转录组数据的大菱鲆(Scophthalmus maximus) SNP标记开发及多态性分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

王婷  黄智慧  马爱军  马得友  王新安  夏丹丹  马本贺 《海洋与湖沼》2014,45(6):1300-1307

大菱鲆(Scophthalmus maximus)是最具商业价值和养殖前途的海水鱼类之一, 雌雄间生长有一定的差异。其高通量雌雄转录组测序的完成为大规模鉴定和开发SNP标记提供了参考序列。本研究基于大菱鲆雌雄转录组测序数据, 选择其中45个SNP位点, 设计引物63组, 其中21个位点(46.7%)应用小片段高分辨率熔解曲线(HRM)技术分型成功。对其进行多态性检测, 21个位点均具有二个单倍型。观测杂合度Ho的分布范围为0.256—1.000, 期望杂合度He的范围为0.276—0.518, 19个位点符合Hardy-Weinberg平衡。14个SNP位点位于基因编码区, 其中3个属于非同义突变。含有这些SNP位点的基因大多与信号转导和转录翻译相关。本研究结果表明, 高通量转录组测序和小片段HRM适合大规模SNP标记开发, 为大菱鲆的分子遗传育种提供了候选标记资源。  相似文献   

大菱鲆(Scophthalmus maximus)、星斑川鲽(Platichthys stellatus)及其杂交种的形态学分析   总被引：3，自引：0，他引：3  

马海涛  韩承慧  滕照军  刘相全  杨建敏  田玉秋  姜海滨 《海洋与湖沼》2014,45(6):1380-1386

利用方差分析、聚类分析、判别分析和主成分分析等多元分析方法,对大菱鲆、星斑川鲽及其杂交种(大菱鲆♀×星斑川鲽♂)的可数性状和可量性状进行了分析。结果表明:(1)可数性状中,除腹鳍鳍条数外,杂交种与母本大菱鲆差异不显著,而与父本星斑川鲽差异极显著。(2)可量性状中,杂交种和大菱鲆差异不显著的性状占可量性状的45%,而与星斑川鲽都为显著差异。可量性状的杂种指数平均值为15.56,显示杂交种可量性状总体属于偏母本。(3)聚类分析表明,杂交种与大菱鲆形态较为接近,先聚为一支,再与星斑川鲽聚为一支。(4)主成分分析表明,共获得了4个主成分,其累积总变异的贡献率为73.49%。主成分散点图表明杂交种在形态差异上独立于大菱鲆和星斑川鲽。(5)判别分析表明,利用10个对结果影响贡献率较大的参数分别构建了其判别函数,对大菱鲆、星斑川鲽和杂交种的综合判别准确率达到98.9%,判别效果非常显著。研究认为,杂交种的形态与母本比较相似,但可以通过形态判别分析将三者进行区分判别。  相似文献   

大菱鲆（Scophthalmus maximus）大规模家系选育优良家系的生长发育规律   总被引：3，自引：1，他引：2       下载免费PDF全文

王新安  马爱军  黄智慧  刘庆明  郭黎  杨志  曲江波 《海洋与湖沼》2011,42(2):266-273

运用Logistic、Gompertz和von Bertalanffy3种生长模型分别对大菱鲆的5个优良家系E♂1×E♀2、F♂4×N♀3、F♂2×E♀4、E♂2×F♀1、F♂1×F♀4及对照组群体的生长曲线进行了拟合和比较分析。结果表明,家系E♂1×E♀2、F♂2×E♀4和E♂2×F♀1的最优拟合模型为Gompert...  相似文献   

云纹石斑鱼（Epinephelus moara）早期发育阶段的摄食与生长特性   总被引：2，自引：0，他引：2  

陆丽君  陈超  马爱军  翟介明  王新安  李伟业 《海洋与湖沼》2011,42(6):822-829

采用随机取样实验生态学方法,对人工培育的云纹石斑鱼的仔、稚、幼鱼各发育阶段的形态特征及摄食变化状况进行了观察和描述。结果表明,云纹石斑鱼仔、稚鱼生长期间,分别以牡蛎幼体、轮虫、卤虫为饵料,幼鱼摄食配合饲料。形态学数据测量结果表明,云纹石斑鱼仔、稚、幼鱼的全长、体重和日龄三者之间存在相关关系。全长与日龄的关系式为L=2....  相似文献   

中国大菱鲆产业现状及发展趋势分析     

米娜莎  王栋 《海洋科学》2011,35(6):96-99

大菱鲆（Scophthatmus maximus）是原产于欧洲的天然良种,它的开发养殖对欧洲水产业产生了巨大影响,也引起了世界其他国家的广泛关注。因大菱鲆具有对生态环境适应能力强,并能适应低水温生活,生长速度快,品质好等特点,所以,成为各国竞相引进的对象。  相似文献   

几种益生菌对大菱鲆幼鱼生长及消化酶活性的影响   总被引：1，自引：0，他引：1       下载免费PDF全文

高凤祥  郭文  潘雷  胡发文  菅玉霞  张少春  王雪 《海洋科学》2011,35(1):10-16

作者以初体质量为(4.80±0.11)g 的大菱鲆(Scophthalmus maximus)为研究对象,在循环水水族箱中进行60 d 饲喂实验,研究饵料中添加单一益生菌和复合益生菌对大菱鲆生长及消化道酶活性的影响.以基础饲料为对照组,在基础饲料中分别添加枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、地衣芽孢杆菌...  相似文献   

大菱鲆亲子鉴定的微卫星多重PCR技术建立及应用     

苗贵东  杜民  杨景峰  徐营  樊廷俊  陈松林 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2011,41(1)

用8个微卫星标记组合建立了2个微卫星多重PCR体系,对大菱鲆7个人工选育家系进行了系谱认证、亲子鉴定和遗传多样性研究.2个多重PCR体系中8个微卫星位点共检测到等位基因49个,每个位点等佗基因数为3～8个.根据已知亲本及子代基因型,成功推断出了3个缺失亲本的基因型.在双亲未知的情况下2个多重PCR的8个微卫星位点累积排除概率是96.58%,已知1个亲本时累积排除率为99.71%,亲子鉴定准确率为96.42%.采用70个个体进行双盲验证,利用UPGMA法对7个家系的70个体进行了聚类分析,同一家系95.71%的个体聚类分析结果与系谱来源一致.Cervus 2.0软件亲子鉴定结果表明亲子鉴定准确率为92.86%.2个多重PCR体系的建立为大菱鲆不同家系混养后的亲子鉴定、系谱分析和分子辅助家系管理提供了技术手段.  相似文献   

稀土对大菱鲆生长和非特异性免疫力的影响     

崔丽卿  徐玮  汪东风 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2011,41(7)

以初始体质量为(12.2±0.01)g的大菱鲆(Scophthalmus maximus)为实验对象,进行为期56 d的摄食生长实验,在基础饲料中添加240 mg/kg的稀土(Rare earth elements,REE),研究了REE对大菱鲆生长和非特异性免疫力的影响.结果表明:饲料中添加稀上后,大菱鲆的成活率提了8.95％,特定生长率提高了 15.79％,增重率提高了26.88％,而饲料系数显著低于对照组(P＜0.05);饲料中添加稀土喂养的大菱鲆血液中性粒细胞的吞噬指数和超氧化歧化酶活性高于对照组.同时,饲料中添加稀土后,大菱鲆抵抗迟缓爱德华氏菌感染的能力增强.因此,在饲料中添加REE,能够显著提高大菱鲆的生长和非特异性免疫力.  相似文献   

三（2-氯乙基）磷酸酯（TCEP）对大菱鲆（Scophthalmus maximus）免疫相关基因表达的影响          下载免费PDF全文

刘聪  衣丹  柴迎梅  丛柏林 《海洋科学进展》2022,40(3):473-483

三（2-氯乙基）磷酸酯（Tris(2-carboxyethyl)phosphine, TCEP）是一种新型内分泌干扰物（Endocrine Disrupting Chemicals,EDCs),低剂量就会造成很强的生物毒性。通过研究不同质量浓度梯度的TCEP对养殖大菱鲆的胁迫,发现其在24 h 、48 h 、72 h 和96 h的半致死浓度（LC₅₀）分别为190.76 mg/L、159.94 mg/L、140.70 mg/L和110.71 mg/L;安全浓度（SC）为33.60 mg/L。24 h内不同质量浓度梯度的TCEP和不同胁迫时间对养殖大菱鲆的影响表明,高于质量浓度33.60 mg/L的TCEP对大菱鲆具有急性毒性效应。用实时荧光定量PCR技术分析TCEP急性胁迫的养殖大菱鲆体内2种细胞免疫因子-组织相容性复合体alpha（MHC-Ⅱ α）和肿瘤坏死因子alpha（TNF-α）的基因相对表达水平,发现经TCEP胁迫后2种细胞免疫因子的表达量都显著上调;随TCEP的质量浓度升高,特别是达到47.69 mg/L（$ \frac{1}{4} $ LC₅₀）以上时表达量的变化更加明显;而胁迫时间超过12 h,基因表达量会呈现先上升后下降的趋势,说明对大菱鲆免疫系统造成急性损伤。研究结果可为大菱鲆健康养殖提供参考,并为环境污染物检测提供分子标记参考。  相似文献   

大菱鲆(Scophthalmus maximus)热休克蛋白SmHsp47相互作用蛋白His-pull down和质谱鉴定     

朱春月  孙志宾  马爱军  刘志峰  杨敬昆  赵亭亭 《海洋与湖沼》2021,52(4):971-982

首次克隆了大菱鲆(Scophthalmusmaximus)热休克蛋白Sm Hsp47基因。该基因c DNA序列全长为1 927 bp,其中开放阅读框长度为1 218 bp,编码一条长度为405个氨基酸的多肽链。结果表明,大菱鲆Sm Hsp47基因在肝脏、皮肤、鳃和肠等4个组织中都有表达,表达量最高的组织是肝脏,表达量最低组织是鳃; 25°C处理6 h后Sm Hsp47在皮肤中的表达量增加150多倍。利用大肠杆菌原核表达系统表达了Sm Hsp47的his标签融合蛋白,然后利用His-pull down技术捕获了Sm Hsp47的相互作用蛋白质,通过质谱分析鉴定出31种候选蛋白,其中大部分蛋白为参与翻译后修饰,蛋白转换及分子伴侣;此外还包括参与脂转运与代谢、能量产生与转换、细胞骨架、防御机制等过程的蛋白质。从31种候选蛋白中进一步筛选出3种分值较高的蛋白:未知蛋白(uncharacterizedprotein,A0A6A4TFV0)、胎球蛋白B(FetuinB,A0A2U9C388)和胶原结合蛋白(collagen-bindingprotein,A0A2U9B608),可为后续的研究提供方向。  相似文献