高识别力的微卫星标记系统在鳜属(Siniperca)物种鉴定中的应用          下载免费PDF全文

鲁双庆  匡刚桥  刘臻  刘红玉  张建社  刘峰 《海洋与湖沼》2007,38(4):379-384

根据自行分离的翘嘴鳜微卫星序列（GenBank登录号：DQ789247-DQ789306）设计并合成20对微卫星引物,对鳜属鱼类4个物种即翘嘴鳜、大眼鳜、斑鳜和暗鳜共80个个体进行了物种鉴定分析.结果表明,20对微卫星引物共检测到293个等位基因,大小在80-301bp之间.它们在4个物种中的多态性位点百分率分别为90%、75%、85%和85%,累积个体识别率和非父排除率均达到0.9999,属于高识别力的微卫星遗传标记系统,可以用来进行鳜属鱼类物种的鉴定分析.UPGMA聚类分析表明,翘嘴鳜与暗鳜之间亲缘关系最近,可归属于第Ⅰ类;大眼鳜为第Ⅱ类;斑鳜独自为第Ⅲ类.本研究可为鳜属鱼类的分类及进化关系、群体遗传结构分析等提供理论支持,为野生原种鳜类遗传多样性的监测和评估以及鳜类优良的种质资源得到合理保护和开发利用奠定基础.  相似文献   

萼花臂尾轮虫(Brachionus calyciflorus)COI基因序列变异及种群遗传结构分析   总被引：4，自引：0，他引：4  

董云伟  牛翠娟 《海洋与湖沼》2004,35(5):473-480

利用线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome oxidaseⅠ，COI)基因序列对北京地区和江汉湖群部分湖泊萼花臂尾轮虫(Brachionus calyciflorus)种群遗传结构进行了初步分析。以特异引物进行PCR扩增，获得了661bp的基因片断序列，所得序列与Genbank中B．calyciflorus COI序列的同源性为82％—93％。在6个种群中，共获得了15种单元型。序列分析结果表明，不同季节单元型之间的遗传距离较大(0．248-0．263)，而在同一季节单元型之间遗传距离较小(0．002-0．031)。种群遗传结构分析表明，各种群之间无共享的单元型，同一季节不同湖泊种群之间存在着一定程度的遗传分化，但未按照地理位置形成明显的地理格局。按采样时间分组进行AMOVA分析，组间差异高达94．09％；DH-I与其他种群之间存在着明显的遗传分化。同一湖泊不同季节样品之间，遗传变异较大，这表明在同一湖泊存在着不同基因型的轮虫休眠卵，当环境条件发生了变化后，不同基因型之间会发生更迭。  相似文献   

中国近海带鱼种群生化遗传结构及其鉴别的研究   总被引：17，自引：2，他引：17  

王可玲  张培军  刘兰英  尤锋  徐成  王建飞 《海洋学报》1994,16(1):93-104

用淀粉胶和聚丙烯酰胺凝胶电泳，分析了中国近海带鱼（Ｔｒｉｃｈｉｕｒｕｓ）９个取样群体４７２尾鱼的１１种同工酶．并对它们进行了生化遗传分析，共记录出２４个基因座位．各取样群体遗传相似度和遗传距离的计算表明，中国近海的带鱼不是过去认为的一个种、３～５个种群，而是存在３个不同的种８个种群．  相似文献   

广西地区文蛤的遗传多样性研究   总被引：13，自引：3，他引：13  

阎冰  邓岳文  杜晓东  兰国宝  王爱民 《海洋科学》2002,26(5):5-8

以随机扩增多态性DNA（RAPD）研究广西的山口、北海、犀牛角、东兴的文蛤种群的遗传多样性。结果表明，在筛选的60个引物中，23个呈阳性反应，其中10个引物可产生105条稳定、清晰的带。山口、北海、犀牛角、东兴的文蛤种群的遗传多样性指数分别为0.1995,0.2039，0.1773,0.1936；多态位点比例分别为86.32%，90.63%,81.05%,88.00%,4个种群间的遗传距离在0.050～0.070之间，相邻种群的遗传差距较小。除犀牛角种群以外，其它3个种群的遗传变异水平较高。  相似文献   

AFLP analysis revealed differences in genetic diversity of four natural populations of Manila clam(Ruditapes philippinarum) in China   总被引：7，自引：0，他引：7  

LIU Xiangquan  BAO Zhenmin  HU Jingjie  WANG Shi  ZHAN Aibin  LIU Hui  FANG Jianguang  WANG Rucai 《海洋学报(英文版)》2007,26(1):150-158

1 IntroductionManila clam (Ruditapes philippinarum) is aworldwide distributed species. In China, it is foundfrom the northern to southern seashores (Wang etal., 1993; Zhuang, 2001). This species is eura-line with the salinity tolerance ranging from 20 to4…  相似文献   

石鲽同工酶的组织表达和群体遗传变异研究     

徐建鹏  张全启齐洁 王志刚 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2007,37(2):265-265

采用水平淀粉凝胶电泳技术，研究了石鲽（Kareius bicoloratus）同工酶的组织表达和群体遗传变异。结果表明，14种同工酶共记录31个基因座位，各同工酶的表达均有明显的组织差异，基因座位SOD^＊，GDH^＊，G3PDH～2^＊和ADH-2^＊仅在肝脏中表达，SDH-1^＊，MDH-1。和ADH-1。仅在肌肉中表达，LDH—B^＊和LDH—C^＊仅在眼睛中表达，MDH-2^＊，GPI-3^＊和SDH-2^＊在所有检测的组织中均有表达，其余酶的表达则表现出不同程度的组织差异，与各组织完成特有的生化代谢活动有关。选取肌肉和肝脏对中国青岛、威海石鲽2个地理自然群体的遗传结构和遗传分化进行研究。青岛群体和威海群体的多态座位比率分别为29．17％和25．00％，观察杂合度分别为0．028±0．014和0．040±0．019；期望杂合度分别为0．039±0．017和0．052±0．022。结果表明，两群体间的群体分化度和遗传距离分别为0．012和0．0011，表明石鲽群体间的遗传分化较低。与其它鲽形目鱼类相比，石鲽群体的多态座位比率和平均杂合度均处于中间水平。  相似文献   

海水养殖鱼类细菌性疾病研究概况   总被引：8，自引：0，他引：8  

钱云霞  王国良  邵健忠 《海洋湖沼通报》2001,(2):78-87

本文概述性地介绍了发生在海水养殖中的常见细菌性疾病包括弧菌现、链球菌症、卡诺氏菌症、细菌性肾病、巴斯德氏杀菌症、爱德华氏症、滑走细菌症和杀鲑气单胞菌症等的主要症状、流行情况及病原菌特征，通过遗传育种筛选有抗病力的养殖品种是人们正在努力的方向，目前的研究重点主要在鱼类抗病能力方差分析研究及抗病育种的方法研究，免疫接种是提高养殖鱼类对某一特定性病原菌的最有效的方法，目前已有三十多种菌苗上市，通过使用免疫刺激剂提高鱼类的非特异性免疫力已显示一定的应用前景，虽然抗菌素由于存在抗药菌株和鱼体残留，但它仍是目前对细菌性疾病疾病的常规疗法，而海洋藻类提取物对细菌的抑制作用已被人们所认识，它将会成为一种有潜力的抗菌药物。  相似文献   

花鲈和鲈鱼群体的遗传分化研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

胡自民  高天翔  韩志强  宋林 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2007,37(3):413-418

利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对3个中国花鲈(Lateolabrax maculatus)群体(威海,舟山和北海)和4个日本鲈鱼(L.japonicus)群体(东京湾、山口、有明海和八代海)进行了遗传分化研究。18条随机引物在7个群体中共扩增出159条谱带,其中多态性谱带133条(83.65%)。花鲈和鲈鱼群体间的平均等位基因数和平均有效等位基因数分别为1.836 5和1.524 2,Nei’s多样性指数和Shannon多样性信息指数分别为0.3075和0.4586。花鲈和鲈鱼群体内的遗传多样性分别为0.3156~0.3669和0.2982~0.5150。UPGMA聚类分析显示,舟山、威海和北海3个花鲈群体亲缘关系较近并形成一分支,而日本有明海与八代海的鲈鱼群体同花鲈关系较远,它们与另2个鲈鱼群体(东京湾和山口)形成另一分支。本文结果进一步从分子水平上支持将中国产花鲈和日本的鲈鱼划分为2个种的观点,并且RAPD数据表明花鲈和鲈鱼群体内都出现了明显的遗传分化。  相似文献   

橙色莫桑比克罗非鱼和荷那龙罗非鱼的AFLP分析   总被引：6，自引：0，他引：6  

杨淞  叶星  卢迈新  黄樟翰  白俊杰 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2006,36(6):937-940,980

运用AFLP分子标记技术检测了橙色莫桑比克罗非鱼（Oreochromis mossambicus）和荷那龙罗非鱼（Oreochromis hornorum）的种群遗传多样性。提取2种鱼的基因组DNA，经EcoR Ⅰ和Mse Ⅰ限制性内切酶酶切并加接头，从16对选扩引物组合中选出3对扩增结果较好的引物进行PCR扩增。扩增产物经PAGE胶电泳、银染，检测其多态性。3对引物在2种罗非鱼的40个个体中共扩增出94条带，其中多态性条带76条，占总扩增条带的80．9％，2个群体的多态性条带比例分别为71．6％和52．4％。根据Nei氏（1978）统计分析得出橙色莫桑比克罗非鱼种群内遗传相似系数为0．765。荷那龙罗非鱼的为0，821，表明2个罗非鱼种群均具有较高的遗传多样性，橙色莫桑比克罗非鱼种群内遗传多样性相对更高些。2种罗非鱼的种间遗传距离为0．279，推测该杂交组合可能具有杂种优势。  相似文献   

栉孔扇贝(Chlamys farreri)自然群体遗传多样性的RAPD分析   总被引：7，自引：0，他引：7  

刘亚军  孔晓瑜  喻子牛 《海洋与湖沼》2006,37(4):289-296

利用RAPD技术对栉孔扇贝(Chlamysfarreri)的四个自然群体(大连、烟台、青岛、韩国)的遗传多样性进行了分析。12个随机引物在四个群体中共检测到123个位点,其中多态位点109个,多态位点比例为88.62%;四个群体中均未检测到各群体特有的扩增带。韩国、烟台、大连、青岛四个群体的遗传多样性指数(Shannon指数)分别为0.2557、0.2557、0.2344和0.2249,以韩国和烟台群体遗传多样性较高,其次为大连群体,青岛群体最低,但它们之间无明显差异。不同群体的遗传多样性指数的平均数Hpop为0.2427,整个栉孔扇贝自然群体的遗传多样性指数Hsp为0.2503。遗传多样性剖分显示,绝大多数(97%)的遗传多样性是由群体内不同个体间的差异造成的,只有很小部分(3%)的遗传多样性与群体间的遗传分化有关。而采用基于单倍型(等位基因)之间的进化距离的AMOVA分析得到的这两个数据则分别为99%和1%,Φ值为0.010,且P=0.05,表明群体间遗传分化明显程度位于临界值。  相似文献