven tests were detected for reasonable significant deviation from Hardy-Weinberg equilibrium. Fis values were positive at five loci, suggesting that there was a relatively high degree of inbreeding within stocks. Pairwise Fst values ranged from 0.0225 to 0.151, and most of the stock pairs were moderately differentiated. Genetic distance and cluster analysis using UPGMA revealed a close genetic relationship of L. vannamei between Pop2 and Pop3. AMOVA indicated that the genetic variation among stocks(11.3%) was much lower than that within stocks(88.7%). Although the seven stocks had a certain degree of genetic differentiation and a rich genetic diversity, there is an increasing risk of decreased performance due to inbreeding in subsequent generations.  相似文献   

红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)性别差异微卫星标记的筛选     

岳亮  马爱军  赵艳飞  王新安  何伟国  孟雪松  翟介明  刘圣聪 《海洋与湖沼》2014,45(1):172-177

采用以BSA为基础的微卫星标记技术对红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)雌、雄群体进行性别差异标记筛选的研究。用雌、雄各30个个体构建雌、雄基因池,利用66对微卫星引物扫描雌、雄基因池。在雌、雄基因池中扩增出差异条带的引物有8对。用两个各包括30个雌、雄个体的群体对这8对引物进行两轮个体验证。结果表明,引物f383在两个雌、雄群体中扩增出的差异条带与性别都呈极显著相关性(r分别为0.710和0.673)(P0.01),f383是与红鳍东方鲀雄性呈正相关的微卫星标记。红鳍东方鲀性别差异微卫星标记的获得,为其性别相关基因的克隆和性别决定机制的研究提供理论基础。  相似文献   

东北亚地区M_S6.0以上地震异常电磁波动研究     

杨牧萍  钱庚  张学民  申旭辉  张萌  金艳铭 《大地测量与地球动力学》2022,42(7):669-674

利用2005-01~2009-12 DEMETER电磁卫星详查模式下磁场与电场的极低频（ELF）三分量波形数据,选取东北亚地区（38°~58°N,105°~145°E）6个M_S≥6地震,对震前30 d震中上空±10°的6 000余条1130和1135轨道数据进行波矢分析和坡印廷矢量分析。结果发现,2005-08-16日本本洲东岸近海M_S7.2地震和2009-06-05日本北海道地区M_S6.6地震震前在质子回旋频率以下记录到来源于地球的异常电磁波扰动;2005-11-10俄罗斯西伯利亚东南部M_S6.4地震和2007-08-02俄罗斯萨哈林岛(库页岛)M_S6.8地震震前在质子回旋频率以下没有记录到异常电磁波扰动;2007-02-17日本北海道地区M_S6.2地震和2008-06-13日本本州东岸近海M_S7.3地震震前在质子回旋频率以下记录到异常电磁波扰动,但并非来源于地球。  相似文献   

福建闽南地区与广西北海地区波纹巴非蛤的形态差异与遗传多样性分析          下载免费PDF全文

周治东  张丽艳  霍云龙  李海平  何雪蒨  张跃平 《应用海洋学学报》2023,42(4):581-590

本研究采用形态学和微卫星分子标记对福建闽南地区（厦门、云霄、惠安）及广西北海4个野生波纹巴非蛤群体进行形态学与遗传多样性分析。主成分与聚类分析结果表明：惠安与北海群体的形态最为相近,其次为云霄群体,而厦门群体的趋异度最大。构建了两个主成分PC1和PC2,其中PC1的贡献率为36.134%,PC2的贡献率为21.443%,累计贡献率为57.577%。建立了4群体的判别函数,判别准确率P₁为43.3%~93.5%,P₂为44.8%~88.0%,综合判别率为66.1%。4个波纹巴非蛤群体的整体遗传多样性较高,群体间遗传分化微弱,属于同1个自由交配组群,NJ系统发育树聚类结果未检测到与地理位置相对应的谱系结构,这可能与人为引种、贸易及增殖放流等活动导致波纹巴非蛤不同群体间频繁基因交流有关。建议今后在波纹巴非蛤的资源管理和开发利用时,加强本地种质资源的保护。  相似文献