雨生红球藻β-胡萝卜素酮化酶基因克隆、分析及叶绿体表达载体构建     

檀琮萍  梁成伟  苏忠亮  秦松 《海洋通报》2007,26(1):35-40

β-胡萝卜素酮化酶(BKT)是雨生红球藻虾青素合成途径中的关键酶。根据GenBank中所收录的雨生红球藻BKT的cDNA序列设计特异性引物,以高光照处理的雨生红球藻细胞的总RNA为模板,采用RT-PCR的方法克隆出了β-胡萝卜素酮化酶基因(bkt)。序列测定结果表明,bkt全长960bp编码320个氨基酸。克隆的bkt序列与GenBank收录的BKT的cDNA(AY603347)序列只相差一个碱基。并对其编码的氨基酸进行了二级结构的预测和疏水性分析。同时将所克隆的bkt构建入衣藻叶绿体表达载体p64Dbkt,为基因的进一步表达研究及探索其作用机制奠定了基础。  相似文献   

Phaeocystis globosa与Phaeocystis antarctica叶绿体psbA基因的比较   总被引：3，自引：0，他引：3       下载免费PDF全文

杨泽民  章群  谢数涛  韩博平  吕颂辉  Hodgkiss 《海洋科学》2005,29(1):24-28

测定了2株球形棕囊藻Phaeocystis globosa P1、P2的psbA基因序列。发现得到的2个序列完全相同。以P2序列对比分析了P．globosa和P．antarctica的psbA基因在DNA序列、氮基酸序列和RNA二级结构上的差异性，发现2种棕囊藻psbA基因DNA序列和氨基酸序列非常保守，无插入／缺失，其核苷酸和氨基酸变异率分别为1．88％和1．13％。与核基因核苷酸的碱基替换不同，psbA基因核苷酸的碱基替换主要发生在密码子的第1位上。且不引起氨基酸的变化，引起氨基酸变化的碱基替换都发生在密码子的第2位和第3位上。在RNA二级结构上两序列的1～4茎环结构完全相同，表现出明显的棕囊藻属的特异性，其它结构区域差异较大。种间差异表现明显。由于psbA基因DNA序列和氨基酸序列非常保守，可能不适宜棕囊藻属的系统发育分析。但其RNA二级结构可能对于棕囊藻的分子分类有一定的参考价值。  相似文献   

Effect of Cyclic Loading Frequency on Undrained Behaviors of Undisturbed Marine Clay   总被引：2，自引：0，他引：2  

陈云敏  姬美秀黄博 《中国海洋工程》2004,18(4):643-651

Based on a series of cyclic triaxial tests, the effect of cyclic frequency on the undrained behaviors of undisturbed marine clay is investigated. For a given dynamic stress ratio, the accumulated pore water pressure and dynamic strain increase with the number of cycles. There exists a threshold value for beth the accumulated pore water pressure and dynamic strain, below which the effect of cyclic frequency is very small, but above which the accumulated pore water pressure and dynamic strain increase intensely with the decrease of cyclic frequency for a given number of cycles. The dynamic strength increases with the increase of cyclic frequency, whereas the effect of cyclic frequency on it gradually diminishes to zero when the number of cycles is large enough, and the dynamic strengths at different frequencies tend to the same limiting minimum dynamic strength. The test results demonstrate that the reasons for the frequency effect on the undrained soil behaviors are beth the creep effect induced by the loading rate and the decrease of sample effective confining pressure caused by the accumulated pore water pressure.  相似文献   

海洋生物中牛磺酸的生物活性及其含量测定   总被引：4，自引：0，他引：4  

谭乐义  薛长湖  林洪  李兆杰 《海洋科学》2001,25(1):26-27

牛磺酸 (Ｔａｕｒｉｎｅ ,Ｔａｕ)是一种非蛋白质结构氨基酸的特殊氨基酸。它以游离氨基酸的形式普遍存在于动物体内各种组织 ,并以小分子二肽或三肽的形式存在于中枢神经系统 ,但不参与蛋白质合成。最早是１８２７年从牛的胆汁中发现了这种含硫氨基酸 ,又称为牛胆碱 ,牛胆素。其分子式为Ｃ２Ｈ ７ＮＯ ２Ｓ ,是一柱状结晶体 ,熔点为３１０℃。牛磺酸在鱼、贝类中含量十分丰富 ,软体动物中尤甚。可以说海洋生物是牛磺酸的天然宝库。１生物活性研究近况１８８６年 ,Ｓｃｈｍｅｉｄｅｂｅｒｇ等人就认为牛磺酸具有药物作用 ,但直到１９７５年…  相似文献   

对Folin-酚法测定藻类蛋白质的改进   总被引：3，自引：0，他引：3  

钱凯先  王澍生 《海洋与湖沼》1989,20(2):192-196

在实验室中用以测定藻类蛋白质的方法很多,其中,Folin-酚法是应用最广泛的一种微量测定方法。该法综合了Folin和双缩脲法的优点,其所显的颜色比酚试剂单独使用时增加3—15倍,而灵敏度比双缩脲法增加近100倍。但是,Folin-酚法在测定藻类蛋白质时存在着样品的蛋白质提取问题,藻类细胞一般具有坚厚的细胞壁,有的在壁外  相似文献   

雨生红球藻β-胡萝卜素酮化酶基因的cDNA和基因组DNA克隆及序列分析     

滕长英  张立  秦松  曾呈奎 《海洋科学》2006,30(8):20-27

根据已知的β-胡萝卜素酮化酶(β-carotene ketolase,BKT)的cDNA序列设计引物,利用长距离PCR扩增获得了bkt基因的cDNA完整编码片段及基因组DNA片段,并对这些片断进行了序列测定。cDNA和基因组DNA比对结果表明该基因至少包括5个内含子,它们的剪切位点皆符合GU-AG规律。在比对结果中同时还发现一个19bp的短序列重复,该重复序列在bkt的cDNA和基因组DNA上都发生了多次重复,推测在BKT的表达调控中可能具有一定功能。另外,在序列比对过程中还发现本实验所获得的cDNA和基因组DNA序列与前人报道的cDNA序列之间都存在多处单碱基差异和19bp的短序列差异。  相似文献   

甲壳动物线粒体DNA的研究   总被引：4，自引：0，他引：4  

方李宏  薛俊增  董双林 《海洋湖沼通报》2004,199(2):59-65

对于甲壳动物的分子生物学研究特别是其中与进化相关的研究工作目前主要围绕着线粒体基因序列开展。在近20年的生物线粒体序列研究过程中线粒体全序列的数量经历了一个飞速发展的过程，但甲壳动物中仅有8个物种的线粒体全序列完成测序。通过对NCBI(National Center for Biotechnology Infomation)的GenBank中数据的分析我们发现线粒体基因序列的数量占全部序列数的近一半。甲壳动物线粒体序列的研究主要围绕着12s rRNA、16s rRNA和COI进行，国内的相关研究处于起步阶段。  相似文献   

日本(虫寻)和底栖短桨蟹线粒体DNA 12SrRNA基因序列的初步研究   总被引：6，自引：1，他引：6  

高天翔  张秀梅  渡边精一  伏屋玲子 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2004,34(1):43-47

以相应引物对日本和底栖短桨蟹的线粒体 DNA1 2 S r RNA基因片段进行了 PCR扩增和序列测定 ,分析比较了 2种间序列差异。结果表明 :日本 1 2 S r RNA基因片段长度为 41 4 bp,底栖短桨蟹为 41 5bp,2种的 A,T,G,C含量分别为 1 51 bp(36.47% ) ,1 53bp(36.96% ) ,43bp(1 0 .39% ) ,67bp(1 6.1 8% )和 1 50 bp(36.1 4 % ) ,1 55bp(37.35% ) ,44bp(1 0 .60 % ) ,66bp(1 5.90 % )。 2种间共出现了 3个碱基的缺失 /插入和 38bp的序列差异 ,其碱基转换与碱基颠换比约为 2 .1 7。  相似文献   

海水中痕量苯系物的气相色谱测定的研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

王中柱崔仙舟  张学华朱潇杰 《山东海洋学院学报》1985,15(2):34-41

Domestic polymeric microbeads GDX-502 were used to concentrate benzene hydrocarbon from seawater. The absorbed benzene hydrocarbon was removed by thermal desorption and directly injected into gas chromatograph and determined by FID detector. It was optimal for the rapid and precise determination of trace benzene hydrocarbon in seawater. In this Paper the investigation of benzene hydrocarbon in the coastal water of Jiaozhou Bay (Qingdao) is reported as well. The data for benzene hydrocarbon are listed in table 3 for 1984 and the station locations are given in figure 6.  相似文献   

缺少密度或孔隙度测定数据的块体堆积速率的计算     

T.J.S.Sykes孙萍  梁宏锋 《海洋地质前沿》1995,(8):15-17

缺少密度或孔隙度测定数据的块体堆积速率的计算Ｔ．Ｊ．Ｓ．Ｓｙｋｅｓ等块体堆积速率（ＭＡＲ）计算已被应用于深海钻探计划（ＤＳＤＰ）和大洋钻探计划（ＯＤＰ）岩心，以研究大洋盆地的沉积物演化，或把ＭＡＲ数据分离成岩石学成分以决定方解石补偿深度（ＣＣＤ）的历...  相似文献