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耐旱苔藓植物DNA提取及优化RAPD、 ISSR反应体系的建立 总被引：1，自引：0，他引：1
耐旱苔藓植物常常单个个体矮小、生物量低,如何从细小的单个个体中有效提取总DNA是进一步开展居群遗传多样性研究的关键。本研究以古尔班通古特沙漠广泛分布的刺叶墙藓（Tortula desertorum）为对象,使用快速提取法、2×CTAB法及DNeasy plant mini kit试剂盒提取法等3种方法对刺叶墙藓单个个体的总DNA进行提取。结果表明,2×CTAB法提取的DNA纯度高,凝胶电泳显示无明显降解现象,适宜作为PCR扩增的模板。利用所提取的单个个体DNA为模板,建立了优化的RAPD、ISSR反应体系。 相似文献
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内蒙古中西部草原区五种针茅的遗传多样性研究 总被引：1，自引：0，他引：1
利用RAPD（Random Amplified Polymorphism DNA, RAPD）分子标记技术,对内蒙古中西部草原区16个不同地理种群的五种针茅的遗传多样性及其种间关系进行了研究。从102个10碱基随机引物中筛选出28个有效引物,共扩增出389条带,多态性条带345条,占88.69%,说明针茅属植物具有丰富的遗传多样性,对环境的适应能力较强,PCA分析表明水热成为其地理分布的决定性因素。依据五种针茅的Jaccard相似系数所做的UPGMA聚类分析表明,大针茅和克氏针茅之间的遗传距离比较小聚为一类,它们与本氏针茅、短花针茅和小针茅间的遗传距离都比较大。 相似文献
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霸王基因组RAPD优化条件的建立 总被引：9，自引：4，他引：5
实验以霸王20 d龄无菌籽苗为材料,使用CTAB法提取其基因组DNA,进行RAPD条件优化分析。通过单因子实验分别研究了Mg2+浓度、dNTPS浓度、Taq酶的浓度、引物浓度和模板DNA浓度对RAPD反应的影响,即在25 μL总反应体系中,Mg2+的适宜浓度为1.5~2.5 mmol\5L-1、dNTPs的适宜浓度为0.2~0.3 mmol\5L-1、随机引物的浓度以1.2 μmol\5L-1为宜、Taq酶的用量以2.0 U为佳、模板DNA的最适用量为50 ng。本研究的PCR扩增程序为94℃预变性8 min, 94℃变性1 min, 37℃退火1 min, 72℃延伸2 min,设40个循环,最后72℃保温6 min。 相似文献
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荒漠植物白刺总DNA提取及鉴定 总被引：7，自引：1，他引：6
荒漠植物白刺含有较多的多糖、酚类等次生代谢物,用常规的CTAB、SDS等方法难以获得高质量的总DNA。针对这一问题探索出一种适合白刺属植物总DNA提取的方法。其特点是在裂解细胞膜之前,首先用无CTAB缓冲液进行两次多糖、酚类等次生代谢物的抽提;加大CTAB浓度,用3×CTAB作为裂解液;在用异丙醇沉淀DNA之前,用高浓度NaCl再次分离多糖。用这种方法我们对分布于甘肃的四种白刺属植物的总DNA进行了提取,开展了与总DNA相关的PCR扩增和其他遗传学分析,并取得满意的结果。 相似文献
5.
锦鸡儿属植物的遗传多样性及其种间关系 总被引：10，自引：3，他引：7
利用RAPD技术,对甘肃省自然分布的11种锦鸡儿属(CaraganaFabr.)植物的遗传多样性及其种间关系进行了研究。从34个10碱基随机引物中筛选出能产生稳定多态性标记的引物11个,共扩增出128个位点,主要集中在200~2000bp之间,其中104个表现出多态性,多态性比率高达81.25%;根据POPGENE32软件计算的Shannon多样性指数与Nei指数也较高,分别为0.3889和0.2517。说明锦鸡儿属植物具有丰富的遗传多样性,对环境变化的适应能力较强。应用UPGMA法进行聚类分析,结果表明,RAPD分析所反映的种间遗传关系与传统的形态学分类结果基本一致,但也有个别种的从属地位稍有变化。这说明还需要将分子标记的研究结果与形态学和其他方法结合起来进一步进行研究。 相似文献
6.
山区开矿和城镇建设使毛木耳资源日益匮乏，为了合理保护利用毛木耳资源，为新品种选育提供理论依据。也为毛木耳DNA指纹图谱的构建奠定基础，从分子水平上探讨毛木耳种间、品种间遗传关系，用ISSR标记分析毛木耳种质资源。结果表明：从27条ISSR引物中筛选出适合毛木耳种质分析的17个ISSR引物。17个引物共扩增出155条带，多态性位点155；多态性位点比率100％。基于扩增条带数据库建立了Jaccared遗传相关系数矩阵。构建了相似的分子树状图，将55个供试菌株分为5类群：Ⅰ类群含12个菌株，Ⅱ类群含11个菌株，Ⅲ类群含2个菌株，Ⅳ类群含24个菌株，Ⅴ类群含6个菌株。55个菌株的平均遗传相似系数为0．4109。同时类群的划分与菌株来源的地理分布没有关系。菌株间的遗传多样性十分丰富。用ISSR标记技术能将以传统形态特征为分类依据定名的菌株全部分开。 相似文献
7.
极地海区浮游动物对全球气候变化的响应极其敏感,其群落结构已成为研究全球变化对海洋生态系统影响的重要指标,而DNA条形码则是浮游动物种类鉴定的有效工具。采用线粒体细胞色素c氧化酶第一亚基编码基因(mtCOI)特异扩增测序的方法,分析了南大洋32种常见浮游动物的94条DNA条形码序列,其长度分布在830碱基到1050碱基之间。发现南极常见浮游动物种内遗传差异均值为0.67%,分布在0—2.6%之间;同属近源种间遗传差异均值为14.3%,分布在0.1%—29.3%之间。哲水蚤属的近缘哲水蚤(Calanus propinquus)和C.simillimus遗传相似度非常高。考虑到上述两者在形态和遗传上的相似性,本研究认为两种可能为同种异名,有待开展深入研究确认C.simillimus种的地位。除了哲水蚤属的两种外,所有样品种内、种间遗传差异显著,且同种的不同样品都聚到一起形成单系群。结果表明mtCOI序列可以作为DNA条形码实现南极浮游动物常见种的准确鉴定(水母和海樽等胶质浮游动物的有效性未验证)。以上结果也得到了示踪向量分析的证实。本研究新增的DNA条形码数据以及新提供的兼并引物必将推动南极浮游动物环境样品的宏基因组学研究。 相似文献
8.
不同海拔区兰州百合(Lilium davidii.var.unicolor)栽培群体遗传多样性 总被引：1，自引：1，他引：0
《中国沙漠》2016,(4)
为了研究不同海拔区兰州百合(Lilium davidii.var.unicolor)栽培群体的遗传多样性和遗传分化,应用ISSR技术,用8条ISSR引物对甘肃七道梁4个海拔区兰州百合栽培群体共175个个体进行扩增,共扩增出59条带,其中多态性条带为51条。结果显示:(1)兰州百合栽培群体在物种水平遗传多样性较高,物种水平上PPF=86.44%,h=0.2163,I=0.3413;(2)兰州百合栽培群体间遗传相似很高,4个栽培群体间的遗传一致度0.9860~0.9951;遗传分化系数均值Gst=0.113,栽培群体间变异占总变异的11.3%,群体内变异占总变异的88.7%,基于Gst的判定结果表明,各栽培群体遗传分化中等;(3)基于Gst值估算基因流Nm=3.9247,选择以及迁移是影响各栽培群体间Nm、群体遗传平衡、种群间遗传结构分化的主要因素。 相似文献
9.
以三江平原狭叶甜茅(Glyceriaspiculosa)为研究对象,选取3个不同群落类型:狭叶甜茅优势种群落、狭叶甜茅和毛苔草(Carexlasiocarpa)为共建种的群落以及狭叶甜茅为主要伴生种的群落,共45个材料进行了ISSR分子标记分析。结果从41个引物中筛选出7个有效引物,扩增出80条清晰条带,平均每个引物扩增了11.4条带,其中70个位点是多态的,总的多态位点比率为87.5%,表明被测材料间ISSR标记多态性较高。利用Popgen(version1.32)软件分析了扩增结果,并得到了狭叶甜茅不同群落类型的遗传距离、遗传一致度、Nei和Shannon信息指数等遗传特征。结果表明,对于一个物种来说,当地理距离太近不能成为影响其遗传多样性水平的因素时,其构成的种群在群落中的地位将是影响遗传多样性水平的主要因素之一。 相似文献
10.
摸索沙拐枣属（Calligonum L.）七种植物沙拐枣（Calligonum mongolicum Turcz. ）、泡果沙拐枣（C. junceum (Fisch. et Mey.) Endl.）、无叶沙拐枣（C. aphyllum (Pall.) Gürke）、红果沙拐枣（C. rubicundum Bge.）、心形沙拐枣（C. cordatum E. Kor. ex N. Pavl.）、密刺沙拐枣(C. densum Borszcz.)、乔木状沙拐枣（C. arborescens Litv.）的总DNA提取方法并对DNA样品的纯度和浓度进行鉴定,对传统的CTAB法进行方法和材料的改进,开展与总DNA相关的PCR扩增和其他遗传学分析,并取得满意的结果。其结果对于沙拐枣属植物的有关研究提供了有效的实验手段。 相似文献
11.
In a preliminary investigation, Random Amplified Polymorphie DNA (RAPD) analysis and partial mitochon-drial ND2 gene sequencing were conducted to study the genetic variation of the Indian mackerel, Rastrelliger kanagurta along a 450 km stretch of its distribution on the west coast of Peninsular Malaysia. A total of 53 individuals from 6 popu-lations were analyzed using 4 RAPD primers and a sub-sample of 15 individuals was chosen for sequencing of partial ND2 gene. Comparison between the 2 markers revealed genetic structuring in the RAPD results but genetic homogeneity for ND2 gene. Based on the former there may be at least 2 genetically differentiated groups of Rastrelliger kanagurta a-long this stretch. 相似文献
12.
In order to provide a theoretical basis for the protection and development of T. ciliata germplasm resources, we studied the genetic diversity of T. ciliata by using SSR (Simple Sequence Repeat) primers to evaluate the genetic diversity of 192 T. ciliata germplasm samples from 24 populations of 5 provinces. DataFormater, Popgene, NTSYS, TFPGA and other software were used for genetic data conversion, genetic parameter estimation, dendrogram construction and genetic variation analysis. The results showed that: 1) a total of 17 alleles (Na) were detected in seven pairs of primers, with an average of 2.260 for each primer. Among them, the highest numbers of alleles (4) were detected in primers S11 and S422.The mean value of Nei’s genetic diversity index (H) was 0.4909, the mean value of Shannon information index (I) was 0.7321, and the mean value of polymorphic information content (PIC) was 0.5182. The mean expected heterozygosity (He) and observed heterozygosity (Ho) were 0.1055 and 0.4956, respectively. The Nei°s genetic distances of the populations ranged between 0.0002 and 2.6346, and the mean was 0.5477. The average genetic diversity level (H=0.1044) of the 24 populations was lower than that of the species (H=0.4909). 2) The genetic differentiation coefficients (Fst) varied from 0.2374 to 0.9148, with an average value of 0.7727. The mean of population gene flow (Nm) was 0.0735, indicating a low level of genetic exchange between populations, and suggesting that the genetic variation mainly came from within populations. 3) With the UPGMA method, the 24 populations were clustered into 3 groups at Nei’s genetic identity (0.99): the populations from Guizhou Province and Guangxi Zhuang Autonomous Region were clustered into one group, the populations from Hunan Province were in another group, and the populations from Hubei Province were in the third group. The Mantel test analysis showed a significant correlation between Nei’s genetic distance and geographic distance (r=0.6318, P=0.009?0.05). The genetic diversity of the 24 populations of T. ciliata was at a low level. Geographic isolation was the main reason for genetic differentiation among T. ciliata provenances. In the protection of germplasm resources of T. ciliata, emphasis should be placed on breeding genetic resources from the populations with higher genetic diversity (P14, for example). As for the populations with low genetic diversity, an ex-situ protection strategy as well as ecological and timber objectives, should be taken into account to maximize the conservation and utilization of the diversity of T. ciliata. 相似文献
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三江平原NDVI时空变化及其对气候变化的响应 总被引：2，自引：0，他引：2
基于2000—2014年生长季MODIS NDVI数据和同期降水、平均气温的格点数据，采用趋势分析法、SPEI指数、相关分析法，对三江平原NDVI时空变化特征和对气候变化的响应进行了分析。结果表明：近15年三江平原区生长季的NDVI以0.017/10a的速率呈缓慢上升趋势。其中NDVI显著增加和极显著增加的面积占比分别为13.43%和12.55%，NDVI变化趋势轻度改善的面积较大，占比为25.52%；三江平原地区生长季的多年平均气温总体呈下降趋势，降水量呈上升趋势，总体上生长季标准化降水蒸散指数（SPEI）数值呈上升趋势，干旱化逐年减弱，中等干旱状况得到缓解，渐渐过渡到轻微湿润状态，对植被覆盖面积的增加有促进作用，也为该区域的生态环境恢复提供了有利条件；三江平原地区生长季NDVI与生长季气温、降水量及SPEI主要呈正相关，与降水呈正相关面积占72.64%，与SPEI呈正相关的面积占70.51%，与气温呈正相关的面积占56.73%。NDVI与降水的相关性最高，说明降水是三江平原植被生长的主导气候因子。 相似文献
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Diversity and genetic differentiation in Artemia species and populations detected by AFLP markers 总被引：1，自引：0，他引：1
Yi Sun Wen-Qin Song Yi-Cheng Zhong Run-Sheng Zhang Theodore J. Abatzopoulos Rui-Yang Chen 《International Journal of Salt Lake Research》1999,8(4):341-350
Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) markers were successfully employed to analyze 15Artemia species and strains for genetic diversity. AFLP markers are extremely sensitive to even a small sequence variation. They
are stable and more polymorphic than RAPD. Twelve pairs of primer combinations were used to detect AFLP bands, of which 384
were polymorphic, and DNA fingerprintings were obtained by using silver staining. The polymorphism analysis leads us to the
following conclusions: 1.Artemia tibetiana seems to differentiate fromA. sinica. 2. The parthenogenetic populations from inland salt lakes could follow an evolutionary path that is different from that
of the coastal parthenogenetic populations. 相似文献
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毛乌素沙地丘间低地主要植物叶片性状及其相互关系 总被引：1，自引：0，他引：1
以毛乌素沙地丘间低地30种主要植物为研究对象,比较不同功能群植物叶片性状的变异特征,分析植物叶片各性状之间的关系。结果表明:30种植物的比叶面积的变异系数最大,比叶面积与叶片干物质含量呈现极显著的负相关关系,叶片干物质含量与叶片碳含量呈显著的正相关关系,叶氮含量与叶片碳氮比呈极显著负相关关系,叶面积与其他所有的叶片性状都无相关性。比叶面积、叶片干物质含量、叶面积、叶氮含量和叶碳含量在不同功能群之间存在显著差异,叶片碳氮比在不同功能群之间没有显著差异。研究结果有助于了解毛乌素沙地丘间低地环境变化对植物种群的作用,增进对丘间低地植被演变特征的认识。 相似文献
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The genetic diversity of Artemisia halodendron(Asteraceae), a constructive and dominant species in Horqin Sandy Land,was investigated to examine the genetic relationships with different hydrothermal regions in Horqin Sandy Land. We sequenced chloroplast DNA(cp DNA) fragments(trn L–F) of 243 plants from 10 populations across the Horqin Sandy Land.The analyses of cp DNA variation identified seven haplotypes. A low level of haplotype diversity(H_d=0.706) and nucleotide diversity(π=0.0013) was detected. Haplotypes clustered into two tentative clades. Low genetic differentiation among regions was consistently indicated by hierarchical analyses of molecular variance(AMOVA). Across the sampled populations, the haplotype distributions were differentiated with hydrothermal gradients. 相似文献
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为了研究不同生活型植物营养元素含量随季节变化的响应机制,在生长季内,对阿拉善地区荒漠植物霸王(Zygophyllum xanthoxylon)、猫头刺(Oxytropis aciphylla)、沙冬青(Ammopipta nthus mongolicus)、红砂 (Reaumuria soongorica)、驼绒藜(Ceratoides latens)、白刺(Nitraria tangutorum)6种灌木及多裂骆驼蓬(Peganum multisectum)、葡根骆驼蓬(Pegamum nigrllastrum)、无芒隐子草(Cleistogenes songorica)3种草本植物连续观察,采集叶片,分析矿质养分含量和比叶面积(SLA)的季节变化特征,并对牧草的营养均衡价进行了评价,同时探讨了其叶片发育特征与矿质元素含量的关系。结果显示:(1)不同生活型植物在生长季内的SLA变化规律不同,9种植物叶片SLA均在中等偏下的水平。(2)4种常量元素(K、Ca、Na、Mg)含量在生长季内的波动较大,4种微量元素(Fe、Mn、Zn、Cu)含量在生长季内的随月份变化不大,且大部分植物叶片Zn和Cu含量在生长季内维持在"低"水平。(3)9种牧草SLA与矿质元素Cu之间表现出较强的负相关,而与其他元素无显著的相关性。(4)植物种类与采样月份对植物叶片元素的交叉分析显示,植物叶片K、Na、Ca、Mg、Mn、Cu、Zn含量的变异主要受植物种类影响,植物叶片Fe含量的变异主要受植物种类和采样时间的交互作用影响。 相似文献
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为分析研究生态保护与修复工程实施背景下甘肃中东部植被生长季NDVI时空变化及其对气候因子的响应，采用MODIS数据产品MOD09Q1，运用最大值合成法、趋势分析法与相关分析法，对该区域2008—2016年NDVI的时空变化特征及其对气候因子的响应进行了分析研究。结果表明：（1） 时间层面上，2008—2016年植被生长季NDVI呈现出增加的趋势，增加速率为0.001 4 a-1，2012年增幅最大；空间层面上，2008—2016年研究区内的低山丘陵区和平原区的植被生长季增加明显；部分中起伏山地植被活动减弱。（2） 生长季NDVI对不同气候因子的响应程度不同，在P<0.05的显著性水平下，生长季NDVI对气温的变化最敏感，区域内大部分面积上二者呈现出强相关与极强相关；降水次之，以中等相关与强相关为主；太阳辐射最小，以弱相关甚至不相关为主。研究结果可为针对区域差异性并有所侧重的生态工程的实施提供相应的参考与依据，从而加强区域生态安全，进而促进国家生态安全屏障的加快建设。 相似文献