仿刺参(Apostichopus japonicus) mtDNA三个基因片段的序列分析   总被引：10，自引：0，他引：10  

李颖  刘萍  孙慧玲  马甡  高天翔  王清印 《海洋与湖沼》2006,37(2):143-153

采用PCR技术对中国烟台、威海和莱州三个地点仿刺参的16S rRNA、COI、IrRNA-COI三个mtDNA基因片段进行了扩增和测序,分别得到了长度约为570bp、640bp和900bp的三段序列,分析了三个采样点样品的遗传多样性。结果表明,每段基因序列扩增均获得两种单倍型,已在Genbank中注册(注册号码:AY852278—AY852283)。通过比较,三个地点样品的序列差异不显著,无缺失、插入、颠换的现象,只有个别位点出现转换,其中16S rRNA序列最为保守,16S rRNA、COI、IrRNA-COI三段序列A T的平均含量为56·2%、59·2%、61·8%,均大于G C含量。三个采样点样品同源性为99·84%—99·96%。将获得的仿刺参DNA序列和Genbank中的来自东太平洋8个外群进行基因序列比较,结果发现,不同目、科的海参的序列差异显著。采用DNAsp统计了各类位点数;MEGA2·1分析了碱基组成和遗传距离,构建了系统树。系统树体现的分类关系与这些物种的形态学分类关系完全一致。  相似文献   

南海沉积物中有孔虫分子生物学鉴定的初步研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

徐美香  赵泉鸿  肖湘 《台湾海峡》2004,23(3):354-359

本文以南海深海表层沉积物中的有孔虫样品为研究对象,提取了样品的总DNA片段,利用特异性DNA探针,进行有孔虫的SSUrDNA扩增,对获得的PCR产物进行克隆,测序及分析,证实确为潜在的有孔虫DNA.进化树分析揭示了研究样品中可能存在的有孔虫种类,该方法的建立为有孔虫壳体的鉴定提供了新的技术手段  相似文献   

DNA adducts in mussels and fish exposed to bulky genotoxic compounds     

Dolcetti L  Zuanna LD  Venier P 《Marine environmental research》2002,54(3-5):481-486

Biological and procedural factors can influence DNA adduct detection in aquatic organisms. Among them, functional structure and metabolic traits represent major biological determinants for adducts formed by lipophilic pro-mutagenic contaminants. In detecting DNA adducts through the 32P-postlabelling assay, efficiency in DNA purification, digestion, labelling, as well as adduct enrichment and quantification may explain differences between independent studies. Reference DNA adducts have been used to verify some 32P-postlabelling aspects. Data obtained for mussels and fish treated with benzo[a]pyrene (B[a]P) and environmentally exposed to genotoxins confirm the above assertions. Although the 32P-postlabelling assay cannot be proposed for routine biomonitoring it appears a reliable and very sensitive index of exposure to genotoxic pollutants in both fish and mollusks.  相似文献   

PCR法制备地高辛标记探针斑点杂交 检测白斑综合症病毒(WSSV)   总被引：2，自引：0，他引：2  

雷质文  史成银  黄倢  杨冰  俞开康  战文斌 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2001,31(2):201-204

用PCR法成功制备了DIG标记探针，探针长度为547bp，探针的产量为21.6ng/μL。此探针与随机引物合成探针检测样品灵敏度相近。用此探针核酸斑点杂交法检测了54尾中国对虾。结果表明此探针在对白斑综合症病毒的检测、对虾暴发性流行病的诊断等方面具有很高的应用价值。  相似文献   

Identification of Porphyra lines using computerized DNA fingerprinting   总被引：3，自引：0，他引：3  

Wang Bin  Jia Jianhang  Shi Jinfeng  Chen Yihu  Jin Demin  Xu Pu  Mei Junxue  Weng Manli 《海洋学报(英文版)》2001,20(3):401-407

ImpIONPorghyra is one of the most important rnarine a1gae with glObal distribution and importanterenomic value. AIthOtJgh the yield of POrPhpo is lower than that of kelp, the output valueof Porghpp occupies the first place in rnarine algae in China. The traditional taxonomy ishanly had on the morpbolOgical characteristics, such as the morpbobeical traits size, rnar-gin celIs and the number of repnductive cells. However, most of morPhobeical traits are af:fected by environrnntal factOrs …  相似文献   

卵磷脂对花尾胡椒401幼鱼谷肤甘肤一硫一转移酶，谷肤甘肤过氧化物酶和DNA完整性的影响   总被引：7，自引：0，他引：7  

董宏坡  陈彦  谢仰杰  王重刚 《海洋科学》2004,28(4):25-28

采用不同卵磷脂添加量的配合饲料投喂花尾胡椒鲷(Plectorhyncchus cinctus）幼鱼，同步测定幼鱼的谷胱甘肽-硫-转移酶和谷胱甘肽过氧化物酶活性以及DNA完整程度。结果表明，谷胱甘肽-硫-转移酶和谷胱甘肽过氧化物酶活性随着饲料中卵磷脂含量的增加而提高，而DNA单链断裂程度随着饲料中卵磷脂含量的增加而减少。这提示卵磷脂能够提高鱼体的抗氧化防御系统的机能。  相似文献   

牙鲆、石鲽和川鲽的线粒体16S rRNA基因片段的序列比较研究   总被引：2，自引：0，他引：2  

孔晓瑜  刘亚军  喻子牛  庄志猛  武云飞 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2001,31(5):713-722

以相应引物对牙鲆(Paralichthysolivaceus)和石鲽(K.areiusbicoloratus)的线粒体16SrRNA基因片段进行了PCR扩增,PCR产物经T载体连接之后进行了克隆、测序,均得到了590bp的碱基序列,并将其与GenBank中牙鲆线粒体全序列相应片段和川鲽(Platichthysflesus)相应片段进行比较,结果表明,川鲽和石鲽序列差异很小(核苷酸差异数为7,同源性为98.8%);而牙鲆与川鲽和石鲽的序列差异明显(核苷酸差异数为90～93,同源性约为84%),且大多数核苷酸变异位点集中在序列中部大约200bp的区域.  相似文献   

福建太平洋牡蛎种群微卫星DNA分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

陈曦  黄勤  江锦祥  马平 《台湾海峡》2007,26(4):548-554

本文采用Ucdcg153、157、202微卫星引物对福建两个太平洋牡蛎(学名为长牡蛎Crassostrea gigas)养殖种群进行扩增分析和序列测定.与采自漳浦旧镇的近江牡蛎(C. ariakensis)比较,前者对以上三种引物全部呈阳性反应,后者只对Ucdcg157显阳性.与Genebank提供的相关序列比较,福建太平洋牡蛎与Genebank样品应属同源,其中漳浦霞美和厦门白礁的样品则可能代表同一种群的两个衍生品系.本项调查结果同时显示,近亲繁殖的育苗方式已经导致福建太平洋牡蛎种群裂化;任其发展不利于维护良种优势.本次采集的样品中未发现显示葡萄牙牡蛎、熊本牡蛎和美洲牡蛎微卫星特征的个体.  相似文献   

Mitochondrial DNA analyses of narrow-barred Spanish mackerel (Scomberomorus commerson) suggest a single genetic stock in the ROPME sea area (Arabian Gulf, Gulf of Oman, and Arabian Sea)     

Hoolihan  John P.; Anandh  Prem; van Herwerden  Lynne 《ICES Journal of Marine Science》2006,63(6):1066-1074

  相似文献   

镉致鲫(Carassius auratus)外周血单个核细胞DNA损伤与增殖抑制   总被引：7，自引：0，他引：7  

丁磊  黄鹤忠  吴康  张伟明  时夕金  周建华 《海洋与湖沼》2005,36(1):61-66

采用体内注射染镉的方法进行镉诱导鲫外周血单个核细胞(PBMC)DNA损伤与增殖抑制相关性的研究。将鲫(400g／尾)驯养4周后进行随机分组，每组5尾，以Cdh浓度1．25、2．50和3．75mg／kg腹腔注射染鲫，以生理盐水腹腔注射鲫为对照，染镉后0、3、5、7、10和14天取无菌抗凝鲫血，经淋巴细胞分离液离心分离获取PBMC，用单细胞凝胶电泳法检测PBMC的DNA损伤，用^3H-胸腺嘧啶脱氧核苷掺入法检测PBMC的增殖。结果表明，3天时各染镉组DNA迁移度增加，5天时继续加大并于7天时达到峰值，10天和14天时呈现逐渐减小的趋势。1．25mg／kg组与对照组在不同时间放射性活度(咖m)的差异均无显著性；0天和3天时各染镉组与对照组咖m的差异均无显著性；5天时2．50和3．75mg／kg组dpm明显下降，7天和10天时dpm与5天时基本相同，14天时dpm呈上升趋势。镉诱导DNA损伤与其抑制PBMC增殖相比，作用时间短且浓度低，初步推测镉诱导的DNA损伤是镉抑制PBMC增殖的重要机制之一。  相似文献