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1.
近年来, 土壤微生物蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)芽孢计数对下伏金矿化的指示作用已被不同国家的地质工作者所证实, 但由于鉴别手段的限制, 对金矿化指示菌株的鉴定一直停留在传统的微生物分类鉴定上, 本研究将分子生物学的技术引入到金矿化指示菌株的鉴定中, 从而将微生物找矿中的微生物鉴定手段提高到分子水平.从湖北省嘉鱼县蛇屋山金矿区分离到的矿化指示菌株中随机挑取2株菌Y1和Y2, PCR扩增并测定其16SrDNA和16S-23SrDNA区间序列.经系统发育和生理生化试验综合分析, 表明Y1为蕈状芽孢杆菌(B.mycoides), Y2为蜡样芽孢杆菌, 两者都属于蜡样芽孢杆菌群, 证明蜡样芽孢杆菌群是金矿化指示菌, 同时也证明了传统微生物找矿法利用选择性培养基对蜡样芽孢杆菌群菌芽孢计数方法的可靠性和利用分子生物学技术进行采矿的可行性.菌株16SrDNA和16S-23SrDNA区间核苷酸序列的确定也为下一步微生物找矿中的基因探针试剂盒的制作奠定了基础. 相似文献
2.
通过建立高效率的微生物未培养DNA提取技术和16SrDNA分析技术,在中国大陆钻探深层岩芯中发现微生物存在的证据。从地下430.00米(S1)与1033.77米(S13)深度岩芯中分别提取到微生物DNA,进行16SrDNAPCR扩增,通过对S13样品DNA中克隆得到的54个16SrDNA的序列测定,初步构建了该深度地下微生物群落的系统进化树,发现了23种不同的微生物序列存在。通过DAPI染色证明在地下1033.77米的微生物数量约为1×104个/克岩石,采用实时定量PCR分析分析,发现了其中两种微生物(CCSD1305与CCSD1307)的数量为6.6×104 /g岩石与2.18×106个/g岩石。 相似文献
3.
中国大陆科学钻探（CCSD）微生物研究——地下3900米一株细菌的分离与鉴定 总被引：2，自引：0，他引：2
在中国大陆科学钻探科钻一井的3911.28米处利用厌氧培养基分离到一株细菌CCSDFL3900,该菌的最适生长温度为65℃,兼性厌氧,革兰氏染色为阴性,端生芽孢,不运动,电镜观察无鞭毛。利用细菌16SrDNA通用引物对其16SrRNA进行PCR扩增,16SrRNA序列及其进化树分析结果显示,该菌为芽孢杆菌或地杆菌。生化试验检测显示,该菌株能够利用多种糖类发酵产酸,最终鉴定为热坚芽孢杆菌。 相似文献
4.
对青海省祁连山永久冻土区天然气水合物DK一2钻孔的11件样品进行分析,通过微生物群落分析来探寻水合物层样品与非水合物层样品的差别。在11件样品中均发现了细菌16SrDNA,未检测到海洋天然气水合物地区常见的古菌16SrDNA、mc以（I,Ⅱ）、pmoA、mmoX和mxaF。分析得到的细菌16SrDNA分属5个门,包括变形杆菌门、放线菌门、拟杆菌门、厚壁菌门和异常球菌一栖热菌门,随着样品深度的增加,细菌多样性有降低的趋势。对非水合物层样品DK2—19和水合物层样品DK2—25进行细菌系统发育树分析,发现这2个样品群落结构相差较大。水合物层样品与非水合物层样品细菌群落对比后发现,水合物层样品中叫一变形杆菌的比例低于非水合物层样品中1一变形杆菌的比例,而Arthrobacter属多发现于非水合物层的样品中。 相似文献
5.
从西藏搭格架铯硅华矿床区热泉中分离培养高温菌T4-1,并进行了格兰氏染色、显微镜观察、室内温度实验、16SrRNA基因分析等。结果表明,T4-1为杆状菌,格兰氏染色阳性,其生长范围为45~80℃,最适生长温度70℃。16SrRNA基因分析结果表明,该菌株属于地芽孢杆菌属(Geobacillus),在发育树上,T4-1菌株与高温烷烃地芽孢杆菌(Geobacillus the rmoleovorans)非常近。本研究为进一步开展西藏高温微生物资源以及微生物参与成矿作用的研究提供了首例。 相似文献
6.
嗜热和非嗜热Crenarchaeota的生物多样性及演化意义 总被引：1，自引：0，他引：1
Crenarchaeota,
Euryarchaeata和Korarchaeota组成古菌中3个领域. Euryarchaeota是原核生物中重要的种群,得到了很好的研究,而Crenarchaeota和Korarchaeota直到最近才逐渐受到关注.古菌的生态和演化研究都属于Crenarchaeota领域.一个很重要的观点就是Crenarchaeota的所有独立种群都是极端嗜热的,非嗜热Crenarchaeota目前为止还没有分离出来.嗜热Crenarchaeota主要是在深海热烟囱和陆地热泉中发现的,特征是高温(>80
℃)和低pH值(<6).多种嗜热Crenarchaeota化能自养可以利用还原性无机化合物,例如H2和还原性硫.这个特性连同生命树群的深入分支说明生命最后共同的祖先可能是在热液体系中的嗜热自养生物.非嗜热Crenarchaeota和嗜热Crenarchaeota有很近似的系统关系.尽管一般情况下非嗜热Crenarchaeota是不可以培养的,但是其对敞开体系海相、陆相土壤、湖泊和地下的中低温环境的适应性日益增强.这主要取决于独立培养分子学技术的发展,例如16S
rRNA基因序列.此外,海洋和土壤中非嗜热Crenarchaeota的研究还表明,非嗜热Crenarchaeota确定组成在碳循环的生物地球化学循环中起着非常重要的作用. 相似文献
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马兰和普若岗日冰芯记录了气候环境变化对中低纬度地区微生物群落分布和矿物结构的影响.研究表明,可培养微生物群落组成以细菌为主.进一步的16S(18S)rDNA序列分析表明,嗜细胞菌-黄杆菌属和衣藻属是冰芯微生物的优势地方菌群.微生物群落密度与矿物含量有密切的对应关系,较多的微生物群落一般出现在矿物含量较高的冰层中.但是,在个别具有很多矿物微粒的样品中却没有出现预期很多的微生物.马兰冰芯研究还揭示了寒冷期微生物群落密度大和暖期微生物群落密度小的反相关关系.与暖期W1中发生的一次较大的降温突变相对应,在L1中微生物数量也出现一个峰值.该研究为利用冰芯记录重建古气候环境变化提供了另一个有效手段. 相似文献
8.
白云石成因问题是地质学上长期悬而未决的难题之一.近年来,微生物诱导白云石沉淀逐渐成为白云石成因的重要理论之一,但其中微生物的作用机理远未探明.现生白云石主要分布于高盐环境,该环境中的优势菌群为嗜盐菌,包括嗜盐细菌和嗜盐古菌.因而此次选取三株嗜盐古菌Natrinema sp.J7-1、Natrinema sp.J7-3和Natrinema sp.LJ7,研究其诱导白云石沉淀的能力,并对比不同细胞浓度对白云石沉淀的影响,以期更深入地了解微生物在白云石形成中的作用.通过X射线衍射 (XRD) 检测沉淀物的物相,利用扫描电子显微镜 (SEM) 观察所得矿物形态,同时辅以能量色散谱分析 (EDS) 分析矿物的元素组成.实验结果表明三株嗜盐古菌皆可诱导球型、哑铃型、花椰菜型以及球形聚集体等白云石的形成,且在较高细胞浓度下诱导形成的矿物中白云石含量增多.分析表明细胞浓度的增加会导致细胞表面羧基含量的增加,从而为白云石的沉淀提供更多的成核位点,有利于Mg进入矿物晶格,从而诱导白云石沉淀,本结果进一步提高了对微生物白云石成因机理的认识. 相似文献
9.
深海热液口由于剧烈的温度(可达到400℃以上)、pH和化学梯度,成为地球生命起源和演化研究的焦点,海底热液口生命系统为人类提供了一个探索深部生命及生命起源和进化的窗口.本文主要开展了瓜伊马斯深海热液口高温环境下沉积物和烟囱样品中古菌多样性的研究.采用实时荧光定量PCR首先对样品中古菌进行了定量,发现沉积物和烟囱两个样品都含有高丰度的古菌,沉积物和烟囱中古菌分别达到1.47×109拷贝数/g和5.29× 108拷贝数/g(湿重).通过核糖体小亚基16S rRNA基因的PCR扩增,文库构建和系统发育分析,发现沉积物和烟囱样品中的古菌类群多数是嗜热和超嗜热微生物,但两个样品中的古菌群落组成差异很大:沉积物以泉古菌门为主,优势菌群为Miscellaneous Crenarchaeota Group (MCG)和Hot Water Crenarchaeota Group Ⅰ(HWCG Ⅰ);烟囱样品则主要是广古菌门类群,其中以Thermococcales,Marine Benthic Group D (MBGD)/Deep Hydrothermal Vent Euryarchaeota 1(DHVE 1)为主.在沉积物样品中发现了一个新的MCG类群,命名为MCG-H,可能是MCG的高温独特类群.研究揭示,在瓜伊马斯深海热液口烟囱和沉积物中都包含有丰富的古菌类群包括未被发现的新类群,对瓜伊马斯深海热液口古菌分布和多样性的研究将为进一步深入的古菌生理功能和演化的研究提供基础. 相似文献
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董发勤 代群威 饶瀚云 王富东 赵学钦 蒋忠诚 张强 李博文 Alexander I.Malov Enrico Capezzuoli Augusto Auler 《中国岩溶》2021,40(2):264-272
本文通过调查黄龙风景区水体的环境地质特征与微生物群落结构及多样性,并与黄石公园对比分析,探讨了两种特殊地理环境下的微生物群落结构和多样性及其对钙华沉积的影响。结果表明:黄龙沟泉水属于地下冷泉,且景区内覆盖着大量植被,水体中有大量藻类和细菌;黄石公园猛犸象温泉区泉水属于地下热泉,植被覆盖率很低,泉水中微生物多为嗜热菌,藻类较少。黄龙与黄石钙华主要由方解石组成并且微生物参与了钙华的形成过程。微生物对钙华沉积的作用,主要分为模板作用、产物诱导作用和代谢调控作用,对比探讨了特殊地质环境下的微生物对钙华沉积的贡献,指出微生物沉积作用在钙华沉积过程中的重要性,可为黄龙钙华“黑化”防治提供理论依据。 相似文献
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新疆东帕米尔高原慕士塔格峰洋布拉克冰川雪冰及融水中可培养细菌多样性分析 总被引：1，自引：0，他引：1
采用LB和PYGV两种培养基分离培养慕士塔格峰洋布拉克冰川雪冰及融水中可培养细菌,通过分离菌株16S rDNA的PCR-RFLP图谱和基于基因序列相似性的系统发育分析揭示细菌多样性。结果从样品中共分离到178株菌,分属于变形菌门（Proteobacteria）中的α-Proteobacteria、β-Proteobac-teria、γ-Proteobacteria纲,厚壁菌门（Firmicutes）,放线菌门（Actinobacteria）和拟杆菌门（Bacteroidetes）6个类群,以假单胞菌Pseudomonas、黄杆菌Flavobacterium、紫色杆菌Janthinobacterium为优势菌群。 LB和PYGV两种培养基在分离的细菌数量及种群多样性、优势菌属、特有菌属方面呈现一定差异。结果表明,慕士塔格峰洋布拉克冰川地区可培养细菌多样性丰富,且存在一定的地方特异性菌属,寡营养培养基更利于极端微生物的恢复生长。 相似文献
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Brian P. Hedlun Jessica K. Cole Amanda J. Williams Weiguo Hou Enmin Zhou Wenjun Li Hailiang Dong 《地学前缘(英文版)》2012,3(3):273-288
The Rehai Geothermal Field,located in Tengcbong County,in central-western Yunnan Province, is the largest and most intensively studied geothermal held in China.A wide physicochemical diversity of springs(ambient to ~97℃;pH from≤.8 to≥9.3) provides a multitude of niches for extremophilic microorganisms.A variety of studies have focused on the cultivation,identification,basic physiology,taxonomy,and biotechnological potential of thermophilic microorganisms from Rehai.Thermophilic bacteria isolated from Rehai belong to the phyla Firmicutes and Deinococcus-Thenmts. Firmicutes include neutrophilic or alkaliphilic Anoxybacillus,Bacillus,Caldalkalibacillus.Caldanaerobacier, Laceyella,and Geobacillus,as well as thermoacidophilic Alicyclobacillus and Sulfobacillus. Isolates from the Deinococcus-Thermus phylum include several Meiothermus and Thennus species.Many of these bacteria synthesize thermostable polymer-degrading enzymes that may be useful for biotechnology. The thermoacidophilic archaea Acidianus.Melal/osp/utera.and Suljolobus have also been isolated and studied.A few studies have reported the isolation of thermophilic viruses belonging to Siphoviridae(TTSP4 and TTSPIO) and Fuselloviridae(STSVl) infecting Thennus spp.and Suljolobus spp..respectively.More recently,cultivation-independent studies using 16S rRNA gene sequences, shotgun metagenomics,or "functional gene" sequences have revealed a much broader diversity of microorganisms than represented in culture.Studies of the gene and mRNA encoding the large subunit of the ammonia monooxygenase(imioA) of ammonia-oxidizing Archaea(AOA) and the tetraether lipid erenarchaeol. a potential biomarker for AOA.suggest a wide diversity,but possibly low abundance,of thermophilic AOA in Rehai.Finally,we introduce the Tengchong Partnerships in International Research and Education(PIRE) project,an international collaboration between Chinese and U.S.scientists with the goal of promoting international and interdisciplinary cooperation to gain a more holistic and global view of life in terrestrial geothermal springs. 相似文献
14.
Combined effects of heavy metal and polycyclic aromatic hydrocarbon on soil microorganism communities 总被引：2，自引：0，他引：2
Soil contaminated sites contain a variety of pollutants, especially heavy metals and polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs).
Interactions between heavy metals have been relatively well studied, but little is known about interactions between heavy
metals and PAHs. The combined effect of heavy metals and PAHs on soil microorganism was studied in laboratory conditions and
evaluated by random denaturing gradient gel electrophoresis. We extracted DNA directly from contaminated soils and then amplified
the V3 sequences of the 16S rDNA. The results showed that with different culture time, the gene diversity of the single and
combined contaminated soil differed as well. After 15 days of culture, the microorganisms were stimulated and accommodated.
After 45 days of cultivation, the quantities of the soil microorganisms were affected. It is concluded that some of the microorganisms
utilize phenanthrene as important carbon resources. Microorganisms directly isolated from soil could reflect the diversity
of soil microorganism and population distribution conditions. 相似文献
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东海内陆架泥质区沉积物古菌群落垂向分布特征 总被引：1，自引：0，他引：1
为研究东海内陆架闽浙沿岸泥质区不同深度沉积物中古菌群落垂向分布特征, 利用古菌16S rDNA基因文库得到473个有效克隆、50个OTUs(Operational Taxonomic Units).16S rDNA序列系统进化和统计分析发现古菌分别归属于泉古生菌(Crenarchaeota)和广古生菌(Euryarchaeota), 其中以Miscellaneous Crenarchaeotic Group(MCG)为主, 仅含少量的Marine Benthic Group B(MBG-B)、South African Gold Mine Euryarchaeotic Group(SAGMEG)、Anaerobic Methanotrophs 3(ANME-3)、Marine Crenarchaeotic Group I(MG-I)和Marine Benthic Group D(MBG-D).该泥质区沉积物可能存在由ANME-3催化的甲烷厌氧氧化作用, 同源序列分析表明其古菌群落分布与周边环境有较大联系.UniFrac与沉积物环境因子分析表明该泥质区古菌群落垂向分布与沉积物有机质含量和粒度变化密切相关. 相似文献
16.
西太平洋深海沉积物古菌多样性垂直分布 总被引：3，自引：2，他引：1
以提取并纯化的西太平洋深海沉积物DNA为模板,利用古菌PCR特异性引物扩增出样品中古菌的16S rDNA片段,构建其克隆文库,建立阳性克隆子RFLP(Restriction Fragment Length Polymor-phism)酶切图谱。据酶切图谱对所获得的120个克隆进行测序,并与数据库中的序列进行比对,从而进行古菌的多样性和系统发育分析。结果表明,沉积物中扩增的16S rDNA古菌序列分别来自泉古生菌(Crenarchaeota)和广古生菌(Euryarchaeota),以Marine Benthic Group B(11.8%)、Marine Benthic Group D(13.6%)、Marine Crenarchaeotic Group(68.69%)为主。少量序列为South African Gold Mine Euryarchaeotic Group(1.07%)、Deep-Sea Hydrothermal Vent Euryarchaeotic Group(1.61%)、UIIB(1.25%)、VALIII(1.79%)、Marine Benthic Group E(0.18%)。以上结果表明西太平洋深海沉积物中有丰富多样的古菌群落。 相似文献
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Geochemical constraints on chemolithoautotrophic metabolism by microorganisms in seafloor hydrothermal systems 总被引：10，自引：0，他引：10
Mixing of hydrothermal fluids and seawater at the ocean floor, combined with slow reaction kinetics for oxidation/reduction reactions, provides a source of metabolic energy for chemolithotrophic microorganisms which are the primary biomass producers for an extensive submarine ecosystem that is essentially independent of photosynthesis. Thermodynamic models are used to explore geochemical constraints on the amount of metabolic energy potentially available from chemosynthetic reactions involving S, C, Fe, and Mn compounds during mixing of hydrothermal fluids with seawater. For the vent fluid used in the calculations (EPR 21 degrees N OBS), the model indicates that mixing environments are favorable for oxidation of H2S, CH4, Fe2+ and Mn2+ only below approximately 38 degrees C, with methanogenesis and reduction of sulfate or S degrees favored at higher temperatures, suggesting that environments dominated by mixing provide habitats for mesophilic (but not thermophilic) aerobes and thermophilic (but not mesophilic) anaerobes. A maximum of approximately 760 cal per kilogram vent fluid is available from sulfide oxidation while between 8 and 35 cal/kg vent fluid is available from methanotrophy, methanogenesis, oxidation of Fe or Mn, or sulfate reduction. The total potential for chemosynthetic primary production at deep-sea hydrothermal vents globally is estimated to be about 10(13) g biomass per year, which represents approximately 0.02% of the global primary production by photosynthesis in the oceans. Thermophilic methanogens and sulfate- and S degree-reducers are likely to be the predominant organisms in the walls of vent chimneys and in the diffuse mixing zones beneath warm vents, where biological processes may contribute to the high methane concentrations of vent fluids and heavy 34S/32S ratios of vent sulfide minerals. The metabolic processes taking place in these systems may be analogs of the first living systems to evolve on the Earth. 相似文献