溶藻弧菌的PCR快速检测方法   总被引：4，自引：0，他引：4  

韩一凡  莫照兰  李杰  茅云翔  肖鹏  汪笑宇  杨官品 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2009,39(6)

为建立溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)的PCR快速检测方法,本研究根据弧菌toxR基因的高变区序列设计1对扩增片段为161 bp的引物,进行了特异性和敏感性试验.结果表明该方法能特异地检测溶藻弧菌,每个PCR反应检测的敏感度为0.01 pg的DNA和3.7CFU的细菌.用溶藻弧菌人工感染大菱鲆,以建立的PCR方法检测感染鱼的肝、脾、肾阳性检出率为100%.该方法可用于对感染溶藻弧菌的水生动物疾病进行诊断.  相似文献   

台湾海峡多管水母属——新种及基于线粒体COI序列分析鉴定多管水母   总被引：1，自引：0，他引：1       下载免费PDF全文

郑连明  林元烧  李少菁  曹文清  许振祖  黄加祺 《海洋学报》2008,30(4):139-146

报道了中国台湾海峡多管水母属一新种——台湾多管水母(Aequorea taiwanensis n.sp.),详细描述其形态特征,并基于线粒体COI基因片段序列,比较、分析了该新种和乳突多管水母、锥状多管水母的序列差异及遗传距离。形态学和分子学数据都支持台湾多管水母为多管水母属有效种。3种多管水母mtCOI基因片断序列在种间存在明显的多态性,3种多管水母的种间序列差异为9.10%~11.9%,种间遗传距离为0.097~0.130,说明该基因片段适用于多管水母属种、种以下阶元及地理种群甄别和种间系统进化学分析。结合其他学者研究结果,认为mtCOI序列差异10%~20%可以作为多管水母属及其他水螅水母纲动物同属种间差异的标准。  相似文献   

鱼类性别决定与分化相关基因研究进展   总被引：2，自引：0，他引：2       下载免费PDF全文

文爱韵  尤锋  徐永立  张培军 《海洋科学》2008,32(1):74-80

在脊椎动物系统进化中,鱼类处于承前启后的关键地位.与高等脊椎动物相比,鱼类的性别决定机制具有原始性、多样性和易变性,并具有所有脊椎动物的性别决定方式,存在从雌雄同体到雌雄异体的各种性别类型,性逆转在鱼类也是较为常见的现象,因此鱼类性别决定机制研究对于整个脊椎动物类群性别决定机制的形成及进化途径的揭示有非常重要的理论价值.而且鱼类的性别发育是以遗传因素为基础,并受到自身内分泌调节和外界环境的影响,是三者相互作用的结果,故其性别决定与分化没有一个普遍的模式,给性别决定与分化研究带来了一定难度.但随着分子生物学技术的迅猛发展,近20年来有关鱼类性别决定与分化机理及性别相关基因的研究已经取得了相当大的进展.作者根据现有文献资料,对鱼类性别决定与分化相关基因的研究动态和进展作一综述,并对目前存在的热点问题进行了探讨,以期为今后鱼类性别决定与分化相关基因深入研究提供参考.  相似文献   

五种紫菜同工酶标记的遗传分析     

沈颂东  李艳燕  许璞  张美如  袁昭兰  王建伟  朱建一 《海洋通报(英文版)》2010,12(1):65-78

用垂直凝胶电泳来研究采自中国的（条斑紫菜×坛紫菜）杂交种、坛紫菜、条斑紫菜、少精紫菜、半叶紫菜的同工酶多态性。然后分析最小可能位点数和观察同位基因数、遗传差异性和采用平均连接聚类法。选取23种酶带中的六个酶（MDH，ME，LDH，GDH，IDH和G-6-PDH）进行分析。最小可能等位基因位点数显示五种紫菜在ME等位基因位点都只有一个。LDH和GDH等位基因位点半叶紫菜和少精紫菜和另外的三种紫菜不同，而在分析MDH时半叶紫菜比较独特。在IDH位点分析时少精紫菜和坛紫菜和其他三种不同，而条斑紫菜和坛紫菜和其他三种不同在G-6-PDH位点不一致。总的来看，最小可能等位基因位点数分析半叶紫菜是最分离的。遗传多样性结果分析表明当遗传相似度为0．7550时，五种紫菜中的遗传变异研究受到限制。条斑紫菜和坛紫菜的杂交种非常接近少精紫菜。当遗传相似度达到0．8937时，出乎意料的是条斑紫菜和坛紫菜遗传同一。性很低。条斑紫菜4个株系的平均遗传相似度仅为0．7428，差异比较大。在所有紫菜中半叶紫菜是最分化的分支，它与最小可能等位基因位点数分析一致。  相似文献   

淋巴囊肿病毒锌指蛋白基因lcn140的原核表达与结构分析     

闫秀英  孙修勤 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2009,39(6)

应用生物信息学分析方法,预测到中国牙鲆淋巴囊肿病毒分离株(LCDV-cn)的lcn140基因编码锌指蛋白.为了进一步研究lcn140基因的功能,本文对lcn140基因进行了原核表达与结构分析.首先将lcn140基因克隆到pET24a(+)原核载体,再以E.coli BL21(DE3)为宿主菌表达目的蛋白;通过生物信息学软件分析,了解其结构与序列特征.结果表明,lcn140基因在原核载体中得到成功表达,表达的his标签融合蛋白主要以包涵体形式存在;在结构和序列方面,lcn140基因编码C3H1型锌指蛋白,其含有4个C3H1锌指结构和4段简单重复序列.该结果为LCDV-cn的发生、发展提供了分子基础.  相似文献   

雨生红球藻中IPP异构酶基因表达调控机制的初步研究     

高政权  孟春晓  叶乃好 《海洋通报(英文版)》2009,11(1):37-42

单细胞淡水绿藻-雨生红球藻能够在一定条件积累一种次生类胡萝卜素-虾青素，因而在生长后期藻体变为深红色。其中，IPP异构酶在雨生红球藻中的虾青素合成过程中发挥了重要作用。在本研究中，我们首次通过基因组上游步移克隆到了雨生红球藻中IPP异构酶基因的两个不同5’上游侧翼序列，大小分别是1．8kb和2．5kb。利用生物信息学方法分别对这两个不同5’上游侧翼序列进行了序列分析，结果发现，二者具有某些相同的顺式作用元件，如可能的脱落酸反应元件（ABRE）、干燥或低温反应元件（DRE／C-repeat）、几种光反应元件（G-box，GAG-motif，I-boxand ATC-motif）、热激反应元件（HSE）、机械伤害反应元件（WUN-motif）、水杨酸反应元件（TCA-element）、生长素反应元件（TGA-element）、茉莉酸甲酯反应元件（TGACG-element）、缺氧特异反应中的增强子类似元件（GC-motif）和反式作用因子MYB蛋白的结合位点（MBS and MRE），但是二者并不具有典型的TATA框和CCAAT框。上述研究预示了雨生红球藻虾青素合成中IPP异构酶基因转录调控方式的多样化。  相似文献   

一种利用多时相TM影像分析地表植被变化的新方法：——以敦煌地区绿洲植 …   总被引：6，自引：0，他引：6  

李本纲  陶澍 《遥感学报》2000,4(4):295-298

变化分析是多时相遥感影像的主要应用领域。以敦煌绿洲为例,探讨一种应用多时相ＴＭ影像进行地表植被变化分析的新方法。结果证明,用不同时相的ＮＤＶＩ影像进行彩色合成可以直观地反映地表植被的变化,而利用色彩变换得到的各分量可以对变化特点进行定量分析。其中色度反映变化类型,饱和度反映变化强度,而亮度图像则反映地表植被多年来的总体长势。除了直观和定量的特性之外,该方法还可以用于其它类型的变化分析,具有可扩展性  相似文献   

猪雌激素受体(ESR)基因的多态性分析     

叶昌辉  黄如渠  谢为天  许英梅 《广东海洋大学学报》2002,22(3):70-72

母猪的产仔数是一个重要的经济性状 ,产仔数的提高将大大增加肉猪的产量 ,给养猪业带来巨大的经济效益 ,因此 ,有效地提高猪的产仔数一直是猪育种的主要目标之一。由于猪产仔数的遗传力很低 (约为 0 .1 ) ,并且要等到母猪产仔后才能度量 ,这种传统的选育方法其育种周期长、遗传进展小 ,因此开发和利用新的选育标记来提高猪的繁殖性就倍受重视。随着现代分子生物学和分子遗传学的发展 ,使得寻找多仔基因的遗传标记和标记辅助选择(Ｍａｒｋｅｒａｓｓｉｓｔｅｄｓｅｌｅｃｔｉｏｎ ,ＭＡＳ)成为可能。 1 994年Ｒｏｔｈｓｃｈｉｌｄ通过候选基…  相似文献   

微型DNA条形码在鱼类物种鉴定中的适用性研究          下载免费PDF全文

邢炳鹏  张稚兰  王彦国  孙柔鑫  王春光 《应用海洋学学报》2020,39(4):559-565

以台湾海峡11目38科66属85种355个鱼类样品为研究对象，选取线粒体COⅠ基因中长为313 bp的序列为微型条形码，探讨微型DNA条形码技术在鱼类分类鉴定中的适用性。共获取355条基因序列，序列中T、C、A、G碱基的平均含量占比分别为29.50%、30.10%、24.90%和15.50%；AT含量占比均高于50%。样品种内、种间、属间、科间和目间的K2P （Kimrua 2 Parameter）遗传距离分别为0.37%、18.10%、22.10%、25.40%和27.80%，遗传距离随着分类阶元的提高而增大，种间遗传距离是种内遗传距离的49倍，表明该微型DNA条形码可用于鱼类的分类鉴定，可有助于渔业资源调查和生物多样性保护。  相似文献   

火焰原子吸收分析中增感效应的应用     

侯贤灯 《地质实验室》1990,6(2):100-103

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