南海西沙海槽沉积物细菌多样性初步研究   总被引：9，自引：1，他引：8  

李涛  王鹏  汪品先 《地球科学进展》2006,21(10):1058-1062

对来自南海西沙海槽的深海沉积物进行总DNA提取,并构建细菌16S rDNA文库。细菌16S rDNA系统发育分析表明沉积物中细菌分属4个类群：变形杆菌(Proteobacteria)、浮霉菌(Planctomycene)、低G+C含量革兰氏阳性菌和放线菌(Actinobacteria),它们分别占总体的49%、22%、22%和7%。Proteobacteria类群又以δ Proteobacteria亚群占优势,其他分属α 和γ Proteobacteria亚群。Planctomycene和低G+C含量革兰氏阳性菌两个常见于浅海的类群,在西沙海槽沉积物的丰度高于其他深海沉积物,可能是随沉积物被浊流搬运至海槽。  相似文献   

水域生境好氧不产氧光合细菌(AAPB)研究进展     

张海涵  王燕  刘凯文  黄廷林  李楠  杨尚业  司凡  苗雨甜  黄鑫  张梦瑶 《湖泊科学》2020,32(6):1585-1598

好氧不产氧光合细菌（aerobic anoxygenic photosynthesis bacteria,AAPB）是广泛分布于海洋、湖泊及河流等典型水域生境中的异养原核生物,能够以环境中有机物为营养物质来获取细胞生长及代谢所需的能量,同时借助自身独特的菌绿素完成光合作用产能但不合成氧气,在物质循环与能量流动中扮演着重要角色.近年,越来越多的AAPB种属被陆续报道,基于光合基因,例如光合反应中心M亚基（pufM）的分子系统发育分析显示,大部分AAPB属于α-、β-及γ-变形菌,且丰度及多样性随生境的不同而呈现时空地理格局异质性.本文对AAPB的栖息环境与生长特性、丰度与分布、生态功能以及环境驱动因子等方面的研究进展进行了回顾和综述.目前,针对水库生态系统AAPB的研究鲜见报道,作者建议开展水库生境中AAPB多样性分布、环境驱动因素及生态功能研究,丰富对于水生生态系统中功能微生物种群生态结构与代谢功能的认识.  相似文献   

转MT-like基因衣藻的重金属结合能力与抗性特征分析   总被引：7，自引：0，他引：7  

胡章立  邢苗  吴玉荷  涂欢 《湖泊科学》2002,14(3):247-252

通过对转MT－like基因衣藻和其野生品系的比较分析,发现转基因藻株对重金属镉和铜的结合能力及抗性均有大幅提高。在重金属结合能力方面,低浓度（5－10μmol/L）的镉溶液中,转基因藻重金属结合量是野生株的1.5倍左右,而相对高浓度（30－50μmol/L）的镉溶液中,由于重金属对藻细胞的毒害作用,使两者的差异不明显。在重金属铜和镉的抗性,转基因藻表现出明显高于野生藻株的抗性特征。用转基因藻去处理含铜的工业废水,结果发现转基因藻的处理效率可以提高10％以上。这说明DNA重组技术对提高藻类的废水处理效率方面具有较大的潜力。  相似文献   

微藻基因诱变研究及应用进展     

杨端鹏  李仲先  王胜男  牛建峰  王广策  李健 《海洋科学》2021,45(11):165-178

微藻是单细胞小型光合生物,是自然界最重要的初级生产者,在食品、能源、医药和环境等行业领域有重要应用。微藻生物技术产业发展所需要的优良微藻株系,除了通过筛选获得外,还可以利用基因诱变或者基因工程等方法获得。利用基因诱变方法获得的突变株,不是转基因作物,且具有更适宜生产需要的优良性状。本文主要综述基因诱变在微藻育种中最新的应用研究进展,为微藻产业化研发工作提供参考。  相似文献   

4种壳色蛤仔TYR基因的表达特性研究     

姜力文  聂鸿涛  李东东  霍忠明  李妹妍  闫喜武 《海洋科学》2017,41(11):1-7

为了解色素控制基因与壳色的关系,本实验用荧光定量聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)技术分析了酪氨酸酶基因(Tyrosinase,TYR)在菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)4种壳色蛤仔和7种组织中的表达特性。结果表明,酪氨酸酶基因在鳃、外套膜、闭壳肌、性腺、内脏团、水管和唇瓣中均有表达,其中外套膜中表达量较高,其次为鳃,在闭壳肌中表达量最少。不同的酪氨酸酶基因在4种壳色的表达量不同,酪氨酸酶基因TYR2、TYR3、TYR6和TYR9在白斑马蛤中表达量居高,且与斑马蛤和白蛤差异显著(P0.05)。TYR2、TYR6和TYR10在橙蛤中表达量最高,推测与橙色形成有关。TYR11在斑马蛤中表达量最高,且与白蛤和白斑马蛤差异显著(P0.05),推测与背景色形成有关。系统发育分析结果表明,TYR3与马氏珠母贝(Pinctada martensii)同源性最高为64%。TYR10与加州双斑蛸(Octopus bimaculoides)同源性最高,为53%。与长牡蛎进化关系最近。  相似文献   

厚壳贻贝(Mytilus coruscus)Hox基因家族的鉴定、进化与表达分析     

徐敏慧  颜成瑞  顾忠旗  黄继  李继姬  叶莹莹  夏立萍 《海洋与湖沼》2023,3(3):895-906

为探究厚壳贻贝Hox基因家族的定位、进化以及在不同成体组织中的表达模式,基于厚壳贻贝全基因组数据,结合生物信息学方法,鉴定分析厚壳贻贝Hox基因家族成员的理化性质、染色体分布、系统进化关系、基因结构以及表达分析。结果显示,从厚壳贻贝全基因组数据中鉴定出11条Hox基因序列,并分别命名为Hox1-5、Antp、Lox2、Lox4、Lox5、Post1、Post2。对11条Hox序列的基本特征分析发现最长的是编码703个氨基酸的Hox2,最短的是编码190个氨基酸Post2,等电点5.11～10.22,且不均等分布于同一条染色体上。亚细胞定位预测结果显示,除Post1基因在细胞质和细胞核中均有发现,其余10个基因亚细胞均定位在细胞核内。系统进化分析发现,使用厚壳贻贝中鉴定出的101条氨基酸序列进行建树,聚类的结果倾向于四类,而从已鉴定的厚壳贻贝11个基因结合软体动物Hox建树结果分析, Post1和Post2聚为一支, Hox4、Antp、Lox5、Lox2和Lox4聚为一个大类,Hox1、Hox2和Hox3各自聚为一类Hox,此外,Hox5单独聚为一类。厚壳贻贝不同组织的qRT-PCR结...  相似文献   

18S rRNA基因在节肢动物系统进行研究中的意义     

吴平  张克云 《现代地质》2000,14(3):355-362

采用多种分析方法对４０种节肢动物的１８ＳｒＲＮＡ基因全序列进行了分子系统学研究,结果表明,现生４个类群的系统发生关系为（多足类＋鳌肢类）（昆虫类＋甲壳类））,且表现为辐射状（爆发式）分支形式;甲壳类的各个类群间也呈爆发式进化;介形类的速足介和丽足介两个类群是非单系的起源的,它们的分化发生在甲纲各类群的分化之前;所有分析均显示速足介类支系中的金星介科的文科维异壳介（Ｈｅｔｅｒｏｃｙｐｒｉｓ ｖａｎｄ  相似文献   

蓝藻生物钟分子机制研究进展   总被引：3，自引：1，他引：2  

徐虹  章军 《海洋科学》2004,28(7):61-66

地球的自转和公转产生了周而复始的昼夜更替和季节变换,与之相适应,生物的体内生理活动和外在行为也表现出同样的周期节律性。从单细胞的分裂生殖到植物的光合作用、动物的激素分泌,都有昼夜节律性的存在。由于这种昼夜节律现象从单细胞生物到多细胞生物,从原核生物到真核生物都普遍  相似文献   

贝类同工酶研究进展   总被引：1，自引：0，他引：1  

王冬群  李太武  苏秀榕 《海洋科学》2004,28(11):72-76

同工酶是存在于生物的同一种属或同一个体的不同组织,甚至同一组织或同一细胞中,催化同一种化学反应,但酶分子结构有所不同的一组酶。它是由染色体上的不同的基因位点或同一位点的等位基因编码的,是基因型的生化表现型,它反映了编码酶蛋白的ITNA序列信息,酶谱的变化反映了等位基因和位点的变化。Buth等认为利用凝胶电泳技术,能够得到具有较好的同源性和可比性的同工酶谱,通过对酶谱的进一步分析,可以较深入、直接地了解物种的遗传信息,是分析生物的发育、遗传、系统进化和生理过程的有效探针。  相似文献   

东海温州水域4类常见耐药基因的流行情况研究     

金晶磊  周前进  邵鑫斌  王瑶华  陈炯  闫茂仓  苗亮  唐标  张严峻 《海洋与湖沼》2021,52(4):947-959

磺胺类、四环素、喹诺酮类和多粘菌素抗生素是医学与养殖业中的常用抗生素,其中多粘菌素在畜牧养殖业中常作为促长剂添加。调查分析了这4类抗生素的常见耐药基因在东海温州近海水域的分布情况。利用抗性平板筛选温州近海水域对磺胺类、四环素类及喹诺酮类抗生素耐药的可培养细菌分离株,对耐药分离株通过PCR方法进行目标耐药基因检测;对目标耐药基因阳性的耐药分离株进行多粘菌素耐药基因MCR检测以及采用微量二倍稀释法测定对上述4类抗生素的耐药性。结果表明,利用抗性平板筛选获得可培养耐药分离株1 605株,从中筛选到目标耐药基因阳性的51株,检出率为3.18%,包括含磺胺类耐药基因35株、含四环素耐药基因36株、含喹诺酮耐药基因17株、含多粘菌素耐药基因2株; 51株耐药菌归于7个菌属,其中气单胞菌属(Aeromonas sp.) 43株,占比84.31%,枸橼酸杆菌属(Citrobacter sp.)和希瓦氏菌属(Shewanella sp.)各2株,埃希氏菌属(Escherichia sp.)、类芽孢杆菌属(Paenibacillus sp.)、Thalassobius sp.及Amphritea sp.各1株;上述2株非常见分离株不统计在内,常见的49株均对四环素耐药, 41株对多粘菌素耐药,对磺胺类和喹诺酮类耐药的分离株均为34株;同时,发现23株对4类抗生素均产生耐药, 16株对多达3种抗生素耐药,多重耐药现象普遍存在。同时,鉴定出MCR-3阳性的条件致病菌维氏气单胞菌和豚鼠气单胞菌各1株。综上,温州市近海水域中含有常见耐药基因的耐药分离株检出率较低,但同一耐药基因的细菌分布多样,对磺胺类、四环素类、喹诺酮类及多粘菌素类等4类抗生素表现出较强的耐药性,多重耐药现象明显。研究结果将为评估温州近海水域的细菌耐药性风险,规范抗生素的使用提供科学依据。  相似文献