Rapid,specific and sensitive detection of Vibrio vulnificus by loop-mediated isothermal amplification targeted to vvhA gene     

ZHANG Lina  WANG Mingyi  CONG Dianxia  DING Shuyan  CONG Rinan  YUE Jinyong  GENG Jianli  HU Chengjin 《海洋学报(英文版)》2018,(4)

Vibrio vulnificus is an estuarine bacterial pathogen for human.The rapid,specific and sensitive detection of V.vulnificus is urgently needed for early disease diagnosis and timely treatment of V.vulnificus infection.In the study,a loop-mediated isothermal amplification(LAMP) technique was developed for V.vulnificus detection with a set of primers,composed of two out primers and two inner primers targeted to vvh A gene.The optimal amplification temperature was 63°C and the reaction only took 35 min.The amplification products could not only be detected by agarose gel electrophoresis with ladder-like pattern bands,but also could be visualized using calcein with naked eye directly.Forty-five strains were tested for the specificity of LAMP assay,and all the V.vulnificus strains were identified correctly while other strains were negative results.The sensitive of the new LAMP assay was 100-fold more sensitive than the conventional PCR.Meanwhile,all the V.vulnificus strains were detected correctly in spiked,clinical and environmental samples by the new LAMP assay.Compared with other well-known techniques,the new LAMP assay targeted to vvh A gene was extremely rapid,simple,sensitive and specific for V.vulnificus identification.  相似文献   

利用扩增vvhA基因的环介导等温扩增技术快速，特异而敏感地检测创伤弧菌     

张丽娜  王明义  丛殿霞  丁淑研  丛日楠  岳进勇  耿建利  胡成进 《海洋学报(英文版)》2018,37(4):83-88

创伤弧菌是一种可感染人类的河口病原菌。建立快速,特异而敏感的检测方法,有助于创伤弧菌感染的早期疾病诊断和及时治疗。本研究设计了针对vvhA基因的一系列引物（包括两对外部引物和两对内部引物）,采用环介导等温扩增技术（LAMP）来检测创伤弧菌。结果显示,本方法的最适扩增温度是63℃,反应仅需35分钟。扩增产物不仅可以用含有DNA ladder的琼脂糖凝胶电泳检出,也可借助钙黄绿素直接肉眼观察。采用45株菌株检测该方法的特异性,其中所有创伤弧菌均被检出而其他菌株检测结果皆为阴性。本方法的敏感性是普通PCR扩增的100倍,同时利用该方法可以准确检测出所有的模拟样品、临床标本及环境样品。与其他已知方法比较,针对vvhA基因的介导等温扩增技术可以快速、简单、敏感及特异地鉴定创伤弧菌。  相似文献   

不同排列方式和间隙比下双圆柱流致振动特性研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

刘巨保  杨明  岳欠杯  丁宇奇  姚利明 《海洋工程》2018,36(4):105-113

采用基于ALE的流固耦合分析方法,将圆柱体振动模型简化为平面双自由度质量-弹簧-阻尼系统,进行了计算参数无关性分析。对不同θ角和间隙比T下的双圆柱流致振动进行数值模拟,并与单圆柱振动计算结果进行比较,得到了不同θ角和间隙比T下中心圆柱的升阻力系数、流场分布和运动轨迹变化情况。通过分析发现小间隙比下由于两圆柱间的相互干扰,改变了中心圆柱的尾涡结构,导致了升力和阻力系数随不同θ角而发生变化;小间隙比下由于两圆柱间的相互干扰影响,均使中心圆柱的轨迹在不同θ角下发生了较大的变化,顺流向的振动频率与单圆柱振动时相比出现了多倍频,导致其运动轨迹发生了变化。  相似文献   

OMS平台模型的服务化封装方法研究     

闾国年  温永宁  乐松山  张丰源  陈旻  王明 《地理信息世界》2018,(3):11-16

以OMS平台模型为研究对象,提出了一种地理分析模型服务化封装策略,以减少在模型提供者和模型使用者之间共享模型时遇到的障碍。通过设计模型描述接口、模型执行接口和模型部署接口,实现OMS平台模型的封装策略,形成标准化部署包。相关部署包可以部署到模型服务容器上,并发布为网络空间可重用共享的服务,以支撑分布式模型集成与模拟。本文以OMS平台下的AgES-W模型为案例,验证了模型封装策略的可行性和实用性,为网络环境下模型共享与集成奠定了基础。  相似文献   

青岛海洋趋磁球菌QH-3 的鞭毛特征     

周克  潘红苗  岳海东  肖天  吴龙飞 《海洋科学》2010,34(12):88-92

趋磁细菌(magnetotactic bacteria,MTB)是一类能够沿着磁力线运动的特殊细菌。MTB在胞内磁小体的导向下借助自身鞭毛进行趋磁趋氧运动,以到达适宜的生境。本研究在青岛潮间带沉积物中发现大量的趋磁球菌,通过光镜与透射电镜对其运动方式与显微结构进行观察。结果显示优势趋磁细菌为卵球形,大小为2.5μm×2.1μm,宽长比为0.85,将其命名为QH-3。QH-3为趋北型(North-seeking)MTB,运动速度88μm/s,细胞内两侧各有一条由棱柱形颗粒组成的磁小体链。QH-3在菌体同一侧有两个由直径62 nm±9 nm的鞘包裹7根鞭毛组成的鞭毛束。这种特殊的鞭毛结构与已报道的致病菌的不同,而与法国地中海趋磁球菌MO-1的相似。  相似文献   

抗冰导管架平台动力特性分析     

张大勇  岳前进  车啸飞  刘圆  李辉辉 《海洋工程》2010,28(1)

目前的抗冰导管架平台结构设计主要是考虑极限冰力引起的破坏,尚未形成基于动冰力响应分析的结构设计。为了更好研究冰荷载、冰激振动机理以及提出合理的概念设计,冰荷载下抗冰导管架结构的动力特性分析是十分必要的。基于现场冰与导管架结构相互作用的多年观测以及数值模拟研究,分析渤海辽东湾典型导管架结构在交变冰力作用下的动力特性,提出了适于冰荷载研究与抗冰导管架结构概念设计、分析的简化力学模型,解释柔性抗冰导管架结构动力效应显著的原因。  相似文献   

东昆仑活动断裂带西大滩段断层气(Rn,CO2)的释放特征   总被引：1，自引：0，他引：1       下载免费PDF全文

李陈侠  徐锡伟  F Perrier  P Richon  陈桂华  Y Klinger  J-M Nocquet  C Romieu  张晓清  常振广 《地震地质》2007,29(4):905-909

通过在东昆仑活动断裂带西大滩段进行断层气测试,首次获取了该断裂带中Rn和CO2的释放量。在2004年开挖的2～3m深的探槽内,氡浓度可达20732Bq.m-3,氡发射率可达433mBq.m-2.s-1,远高于在地表的氡浓度505～2380Bq.m-3与氡发射率7～28.19mBq.m-2.s-1(地表氡发射率均值为14.7mBq.m-2.s-1,与世界平均值相当)。从而我们推断该断裂具有从上部第四系覆盖物到深部花岗岩之间的良好连通性。在地表CO2的析出率平均值为18.9g.m-2.d-1,与通常的背景值相当,在探槽中和距离断层1km的地方没有明显的空间变化,但是在断层北侧3km处的一个近乎直立的千枚岩小山上,CO2的析出率却很高,为421g.m-2.d-1,同时该处氡的发射率也高,达503mBq.m-2.s-1,因此,有必要在该断裂附近进行长期监测  相似文献   

中国黄土与红色粘土记录的地磁极性界限及地质意义   总被引：13，自引：0，他引：13       下载免费PDF全文

岳乐平 《地球物理学报》1995,38(3):311-320

本文报道由蓝田、陕县、洛川、西峰、平凉、兰州及靖远等剖面获得的古地磁研究结果．主要结论为：１．中国黄土剖面记录了Ｂｒｕｎｈｅｓ正极性带与Ｍａｔｕｙａｍａ负极性带，Ｂｒｕｎｈｅｓ／Ｍａｔｕｙａｍａ极性转换过程位于第８层黄土（Ｌ８）．在段家坡黄土剖面该转换过程对应的地层厚度为０．３７５ｍ，持续时间约６０００ａ．转换过程由３次极性变化构成，每次经历的时间约为４００ａ．２．Ｊａｒａｍｉｌｌｏ正极性亚带（Ｊ）位于标志层Ｌ９至Ｌ１５之间，大约Ｓ１０－Ｓ１３位置．３．Ｏｌｄｕｖａｉ正极性亚带（Ｏ）对应的地层为Ｓ２７－Ｓ３３４．Ｒｅｕｎｉｏｎ正极性亚带（Ｒ）由两部分组成，在蓝田段家坡黄土剖面分别位于Ｌ３６和Ｓ３８５．Ｍａｔｕｙａｍａ负极性带与Ｇａｕｓｓ正极性带界限（Ｍ／Ｇａ）位于黄土和红色粘土交界处，中国黄土的底界年龄为２．４８Ｍａ左右．黄土与红色粘土为整合接触关系．６．黄土下伏的红色粘土记录了Ｇａｕｓｓ正极性带，Ｇｉｌｂｅｒｔ负极性带和古地磁年表编号５（Ｅｐｏｃｈ５）．  相似文献   

川西地区小震重新定位及其活动构造意义   总被引：59，自引：18，他引：59       下载免费PDF全文

朱艾斓  徐锡伟  周永胜  尹京苑  甘卫军  陈桂华 《地球物理学报》2005,48(3):629-636

使用双差地震定位法对川西地区1992～2002年的13367个小震进行重新定位， 初步分析了地震活动性与地表活动构造的关系及其揭示的构造信息. 重新定位后，地震活动沿活动断裂成线（带）状分布现象非常突出，呈现出与地表活动构造的密切关系：结构简单的单一走滑断层具有上宽下陡的花状结构特征，拉分盆地与逆断裂具有线性而发散的分布式结构特征，逆断裂之下还存在缺震层. 此外，沿活动断裂带地震活动还具有空间分段性，揭示出局部地段存在着隐伏活动断裂和可圈定为地震危险区的地震空区. 震源深度分布显示，川西高原在15～20km的深度范围内普遍存在厚度约5km的缺震层，以高温高压实验结果为基础，通过计算川西地区地壳强度表明，大约14～19km的深度范围花岗岩处于塑性流变状态，说明缺震层的出现具有地壳物质塑性变形基础.  相似文献   

滇西兰坪盆地西缘铜矿床矿物流体包裹体研究   总被引：5，自引：0，他引：5  

徐晓春  谢巧勤  陆三明  陈天虎  黄震  岳书仓 《矿物学报》2005,25(2):170-176

滇西兰坪中新生代盆地西缘发育众多的铜多金属矿床，主要以脉状或透镜状赋存于由砂岩、粉砂岩和页岩组成的含盐红色碎屑岩建造中，或产于火山岩中。本文在前人工作基础上，对区域3个代表性矿床进行了系统的矿物流体包裹体地球化学研究，结果表明：区域铜矿床矿物流体包裹体类型简单，以气液两相包裹体和液相包裹体为主；均一温度不高，显示成矿为中低温度；流体包裹体成分显示为a^＋（K^＋）＋Ca^2＋Cl^-＋SO^2-4型，表明成矿流体主要是以大气降水补给的热卤水；成矿流体气相组成主要为H2O和CO2，还原性烃类气体的存在并与氧化性气体的反相关关系显示其与盆地有机质的密切关系及在成矿过程中的重要性。结合成矿地质背景及矿物氢氧同位素的分析，认为该带中的矿床地幔物质参与成矿是次要的，成因上应为受深断裂控制的、大气降水补给的热卤水型矿床。  相似文献